Tomography Tracking Instrukcja użytkownika

Wielkość: px

Rozpocząć pokaz od strony:

Download "Tomography Tracking Instrukcja użytkownika"

Nina Piotrowska
8 lat temu
Przeglądów:

1 Tomography Tracking Instrukcja użytkownika 1

2 Spis treści 1. Wymagania Pierwsze uruchomienie Główne okno aplikacji Menu podręczne... 4 a. Zakładka File... 4 b. Zakładka Edit... 4 c. Zakładka Process... 4 d. Zakładka Analyze... 5 e. Zakładka Samples... 5 f. Zakładka View... 5 g. Zakładka Help Podstawowe scenariusze pracy... 6 a. Załadowanie folderu z sekwencją obrazów... 6 b. Załadowanie folderu z próbkami... 8 c. Załadowanie pliku XML z wynikami

Zakładka Samples... 5 f. Zakładka View... 5 g. Zakładka Help... 6 5. Podstawowe scenariusze pracy... 6 a.

3 1. Wymagania User Manual System operacyjny Windows XP, Vista, 7.NET Framework 4.0 Client Profile Runtime Procesor obsługujący instrukcje SSE2 (minimum Pentium IV) Pamięd ram 1GB (dla Windows Vista/7 2GB) 2. Pierwsze uruchomienie Przy pierwszym uruchomieniu program poprosi o wybranie katalogu roboczego. Aby program nie pytał o katalog roboczy, za każdym razem, kiedy będzie uruchomiony, należy zaznaczyd pole (1). 3. Główne okno aplikacji Po wybraniu katalogu roboczego zobaczymy główne okno aplikacji. Z lewej strony (1) znajduje się lista plików znajdujących się w wybranym przez nas katalogu. Na głównym planie (2) widad podgląd aktualnie zaznaczonego pliku, po wstępnej obróbce obrazu, pliku próbki lub wizualizacji drogi znacznika na sekwencji zdjęd (w zależności od aktywnego trybu pracy). U góry okna znajduje się menu podręczne (3), poniżej skróty do najczęściej używanych funkcji (4). 3

Pierwsze uruchomienie Przy pierwszym uruchomieniu program poprosi o wybranie katalogu roboczego.

eksploratorze Windows Exit (4) zamyka aplikacje b.

4 4. Menu podręczne a. Zakładka File Open folder (1) umożliwia wybranie folderu z kolekcją plików.tiff do przetworzenia Open samples folder (2) umożliwia otworzenie folderu z plikami próbek treningowych dla sieci neuronowej Open samples In Windows Explorer (3) otwiera katalog z próbkami w eksploratorze Windows Exit (4) zamyka aplikacje b. Zakładka Edit Change workspace (1) umożliwia wybór katalogu roboczego Ask about workspace on start (2) pole wyboru zaznaczenie spowoduje, że aplikacja będzie pytad o katalog roboczy przy każdym uruchomieniu Reset user settings (3) powoduje skasowanie ustawieo użytkownika i przywrócenie domyślnych c. Zakładka Process Process (1) rozpoczyna szukanie znacznków w całej kolekcji plików. Ta opcja jest dostępna, tylko gdy zostanie wybrany katalog z plikami.tiff Preview (2) szuka i wyświetla znaczniki tylko na zaznaczonym pliku. Ta opcja jest dostępna, tylko gdy zostanie wybrany katalog z plikami.tiff Settings (3) umożliwia zmianę parametrów szukania znaczników 4

d. Zakładka Analyze Analyze from XML -> Curves (1) umożliwia załadowanie pliku xml ze współrzędnymi znalezionych plików i ich wizualizację za pomocą krzywych Analyze from XML -> Points (2) jw.

5 d. Zakładka Analyze Analyze from XML -> Curves (1) umożliwia załadowanie pliku xml ze współrzędnymi znalezionych plików i ich wizualizację za pomocą krzywych Analyze from XML -> Points (2) jw. tylko wizualizacja za pomocą punktów e. Zakładka Samples Enable extraction (1) przełącza program w tryb wydobywania próbek do nauki sieci neuronowej Show preview (2) pokazuje okno z podglądem ostatnio zaznaczonego obszaru Save positive sample (3) zapisuje zaznaczony obszar jako pozytywną próbkę Save negative sample -> Normal (4) zapisuje zaznaczony obszar jako zwykłą negatywną próbkę Save negative sample -> Part of marker (5) zapisuje zaznaczony obszar jako negatywną próbkę, która zawiera tylko częśd znacznika Save negative sample -> Wierd (6) zapisuje zaznaczony obszar jako negatywną próbkę, z wyróżniającym się artefaktem f. Zakładka View Zoom in (1) powoduje powiększenie obrazu Zoom out (2) powoduje oddalenie obrazu Normal size (3) wyświetla obraz w oryginalnym rozmiarze Fit to Window (4) dopasowuje powiększenie obrazu, do rozmiaru okna 5

Zakładka Samples Enable extraction (1) przełącza program w tryb wydobywania próbek do nauki sieci neuronowej Show preview (2) pokazuje okno z podglądem ostatnio zaznaczonego obszaru Save positive

