KATEDRA CHEMII MEDYCZNEJ

Transkrypt

1 Sylwia Rodziewicz-Motowidło KATEDRA CHEMII MEDYCZNEJ Katedra Chemii Medycznej dr hab. Sylwia Rodziewicz-Motowidło dr hab. Franciszek Kasprzykowski dr hab. Aleksandra Kołodziejczyk dr Regina Kasprzykowska dr ElŜbieta Jankowska dr Aneta Szymańska dr Marta Spodzieja dr Ewa Wieczerzak dr Paulina Czaplewska Prof. dr hab. Wiesław Wiczk dr Katarzyna Guzow

2 STUDIA I STOPNIA (3-letnie licencjackie) KaŜdy projekt studencki zawiera część teoretyczną, polegającą na badaniach literaturowych, oraz część eksperymentalną, w której studenci zapoznają się z szeregiem nowoczesnych metod syntezy organicznej jak np.: synteza na nośniku stałym (manualna i w syntezatorze automatycznym) synteza mikrofalowa synteza regio- i stereoselektywna oraz technikami analitycznymi, stosowanymi w laboratoriach chemicznych takimi jak m.in: wysokosprawna chromatografia cieczowa na fazach odwróconych RP-HPLC (skala preparatywna i analityczna) elektroforeza Ŝelowa spektrometria mas spektrometria FT-IR, NMR metody chiralooptyczne (CD) Zajęcia praktyczne odbywają się pod kierunkiem dr Ewy Wieczerzak, dr ElŜbiety Jankowskiej, dr Anety Szymańskiej oraz dr Pauliny Czaplewskiej w grupach w pracowniach naukowych, w których znajduje się potrzebna aparatura specjalistyczna. Tematy prac dyplomowych 2012 Budowa i funkcje proteasomu Kinetyka reakcji enzymatycznych Agregacja krótkich peptydów wywodzących się z białek amyloidogennych Allosteryczne modulatory aktywności proteasomu. Poszukiwanie nowych modulatorów w oparciu o pulę białkową wirusów: Herpes Simplex, Herpes Zoster, Polio. Syntetyczne chemoterapeutyki przeciwbakteryjne. Cele komórkowe dla antybiotyków. Bakterie chorobotwórcze i lekooporność. Białka rekombinantowe jako nowoczesne terapeutyki. Genetycznie modyfikowane organizmy - szanse i zagroŝenia. Ciałka inkluzyjne - dr Jekyll czy mr Hyde? Keratyna (budowa, funkcje, zastosowanie oraz metody izolacji). Kolagen (budowa, funkcje, zastosowanie oraz metody izolacji) Elastyna (budowa, funkcje, zastosowanie oraz metody izolacji) Przeciwciała funkcja, budowa, metody oznaczanie epitopu i paratopu Białko surowicze Amyloidu A oddziaływanie z innymi białkami. Testy immunoenzymatyczne - współczesne modyfikacje testu ELISA Porównanie struktur krystalicznych ludzkiej cystatyny C i jej mutantów Metody badania oddziaływań pomiędzy białkami ze szczególnym uwzględnieniem zastosowania biosensorów.

3 Dr hab. Aleksandra Kołodziejczyk Wybrana tematyka badawcza realizowana Dr Aneta Szymańska w Katedrze Chemii Medycznej Dr ElŜbieta Jankowska Dr Ewa Wieczerzak Dr Paulina Czaplewska Dr hab Sylwia Rodziewicz-Motowidło Amyloidy Badania mechanizmu dimeryzacji, oligomeryzacji i fibrylizacji cystatyny C człowieka. Badania konformacyjne peptydu beta-amyloidowego, jego fragmentów i mutantów. Synteza chemiczna oraz badanie mechanizmu agregacji białka SAA oraz jego fragmentów Badania konformacyjne peptydów, białek i ich pochodnych posiadających właściwości amyloidogenne Ludzka Cystatyna C (hcc) loop L1 dimerization oligomerization by association of dimers molecule opening fibrilization run-away oligomerization fibrilization Two possible mechanism of oligomerization process of human cystatin C.

4 Serum Amyloid A Kompleks hcc-aβ Dr Aleksandra Kołodziejczyk pok. 70 Aktualnie prowadzone badania: Synteza i badania fizykochemiczne białek/peptydów agregujących Badania oddziaływań między agregujacymi białkami/peptydami.

5 Dr Aneta Szymańska pok. 212 Aktualnie prowadzone badania: Badania czynników wpływających na stabilność konformacyjną cystatyny C Badanie procesu dimeryzacji i oligomeryzacji ludzkiej cystatyny C Otrzymywanie i badania konformacyjne mutantów ludzkiej cystatyny C. Badania trwałości termodynamicznej i fałdowania cystatyny C Wpływ fragmentów białek i peptydów oddziałujących z cystatyną C proces na jej agregacji Krystalizacja mutantów cystatyny C Badania motywu zamka sterycznego w cystatynie C Dr Paulina Czaplewska pok. 64 Aktualnie prowadzone badania: Oddziaływanie ludzkiej cystatyny C z biologicznie aktywnymi ligandami - białkiem surowiczym SAA, peptydem beta amyloidowym oraz monoklonalnymi przeciwciałami Zastosowanie pochodnych benzoksazolalaniny do badania oddziaływań typu białko-białko, białko-peptyd.

