Efektywne wykorzystanie klastra Zeus w obliczeniach wykonywanych pakietem Blender. Maciej Czuchry, Klemens Noga

Transkrypt

1 Efektywne wykorzystanie klastra Zeus w obliczeniach wykonywanych pakietem Blender Maciej Czuchry, Klemens Noga WFiIS AGH, Kraków, 18 grudnia 2014

2 Plan szkolenia 2 Rejestracja Dostęp do klastra Przeprowadzanie obliczeń klaster Zeus system kolejkowy szczegóły obliczeń najlepsze praktyki Dokumentacja i pomoc dla użytkowników Zasoby PL-Gridu rejestracja kont sposoby dostępu przydzielanie mocy obliczeniowych zespoły i granty obliczeniowe

3 Rejestracja 3 Rejestracja elektroniczna przez Portal Użytkownika PL-Grid rejestracja w pełni elektroniczna ( weryfikacja użytkownika na podstawie OPI możliwość łatwego rozszerzenia konta na nowe usługi

4 Dostęp do klastra 4 Dostęp lokalny Klaster Zeus pracuje w środowisku Linux - system operacyjny Scientific Linux 6 Logowanie na węzeł dostępowy UI (User Interface) klastra: wykorzystując bezpieczny protokół SSH: kopiowanie plików ssh login@zeus.cyfronet.pl w środowisku Windows np. programem PuTTY ( tryb graficzny zdalne wyświetlanie wykorzystując X11 (dla Windows jako serwer X11 np. Xming) scp plik login@zeus.cyfronet.pl: w środowisku Windows np. program WinSCP ( Nie wolno wykonywać żadnych obciążających operacji na węźle dostępowym klastra Sprawiedliwym przydzielaniem zasobów zajmuje się system kolejkowy Torque/PBS

5 Zeus klaster heterogeniczny 5 Składowe klastra Zeus Zeus składa się z węzła dostępowego (UI) oraz grup węzłów o różnych parametrach tradycyjne węzły (1100+ węzłów, w tym 130+ węzłów z dużą ilością RAM) vsmp zespół maszyn wirtualnych (kilka węzłów) GPGPU węzły zawierające procesory graficzne GPGPU (44 węzły, 208 kart GPGPU) Własność Zeus Zeus BigMem Zeus vsmp Zeus GPGPU Szybkość CPU GHz 2.67; 2.30 GHz 2.67 GHz 2.93; 2.40 GHz RAM 16, 24 GB 96, 256 GB do 6 TB 72, 96 GB Ilość rdzeni na węźle 8, 12 12, 64 do InfiniBand tak tak tak Dodatkowe RAMDysk karty GPGPU

6 Zeus klaster heterogeniczny 6 Składowe klastra Zeus - systemy plików Składowanie danych - dostęp po NFS (dość powolny, nie używać do obliczeń) $HOME katalog domowy użytkownika quota 7 GB codzienny backup $STORAGE długotrwałe przechowywanie plików quota 100GB Dyski na pliki tymczasowe (tzw. scratch) $TMPDIR wskazuje na katalog lokalny na węźle obliczeniowym dostępny jedynie z węzła do którego jest podłączony dostępny tylko w trakcie wykonywania zadania $SCRATCH rozproszony system plików Lustre dostępny z każdego z węzłów klastra Dla użytkowników PL-Grid na podstawie grantów obliczeniowych (SLA) dostępna dodatkowa przestrzeń na składowanie plików ($PLG_GROUPS_STORAGE)

7 Oprogramowanie 7 Modules sposób zarządzania oprogramowaniem Aplikacje często wymagają specyficznego środowiska uruchomieniowego (m.in. zmiennych środowiskowych, dostępu do bibliotek) Narzędzie Modules umożliwia proste ustawianie środowiska uruchomieniowego dla programów niezależnie od specyfiki maszyny dostępowej. Zalety: łatwe ustawianie środowiska uruchomieniowego programów przenoszenie skryptów obliczeniowych między maszynami możliwość łatwego uruchamiania różnych wersji programów (często o skonfliktowanych środowiskach uruchomieniowych) Wady: transparentne dla użytkownika uruchamianie wersji zoptymalizowanych na konkretny typ węzła obliczeniowego jedno dodatkowe polecenie do zapamiętania