6 g. Zakładka Help Zakładka help zawiera Show help, którego kliknięcie spowoduje wyświetlenie tej instrukcji użytkownika. 5. Podstawowe scenariusze pracy a. Załadowanie folderu z sekwencją obrazów Aby załadowad folder z sekwencją obrazów, w menu podręcznym wybieramy File -> Open folder. Na liście plików pokazane zostaną obrazy w formacie tiff znajdujące się w aktualnym katalogu. Na podglądzie zobaczymy obraz po wstępnym filtrowaniu. W trybie tym można przełączyd się do trybu wydobywania próbek. Można też rozpocząd proces analizy sekwencji obrazów, lub zobaczyd znalezione znaczniki na pojedynczym obrazie. Tryb wydobywania próbek służy do wskazywania próbek pozytywnych oraz negatywnych, które można wykorzystad do nauki sieci neuronowej. Aby włączyd tryb wydobywania, należy zaznaczyd w menu kontekstowym Samples -> Enable extraction. Aby zaznaczyd próbkę, wystarczy kliknąd w wybranym miejscu obrazu. Jeśli dokonano pomyłki, wystarczy kliknąd w innym miejscu obrazu, próbka nie zostanie zapisana. Aby zapisad próbkę należy z menu kontekstowego Samples wybrad Save positive/negative sample. Jeśli w menu Samples zaznaczono Show preview, na ekranie pojawi się okno (1), na którym widnieje powiększona próbka. Na poniższym widnieją próbki zaznaczone jako positive (2), normal negative (3), negative with part of marker (4), wierd negative(5) oraz aktualnie zaznaczona próbka (6), która nie została zapisana. 6

Na liście plików pokazane zostaną obrazy w formacie tiff znajdujące się w aktualnym katalogu. Na podglądzie zobaczymy obraz po wstępnym filtrowaniu.

Horizontal margin (1) służy do określenia jaka częśd obszaru po bokach obrazu ma byd ignorowana przy szukaniu znaczników.

7 Tryb podglądu znalezionych znaczników na zaznaczonym obrazie umożliwia podgląd i przetestowanie ustawieo odnajdywania. Ustawienia można zmieniad wchodząc w menu podręcznym Process -> Settings. Horizontal margin (1) służy do określenia jaka częśd obszaru po bokach obrazu ma byd ignorowana przy szukaniu znaczników. Top margin (2) oraz Bottom margin (3) służy do określania jaka częśd obszaru odpowiednio u góry i dołu ma byd ignorowana przy szukaniu znaczników. Cerainty level (4) służy do ustawienia progu sieci neuronowej, powyżej którego fragment jest uznawany za znacznik. Po rozpoczęciu procesu wyszukiwania znaczników na pojedynczym obrazie okno programu będzie wyglądało następująco: znalezione znaczniki (1) są zaznaczone w ramkach. 7

Tryb przetwarzania sekwencji obrazów można znaleźd w menu podręcznym Process - > Process. Po rozpoczęciu procesu wyszukiwania znaczników, zostanie wyświetlony pasek postępu.

Po zakooczonym procesie wyszukiwania znaczników, zostanie wyświetlona prośba o zapisanie pliku XML zawierającego współrzędne znaczników na obrazach. b.

8 Tryb przetwarzania sekwencji obrazów można znaleźd w menu podręcznym Process - > Process. Po rozpoczęciu procesu wyszukiwania znaczników, zostanie wyświetlony pasek postępu. Pokazano na nim: czas, który upłynął (1), szacowany czas, za jaki zakooczy się proces (2), pasek postępu (3). Proces można przerwad, klikając przycisk anulowania (4). Po zakooczonym procesie wyszukiwania znaczników, zostanie wyświetlona prośba o zapisanie pliku XML zawierającego współrzędne znaczników na obrazach. b. Załadowanie folderu z próbkami Aby załadowad folder z próbkami należy wejśd w menu podręczne File -> Open samples folder. Po załadowaniu folderu z próbkami uczącymi dla sieci neuronowej na liście plików zostaną wyświetlone zapisane pliki sieci neuronowej. Po prawej stronie wyświetlony zostanie podgląd próbki. c. Załadowanie pliku XML z wynikami Aby załadowad plik z wynikami wyszukiwania znaczników należy wejśd w menu podręczne Analyze -> Analyze from XML -> Curves. Użytkownik zostanie poproszony o wybranie pliku XML. Po otworzeniu pliku XML na głównym planie zostanie wyświetlona wizualizacja trasy (1) jaką przebyły znaczniki na sekwencji obrazów. 8

Trasę znaczników można również wizualizowad za pomocą punktów, których kolor wyznacza upływ czasu zgodnie z linią czasu na poniższym rysunku.

9 Trasę znaczników można również wizualizowad za pomocą punktów, których kolor wyznacza upływ czasu zgodnie z linią czasu na poniższym rysunku. czas Aby dokonad wizualizacji kolorowymi punktami, należy wejśd w menu podręczne Analyze -> Analyze from XML -> Points. Wynik wizualizacji widad na poniższym obrazku. 9

czas Aby dokonad wizualizacji kolorowymi punktami, należy wejśd w menu

Podobne dokumenty

1. Wprowadzenie. 1.1 Uruchamianie AutoCAD-a 14. 1.2 Ustawienia wprowadzające. Auto CAD 14 1-1. Aby uruchomić AutoCada 14 kliknij ikonę

Auto CAD 14 1-1 1. Wprowadzenie. 1.1 Uruchamianie AutoCAD-a 14 Aby uruchomić AutoCada 14 kliknij ikonę AutoCAD-a 14 można uruchomić również z menu Start Start Programy Autodesk Mechanical 3 AutoCAD R14