Academic year: 2012/2013 Code: EIB BN-s ECTS credits: 4. Electrical Engineering, Automatics, Computer Science and Engineering in Biomedicine

Transkrypt

1 Module name: Genetyka molekularna Academic year: 2012/2013 Code: EIB BN-s ECTS credits: 4 Faculty of: Electrical Engineering, Automatics, Computer Science and Engineering in Biomedicine Field of study: Biomedical Engineering Specialty: Bionanotechnologies Study level: Second-cycle studies Form and type of study: Full-time studies Lecture language: Polish Profile of education: Academic (A) Semester: 3 Course homepage: Responsible teacher: Academic teachers: prof. dr hab. Rokita Hanna (hanna.rokita@uj.edu.pl) prof. dr hab. Rokita Hanna (hanna.rokita@uj.edu.pl) dr Horwacik Irena (irena.horwacik@uj.edu.pl) mgr Durbas Małgorzata (malgorzata.durbas@uj.edu.pl) Description of learning outcomes for module MLO code Student after module completion has the knowledge/ knows how to/is able to Connections with FLO Method of learning outcomes verification (form of completion) Social competence M_K001 Wobec ciągłego aktualizowania się wiedzy w zakresie przedmiotu student rozumie potrzebę ciągłego uczenia się. IB2A_K01, IB2A_K03, IB2A_K04 Activity during, Test, Report, Participation in a discussion, Execution of laboratory, Completion of laboratory M_K002 Student umie współpracować (w grupach 2-osobowych) w celu wykonania ćwiczenia w oparciu o instrukcję i pod nadzorem prowadzącego, potrafi analizować i ocenić przebieg ćwiczenia i uzyskane wyniki oraz przygotować raport z ćwiczeń IB2A_K01, IB2A_K03, IB2A_K04 Activity during, Report, Participation in a discussion, Execution of laboratory, Involvement in teamwork, Completion of laboratory M_K003 Student zapoznaje się z obsługą sprzętu laboratoryjnego używanego w czasie ćwiczeń i zasadami bezpiecznego wykonywania doświadczeń IB2A_K01, IB2A_K04 Activity during, Report, Participation in a discussion, Execution of laboratory 1 / 6

2 Skills M_U001 Student potrafi przedstawić budowę kwasów nukleinowych i ich biologię. Wie jakie metody stosuje się w badaniu procesów genetycznych. IB2A_U01, IB2A_U02, IB2A_U03, IB2A_U04, IB2A_U06, IB2A_U13 Activity during, Test, Report, Execution of laboratory, Completion of laboratory Wobec ciągłego aktualizowania się wiedzy w zakresie przedmiotu student rozumie potrzebę ciągłego uczenia się. Knowledge M_W001 Student zna budowę i właściwości kwasów nukleinowych oraz mechanizmy syntezy, naprawy i rekombinacji DNA, mechanizmy kontroli potranskrypcyjnej ekspresji genów (składanie mrna, redagowanie, degradacja i interferencja RNA), proces translacji, budowę genomów i podstawowe metody ich badania oraz molekularne podstawy dziedziczenia. IB2A_W01, IB2A_W03, IB2A_W06 Activity during, Test, Participation in a discussion M_W002 Zna technologie rekombinacji DNA (PCR, sekwencjonowanie DNA, klonowanie DNA, hybrydyzacja kwasów nukleinowych, technologia macierzy i mikromacierzy DNA, PCR w czasie rzeczywistym, technologia irna), klonowanie zwierząt oraz podstawy genetyki molekularnej człowieka (choroby genetyczne, terapia genowa). IB2A_W01, IB2A_W03, IB2A_W06 Activity during, Test, Participation in a discussion M_W003 Student posiada praktyczną znajomość metod izolacji i oczyszczania kwasów nukleinowych, w tym izolacji plazmidowego DNA, technik transformacji bakterii wybranymi plazmidami, potrafi przeprowadzić elektroforetyczny rozdział RNA i DNA, potrafi posługiwać się enzymami restrykcyjnymi, zna podstawy hybrydyzacji kwasów nukleinowych oraz reakcji łańcuchowej polimerazy - PCR IB2A_W01, IB2A_W02, IB2A_W03, IB2A_W06 Activity during, Test, Report, Participation in a discussion, Completion of laboratory FLO matrix in relation to forms of MLO code Student after module completion has the knowledge/ knows how to/is able to Form of 2 / 6

3 Lectures Auditorium Laboratory Project Conversation seminar Seminar Practical Fieldwork Workshops Others E-learning Social competence M_K001 M_K002 M_K003 Skills M_U001 Knowledge M_W001 Wobec ciągłego aktualizowania się wiedzy w zakresie przedmiotu student rozumie potrzebę ciągłego uczenia się. Student umie współpracować (w grupach 2-osobowych) w celu wykonania ćwiczenia w oparciu o instrukcję i pod nadzorem prowadzącego, potrafi analizować i ocenić przebieg ćwiczenia i uzyskane wyniki oraz przygotować raport z ćwiczeń Student zapoznaje się z obsługą sprzętu laboratoryjnego używanego w czasie ćwiczeń i zasadami bezpiecznego wykonywania doświadczeń Student potrafi przedstawić budowę kwasów nukleinowych i ich biologię. Wie jakie metody stosuje się w badaniu procesów genetycznych. Wobec ciągłego aktualizowania się wiedzy w zakresie przedmiotu student rozumie potrzebę ciągłego uczenia się. Student zna budowę i właściwości kwasów nukleinowych oraz mechanizmy syntezy, naprawy i rekombinacji DNA, mechanizmy kontroli potranskrypcyjnej ekspresji genów (składanie mrna, redagowanie, degradacja i interferencja RNA), proces translacji, budowę genomów i podstawowe metody ich badania oraz molekularne podstawy dziedziczenia / 6

