Zakład Mikrobiologii i Biotechnologii dr Justyna Rucha³a - Kierownik Zak³adu / Justyna Rucha³a, PhD, Head of Department Tel./Phone: +48177854945 e-mail: jruchala@ur.edu.pl konsultacje/consultation hours: poniedzia³ek / Monday 8:00-10:00 pok./room 117, D10 prof. dr hab. Andrzej Sybirny / Andrzej Sybirny, PhD, DSc, ProfTit Tel./Phone: +48177855440 e-mail: sibirny@yahoo.com konsultacje/consultation hours: pok./room 440, D9 mgr Ma³gorzata Bednarzak- pracownik in ynieryjno-techniczny/ma³gorzata Bednarzak, MSc, Research, Technical and Administrative Staff Tel./Phone: +48177854945 e-mail: malbed20@gmail.com pok./room 117, D10 Strona 1/6
Department of Microbiology and Biotechnology of the University of Rzeszow works in the fields of biotechnology and cell biology of the non-conventional yeasts. It appears to be the only place where studies in the field of genetic engineering of microorganisms are carried out. The staff of the Department uses the modern methods of molecular genetics, including that of molecular cloning of microorganisms as well as methods of microbial biochemistry and physiology. Department works currently on two grants Opus. In the past, the Department fulfilled grants of Polish Research Committee, Polish Ministry for Science and High Education, 4 exchange grants with Belgium (Wallonia), 2 exchange grants with Austria, Swedish-Polish-Ukrainian grant Visby, EU cross-border grant with Ukraine. Department possesses modern equipment which permits to resolve complicated problems of the contemporary molecular genetics and genetic engineering. The following topics of research activities of the Department of Microbiology and Biotechnology could be depicted: 1. The role of transcription factors in alcoholic fermentation of pentose sugar xylose in the thermotolerant yeast Ogataea polymorpha. The significance of transcription factors CAT8, HAP4A, MIG1 and TUP1 in the regulation of xylose alcoholic fermentation has been established. Using deletion of the mentioned genes, the yeast strains with elevated ethanol production have been isolated. 2. The role of genes and enzymes of pentose phosphate pathway of cytosolic and peroxisomal localization in xylose alcoholic fermentation in the thermotolerant yeast O. polymorpha. For the first time, the role of peroxisomal enzymes of the pentose phosphate pathway, transketolase, and transaldolase, in xylose alcoholic fermentation has been established. The significance of cytosolic and peroxisomal isozymes of ribose-5-phosphate epimerase and ribulose-5-phosphate isomerase in this process is under investigation. Strona 2/6
Strona 3/6
3. Mechanisms of regulation of riboflavin (vitamin B2) synthesis in the flavinogenic yeast Candida famata. The role of genes SEF1 coding for transcription activator, BCRP coding for riboflavin excretase, VMA1 coding for vacuolar ATPase in riboflavin oversynthesis has been established. The strains with elevated riboflavin synthesis have been constructed. 4. Construction of the yeast strains of Komagataella phaffii capable of production of bacterial antibiotics aminoriboflavin and roseoflavin. The synthetic gene coding for aminoriboflavin synthesis has been overexpressed in K. phaffii riboflavin overproducer which allowed obtaining the yeast producer of bacterial antibiotic for the first time. Construction of the yeast producer of roseoflavin is on the way. 5. Mechanisms of autophagic degradation of peroxisomes and cytosolic proteins in the methylotrophic yeast K. phaffii. The new genes ATG26, ATG28, ATG35, GSS1 involved in peroxisome degradation have been discovered. It was proved that the cytosolic enzymes of methanol metabolism are degraded in autophagy, and not in the proteasomal, pathway. Zak³ad Mikrobiologii i Biotechnologii wykonuje badania w dziedzinie biotechnologii oraz biologii komórki dro d y, g³ównie dro d y niekonwencjonalnych, bêd±c prawdopodobnie jedynym tego typu o rodkiem badañ w dziedzinie in ynierii genetycznej drobnoustrojów na Podkarpaciu. Pracownicy oraz doktoranci zak³adu wykorzystuj± nowoczesne metody genetyki molekularnej, w tym klonowania molekularnego mikroorganizmów oraz metody biochemiczne. Pracownicy zak³adu wykonuj± obecnie 2 granty Opus. W przesz³o ci w zak³adzie wykonywano granty KBN, ministerialne badawcze, 4 granty wymiany Strona 4/6
osobowej z Belgi± (Waloni±), 2 granty wymiany osobowej z Austri±, grant szwedzko-polsko-ukraiñski Visby oraz unijny grant transgraniczny z Ukrain±. Zak³ad szczyci siê nowoczesnym wyposa eniem, które pozwala rozwi±zywaæ skomplikowane problemy nowoczesnej molekularnej genetyki i inzynierii genetycznej. Najwa niejsze tematy badawcze Zak³adu Mikrobiologii i Biotechnologii: 1. Rola czynników transkrypscji w fermentacji alkoholowej pentozowego cukru ksylozy u termotolerancyjnych dro d y Ogataea polymorpha. Udowodniono znaczenie czynników transkrypcji CAT8, HAP4A, MIG1 oraz TUP1 w regulacji fermentacji alkoholowej ksylozy. Przy pomocy delecji tych genów uzyskano szczepy ze zwiêkszon± produkcj± etanolu. 2. Rola genów i enzymów szlaku pentozofosforanowego zlokalizowanych w cytozolu i peroksysomach w fermentacji alkoholowej ksylozy u termotolerancyjnych dro d y O. polymorpha. Po raz pierwszy udowodniono rolê enzymów szlaku pentozofosforanowego zlokalizowanych w peroksysomach - transketolazy i transaldolazy w alkoholowej fermentacji ksylozy. Badano znacznenie cytozolowych oraz peroksysomalnych izozymów epimerazy rybozo-5-fosforanu oraz izomerazy rybulozo-5-fosforanu w tym procesie. 3. Mechanizmy regulacji biosyntezy ryboflawiny (witamina B2) u flawinogennych dro d y Candida famata. Zidentyfikowano geny aktywatora transkrypcji SEF1, ekskretazy ryboflawiny BCRP oraz wakuolarnej ATPazy VMA1 uczestnicz±cych w regulacji nadprodukcji ryboflawiny. Skonstruowano ulepszonych producentów tej witaminy. 4. Konstruowanie producentów bakteryjnych antybiotyków Strona 5/6
Powered by TCPDF (www.tcpdf.org) aminorybowlawiny i rozeoflawiny u dro d y Komagataella phaffii. Syntetyczny gen koduj±cy syntezê aminoryboflawiny zosta³ nadeksprymowany u nadproducenta ryboflawiny K. phaffii, co pozwoli³o po raz pierwszy uzyskaæ produkcje bakteryjnego antybiotyku u dro d y. Kontynuowane s± prac± nad konstruowaniem dro d owego producenta rozeoflawiny. 5. Mechanizmy autofagicznej degradacji peroksysomów oraz cytozolowych bia³ek u metylotroficznych drozdzy K. phaffii. Zidentyfikowano nowe geny ATG26, ATG28, ATG35, GSS1 uczestnicz±ce w autofagicznej degradacji proksysomów. Udowodniono, e cytozolowe enzymy metabolizmu metanolu degraduja w szlaku autofagii a nie w proteasomach. Strona 6/6