Serwis Laboratoryjny dla Potrzeb Programów Naukowo-Badawczych INFORMATOR

Transkrypt

1 Katedra Biochemii Klinicznej Uniwersytetu Jagiellońskiego Collegium Medicum Kierownik Katedry Prof. dr hab. med. Aldona Dembińska-Kieć Kraków, ul. Kopernika 15a tel faks Serwis Laboratoryjny dla Potrzeb Programów Naukowo-Badawczych INFORMATOR Pod patronatem władz Collegium Medicum, UJ Kraków 2009

2 Szanowni Państwo, Katedra Biochemii Klinicznej UJCM oferuje Państwu serwis laboratoryjny obsługę realizowanych w Państwa Jednostkach programów naukowo-badawczych i innych form działalności w zakresie badań laboratoryjnych. Oba zakłady Katedry Zakład Biochemii Klinicznej i Zakład Diagnostyki dysponują nowoczesną aparaturą i doświadczeniem zdobytym w trakcie realizacji projektów sponsorowanych z funduszy UE, umożliwiającymi wykonywanie tzw. niestandardowych badań immunochemicznych oraz badań z zakresu biologii molekularnej i genetyki. Zaawansowane technologicznie analizatory i przestrzeganie zasad dobrej praktyki laboratoryjnej zapewniają wysoką jakość analityczną wykonywanych badań najnowocześniejszymi technikami akceptowalnymi w międzynarodowych projektach badawczych. Poza samym wykonywaniem badań oferujemy Państwu konsultacje w zakresie ich doboru, zaopatrzenia w odczynniki, sposobu pobierania materiału i innych wymogów przedanalitycznych oraz interpretacji i opracowania wyników, jak i służymy doradą w opracowywaniu i realizacji projektów badawczych. Zapraszamy do współpracy! Dr hab. med. Bogdan Solnica Kierownik Zakładu Diagnostyki Katedry Biochemii Klinicznej UJCM Prof. dr hab. med. Aldona Dembińska-Kieć Kierownik Katedry Biochemii Klinicznej i Zakładu Biochemii Klinicznej UJCM 2

3 Zakład Biochemii Klinicznej Kraków ul. Kopernika 15a tel.: (12) , (12) , (12) faks: (12) Zakład Biochemii Klinicznej Katedry Biochemii Klinicznej UJCM posiada nr ewidencyjny Krajowej Izby Diagnostów Laboratoryjnych nr KIDL 2213 Badania są wykonywane w Pracowniach, posiadających indywidualny nr ewidencyjny Krajowej Izby Diagnostów Laboratoryjnych: 1. Pracownia Biologii Molekularnej i Diagnostyki Genetycznej Zakładu Biochemii Klinicznej nr KIDL: Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Patogenów, Zakładu Biochemii Klinicznej nr KIDL: Pracownia Diagnostyki i Biochemii Zaburzeń Lipidów Zakładu Biochemii Klinicznej nr KIDL Pracownia Immunochemii Zakładu Biochemii Klinicznej nr KIDL: 2661 Pracownia Biologii Molekularnej i Diagnostyki Genetycznej Zakładu Biochemii Klinicznej nr KIDL: 2214 Zakres oferty diagnostycznej: 1. Badanie zmienności genów (mutacje i polimorfizmy genetyczne) związanych z rozwojem otyłości, zespołu metabolicznego, nadciśnienia tętniczego, cukrzycy typu 2, cukrzycy typu młodzieńczego (MODY), kardiomiopatii, miażdżycy i innych genetycznie uwarunkowanych chorób (w uzgodnieniu ze stroną zainteresowaną). a. Wykrywanie mutacji punktowych za pomocą metody RFLP b. Wykrywanie mutacji punktowych za pomocą techniki Real-Time PCR c. Wykrywanie nowych lub znanych mutacji/polimorfizmów metodą sewencjonowania 2. Badanie ojcostwa 3. Analiza genetycznie uwarunkowanej wrażliwości na leki 3

4 Wszelkich niezbędnych informacji udzielają: Dr Iwona Wybrańska tel ; Dr Beata Kieć-Wilk; mgr Barbara Zapała Końcowa forma uzgodnień do ustalenia z Kierownikiem Katedry Cennik przykładowych badań oferowanych w zakresie proponowanych usług: Badanie/gen/ choroba metoda cena uwagi leptyny otyłość jednogenowa Ob 105Arg>Trp / mutacje genu adiponektyny dopaminergicznego DRD2/region 3 / melanokortyny MCR 3 81Ile>Val/ melanokortyny MCR Asp> Asn/ melanokortyny MCR Val> Ile/ melanokortyny MCR Ile>Leu/ adrenergicznego β2ar 27Gln>Glu/ adrenergicznego β3ar 64 Trp>Arg/ mutacja promotora genu białka rozprzegającego UCP- 1 jądrowego PPAR-γ 12 Pro>Ala/ jądrowego PPAR-γ 115 Pro>Gln/ otyłość, regulacja łaknienia otyłość, regulacja łaknienia otyłość, regulacja łaknienia otyłość, regulacja łaknienia otyłość, regulacja łaknienia sekwencjonowanie 500 sekwencjonowanie 500 sekwencjonowanie 500 sekwencjonowanie 500 otyłość otyłość otyłość otyłość, cukrzyca typu 2 jednogenowa otyłość 4