8 Oprogramowanie 8 Modules sposób zarządzania oprogramowaniem Każda aplikacja zainstalowana na klastrze Zeus ma swój moduł Nazwy modułów: <gałąź>/<nazwa-oprogramowania>/<wersja> Rodzaje gałęzi apps - dla większości programów naukowych compilers - dla kompilatorów gpu - dla programów naukowych wykorzystujących GPGPU libs - dla bibliotek tools - dla programów narzędziowych (np. Python) plgrid - dla programów dostępnych w Infrastrukturze PL-Grid np. compilers/intel/14.0, apps/matlab/r2013b lub apps/blender/2.72b

9 Oprogramowanie 9 Modules sposób zarządzania oprogramowaniem Załadowanie środowiska umożliwiającego uruchomienie aplikacji module add <nazwa-modułu> (np. module add tools/python) module load <nazwa-modułu> (np. module load apps/matlab) Usunięcie modułu module rm <nazwa-modułu> (np. module rm tools/python) module unload <nazwa-modułu> (np. module unload apps/matlab) Listowanie wszystkich dostępnych modułów module avail module avail tools (tylko z poddrzewa tools) module avail apps/blender (dostępne wersje oprogramowania Bledner)

10 Oprogramowanie 10 Modules sposób zarządzania oprogramowaniem Listowanie załadowanych modułów: module list Usuwanie wszystkich załadowanych modułów module purge Podmiana modułów module switch <nazwa-modułu> <nazwa-modułu2> module swap <nazwa-modułu> <nazwa-modułu2> (np. module swap compilers/intel/10.1 compilers/intel/8.1)

11 Oprogramowanie 11 Modules sposób zarządzania oprogramowaniem Informacja o module module whatis <nazwa-modułu> Listowanie zawartości modułu (m.in. jakie zmiany w zmiennych środowiskowych) module display <nazwa-modułu> module show <nazwa-modułu> Moduł ustawiający zmienną do rozproszonego zasobu scratch ($SCRATCH): module add tools/scratch gdy ustawiany wewnątrz zadania obliczeniowego ustawia zmienną SCRATCHDIR wskazującą na katalog tymczasowy zadania utworzony na zasobie Lustre

12 Oprogramowanie 12 Modules uwagi Załadowanie modułu powoduje załadowanie modułów, od których ten moduł zależy Załadowanie domyślnej (zwykle najnowszej) wersji oprogramowania nie wymaga podania wersji modułu Więcej informacji na: Ćwiczenie wykonaj poniższe komendy module avail compilers/intel module show compilers/intel module add compilers/intel which icc module swap compilers/intel compilers/intel/8.1 which icc

13 System kolejkowy PBS 13 Wprowadzenie System kolejkowy zarządza zleconymi zadaniami obliczeniowymi zarządza zasobami klastra przydziela zasoby zadaniom obliczeniowym dba o sprawiedliwą dystrybucję zasobów Zadania obliczeniowe są umieszczane w kolejkach (ang. queue) i uruchamiane w zależności od ich priorytetu. Priorytet zależy m.in. od: wielkości zasobów przyznanych w grancie obliczeniowym ilości zażądanych przez zadanie zasobów i ich dostępności szczególnie istotny jest maksymalny czas trwania obliczeń zasobów klastra zużywanych aktualnie przez danego użytkownika

14 System kolejkowy PBS 14 Komendy Użytkownik komunikuje się z systemem kolejkowym za pomocą komend PBS qsub umieszcza zadanie w kolejce qstat wyświetla status zadań qdel usuwa zadanie z kolejki qalter zmiana parametrów zakolejkowanego zadania Każde zadanie w systemie kolejkowym ma swój własny, unikalny identyfikator zadania tzw. jobid

15 System kolejkowy PBS 15 Zlecanie zadania Do umieszczenia zadania w kolejce systemu kolejkowego służy komenda qsub Komendy opisujące wykonywane zadanie mogą być zebrane w tzw. skrypt uruchomieniowy i przekazywane systemowi kolejowemu poleceniem qsub skrypt Przykładowy skrypt #!/bin/env bash #polecenia wykonywane po uruchomieniu zadania echo "Obliczenia uruchomione na WN:"; hostname module add apps/matlab matlab -nodisplay <matlab.m >matlab.out

