9. Metody dydaktyczne 10. Podstawowe informacje i zaliczone kursy z genetyki i biologii molekularnej oraz dobra znajom angielskiego.

Transkrypt

1 Lp. Opis sylabusu 1. Nazwa przedmiotu Bioinformatyka i genomika 3. Kod przedmiotu BioGenom Typ przedmiotu 7. Rok studiów, semestr Studia II stopnia, semestr I Metody dydaktyczne 10. Podstawowe informacje i zaliczone kursy z genetyki i biologii molekularnej oraz dobra znajom angielskiego / Liczba punktów ECTS 4/3 ECTS 13. az danych; zrozumienie idei algorytmów i metod komputerowych stosowanych w analizach sekwencji nukleotydowych w skali genomowej: identyfikowanie poznanie podstaw transkryptomiki: analiza bioinformatyczna analizy oraz baz genomowe. Poznanie algorytmów i eotydowej na motywó strukturalnych, przewidywanie struktur przestrzennych. Poznanie baz struktur przestrzennych przestrzennych. 14. Forma i warunki zaliczenia zaliczenia z przedmiotu Podstawowe zagadnienia z dziedziny genomiki, bioinformatyki, transkryptomiki i proteomiki; rodzaje genomowych i bioinformatycznych baz danych; - metody analiz mikromacierzy; analizy genomów i genomika porównawcza. Komputerowa analiza sekwencji Bazy struktur przestrzennych (PDB), przyrównanie

2 16. Wykaz literatury 1. P.G. Higgs, T.K. Attwood. Bioinformatyka i ewolucja molekularna, PWN, J.-M. Claverie, C. Notredame. Bioinformatics For Dummies. Wiley Publishing, Inc A.D. Baxevanis, B.F.F. Ouellette (red.) Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins. Wiley-Liss, Inc (lub wersja

3 Lp. Opis 1. Nazwa przedmiotu Immunologia 3. Kod przedmiotu Immu Typ przedmiotu - 7. Rok studiów, semestr I rok studiów II stopnia, I semestr 8. przedmiot - 9. Metody dydaktyczne praca w laboratorium / Liczba punktów ECTS 3/2 ECTS 13. przeciwalergicznych i immunosupresyjnych, metody produkcji i zastosow metody stosowane w diagnostyce i terapii chorób obwodowej e biologicznym z zastosowaniem technik immunoenzymatycznych ELISA 14. Forma i warunki zaliczenia zaliczenia z przedmiotu, a zaliczenia poszczególnych zakres danego przedmiotu (termin podstawowy i poprawkowy). -- ocena wiedzy teoretycznej : trzy o komórkowa tkankowej, obcych. Immunologia nowotworów: naturalna obrona nowotworom, immunoterapia i szczepionki przeciwnowotworowe. Stan zapalny: komórki i przebieg zapalenia i leki przeciwzapalne. Immunologia

4 16. Wykaz literatury Szczepionki: mechanizmy immunizacji, rodzaje szczepionek i kierunki rozwoju szczep przyczyny rozwoju alergii i sposoby leczenia. Techniki immunologiczne w badaniach laboratoryjnych. gnostyce i terapii: morfologia, funkcja, metody identyfikacji; Budowa i alne; Receptory PRR; struktury PAMP. Typy odpowiedzi immunologicznej; Mechanizmy immunologicznej. Unikanie przez patogeny mechanizmów obronnych gospodarza. Immunologia pod Wydanie polskie PZWL lub angielskie Fanger, PWN -Prastowska I. Immunochemia w biologii medycznej. Metody laboratoryjne. PWN, 2009;Abbas A, Lichtman A.,, Basic Immunology, ed. Saunders, 2006