4 M_W002 M_W003 Zna technologie rekombinacji DNA (PCR, sekwencjonowanie DNA, klonowanie DNA, hybrydyzacja kwasów nukleinowych, technologia macierzy i mikromacierzy DNA, PCR w czasie rzeczywistym, technologia irna), klonowanie zwierząt oraz podstawy genetyki molekularnej człowieka (choroby genetyczne, terapia genowa). Student posiada praktyczną znajomość metod izolacji i oczyszczania kwasów nukleinowych, w tym izolacji plazmidowego DNA, technik transformacji bakterii wybranymi plazmidami, potrafi przeprowadzić elektroforetyczny rozdział RNA i DNA, potrafi posługiwać się enzymami restrykcyjnymi, zna podstawy hybrydyzacji kwasów nukleinowych oraz reakcji łańcuchowej polimerazy - PCR Module content Lectures Genetyka molekularna 1.Budowa DNA i chromosomów 2 godz. 2.Transkrypcja genów 4 godz. 3.Translacja 2 godz. 4.Replikacja DNA 2 godz. 5.Regulacja ekspresji genów u Prokaryota i Eukaryota 4 godz. 6.Genomy prokariotyczne 1 godz. 7.Genom człowieka 1 godz. 8.Mutacje DNA i naprawa DNA 2 godz. 9.Rekombinacja DNA 2 godz. 10.Technologia rekombinacji DNA (PCR, sekwencjonowanie DNA, klonowanie DNA, hybrydyzacja kwasów nukleinowych, technologia macierzy i mikromacierzy DNA, PCR w czasie rzeczywistym, technologia irna) 6 godz. 11.Klonowanie zwierząt 2 godz. 12.Genetyka człowieka (choroby genetyczne, terapia genowa) 2 godz. Laboratory Laboratoria 1.Metody izolacji i oczyszczania kwasów nukleinowych. Izolacja RNA 4 godz. 2.Ilościowe oznaczanie i elektroforetyczny rozdział 4 / 6

5 RNA 5 godz. 3.Izolacja plazmidowego DNA 4 godz. 4.Enzymy restrykcyjne. Elektroforeza DNA 5 godz. 5.Wektory pro- i eukariotyczne. Przygotowanie kompetentnych bakterii 4 godz. 6.Transformacja bakterii wybranymi plazmidami 4 godz. 7.Hybrydyzacja kwasów nukleinowych. PCR- reakcja łańcuchowa polimerazy 4 godz. Method of calculating the final grade Metody sprawdzania i kryteria oceny efektów kształcenia: Wykład kolokwium zaliczeniowe Laboratoria prawidłowe wykonanie ćwiczeń laboratoryjnych. 3 pisemne sprawdziany, prawidłowe przygotowanie sprawozdań z ćwiczeń laboratoryjnych. Warunki zaliczenia: Wykład pozytywna ocena z kolokwium zaliczeniowego. Laboratoria wykonanie ćwiczeń laboratoryjnych, pozytywna ocena z trzech sprawdzianów pisemnych, zaliczenie sprawozdań. Ocena końcowa jest średnią z ocen ze sprawdzianów pisemnych. Prerequisites and additional requirements Podstawowa wiedza w zakresie biochemii i chemii. Recommended literature and teaching resources Wykaz literatury do wykładów: 1. Genetyka, PC. Winter, GI. Hickey, HL. Fletcher, tłumaczenie pod red. W. Prus-Głowackiego: Krótkie wykłady, wydanie drugie poprawione, Wydawnictwo Naukowe PWN, Podstawy biologii komórki: wprowadzenie do biologii molekularnej, B. Alberts i in., Wydawnictwo Naukowe PWN, Genomy, TA. Brown, Wydawnictwo Naukowe PWN, Molecular biology of the gene, JD Watson I in., wyd. 5, CSHL Press, 2004, wyd. 6, Wykaz literatury do laboratorium: 1. Podstawowe techniki biologii molekularnej i biotechnologii, M. Bugno, H. Rokita, red., Seria Wydawnicza UJ, Analiza DNA. Teoria i praktyka. Pod red. Ryszarda Słomskiego, Wyd. Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu, Molecular cloning. A laboratory manual. J. Sambrook, E.F. Fritsch, T. Maniatis, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2nd ed., Scientific publications of module course instructors related to the topic of the module Additional scientific publications not specified Additional information Zajęcia odbywają się w wyłacznie w semestrze letnim (do wyboru semestr 1 lub 3). Ćwiczenia laboratoryjne obywają się w blokach 4-5 godzinnych. 5 / 6

6 Student workload (ECTS credits balance) Student activity form Realization of independently performed tasks Examination or Final test Participation in laboratory Preparation for Preparation of a report, presentation, written work, etc. Summary student workload Module ECTS credits Student workload 40 h 31 h 30 h 10 h 9 h 120 h 4 ECTS 6 / 6