16 System kolejkowy PBS 16 Monitorowanie zadań qstat,zeus-jobs Do sprawdzania statusów zadań w systemie kolejkowym służą komendy qstat lub zeus-jobs Statusy zadań: zakolejkowane Q działające R Dodatkowe przydatne filtry qstat u $USER informacja o zadaniach użytkownika $USER qstat n <jobid> informacja o węzłach przydzielonych zadaniu qstat -q ogólna sytuacja na klastrze

17 Zeus klaster heterogeniczny 17 Kolejki dostępne na klastrze Zeus Nazwa max czas Uwagi l_test 0:15:00 kolejka do testów l_prio 1:00:00 l_short 3:00:00 domyślna l_long 336:00:00 l_exclusive 336:00:00 zadania zajmujące całe węzły l_interactive 72:00:00 zadania interaktywne l_infinite 2160:00:00 * l_bigmem 336:00:00 węzły z dużą ilością pamięci* gpgpu 336:00:00 kolejka GPGPU* vsmp - kolejka vsmp* * dostęp na żądanie qstat Q f <nazwa-kolejki> szczegółowe parametry kolejki qstat <nazwa kolejki> wyświetlenie zadań w konkretnej kolejce

18 System kolejkowy PBS 18 Zlecanie zadania przykładowy skrypt blendera #!/bin/env bash #PBS -q tutorial #polecenia wykonywane po uruchomieniu zadania echo "Obliczenia uruchomione na WN:"; hostname module load apps/blender/2.72b time blender -b --python blender.py Opcje PBS pozwalają dostarczyć systemowi kolejowemu informacje o zasobach, które zadanie zmierza zużyć. Sposób wywołania: w linii poleceń polecenia qsub [opcje PBS] w początkowych linijkach skryptu uruchomieniowego poprzedzone dyrektywą #PBS Opcje wyspecyfikowane w linii poleceń nadpisują opcje podane w skrypcie

19 System kolejkowy PBS 19 Zlecanie zadania zmienna PBS_O_WORKDIR #!/bin/env bash #PBS q tutorial #polecenia wykonywane po uruchomieniu zadania echo "Obliczenia uruchomione na WN:"; hostname echo "Biezacy katalog:"; pwd cd $PBS_O_WORKDIR echo "Biezacy katalog:"; pwd module add apps/matlab matlab -nodisplay <matlab.m >matlab.out Skrypt zadania zawsze rozpoczynany jest w katalogu HOME na węźle obliczeniowym (WN). Przejście do katalogu, z którego wysłano skrypt przez zmienną PBS_O_WORKDIR

20 System kolejkowy PBS 20 Zlecanie zadania zmienne środowiskowe PBS dodaje zadaniom zmienne środowiskowe ułatwiające prace Zmienna PBS_JOBID PBS_O_WORKDIR PBS_NP PBS_NODEFILE PBS_GPUFILE PBS_NODENUM TMPDIR Opis identyfikator zadania (jobid) ścieżka, z której wysłano zadanie do PBS ilość procesorów przydzielonych zadaniu plik z nazwami węzłów przydzielonych zadaniu plik z nazwami GPGPU przydzielonych do zadania numer węzła obliczeniowego zadania (0 n-1) ścieżka do katalogu na pliki tymczasowe Dodatkowo po załadowaniu modułu tools/scratch dostępne są zmienne SCRATCHDIR ścieżka do katalogu na pliki tymczasowe na zasobie Lustre

21 System kolejkowy PBS 21 Zlecanie zadania opcje polecenia qsub -q kolejka definiuje kolejkę, do której skierowane zostanie zadanie -N nazwa ustawia identyfikator zadania -I zgłasza zadanie interaktywnie -X przenoszenie obrazu mechanizmem X11 -l zasób ustawia ilość zasobów potrzebnych zadaniu -t n-m,k,l uruchamia zadania tablicowe o numerach od n do m oraz k i l -M <adres użytkownika> powiadomienie mailowe -m bea wysyła powiadomienie na początku (b), końcu (e) lub przy błędzie (a) Pominięcie -q kolejka umieszcza zadanie w domyślnej kolejce Użytkownicy PL-Grid -A id_grantu ustawia grant obliczeniowy, z którego będzie korzystać zadanie zadania bez wyspecyfikowanego grantu obliczeniowego nie zostaną przyjęte przez system kolejkowy (możliwość ustawienia grantu domyślnego)