5 Lp. Opis 1. Nazwa przedmiotu Metody PCR-techniki i praktyczne wykorzystanie 3. Kod przedmiotu MetPCR Typ przedmiotu - 7. Rok studiów, semestr Studia II stopnia, I semestr 8. Prof. dr hab. Mariusz Olczak - Dr hab. Teresa Olczak - przedmiot 9. Metody dydaktyczne lekcyjnych, raz w tygodniu po 2 jednostki lekcyjne. tygodni (6,5 godziny lekcyjnej raz w tygodniu, co drugi - ( osobowych, - 1 raz w tygodniu po 1 godzinie (60 minut). 10. e biologii molekularnej / Liczba punktów ECTS 5 ECTS. 13., stosowanych obecnie w laboratorium, na poziomie PCR, a wykorzystaniem reakcji PCR do mutagenezy oraz identyfikacji nieznanych sekwencji DNA. 14. Forma i warunki zaliczenia zaliczenia z przedmiotu, a zaliczenia poszczególnych zakres danego przedmiotu raz ok. 1 godz.). metod identyfikacji DNA oraz aparatury. Projektowanie typowych i zmodyfikowanych starterów do reakcji PCR oraz starterów i sond do reakcji PCR w czasie rzeczywistym. Projektowanie starterów zdegenerowanych do amplifikacji fragmentu DNA na podstawie podanych sekwencji peptydów. Omówienie reakcji RT i RT-PCR. Mutageneza ukierunkowana i przypadkowa. Technika 5 i 3 RACE. Zastosowanie

6 16. Wykaz literatury metody PCR. RT i RT- starterów do reakcji PCR oraz starterów i sond do reakcji PCR w czasie rzeczywistym. Amplifikacja fragmentu DNA - dobranie warunków i przeprowadzenie reakcji PCR, identyfikacja i analiza produktów reakcji PCR. Projektowanie starterów zdegenerowanych do amplifikacji fragmentu DNA na podstawie podanych sekwencji peptydów oraz opracowanie warunków reakcji PCR. Zaprojektowanie mutagenezy ukierunkowanej i przypadkowej dla i 3 RACE. 1)Berg, Tymoczko, Stryer L. Biochemia. Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa 2003 lub 2)J. Sambrook, D.W. Russel Molecular Cloning. A laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York. Third Edition

7 Lp. Opis sylabusu 1. Nazwa przedmiotu Ewolucja molekularna i filogenetyka chnologii 3. Kod przedmiotu EwolMolFilo Typ przedmiotu o toku studiów 7. Rok studiów, semestr Studia II stopnia, II semestr 8. przedmiot 9. Metody dydaktyczne 10. Podstawowe informacje i zaliczone kursy z genetyki, biologii molekularnej oraz bioinformatyki oraz dobra / Liczba punktów ECTS 3/2 ECTS 13. Zrozumienie molekularnych podstaw ewolucji. Poznanie algorytmów i metod: przyrównania (dopasowania) par sekwencji (macierz punktów, programowanie dynamiczne) i wielu sekwencji oraz metodami poszukiwanie: sekwencji podobnych w bazach danych (algorytmy FASTA i BLAST), motywów i wzorów w sekwencjach. Poznanie metod filogenetyki molekularnej: zebranie sekwencji homologicznych, substytucji, skonstruowanie drzewa filogenetycznego, analiza i ocena drzewa filogenetycznego. Poznanie na az odtwarzania filogenezy grup organizmów. 14. Forma i warunki zaliczenia zaliczenia z przedmiotu Molekularne podstawy ewolucji. Przyrównanie (dopasowanie) par sekwencji (macierz punktów, programowanie dynamiczne przyrównanie lokalne i globalne), systemy punktacji (macierze aminokwasowe przyrównania. Przyrównanie wielu sekwencji (progresywne przyrównanie globalne, przyrównanie sekwencji podobnych w bazach danych (algorytmy FASTA i BLAST), kryteria i ist sekwencji. Motywy i wzory w sekwencjach: sposoby ich profile, logo). Filogenetyka molekularna: etapy analiz filogenetycznych, rodzaje sekwencji homologicznych (ortologi, paralogi, ksenologi), rodzaje modeli molekularny, rodzaje drzew, metody tworzenia drzew filogenetycznych (UPGMA, NJ, ME, LS/FM, MP, ML,

