DOROBEK NAUKOWY DANE BIOGRAFICZNO-NAUKOWE

Transkrypt

1 DOROBEK NAUKOWY PRZEMYSŁAW JAGODZIK DANE BIOGRAFICZNO-NAUKOWE Urodziłem się 11 października 1987 roku w Lesznie. W 2006 roku ukończyłem (matura) Liceum Ogólnokształcące im. Karola Kurpińskiego we Włoszakowicach. Następnie podjąłem dwustopniowe studia na kierunku biotechnologia na Uniwersytecie im. Adama Mickiewicza w Poznaniu. Pracę licencjacką (lipiec 2009) wykonaną pod kierunkiem prof. dr. hab. Artura Jarmołowskiego w Zakładzie Ekspresji Genów Instytutu Biologii Molekularnej i Biotechnologii obroniłem na Uniwersytecie Adama Mickiewicza w Poznaniu. Temat pracy brzmiał następująco: Białko zielonej fluorescencji (GFP) i jego zastosowanie w biologii molekularnej. Celem niniejszej pracy było zebranie informacji dotyczących białka GFP jak i jego roli w biologii molekularnej. Średnia ocen ze studiów I stopnia: dobry plus (4,5) Pracę magisterska (lipiec 2011) wykonaną pod opieką dr Agnieszki Ludwików w Zakładzie Biotechnologii Instytutu Biologii Molekularnej i Biotechnologii obroniłem na Uniwersytecie Adama Mickiewicza. Kierownikiem pracy był prof. dr hab. Jan Sadowski. Tematem niniejszej pracy była: Identyfikacja potencjalnych elementów kaskady sygnałowej z udziałem kinazy MAPKKK18 Arabidopsis thaliana przy użyciu system dwuhybrydowego. Celem niniejszej pracy była identyfikacja potencjalnych partnerów białkowych kinazy MAPKKK18, stanowiących elementy kaskady sygnałowej z jej udziałem. W realizacji tego celu posłużono się powszechnie stosowanym drożdżowym systemem dwuhybrydowym. Pozytywny wynik oddziaływania udało się zaobserwować pomiędzy MAPKKK18 a MKK7, ABI1, PP2CA, PP2CX i PP2CY. Uzyskane wyniki pozwoliły przybliżyć potencjalny udział MAPKKK18 w stresie suszy i w odpowiedzi na ABA. Podczas wykonywania pracy nauczyłem się stosowania następujących technik: drożdżowy system dwuhybrydowy (Y2H), przygotowywanie wektorów do transformacji drożdży, transformacja drożdży metodą szoku cieplnego, izolacja DNA plazmidowego metodą lizy alkalicznej, elektroforeza i PCR. Średnia ocen ze studiów II stopnia: dobry plus (4,5) Pracę doktorską (od października 2013 roku) wykonuję pod kierunkiem prof. dr. hab. Grzegorza Jackowskiego w Zakładzie Fizjologii Roślin Instytutu Biologii Eksperymentalnej na Uniwersytecie im. Adama Mickiewicza w Poznaniu. Tematem mojej pracy jest: Aktywność opiekuńcza chloroplastowej proteazy AtDeg2. Celem postępowania badawczego jest znaczne rozszerzenie wiedzy na temat Strona 1 / 5