22 System kolejkowy PBS 22 Zlecanie zadania opcje polecenia qsub #!/bin/env bash #PBS q l_prio #PBS -N blender.krotki #PBS -M <e.mail@uzytkownika> #PBS -m ae #polecenia wykonywane po uruchomieniu zadania echo "Obliczenia uruchomione na WN:"; hostname echo "Biezacy katalog:"; pwd cd $PBS_O_WORKDIR echo "Biezacy katalog:"; pwd time blender -b --python blender.py Skrypt zadania zawsze rozpoczynany jest w katalogu HOME na węźle obliczeniowym (WN). Przejście do katalogu, z którego wysłano skrypt przez zmienną PBS_O_WORKDIR

23 System kolejkowy PBS 23 Zlecanie zadania specyfikacja zasobów Dostępne rodzaje zasobów (sprecyfikowane flagą -l) walltime maksymalny czas wykonywania zadania nodes ilość i rodzaj węzłów obliczeniowych mem maksymalna ilość pamięci wykorzystywanej przez zadanie pmem maksymalna ilość pamięci wykorzystywanej przez pojedynczy rdzeń obliczeniowy Wartości liczbowe parametrów podajemy jako parametr=wartość, poszczególne zasoby oddzielając przecinkami np. qsub -l walltime=10:00:00,nodes=1:ppn=12,mem=12gb Format parametrów czas hhh:mm:ss pamięć b, kb (=1024b), mb (=1,048,576b), gb (=1,073,741,824b) węzły nodes=ilość-węzłów:ppn=liczba-rdzeni-na-węzeł:właściwości (np. nodes=2:ppn=12 dwa węzły po dwanaście rdzeni)

24 System kolejkowy PBS 24 Zlecanie zadania zadanie na wiele rdzeni #!/bin/env bash #PBS -q l_prio #PBS -N blender.parallel #PBS -M #PBS -m ae #PBS -l walltime=5:00 #PBS -l nodes=1:ppn=4 module load apps/blender/2.72b cd $PBS_O_WORKDIR time blender -b --python blender.py -t $PBS_NP Obliczenia zostaną wykonane na 4 rdzeniach. Zmienna $PBS_NP pozwala łatwo przekazać informacje o ilości zarezerwowanych rdzeni

25 System kolejkowy PBS 25 Cechy węzłów Jeżeli klaster składa się z wielu rodzajów węzłów obliczeniowych są one dodatkowo opisane ich cechami Dostępne rodzaje zasobów Cecha intel, amd mhz2267,mhz2300,mhz2400,mhz2500,mhz2667,mhz2933 L5640,opteron6276,E5645,L5420,X5650,X5670 infiniband Opis producent CPU szybkość procesora typ procesora rdzeń połączony InfiniBand Węzły specyfikujemy podając wszystkie pożądane cechy (np. nodes=2:ppn=12:mhz2267:mem16gb:infiniband) specyfikacja konkretnych cech zmniejsza ilość potencjalnie dostępnych zasobów Informacje o cechach danego węzła można uzyskać poleceniem pbsnodes

26 System kolejkowy PBS 26 Zlecanie zadania, wykorzystanie cech węzłów przykładowy skrypt #!/bin/env bash #PBS -q l_prio #PBS -N blender.intel #PBS -M #PBS -m ae #PBS -l walltime=5:00 #PBS -l nodes=1:ppn=4:intel module load apps/blender/2.72b cd $PBS_O_WORKDIR time blender -b --python blender.py -t $PBS_NP Ćwiczenie: Sprawdź wydajność różnych klas węzłów klastra

27 Zeus GPGPU 27 General-Purpose Graphics Processing Unit Węzły zawierające procesory graficzne nvidia przeznaczone do obliczeń Właśność n*-gpu2.zeus n*-gpu8.zeus Szybkość CPU 2.93 GHz 2.40 GHz ilość rdzeni CPU Zastosowanie zadania wykorzystujące do obliczeń procesory graficzne Dostęp do węzłów dedykowana kolejka gpgpu RAM 72 GB 96 GB GPGPU 2*Tesla M2050 8*Tesla M2090 ilość węzłów należy zgłaszać zasób gpus= (np. nodes=1:ppn=2:gpus=2)