8 16. Wykaz literatury bayesowskie), metoda bootstrap. Ewolucja genów, 1. P.G. Higgs, T.K. Attwood. Bioinformatyka i ewolucja molekularna, PWN, D. Graur, W.-H. Li. Fundamentals of Molecular Evolution (2nd edn). Sinauer Associates Inc., Sunderland, MA R.D.M. Page, E.C. Holmes. Molecular Evolution. A Phylogenetic Approach. Blackwell Science Ltd bioinform

9 Lp. Opis 1. Nazwa przedmiotu Genetyka populacji przedmiot 3. Kod przedmiotu GenetPopul Typ przedmiotu 7. Rok studiów, semestr Studia II stopnia, III semestr 8. Dr Dorota Mackiewicz 9. Metody dydaktyczne 10. Podstawowe informacje i zaliczone kursy z genetyki, angielskiego / Liczba punktów ECTS 2/1 ECTS 13. Zapoznanie z podstawowymi prawami i modelami wykorzystywanymi w genetyce populacji. Nabycie zac komputerowymi wykorzystywanymi w szacowaniu danych genetycznych stosowanych do tego opisu. 14. Forma i warunki zaliczenia zaliczenia z przedmiotu 16. Wykaz literatury Informacja genetyce populacji. Rodzaje markerów genetycznych. genetycznej. Rola mutacji, dryfu genetycznego, doboru naturalnego oraz kojarzenia wsobnego i migracji w genetyka populacji i bioinformatyczna analiza danych oparta o markery genetyczne. Wybrane aspekty 1. Daniel L. Hartl, Andrew G. Clark. Podstawy genetyki populacyjnej. Wydawnictwa Uniwersytetu Warszawskiego 2009.

10 Lp. Opis sylabusu 1. Nazwa przedmiotu Komputerowe i matematyczne modelowanie procesów ewolucyjnych 3. Kod przedmiotu KompModelProc Typ przedmiotu 7. Rok studiów, semestr Studia Ii stopnia, III semestr 8. (osób) przedmiot 9. Metody dydaktyczne 10. Podstawowe informacje i zaliczone kursy z genetyki ogólnej, genetyki populacji, biologii molekularnej, programowania i informatyki oraz do Liczba punktów ECTS 2/2 ECTS 13. komputerowym symulowaniem i matematycznym opisem ewolucji i struktury genetycznej populacji. 14. Forma i warunki zaliczenia zaliczenia z przedmiotu, a zaliczenia poszczególnych zakres danego przedmiotu 16. Wykaz literatury odpowiednio dobieranymi parametrami. Zaliczenie wyników modelowania. Warunkiem dopuszczenia do egzaminu jest zaliczenie Egzamin pisemny, odpowiedzi na pytania, wykonanie zadania. Komputerowe modele typu Monte Carlo genów, genomów i populacji. Model Penna, Lotka- Voltera. Matematyczne próby opisania wyników symulacji komputerowych. Analiza baz danych i porównywanie wyników

11 Lp. Opis 1. Nazwa przedmiotu Wirusologia. 3. Kod przedmiotu Wir3. 4. Polski Typ przedmiotu - 7. Rok studiów, semestr Studia II stopnia, III semestr 8. Dr hab. Egbert Piasecki przedmiot 9. Metody dydaktyczne 10. immunologii i biologii molekularnej Liczba punktów ECTS 3 ECTS Forma i warunki zaliczenia zaliczenia z przedmiotu, a zaliczenia poszczególnych zakres danego przedmiotu semestrze 16. Wykaz literatury Wirusologia ogólna: budowa wirusów, klasyfikacja wirusów, genom wirusowy i jego replikacja, cykl Szczepionki i chemioterapia przeciwwirusowa Wirusologia systematyczna wybranych rodzin wirusów: ortomyksowirusy, pokswirusy, pikornawirusy, hepadnawirusy, flawiwirusy, rabdowirusy, retrowirusy, filo wirusy, wiroidy i HDV, priony 2. L. Collier, J. Oxford: Wirusologia, PZWL 2001