2 aktywności opiekuńczej chloroplastowej proteazy AtDeg2. Zadania badawcze, których wyniki mają się złożyć na rozprawę doktorską zostały sformułowane następująco: 1) Ustalenie, która domena w strukturze pierwszorzędowej AtDeg2 jest odpowiedzialna za aktywność opiekuńczą tego białka 2) Identyfikacja fizjologicznych substratów dla aktywności opiekuńczej AtDeg2 u roślin hodowanych w warunkach ekspozycji na światło o wysokim natężeniu 3) Utworzenie katalogu cech fenotypowych A. thaliana, w których regulacji kształtowania się uczestniczy AtDeg2 poprzez swoją aktywność opiekuńczą lub opiekuńczą i proteazową jednocześnie PROJEKTY BADAWCZE Wykonawca w projekcie: AtDeg2 białko chloroplastowe o podwójnej aktywności: proteazy i białka opiekuńczego. Grant badawczy Narodowego Centrum Nauki na lata Nr projektu 2013/09/B/NZ3/ Kierownik projektu: Określenie efektu mutacji punktowej S268A (zamiana seryny na alaninę w pozycji 268) na aktywność proteazową i opiekuńczą chloroplastowego białka AtDeg2. Grant Dziekana Wydziału Biologii Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu na lata PUBLIKACJE Jagodzik P., Tajdel-Zielinska M., Ciesla A., Marczak M., Ludwikow A. Mitogen-Activated Protein Kinase Cascades in Plant Hormone Signaling. Front. Plant Sci. 2018;9: Adamiec M.*, Jagodzik P.*, Wyka T. P., Ludwików A., Mituła F., Misztal L., Luciński R., Jackowski G. Chloroplast protease/chaperone AtDeg2 influences opening of cotyledons and reproductive development in Arabidopsis. Acta Soc Bot Pol. 2018;87(2): *Obaj autorzy w równym stopniu przyczynili się do powstania pracy. Jagodzik P., Luciński R., Misztal L., Jackowski G. The contribution of individual domains of chloroplast protein AtDeg2 to its chaperone and proteolytic activities. Acta Soc Bot Pol. 2018;87(1): Jagodzik P., Adamiec M., Jackowski G. AtDeg2 - a chloroplast protein with dual protease/chaperone activity. Acta Soc Bot Pol 83(3): Strona 2 / 5

3 DONIESIENIA KONFERENCYJNE 2018: Jagodzik P., Mituła F., Ludwików A., Jackowski G. Identyfikacja fizjologicznego substratu holdazowej aktywności opiekuńczej chloroplastowej proteazy AtDeg2. Konferencja Naukowa Sekcji Fizjologii i Biochemii Roślin PTB oraz Oddziału Lubelskiego PTB "Fotosynteza w świetle badań fizjologicznych i biochemicznych". Lublin, Polska, 2 lipca 2018, s. 13, wystąpienie ustne Jagodzik P., Luciński R., Misztal L., Jackowski G. Chloroplastowa proteaza AtDeg2 posiada aktywność dezagregazy. VI Warsztaty Naukowe Instytutu Biologii Ekspreymentalnej Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu. Poznań, Polska, 15 czerwca 2018, s. 57 Adamiec A., Jagodzik P., Wyka T. P., Ludwików A., Mituła F., Misztal L., Luciński R., Jackowski G. Chloroplastowe białko AtDeg2 uczestniczy w regulacji otwierania się liścieni oraz przebiegu fazy generatywnej u Arabidopsis. VI Warsztaty Naukowe Instytutu Biologii Ekspreymentalnej Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu. Poznań, Polska, 15 czerwca 2018, s : Jagodzik P., Mituła F., Luciński R., Misztal L., Ludwików A., Jackowski G. The search for native protein substrates for chaperone activity of chloroplast protein AtDeg2. 8th Conference of the Polish Society of Experimental Plant Biology "Communication in plants: from cell to environment". Białystok, Polska, , s. 120 Adamiec M., Jagodzik P., Mituła F., Luciński R., Misztal L., Ludwików A., Jackowski G. The involvement of chloroplast protein AtDeg2 in chronological progression of ontogenesis stages in Arabidopsis thaliana. 8th Conference of the Polish Society of Experimental Plant Biology "Communication in plants: from cell to environment". Białystok, Polska, , s. 83 Jagodzik P., Luciński R., Misztal L., Jackowski G. Two approaches confirm that chloroplast protease AtDeg2 is able to inhibit aggregation of denatured proteins. IV International Conference on Research and Education Poznań, Polska, 6-8 kwietnia 2017, s : Jagodzik P., Luciński R., Misztal L., Jackowski G. The importance of a proteolytically active serine and PDZ domains for chaperone activity of chloroplast protease AtDeg2. 2nd Congress of Polish Biochemistry, Cell biology, Biotechnology and Bioinformatics BIO 2016 Expanding beyond the limits. Wrocław, Polska, września 2016, s. 61 Jackowski G., Jagodzik P., Luciński R., Misztal L. Two PDZ domains are required for the chaperone activity of chloroplast protease AtDeg2. Abstracts of the 17th International Congress on Photosynthesis Research. Maastricht, Holandia, 7-12 sierpnia 2016, s. 186 Strona 3 / 5

