Dr Katarzyna Wyrwa. Telefon: (+48 61) Zakład Biometrii i Bioinformatyki

Transkrypt

1 CV Dr Katarzyna Wyrwa Telefon: (+48 61) Zakład Biometrii i Bioinformatyki Zespół Ewolucji Funkcji Systemów Biologicznych Specjalizacja genomika porównawcza roślin i grzybów, filogenomika, metagenomika, bionformatyka Profil badawczy / zakres prowadzonych badań 1. Analiza scenariuszy ewolucyjnych kształtujących współczesne rośliny strączkowe. 2. Analiza metagenomu grzybowego. 3. Analiza ewolucji domen i architektury domenowej białek. Projekty badawcze krajowe i międzynarodowe 1. NCN Nr projektu: 2011/03/NZ2/01420 Tytuł projektu: Cytomolekularny wgląd w genomy Lupinus Kierownik projektu: dr inż. Karolina Leśniewska Okres realizacji: Nr projektu: 2013/08/T/NZ2/00796 Tytuł projektu: Analiza genetyczno-molekularna wybranych genów uczestniczących w wiązaniu azotu atmosferycznego u łubinu wąskolistnego (Lupinus angustifolius L.) Kierownik projektu: mgr Katarzyna Wyrwa Okres realizacji: MNiSW Nr projektu: N N Tytuł projektu: Genom jądrowy Lupinus angustifolius L.: struktura wybranych genów, ich lokalizacja genetyczna i fizyczna oraz analiza porównawcza wybranych regionów genomu z innymi gatunkami roślin strączkowych Kierownik projektu: dr hab. Barbara Naganowska, prof. IGR Okres realizacji:

2 3. MRiRW Nr projektu: 79 Tytuł projektu: Cecha wczesności kwitnienia u łubinu wąskolistnego (Lupinus angustifolius) - podstawy genetyczne i molekularne Kierownik projektu: prof. Bogdan Wolko Okres realizacji: Nr projektu: N /3234 Tytuł projektu: Analiza struktury regionu genomu Lupinus angustifolius zawierającego gen odporności na antraknozę Kierownik projektu: prof. dr hab. Bogdan Wolko Okres realizacji: Staże zagraniczne Australia, University of Western Australia, School of Plant Biology, Perth France, UMR CNRS 6553 Ecobio, Evolution des Génomes et Spéciation, Université de Rennes, Współpraca krajowa 1. Instytut Chemii Bioorganicznej, współpraca w ramach projektu MNiSW 2. Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Poznań, współpraca w ramach projektu MNiSW Współpraca zagraniczna 1. Uniwersytet Australii Zachodniej w Perth, Australia dr Matthew Nelson 2. Royal Botanical Gardens, Kew, Wielka Brytania dr Matthew Nelson Publikacje 1. Wyrwa K., Książkiewicz M., Szczepaniak A., Susek K., Podkowiński J., Naganowska B ). Integration of Lupinus angustifolius L. (narrow-leafed lupin) genome maps and comparative mapping within legumes. Chromosome Research DOI: /s Ksiażkiewicz M., Zieleziński A., Wyrwa K., Szczepaniak A., Rychel S., Karłowski W., Wolko B., Naganowska B. (2014), Remnants of the legume ancestral genome preserved in gene-rich regions: insights from Lupinus angustifolius physical, genetic and comparative mapping, Plant Molecular Biology Reporter Książkiewicz M., Wyrwa K., Szczepaniak A., Rychel S., Majcherkiewicz K., Przysiecka Ł., Karłowski W., Wolko B., Naganowska B. (2013). Comparative genomics of

3 Lupinus angustifolius gene-rich regions: BAC library exploration, genetic mapping and cytogenetics. BMC Genomics 2013, 14:79. 4.Książkiewicz M., Wyrwa K., Szczepaniak A., Naganowska B., Wolko B. (2013), Generich regions in narrow leafed lupin (Lupinus angustifolius L.); Annual Report 2013, Polish Academy of Science, Naganowska B., Wyrwa K., Szczepaniak A., Przysiecka Ł., Książkiewicz M., Wolko B. (2011). Cytogenetic mapping a step towards an integrated genome map of Lupinus angustifolius. W: Lupin crops an opportunity for today, a promise for the future (Naganowska B., Wolko B., Kachlicki P., red.). Proc. 13th Int. Lupin Conf., 6-10 June 2011, Poznań, Poland. ISBN Institute of Plant Genetics Polish Academy of Sciences, Polish Lupin Association, ss Wolko B., Książkiewicz M., Majcherkiewicz K., Wyrwa K. (2010). Markery STS sprzężone z genami odporności na grzyby patogeniczne u łubinu wąskolistnego (Lupinus angustifolius L.). W: Materiały IV Sympozjum Naukowego Jakość środowiska, surowców i żywności (Dubert F i in. red.) Kraków, ISBN , ss Nagrody i odznaczenia 1. Stypendium na wyjazd szkoleniowy TransFormation.Doc realizowane w ramach projektu systemowego Ministra Nauki Szkolnictwa Wyższego pt. Wsparcie systemu zarządzania badaniami naukowymi i ich wynikami. Szwecja, Lund Nagroda indywidualna za osiągnięcia publikacyjne w 2014 roku przyznana przez Dyrektora Instytutu Genetyki Roślin PAN w Poznaniu. 3. Projekt nr PO KL 8.2.2/ /14 pt. "Analiza genetyczno-molekularna wybranych genów uczestniczących w wiązaniu azotu atmosferycznego u łubinu wąskolistnego (L. angustifolius L.)". Wsparcie stypendialne dla doktorantów na kierunkach uznanych za strategiczne z punktu widzenia rozwoju Wielkopolski realizowanego w latach przez Wojewódzki Urząd Pracy w Poznaniu w ramach Programu Operacyjnego Kapitał Ludzki