28 System kolejkowy PBS 28 Zlecanie zadania, wykorzystanie kart GPGPU przykładowy skrypt #!/bin/env bash #PBS -q gpgpu #PBS -N blender.gpgpu #PBS -M #PBS -m ae #PBS -l walltime=5:00 #PBS -l nodes=1:ppn=1:gpus=8 cd $PBS_O_WORKDIR module load apps/blender/2.72b time blender -b --python bmw-gpgpu.py -t $PBS_NP

29 System kolejkowy PBS 29 Zlecanie zadania, wykorzystanie kart GPGPU porównanie wydajności #!/bin/env bash #PBS -q l_prio #PBS -N blender.cpu #PBS -M #PBS -m ae #PBS -l walltime=10:00 #PBS -l nodes=1:ppn=8 cd $PBS_O_WORKDIR module load apps/blender/2.72b time blender -b --python bmw-cpu.py -t $PBS_NP

30 System kolejkowy PBS 30 Zlecanie zadania zadania interaktywne Pracę interaktywną umożliwiają zadania interaktywne qsub I qsub I X gdy potrzebny graficzny tryb wyświetlania Do pracy interaktywnej często przeznaczona jest specjalna kolejka (dla Zeusa jest to l_interactive) W przypadku użycia trybu graficznego należy pamiętać o zalogowaniu się na klaster z użyciem przekierowania wyświetlania X11 (np. ssh -Y -C login@serwer; w PuTTy "Enable X11 Forwarding") włączeniu serwera X11 na maszynie, z której następuje logowanie Nie wolno wykonywać żadnych obciążających operacji na węźle dostępowym (UI) klastra

31 System kolejkowy PBS 31 Zlecanie zadania zadania tablicowe Zadania macierzowe dają możliwość uruchamiania wielu zadań jednym poleceniem qsub t n-m,k,l skrypt.pbs (np. qsub t 0-9 lub qsub t 2,4,7) Zadania te mają tą samą zmienną PBS_O_WORKDIR, dodatkowa zmienna $PBS_ARRAYID pozwala je różnicować (np. tworzyć kolejne katalogi dla obliczeń) #!/bin/env bash #PBS -t 0-4,9 #PBS -l walltime=5:00 OUTPUTDIR=$PBS_O_WORKDIR/${PBS_JOBID%%\[*} mkdir -p $OUTPUTDIR cd $TMPDIR hostname > zadanie.$pbs_arrayid mv zadanie.$pbs_arrayid $OUTPUTDIR qstat t pokazuje każde z komponentów zadań tablicowych osobno

32 System kolejkowy PBS 32 Usuwanie zadań qdel Do usuwania zadań z systemu kolejkowego służy komenda qdel qdel <JobID> Zadania, które są zawieszone, a nie można ich usunąć poleceniem qdel należy zgłaszać poprzez dla użytkowników KDM zeus@cyfronet.pl dla użytkowników PL-Grid - Helpdesk PL-Grid PL lub helpdesk@plgrid.pl

33 System kolejkowy PBS 33 Zmiana parametrów zadań qalter Do zmian parametrów zadań w systemie kolejkowym służy komenda qalter qalter <jobid> [zmieniane_parametry] Przykładowe zastosowania qalter <jobid> -l nodes=x:ppn=y qalter <jobid> -l walltime=hhh:mm:ss qalter <jobid> -N nowa_nazwa_zadania qalter nie może zmieniać kolejki zadania oraz modyfikować istotnych parametrów uruchomionego zadania

34 System kolejkowy PBS 34 Monitorowanie sprawności zadań - zeus-jobs Narzędzie monitorujące sprawność wykonywania zadań wykorzystanie zadeklarowanych procesorów wykorzystanie pamięci Składnia zeus-jobs sortowanie po sprawności zadań zeus-jobs -e- lub zeus-jobs -e+ zadania o niskiej wydajności zeus-jobs w szczegółowe informacje o zadaniach zeus-jobs -f (<jobid>) wyświetlenie pomocy zeus-jobs h