12 Lp. Opis 1. Nazwa przedmiotu Prawo autorskie 3. Kod przedmiotu PrawoAut Typ przedmiotu 7. Rok studiów, semestr Studia II stopnia, III semestr 8. Dr Julian Jezioro przedmiot 9. Metody dydaktyczne 10. Brak Liczba punktów ECTS 3 ECTS 13. Przedstawienie uregulowania prawa autorskiego jako ci intelektualnej z 14. Forma i warunki zaliczenia Zaliczenia ustne lub pisemne (test). zaliczenia z przedmiotu, a zaliczenia poszczególnych zakres danego przedmiotu A. Zagadnienia ogólne: Dobra niematerialne jako przedmiot prawa. Przedmioty intelektualne jako szczególny rodzaj dóbr prawnych. konwencje: UE. e: Prawo autorskie: Przedmiot prawa autorskiego utwory, przedmioty autorskich i pokrewnych. Program komputerowy jako e autorskich pokrewnymi, Komisja Prawa Autorskiego, Fundusz Ochrona wizerunku, tajemnicy korespondencji oraz sui generis baz danych. B. Prawo wynalazku biotechnologicznego). Znaki towarowe,

13 16. Wykaz literatury oznaczenia geograficzne, zwalczanie nieuczciwej konkurencji oraz uregulowanie antymonopolowe i normalizacyjne. Literatura podstawowa: intelektualnej, w: Podstawy prawa autorskiego pod przygotowaniu); J. Barta, R. Markiewicz, Prawo autorskie, Warszawa J. Barta, M. Czajkowska- Ustawa o prawie autorskim i prawach pokrewnych. Komentarz, Kraków 2005; J. Barta, R. Markiewicz, Ustawa o ochronie baz danych. Komentarz, Warszawa 2002; Europejskiej, Warszawa 2003; R. Golat, Prawo autorskie i prawa pokrewne, Warszawa 2005; M. -Niedzielska (red.) Prawo autorskie i prawa Prawa Prywatnego. Tom 13. Prawo autorskie (red. J. Barta), Warszawa 2007; Prawo patentowe, Warszawa 2 - Henzler, Wynalazek biotechnologiczny - przedmiot patentu, Warszawa 2006.

14 Lp. Opis sylabusu 1. Nazwa przedmiotu Ekonomia 3. Kod przedmiotu Ekon wowych 6. Typ przedmiotu - 7. Rok studiów, semestr Studia II stopnia, IV semestr 8. Dr Sebastian Jakubowski 9. Metody dydaktyczne 10. Brak Liczba punktów ECTS 3 ECTS 13. praktycznego wykorzystania przy prowadzeniu prawnych na funkcjonowanie gospodarki narodowej. samodzielnej analizy zjawisk gospodarczych oraz potrzeb gospodarki narodowej. Dodatkowo uczestnik mikroekonomicznej i sposoby ich wykorzystania w 14. Forma i warunki zaliczenia zaliczenia z przedmiotu, a zaliczenia poszczególnych zakres danego przedmiotu 15. czne - - -gospodarcze Podstawy teorii wyboru konsumenta. - iorstwa. - - dochód narodowy. - Determinanty dochodu narodowego kredytowy - Czynniki wzrostu gospodarczego - Bezrobocie - Inflacja 16. Wykaz literatury - R. Milewski, Podstawy ekonomii, Warszawa, najnowsze wydanie. - D. Begg, S. Fischer, R. Dornbusch, Makroekonomia, PWE, Warszawa, najnowsze wydanie.

15