4 Jagodzik P., Luciński R., Misztal L., Jackowski G. The involvement of the active site S268 in the protease and chaperone activity of chloroplast protein AtDeg2. Plant Biology Europe EPSO/FESPB 2016 Congress. Praga, Czechy, czerwca 2016, s. 150 Jagodzik P., Luciński R., Misztal L., Jackowski G. Udział indywidualnych domen chloroplastowego białka AtDeg2 w jego aktywności opiekuńczej. 57. Zjazd PTB Botanika - tradycja i nowoczesność. Lublin, Polska, czerwca 2016, s. 65 Jagodzik P., Luciński R., Misztal L., Jackowski G. The contribution of individual domains of chloroplast protease AtDeg2 to its chaperone activity. Plant Proteases: from roles in life and death to understanding regulation and action. Oxford, Wielka Brytania, kwietnia 2016, s : Jagodzik P., Misztal L., Jackowski G. Obtainment of Esherichia coli strains overexpressing eight versions of Arabidopsis thaliana chloroplast protease/chaperone AtDeg2. 7th International Conference of PhD Students of Szczecin University, Biology Panel Biodiversity at all levels of life. Szczecin, Polska, 17 października 2014, s. 67 Jagodzik P., Ludwików A., Jackowski G. Introduction of mutated version of AtDEG2 gene into destination vector for studies on functional significance of AtDeg2 chloroplast protease/chaperone. 1st Congress of the Polish Biochemistry, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics BIO Warszawa, Polska, 9-12 września 2014, s. 202 Jagodzik P., Ludwików A., Misztal L., Jackowski G. Uzyskanie sześciu wariantów genu kodującego chloroplastową proteazę AtDeg2 i ich wklonowanie do wektora wejściowego. III Konferencja Naukowo-Dydaktyczna Wydziału Biologii. Poznań, Polska, kwietnia 2014, s : Ludwików A., Piechalak A., Małecka A., Szabat M., Jagodzik P., Górska A., Ziółkowski P.,Sadowski J. Protein phosphatases: signalling hubs integrating plant stress response II Konferencja NaukowoDydaktyczna Wydziału Biologii. Poznań, Polska, 5-7 kwietnia 2011, s. 19 Ludwików A., Kubiak P., Szabat M., Górska A., Jagodzik P., Ziółkowski P., Cieśla A., Czaczyk K., Sadowski J. Signal transduction by protein degradation a new function of protein phosphatases 2C clade A in Arabidopsis. FEBS Workshop, Plant Organellar Signaling, From Algae to Higher Plants. Primosten, Chorwacja, 31 sierpnia 3 września 2011 Strona 4 / 5

5 DZIAŁALNOŚĆ POPULARYZATORSKA Udział w pracach związanych z organizacją XI edycji Nocy Naukowców. 30/09/2016 Uczestnictwo w organizacji XIX poznańskiego Festiwalu Nauki i Sztuki 19/04/2016 Udział w pracach związanych z organizacją X edycji Nocy Naukowców. 25/09/2015 Udział w przygotowaniu XVIII edycji Poznańskiego Festiwalu Nauki i Sztuki. 16/04/2015 DZIAŁALNOŚĆ W ORGANACH UNIWERSYTECKICH Pełnienie obowiązków członka Rady Instytutu Biologii Eksperymentalnej Wydziału Biologii UAM w roku akademickim 2016/2017 Pełnienie obowiązków członka Wydziałowej Komisji Ekonomicznej Doktorantów Wydziału Biologii w roku akademickim 2016/2017 Pełnienie obowiązków członka Wydziałowej Komisji Ekonomicznej Doktorantów Wydziału Biologii w roku akademickim 2014/2015 ZAINTERESOWANIA NAUKOWE Obszar moich zainteresowań naukowych w szczególności dotyczy biologii molekularnej: oddziaływania między białkami, struktura i funkcje biologiczne białek, DNA, RNA, procesy transkrypcji i translacji. Wyrażam zgodę na przetwarzanie danych osobowych zawartych w mojej aplikacji dla potrzeb niezbędnych do realizacji procesów rekrutacyjnych zgodnie z ustawą z dnia 29 sierpnia1997 r. o ochronie danych osobowych (t.j. Dz. U. z 2015 r. poz. 2135, 2281, z 2016 r. poz. 195, 677). Strona 5 / 5