35 System kolejkowy PBS 35 Monitorowanie sprawności zadań - zeus-jobs-history Narzędzie monitorujące sprawność wykonywania zadań historycznych wykorzystanie zadeklarowanych procesorów wykorzystanie pamięci Składnia zeus-jobs-history informacja o zadaniach z n poprzednich dni zeus-jobs-history d <n> szczegółowe informacje o zadaniu zeus-jobs-history f jobid wyświetlenie pomocy zeus-jobs-history h

36 Przeprowadzanie obliczeń 36 Zlecenie zadania - uwagi Skrypt zadania zawsze rozpoczynany jest w katalogu HOME na węźle obliczeniowym. Przejście do katalogu, z którego wysłano skrypt przez zmienną PBS_O_WORKDIR Dla każdego zadania tworzone są automatycznie pliki zawierające standardowe wyjście nazwa.o<jobid> standardowe wyjście błędów nazwa.e<jobid> Powyższe pliki nie powinny być bardzo duże (nie więcej niż kilka MB). Gdy polecenia w skrypcie przekierowują dużą ilość danych na standardowe wyjścia należy wyspecyfikować jawnie przekierowanie do pliku standardowe wyjście komenda > plik.out standardowe wyjście błędów komenda 2> plik.err oba strumienie komenda &> plik.log

37 Przeprowadzanie obliczeń 37 Zlecanie zadania dobre praktyki Przy specyfikacji każdego zadania należy zawsze specyfikować maksymalny czas wykonania walltime unikać stosowania kolejki l_infinite specyfikować ilość pamięci wykorzystywanej mem (lub pmem) tworzyć pliki zapisujące kroki obliczeń umożliwiające restart (tzw. checkpointy) w przypadku zadań zrównoleglonych zajmować całe węzły obliczeniowe, zalecana kolejka l_exclusive gdy zadanie przekierowuje dużą ilość danych na standardowe wyjścia należy wyspecyfikować jawnie przekierowania do pliku środowisko obliczeniowe aplikacji i bibliotek ładować komendą module nie ładować modułów w plikach startowych powłok (np..bashrc)

38 Przeprowadzanie obliczeń 38 Zlecanie zadania dobre praktyki Przy specyfikacji każdego zadania należy zawsze nie wykorzystywać do obliczeń $HOME i $STORAGE używać katalogów scratch lokalne dyski scratch (zmienna $TMPDIR) dostęp do danych tylko z jednego węzła duża liczba operacji odczytu/zapisu małych porcji danych (<<1MB) nieduże pliki (do ~10 GB) rozproszony zasób scratch (Lustre; $SCRATCH oraz $SCRATCHDIR) dostęp do danych z wielu węzłów duże pliki tymczasowe (10+GB) duże jednorazowe odczyty/zapisy (1+MB) potrzebny podgląd w trakcie wykonywania czyścić katalogi z plikami tymczasowymi po obliczeniach

39 Przeprowadzanie obliczeń 39 Zlecanie zadania dobre praktyki Blender Przygotowywać projekty na własnych maszynach Korzystać z programowania skryptów poprzez Python Uruchamiać na jednym węźle (nodes=1:ppn=x lub nodes=1:ppn=x:gpgpus=y) zrównoleglenie po wątkach kontrolować liczbę wątków przez polecenie -t $PBS_NP Rendering na GPGPUs tylko silnikiem Cycles

40 Zeus vsmp 40 Versatile SMP Zespół maszyn wirtualnych utworzonych w oparciu o oprogramowanie firmy ScaleMP tradycyjne węzły połączone poprzez InfiniBand w wirtualne węzły możliwość dynamicznego definiowania wielkości wirtualnych węzłów wydajność porównywalna z tradycyjnymi SMP możliwość utworzenia RAMDysku Zastosowanie zadania potrzebujące dużej ilości współdzielonej pamięci operacyjnej (200+ GB) zadania potrzebujące bardzo szybkich dysków (poprzez RAMDysk) oprogramowanie SMP dobrze skalujące się z duża ilością rdzeni obliczeniowych (64+)

