Laboratorium Wirtualne

Transkrypt

1 Obliczenia wielkiej skali i wizualizacja do zastosowań w wirtualnym laboratorium z użyciem klastra SGI Laboratorium Wirtualne Instytut Chemii Bioorganicznej PAN Poznańskie Centrum Superkomputerowo Sieciowe VLab Team Spotkanie projektu SGIGrid 6-7 maja 2004

2 Partnerzy ACK Cyfronet AGH Instytut Chemii Bioorganicznej PAN - Poznańskie Centrum Superkomputerowo Sieciowe Centrum Komputerowe Politechniki Łódzkiej Pośrednio: Politechnika Wrocławska, WCSS

3 Funkcjonalność Zdalny dostęp do drogich przyrządów badawczych Uogólniona architektura umożliwiająca współpracę z różnymi przyrządami laboratoryjnymi Scenariusze pomiarowe umożliwiające definiowanie zadań dla całego cyklu obliczeniowo - pomiarowego Umożliwienie dostępu do zasobów laboratoryjnych użytkownikom z zewnątrz (odpowiednia definicja zadania) Równoważenie obciążenia na przyrządach laboratoryjnych Rozliczanie użytkowników Naukowa biblioteka cyfrowa Praca grupowa Komunikacja z obsługą urządzeń Rezerwacja czasu wykonania eksperymentu Uwzględnienie czynnika ludzkiego podczas zlecania i realizacji eksperymentu

4 Ogólny diagram połączeń w systemie Laboratorium Wirtualnego

5 Architektura

6 Interfejs użytkownika

7 Scenariusz pomiarowy

8 Naukowa biblioteka cyfrowa - Baza danych NMR

9 Zadania WP Specyfikacja VLab WP Określenie wymagań funkcjonalnych WP Szczegółowe specyfikacje modułów WP Architektura WP Budowa szkieletu systemu WP Moduł definicji scenariuszy WP Broker (ogólny scheduler VLab) WP Moduł zlecania zadań WP Wizualizacja strojenia NMR WP Komunikacyjne proxy WP Moduł szeregowania dla danego urządzenia WP Moduł accountingu WP Centrum certyfikacji WP Interface użytkownika WP Testy

10 Aktualny stan prac (1/2) Prace koncepcyjne Określone założenia systemu VLab Zdefiniowane wymagania funkcjonalne i niefunkcjonalne Zdefiniowana architektura Opis funkcjonalności i sposobu działania poszczególnych modułów Zdefiniowany sposób sterowania przepływem zadań Opracowany sposób obsługi zadań interaktywnych Opracowana baza danych NMR Opracowana koncepcja bezpieczeństwa Opracowana metoda rozliczania użytkowników w kooperacji z systemem VUS Zdefiniowany sposób zarządzania laboratoriami i użytkownikami Koncepcja Dynamicznych Scenariuszy Pomiarowych

11 Aktualny stan prac (2/2) Prace implementacyjne Podstawowa funkcjonalność modułów Zakończono prace nad modułami: Job Submission, Local Scheduling, SZD client, Communication proxy, Device proxy; Nowy interfejs użytkownika w postaci portalu umożliwiający: wczytanie opisu zasobów zlecenie scenariusza pomiarowego obserwację stanu zadania komunikację przy pomocy list dyskusyjnych oraz chat a Strony edukacyjne częściowo została opracowana zawartość merytoryczna Projekt bazy danych dla biblioteki cyfrowej danych NMR (LODMAN) Interfejs użytkownika dla biblioteki cyfrowej (LODMAN)

12 Zadania do realizacji Rozbudowa funkcjonalności istniejących modułów w zakresie: zarządzania dynamicznymi scenariuszami pomiarowymi zaawansowanego szeregowania zadań komunikacji z innymi laboratoriami Rozbudowa funkcjonalności interfejsu użytkownika w zakresie narzędzi do zarządzania laboratoriami i użytkownikami Zwiększenie poziomu bezpieczeństwa integracja z Centrum Autoryzacji realizowanym w ramach zadania Zaawansowany system bezpieczeństwa oraz z systemem RAD Zlecanie zadań obliczeniowych do Super-zarządcy Realizacja systemu rozliczeniowego we współpracy z Systemem Użytkowników Wirtualnych Integracja z systemami z podzadań WP3.1.2 i WP3.1.3 (Kraków, Łódź) Dokończenie części edukacyjnej laboratorium

13 Zadania do realizacji ośrodki współpracujące Łódź baza danych NMR 15 maja kolejny etap oddania wersji funkcjonalnej Kraków - system sterowania robotem integracja do 20 czerwca Wrocław bezpieczeństwo działająca wersja usługi - do końca maja

14 Plany na czerwiec Funkcjonalna wersja VLab-a z pierwszą wersją dynamicznych scenariuszy pomiarowych, pierwszą wersją działającą z GRMS-em Łódź działająca wersja bazy NMR Kraków integracja z systemem sterowania robotem