5 mutacja intronowa genu lipazy lipoproteinowej LPL (H)/ mutacja intronowa genu lipazy lipoproteinowej LPL (P) mutacja w sekwencji niekodującej 3 genu apolipoproteiny CIII apo CIII/ mutacja intronowa genu transportera kwasów tłuszczowych FABP-1/ mutacja w promotorze genu TNF-a/ mutacja typu silent genu Heat Shock protein HSP (Gln)/ Heat Shock protein HSP- 70-hom 493 Met>Thr/ mutacja intronowi genu białka transportującego estry cholesterolu CETP /otyłość, stężenie HDL SR BI typu silent SR-BI (419 Arg)/ mutacja CD36/FAT (receptor trombospondyny), typu 2 CD36L DGAT- 1, mutacja w genomie mitochondrialnym A3243G mutacje w genomie mitochondrialnym, mutacje w genie apo E e2(112cys158cys), mutacja w promotorze genu FOXC2 otyłość otyłość otyłość otyłość sekwencjonowanie 500 otyłość otyłość otyłość otyłośc otyłośc, miażdżyca, obniżenie triglicerydemii w teście lipemii, niższe stężenia LDL otyłość, kardiomiopatia, Ch. Alzheimera, nadciśnienie cukrzyca predyspozycja do otyłości, obniżenie HDL, zespół metaboliczny predyspozycja do insulinooporności zespół MELAS podatność na rozwój cukrzycy typu 2, hypertriglicerydemia, zespół Alzheimera hipertriglicerydemia insulinooporność, otyłość sekwencjonowanie sekwencjonowanie

6 mutacje regionu Xp28 genu tafazyny (TAF) mutacje w genie fosfolambanu mutacje genu pompy wapniowej siateczki SERCA (-491C/G ATP2A2) mutacje promotora genu dla paraoksonazy 1 PON1 (-108T/C PON1) mutacje genu enzymu konwertującego ACE D/I mutacje genu angiotensynogenu M235T mutacje genu angiotensynogenu T174M mutacje genu genu angiotensynogenu AT1R (A1166C) mutacje genu genu angiotensynogenu AT1R (A1675G) kardiomiopatie, Zespół Bartha sekwencjonowanie kardiomiopatie sekwencjonowanie kardiomiopatie sekwencjonowanie 240 miażdżyca sekwencjonowanie 240 nadciśnienie nadciśnienie pierwotne nadciśnienie pierwotne nadciśnienie pierwotne nadciśnienie pierwotne badanie ojcowstwa sekwencjonowanie analiza genetycznej wrażliwości na leki analizę wariancji genetycznej w dwóch enzymach cytochromu CYP450: CYP2D6 i CYP2C19, które odgrywają główną rolę w metabolizmie leków określenie fenotypu ludzi o szybkim i wolnym metabolizmie leków sekwencjonowanie/ technika Real-Time PCR istnieje możliwość ustawienia metody w zależności od zapotrzebowania 6

7 Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Patogenów, Zakładu Biochemii Klinicznej nr KIDL: 2660 Zakres oferty diagnostycznej: 1. Badanie ekspresji genów do badań naukowych i diagnostycznych: a. Badanie ekspresji genów techniką Real-Time PCR (7900HT Fast system) b. Badanie ekspresji genów w technice mikromacierzowej w oparciu o 7900 HF Fast System 2. Wykrywanie zakażeń wirusowych, bakteryjnych lub grzybowych w oparciu o techniki RT-PCR 3. Oznaczenia ilościowe i identyfikacja mikroorganizmów w lekach i żywności w oparciu o techniki RT-PCR Wszelkich niezbędnych informacji udzielają: dr Iwona Wybrańska; tel ; mgr Urszula Raźny mgr Barbara Zapała mbwybran@cyf-kr.edu.pl urazny@cm-uj.krakow.pl bnowak82@gmail.com Końcowa forma uzgodnień do ustalenia z Kierownikiem Katedry Badanie/gen/ metoda cena uwagi badanie ekspresji genów do celów badań naukowych i diagnostycznych technika Real Time PCR w przypadku pojedynczych genów, lub wykorzystanie techniki macierzowej (mała macierz w przypadku badania do 384 genów cena do ustalenia w zależności od metody i wykrywanie zakażeń wirusowych, bakteryjnych lub grzybowych oznaczenia haplotypu wirusa brodawczaka (typowanie HPV) profilaktyka raka szyjki macicy oznaczanie ilościowe zakażenia wirusem brodawczaka HPV 16 i 18 oznaczenia ilościowe i identyfikacja mikroorganizmów w lekach i żywności równocześnie) Real Time PCR w przypadku pojedynczych genów, lub wykorzystanie techniki macierzowej (mała macierz w przypadku badania do 384 genów równocześnie) PCR, sekwencjonowanie Real Time PCR Real Time PCR w przypadku pojedynczych genów, lub wykorzystanie techniki macierzowej (mała macierz w przypadku badania do 384 genów równocześnie) identyfikacja w oparciu o sekwencjonowanie cena do ustalenia w zależności od metody i cena do ustalenia w zależności od metody i cena do ustalenia w zależności od doboru metody i 7