4 CV Dr Katarzyna Wyrwa Telefon: (+48 61) Department of Biometry and Bioinformatics Functional Evolution of Biological Systems Team Specialisation comparative genomics of plants and fungi, phylogenomics, metagenomics, bioinformatics Research profile 1. Analysis of evolutionary mechanisms shaping contemporary legumes. 2. Fungal metagenome analysis. 3. Analysis of domain evolution and domain architecture of proteins. National and international grants 1. National Centre of Science (NCS) grants Project no: 2011/03/NZ2/01420 Project title: Cytomolecular insight into Lupinus genomes Project leader: dr inż. Karolina Leśniewska Duration: Project no: 2013/08/T/NZ2/00796 Project title: Insight into Lupinus angustifolius genome: molecular analysis of several genes involved in nitrogen fixationin narrow-leafed lupin. Project leader: mgr Katarzyna Wyrwa Duration: Ministry of Science and Higher Education grants Project no: N N Project title: Nuclear genome of Lupinus angustifolius L: genes structure, their physical and genetic localization and comparative analyzes with model legume plants gemomes. Project leader: prof. dr hab. Barbara Naganowska Duration:

5 3. Ministry of Agriculture and Rural Development Project no: 79 Project title: Flowering time trait in narrow-leafed lupin (Lupinus angustifolius L.) genetic and molecular background Project leader: prof. dr hab. Bogdan Wolko Duration: Project no: N /3234 Project title: Analysis of Lupinus angistifolius genome region carrying anthracnose resistance gene. Project leader: prof. dr hab. Bogdan Wolko Duration: International fellowships / trainings Australia, University of Western Australia, School of Plant Biology, Perth France, UMR CNRS 6553 Ecobio, Evolution des Génomes et Spéciation, Université de Rennes, National co-operation 1. Institute of Bioorganic Chemistry, Poznań, joint Ministry of Science and Higher Education project 2. Adam Mickiewicz University, Poznan, joint Ministry of Science and Higher Education project International co-operation 1. University of Western Australia Perth, Australia dr Matthew Nelson 2. Royal Botanical Gardens, Kew, United Kingdom dr Matthew Nelson Papers 1. Ksiażkiewicz M., Zieleziński A., Wyrwa K., Szczepaniak A., Rychel S., Karłowski W., Wolko B., Naganowska B. (2015) Remnants of the legume ancestral genome preserved in gene-rich regions: insights from Lupinus angustifolius physical, genetic and comparative mapping. Plant Molecular Biology Reporter 2015: 33(1). 2. Książkiewicz M., Wyrwa K., Szczepaniak A., Rychel S., Majcherkiewicz K., Przysiecka Ł., Karłowski W., Wolko B., Naganowska B. (2013) Comparative genomics of Lupinus angustifolius gene-rich regions: BAC library exploration, genetic mapping and cytogenetics. BMC Genomics 2013, 14:79.

6 3. Książkiewicz M., Wyrwa K., Szczepaniak A., Naganowska B., Wolko B. (2013) Gene-rich regions in narrow leafed lupin (Lupinus angustifolius L.). Annual Report 2013, Polish Academy of Science, Naganowska B., Wyrwa K., Szczepaniak A., Przysiecka Ł., Książkiewicz M., Wolko B. (2011) Cytogenetic mapping a step towards an integrated genome map of Lupinus angustifolius. W: Lupin crops an opportunity for today, a promise for the future (Naganowska B, Wolko B, Kachlicki P, red.). Proc. 13th Int. Lupin Conf., 6-10 June 2011, Poznań, Poland. ISBN Institute of Plant Genetics Polish Academy of Sciences, Polish Lupin Association, ss Wolko B., Książkiewicz M., Majcherkiewicz K., Wyrwa K. (2010) Markery STS sprzężone z genami odporności na grzyby patogeniczne u łubinu wąskolistnego (Lupinus angustifolius L.). W: Materiały IV Sympozjum Naukowego Jakość środowiska, surowców i żywności (Dubert F i in. red.) Kraków, ISBN , ss Awards 1. Ministry of Science and Higher Education scholarship TransFormation.Doc for two weeks training, Sweden, Lund Director of Institute of Plant Genetics award (2014). 3. Scholarschip no PO KL 8.2.2/ /14 entitled: Insight into Lupinus angustifolius genome: molecular analysis of several genes involved in nitrogen fixationin narrowleafed lupin..