15 Plany na październik Funkcjonalna wersja VLab-a z: pełną wersją dynamicznych scenariuszy pomiarowych, bezpieczeństwem, interfejsem do zarządzania laboratoriami, rozliczaniem użytkowników integracja z GRMS-em Integracja z innymi zadaniami (np. VUS, sterowanie robotem, bezpieczeństwo, superzarządca)

16 Pierwsze prezentacje & wersja produkcyjna Pierwsza prezentacja działającego systemu na spotkaniu projektu SGIGrid w Krakowie ( ) Prezentacja prototypu na SC2003 w Phoenix ( ) 26 marca 2004 oddano do użytku pracowników ICHB pierwsza wersję produkcyjną VLab Prezentacja Laboratorium Wirtualnego podczas spotkania roboczego projektu SGIGrid dotyczącego bezpieczeństwa Planowane prezentacje i demonstracje na kolejnych konferencjach

17 Harmonogram prac i spotkania Zadania są realizowane zgodnie z harmonogramem Od ostatniego sprawozdania w listopadzie 2003: Odbyło się spotkanie w Poznaniu ( ) dotyczące kwestii bezpieczeństwa Raz w tygodniu odbywają się spotkania poprzez system VRVSa z zespołem z Łodzi Spotkania z uczestnikami innych zadań w ramach PCSS Kontakt mailowy z innymi uczestnikami projektu

18 Publikacje i wystąpienia Zakopane 2003 konferencja ATM S.A. Pionier 2003 Łódź 2003 Bruker Users Meeting SC2003 prezentacja systemu GGF Pionier 2004 Terena 2004 ICCS 2004 NMR School kilka publikacji wysłanych na konferencje międzynarodowe czekamy na recenzje

19 Raporty wewnętrzne M.Lawenda, N.Meyer, M.Okoń, T.Rajtar, Zarządzanie wiedzą i obiegiem informacji w projekcie Laboratorium Wirtualne, PCSS, RW-01 Ryszard W. Adamiak, Z. Gdaniec, M.Lawenda, N.Meyer, Ł. Popenda, M.Okoń, T.Rajtar, M. Stroiński, Adaptacja interfejsu użytkownika spektrometru NMR Varian Unity 300 na potrzeby Laboratorium Wirtualnego, PCSS, RW-02/03 M.Lawenda, N.Meyer, Ł. Popenda, M.Okoń, T.Rajtar, Z. Gdaniec, M. Stroiński, R. W. Adamiak, Laboratorium Wirtualne - Specyfikacja wymagań użytkownika, PCSS, RW-03/03 M.Lawenda, N.Meyer, Ł. Popenda, M.Okoń, T.Rajtar, Z. Gdaniec, M. Stroiński, R. W. Adamiak, Laboratorium Wirtualne - wymagania funkcjonalne, PCSS, RW-05/03 M.Lawenda, N.Meyer, M.Okoń, T.Rajtar, M. Stroiński, Laboratorium Wirtualne - wymagania niefunkcjonalne, PCSS, RW-06/03 R. W. Adamiak, Z. Gdaniec, M. Stroiński, N.Meyer, M.Lawenda, T. Rajtar, M. Okoń, D. Stokłosa, Laboratorium Wirtualne - Specyfikacja Wymagań, PCSS, RW-08/03 R. W. Adamiak, Z. Gdaniec, M. Stroiński, N.Meyer, M.Lawenda, T. Rajtar, M. Okoń, D. Stokłosa, Moduły Laboratorium Wirtualnego, PCSS, RW-09/03 Piotr Mierzyński, Marcin Lawenda, Norbert Meyer, Maciej Stroiński, Dominik Stokłosa, Tomasz Rajtar, Marcin Okoń, Projekt i implementacja bazy danych na potrzeby projektu Laboratorium Wirtualne, PCSS, RW-10/03 Ł. Popenda, Z. Gdaniec, M.Lawenda, N.Meyer, M.Okoń, T.Rajtar, D. Stokłosa, M. Stroiński, R. W. Adamiak, Adaptacja interfejsu użytkownika spektrometru NMR Bruker Avance 600 na potrzeby Laboratorium Wirtualnego, PCSS, RW-14/03, Marcin Lawenda, Norbert Meyer, Maciej Stroiński, Dominik Stokłosa, Tomasz Rajtar, Marcin Okoń, Damian Kaliszan, Secure VNC connection in the Virtual Laboratory, PCSS, RW-4/05 Dominik Stokłosa, Marcin Lawenda, Norbert Meyer, Marcin Okoń, Ariel Oleksiak, Juliusz Pukacki, Tomasz Rajtar, Maciej Stroiński, Jarek Nabrzyski, Interactive task invocation in the Virtual Laboratory, PCSS, RW-5/04,

20 Dziękuję za uwagę