8 izolacja DNA z powierzonego materiału izolacja RNA cena zależna od ilości i rodzaju materiału cena zależna od ilości i rodzaju materiału 8

9 Pracownia Diagnostyki i Biochemii Zaburzeń Lipidów Zakładu Biochemii Klinicznej nr KIDL 2659 Zakres oferty diagnostycznej: 1. Izolacja lipoprotein (metoda ultrawirowania) 2. Oznaczenia parametrów stresu oksydacyjnego 3. Badanie funkcji metabolicznej mitochondriów Wszelkich niezbędnych informacji udzielają: Dr Joanna Góralska tel.: , mgr Anna Gruca tel.: ; mgr Agnieszka Śliwa jgóralska@cm-uj.krakow.pl mbgruca@cyf-kr.edu.pl agasliw@interia.pl Końcowa forma uzgodnień do ustalenia z Kierownikiem Katedry Badanie metoda cena uwagi izolacja lipoprotein osocza (frakcje VLDL, LDL, HDL) metoda sekwencyjnego ultrawirowania ok.35 cena zależna od całkowity potencjał redukcyjny osocza FRAP stężenie wolnych grup tiolowych -SH stężenie końcowych produktów oksydacji lipidów TBARS badanie funkcji mitochondriów komórek z hodowli in vitro i zaburzeń procesów oddychania wewnątrzkomórkowego badanie funkcji mitochondriów komórek z hodowli in vitro i zaburzeń procesów oddychania wewnątrzkomórkowego metoda spektrofotometrczna ok. 32 metoda spektrofotometrczna ok. 35 ekstrakcja i oznaczanie spektrofotometryczne ok. 35 pomiar aktywności kompleksów łańcucha oddechowego mitochondriów metodą wysokoczułej respirometrii (Oxygraph-2k) stężenie ATP w komórkach (ATP/białko) metodą luminescencyjną (lucyferaza/lucyferyna) ok. 60 ok. 35 cena zależna od cena zależna od cena zależna od cena zależna od cena zależna od 9

10 Pracownia Immunochemii Zakładu Biochemii Klinicznej nr KIDL: 2661 Zakres oferty diagnostycznej: Analiza cytokin, czynników wzrostu i hormonów metodami RIA i ELISA Wszelkich niezbędnych informacji udzielają: mgr Anna Zdzienicka, tel.: , mbzdzien@cyf-kr.edu.pl mgr Urszula Raźny urazny@uj-cm.krakow.pl Końcowa forma uzgodnień do ustalenia z Kierownikiem Katedry Wykaz badań wykonywanych techniką ELISA w Pracowni Immunochemii Zakładu Biochemii Klinicznej: LP Oznaczany parametr 1 BDNF-brain derived neutrific factor 2 EGF- epidermal growth factor 3 HGF- hepatocyte growth factor 4 IGF-1 insulin like growth factor 5 PDGF platelet derived growth factor 6 TGF alfa- transforming growth factor 7 TGF beta- transforming growth factor 8 VEGF- vascular endothelial growth factor 9 svegf RII, soluble vascular endothelial growth factor receptor II 10 bfgf- basic fibroblast growth factor 11 P-selektyna 12 vwf-vonwillebrand factor 13 human S GIP-gastric inhibitory polypeptide 15 GLP-1 glucagon like peptide 16 leptyna 17 adiponektyna 18 C-peptyd 19 insulina 20 proinsulina 21 rezystyna 22 grelina 23 gastryna 24 Melatonina 25 sulfatoxy melatonina 10