41 Zeus vsmp 41 Versatile SMP Dostępne maszyny wirtualne Własność n*-vsmp ilość rdzeni 96 RAM 630 GB Zastosowanie zadania wykorzystujące do obliczeń bardzo dużą liczbę RAM (200+ GB) zadania o współdzielonej pamięci, które dobrze zrównoleglają się powyżej 64 rdzeni Dostęp do węzłów dedykowana kolejka vsmp ilość maszyn 2 dostęp na żądanie po uzasadnieniu

42 Dokumentacja 42 Portal Komputerów Dużej Mocy ACK Cyfronet AGH Dokumentacja projektu PL-Grid System pomocy Helpdesk PL-Grid lub Dokumentacja projektu Platon

43 Kontakt 43 Helpdesk PL-Grid lub Admini klastra Zeus - zeus@cyfronet.pl Klemens Noga klemens.noga@cyfronet.pl Maciej Czuchry m.czuchry@cyfronet.pl

44 Czym jest PL-Grid 44 Konsorcjum polskich Centrów Komputerowych Centrum Informatyczne Trójmiejskiej Akademickiej Sieci Komputerowej Poznańskie Centrum Superkomputerowo Sieciowe w Poznaniu Interdyscyplinarne Centrum Modelowania Matematycznego i Komputerowego w Warszawie Wrocławskie Centrum Sieciowo - Superkomputerowe we Wrocławiu Akademickie Centrum Komputerowe CYFRONET AGH w Krakowie (koordynator)

45 Zasoby PL-Gridu 45 Sześć klastrów obliczeniowych rdzeni obliczeniowych 576 TFLOPS 5,58 PB zasobów dyskowych szybkie dyski na pliki tymczasowe 113,26 TB pamięci RAM Procesory: Intel Xeon 4 oraz 6 rdzeni AMD Opteron 6, 12, 16 rdzeni karty GPGPU NVidia Tesla M2050, M2090, K10, K20, K40 akceleratory obliczeń Intel Xeon Phi Różne konfiguracje węzłów obliczeniowych od 8 do 64 rdzeni na węzeł do 256 GB RAM na węzeł vsmp (Intel Xeon) do 6TB RAM oraz 768 rdzeni Pełna konfiguracja na stronie:

46 Rejestracja 46 Portal Użytkownika PL-Grid Rejestracja do infrastruktury oraz usług Rejestracja wymaga imienia i nazwiska adres numeru w Bazie OPI osób Polskiej Nauki organizacji naukowej Jeden login i hasło do wszystkich usług O wszystkie usługi aplikuje się w jednym miejscu

47 Koszt dostępu 47 Dostęp nieodpłatny dla polskich naukowców Dostęp do zasobów oferowanych w ramach projektu PL-Grid jest nieodpłatny dla naukowców i wszystkich osób prowadzących działalność naukową, związaną z uczelnią lub instytutem naukowym w Polsce Walutą są publikacje, w których powinny znaleźć się podziękowania: "Praca została wykonana z wykorzystaniem Infrastruktury PL-Grid. lub "This research was supported in part by PL-Grid Infrastructure."

48 Sposoby dostępu 48 Dostęp lokalny i gridowy Różne sposoby dostępu przy użyciu lokalnych systemów kolejkowych na klastrach CLI lub GUI korzystając z oprogramowania pośredniczącego (UNICORE, QosCosGrid) CLI, GUI lub dedykowane aplikacje na komputerach użytkowników poprzez portale sieciowych dostosowanych do konkretnych dziedzin nauki

49 QCG-Icon 49 Lekki klient graficzny oprogramowania pośredniczącego

50 Przydzielanie mocy obliczeniowych 50 Granty Obliczeniowe Porozumienie miedzy Użytkownikami a PL-Gridem jakie zasoby będą zużyte Granty w jakiej ilości w jakim czasie osobiste (1000h czasu procesora) właściwe (ustalane indywidualnie) Zalety możliwość rezerwacji zasobów większa przewidywalność dostępności zasobów możliwość współdzielenia zasobów przez Zespoły Użytkowników

51 Kontakt 51 Helpdesk PL-Grid lub Admini klastra Zeus - zeus@cyfronet.pl Klemens Noga - klemens.noga@cyfronet.pl