6 Dr ElŜbieta Jankowska pok. 211 Aktualnie prowadzone badania: Badanie procesu denaturacji mutantów agregującego białka - ludzkiej cystatyny C za pomocą spektrometrii mas Krystalizacja mutantów ludzkiej cystatyny C Projektowanie, synteza i badania strukturalne (CD, FTIR, NMR) potencjalnych allosterycznych modulatorów aktywności proteasomu Wybrana tematyka badawcza realizowana w Katedrze Chemii Medycznej Dr hab. Franciszek Kasprzykowski Dr Regina Kasprzykowska Dr hab. Sylwia Rodziewicz-Motowidło Związki przeciwdrobnoustrojowe Projektowanie, synteza i badania biologiczne związków antybakteryjnych, antywirusowych i przeciwgrzybiczych.

7 Dr hab. Franciszek Kasprzykowski pok. 320 Dr Regina Kasprzykowska Wybrana tematyka badawcza realizowana w Katedrze Chemii Medycznej Inhibitory Dr hab. Franciszek Kasprzykowski Dr Regina Kasprzykowska Dr Ewa Wieczerzak Projektowanie, synteza i badania biologiczne inhibitorów procesu osteoporozy. Projektowanie, synteza i badania aktywności azapeptydowych inhibitorów proteaz cysteinowych.

8 Wybrana tematyka badawcza realizowana w Katedrze Chemii Medycznej Dr ElŜbieta Jankowska Dr hab. Franciszek Kasprzykowski Proteasom Projektowanie i synteza (w roztworze i na nośniku stałym) małocząsteczkowych związków peptydów i peptydomimetyków o potencjalnej zdolności inhibowania lub aktywowania proteasomu Krystalizacja i rozwiązywanie struktury kompleksów proteasomu z modulatorami jego aktywności Tat1 Wybrana tematyka badawcza realizowana w Katedrze Chemii Medycznej Dr hab. Sylwia Rodziewicz-Motowidło Dr ElŜbieta Jankowska Peptydy o właściwościach regeneracyjnych Proliferacja (Brd U) 72 h Proliferacja wzgl. % P1 P2 P3 P4 P5 Peptyd

9 Dr Sylwia Rodziewicz-Motowidło pok. 406 Aktualnie prowadzone badania: Bdania konformacyjne cystatyny C oraz białek chaperonowych metodą dynamiki molekularnej. Badania konformacyjne peptydów Alzheimerowych metodą NMR, CD i DSC. Badania konformacyjne antybiotyków peptydowych i ich analogów. Peptydy o właściwościach regeneracyjnych - synteza i badania stymulacji wzrostu fibroblastów Synteza i badania peptydów o właściwościach przeciwnowotworowych Wybrana tematyka badawcza realizowana w Zakładzie Fizykochemii Organicznej

10 Współpraca naukowa - ośrodki krajowe Uniwersytet Wrocławski, Wydział Chemii (prof. dr hab. H. Kozłowski, dr hab. T. Kowalik-Jankowska) Centrum Badań Biokrystalograficznych Instytutu Chemii Bioorganicznej PAN, oraz Wydział Chemii, Uniwersytet A. Mickiewicza, Poznań (prof. dr hab. M. Jaskólski) Centrum Ultraszybkiej Spektroskopii Laserowej, Instytut Fizyki, Uniwersytet A. Mickiewicza, Poznań (prof. dr hab. A. Maciejewski, dr J. Karolczak) Instytut Biochemii I Biofizyki PAN, Warszawa (dr J. Wójcik) Politechnika Gdańska, Zakład Chemii Leków (dr M. Bagiński) Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii, Katedra Biologii Molekularnej i Komórkowej (prof. K. Liberek) Akademia Medyczna w Gdańsku, Wydział Farmacji, Wydział i Zakład Biofarmacji i Farmakodynamiki (dr hab.. Wojciech Kamysz) Akademia Medyczna w Gdańsku, Zakład Biologii Komórki (dr hab. M. Obuchowski) Współpraca naukowa - ośrodki zagraniczne Lund University, Department of Clinical Chemistry, Sweden (prof. A. Grubb) University of KOnstanz, Germany (dr Andreas Marqard) Umea University, Sweden (prof. U. Lerner) Center of Fluorescence Spectroscopy, University of Maryland at Baltimore, USA (prof. J. R. Lakowicz) Slovenian NMR Centre, National Institute of Chemistry, Ljubljana, Slovenia (dr I. Zhukov) University of Massachusetts, Department of Biochemistry and Molecular Biology, Amherst, USA (prof. L. M. Gierasch) University of Texas, San Antonio, USA (prof. M. Gaczynska)

11 Galeria

12