11 26 Wisfatyna 27 beta-tromboglobulina 28 NPY 29 PAI-1 30 tpa 31 GFAP- glial fibrillaryacidic protein 32 NSE- human neuron specific enolase 33 Caspase-1 Cena oznaczenia wynosi od 8 zł do 20 zł, zależnie od użytych odczynników i procedury analitycznej W Pracowni Immunochemii istnieje również możliwość wykonania oznaczeń z wykorzystaniem cytofluorymetru przepływowego CANTO II Becton Dickinson (np. badanie apoptozy, badanie funkcji mitochondriów) Cena do uzgodnienia. 11

12 Zakład Diagnostyki Kraków ul. Kopernika 15a tel. (12) , (12) faks: (12) Zakres oferty diagnostycznej: Pracownia Biochemii Zakładu Diagnostyki nr KIDL: 2951 Markery i parametry związane z obrotem kostnym, interleukiny i chemokiny, czynniki wzrostowe, selektyny, proteazy i ich inhibitory; hormony, markery krzepnięcia i fibrynolizy, cząsteczki adhezyjne i in. Istnieje też możliwość wykonania podstawowych badań biochemicznych. Wszelkich niezbędnych informacji udzielają: Dr Danuta Fedak, tel/faks , Dr hab. Bogdan Solnica, tel/faks , danuta.fedak@uj.edu.pl mbsolnic@cyf-kr.edu.pl Końcowa forma uzgodnień do ustalenia z Kierownikiem Zakładu Wykaz badań wykonywanych techniką ELISA w Pracowni Biochemii Zakładu Diagnostyki LP Oznaczany parametr 1 IL 1alfa 2 IL 1beta 3 IL 2 4 IL 3 5 IL 4 6 IL 5 7 IL 6 8 IL 6 hs (metoda ultraczuła) 9 IL 8 10 IL IL 10 hs (metoda ultraczuła) 12 IL IL IL TNFα 12

13 16 TNFα hs (metoda ultraczuła) 17 srnf RI, rozpuszczalny receptor dla TNFα 18 stnf RII, rozpuszczalny receptor dla TNFα 19 IFNγ, interferon γ 20 GM CSF, granolocytarno makrofagowy czynnik stymulujacy kolonie 21 FGF 23, czynnik wzrostowy fibroblasów IGFBP 2, białko wiążące insulinopodobny czynik wzrostowy, 2 23 IGFBP 3, białko wiążące insulinopodobny czynik wzrostowy, 3 24 Pro MMP 1 25 Total MMP 2 26 Total MMP 3 27 MMP 9 28 TIMP 1 29 PMN Elastaza leukocytarna 30 Elastaza trzustkowa w surowicy krwi i kale 31 BALP, kostna izoforma alkalicznej fosfatazy 32 OC, osteokalcyna 33 GlaOC, osteokalcyna w pełni karboksylowana 34 GluOC, osteokalcyna niedokarboksylowana 35 CTX, C terminalny telopeptyd kolagenu typu I, Serum Cross Laps 36 NTX, N terminalny telopeptyd kolagenu typu I 37 CICP, c terminalny peptyd kolagenu typu I 38 PYRYLINKS D, wolne wiązanie sieciujace, pirydynolina 39 SRANKL, rozpuszczalny receptor dla aktywatora czynnika jądrowego kappa B 40 TRAP, winianooporna kwaśna fosfataza 41 OPG, osteoprotegeryna 42 OPN, osteopontyna 43 OCN, osteonektyna 44 MGP, matrix Gla protein 45 Fetuina A 46 Chromogranina A 47 Erytropoetyna 48 Adrenalina/noradrenalina 49 F 1+2, fragmenty protrombiny 50 TAT, kompleks trombina antytrombina 51 Trombomodulina 52 Follistatyna 53 Free Activin 54 Inhibina B 55 s CD MCP 1, czynnik chemotaktyczny dla monocytów 57 ADMA, asymetryczna dimetylarginina 58 SCD40L 59 TRAIL, tumor necrosis factor related apoptosis inducing ligand 60 Bcl 2, białko hamujące apoptozę 61 Homocysteina 13

14 62 Hsp60 63 Hsp27 64 Hsp90 65 Cytochrom c 66 oxldl 67 przeciwciała przeciwko oxldl 68 Vit 25(OH)D 69 VDP, białko wiążące witaminę D 70 Neopteryna 71 Clamydia pneumoniae IgM 72 Chlamydia pneumoniae IgG Ponadto istnieje możliwość wykonania dowolnego badania techniką ELISA z wykorzystaniem powierzonych odczynników oraz pomiaru spektrofotometrycznego, fluorescencji lub luminescencji. Cena oznaczenia wynosi od 8 zł do 20 zł, zależnie od użytych odczynników i procedury analitycznej. 14