Kształcenie na Wydziale Biologii i Ochrony Środowiska UŁ odbywa się w ramach czterech stacjonarnych Studiów Doktoranckich Studia Doktoranckie

Transkrypt

1

2 Kształcenie na Wydziale Biologii i Ochrony Środowiska UŁ odbywa się w ramach czterech stacjonarnych Studiów Doktoranckich Studia Doktoranckie BIOCHEMICZNO-BIOFIZYCZNE Kierownik: prof. dr hab. Mirosław Soszyński Tel ; miroslaw.soszynski@biol.uni.lodz.pl Studia Doktoranckie EKOLOGII I OCHRONY ŚRODOWISKA Kierownik: prof. dr hab. Mirosław Przybylski Tel ; miroslaw.przybylski@biol.uni.lodz.pl Studia Doktoranckie GENETYKI MOLEKULARNEJ, CYTOGENETYKI I BIOFIZYKI MEDYCZNEJ Kierownik: dr hab. Anita Krokosz, prof. nadzw. UŁ Tel ; anita.krokosz@biol.uni.lodz.pl Studia Doktoranckie MIKROBIOLOGII, BIOTECHNOLOGII I BIOLOGII EKSPERYMWNTALNEJ Kierownik: dr hab. Elżbieta Kuźniak-Gębarowska, prof. nadzw. UŁ Tel ; elzbieta.kuzniak@biol.uni.lodz.pl

3 ZASADY REKRUTACJI Szczegółowe zasady rekrutacji, w tym terminy, wymagane dokumenty i kryteria oceny umieszczone są na stronie internetowej wydziału w zakładce: kandydaci/studia doktoranckie Ponieważ jednym z wymaganych dokumentów podczas rekrutacji jest deklaracja samodzielnego pracownika o gotowości podjęcia się opieki nad pracą naukową i dydaktyczną kandydata prezentujemy poniżej listę dostępnych na rok 2017/2018 miejsc, wraz z proponowanymi do realizacji tematami.

4 TEMATY PRAC Tematy przypisane są do poszczególnych Studiów Doktoranckich. Przy każdym podana jest osoba potencjalnego opiekuna, liczba miejsc, którymi dysponuje dany opiekun oraz dodatkowe informacje np. o współpracy międzynarodowej, krajowej, grantach. Zachęcamy do kontaktowania się z autorami tematów!!!

5 Studia Doktoranckie BIOCHEMICZNO-BIOFIZYCZNE Prof. dr hab. Grzegorz Bartosz (2 miejsca) Katedra Biofizyki Molekularnej, Zakład Biofizyki Błon, Instytut Biofizyki UŁ Ul. Pomorska 141/143, Pawilon Biologii Molekularnej (Budynek D), pokój Bfi Tel ; Temat doktoratu: Terapeutyczny potencjał ciał ketonowych w odniesieniu do układu naczyniowo-sercowego. W epigenetycznych i transkrypcyjnych badaniach nad konsekwencjami działania beta-hydroksymaślanu, jako model badawczy będą wykorzystywane komórki śródbłonka naczyniowego i komórki mięśni gładkich naczynia. Proponowany Opiekun naukowy pomocniczy: dr Aneta Balcerczyk, tel ; aneta.balcerczyk@biol.uni.lodz.pl. Temat doktoratu: Podłoże aktywności biologicznej metaloorganicznych analogów naturalnie występujących substancji o właściwościach przeciwnowotworowych. Proponowany temat pracy będzie realizowany we współpracy z Katedrą Chemii Organicznej UŁ. Proponowany Opiekun naukowy pomocniczy: dr Błażej Rychlik, tel ; blazej.rychlik@biol.uni.lodz.pl. Prof. dr hab. Krzysztof Gwoździński (1 miejsce) Katedra Biofizyki Molekularnej, Zakład Badań Struktur Biopolimerów, Instytut Biofizyki UŁ Ul. Pomorska 141/143, Pawilon Biologii Molekularnej (Budynek D), pokój Bfi 49 Tel ; krzysztof.gwozdzinski@biol.uni.lodz.pl Temat doktoratu: Wpływ wybranych toksyn mocznicowych na strukturę i funkcję erytrocytów i limfocytów człowieka. Tematyką pracy doktorskiej będzie badanie wpływu toksyn mocznicowych na wymienione w tytule komórki krwi człowieka. Zastosowane zostaną metody spektrofotometryczne i spektrofluorymetryczne, metoda elektronowego rezonansu paramagnetycznego oraz metoda cytometrii przepływowej. Określany będzie potencjał przeciwutleniający komórek, ich kształt, właściwości błony plazmatycznej oraz wpływ toksyn na generowanie reaktywnych form tlenu w komórkach. W przypadku limfocytów określona zostanie genotoksyczność oraz proces kierowania komórki na drogę apoptozy/nekrozy. Prof. dr hab. Magdalena Bryś (1 miejsce) Katedra Cytobiochemii, Instytut Biochemii UŁ Ul. Pomorska 141/143, Pawilon Biologii Molekularnej (Budynek D), pokój Bch 61 Tel ; magdalena.brys@biol.uni.lodz.pl Temat doktoratu: Udział receptorów hormonów steroidowych w epigenetycznej regulacji ekspresji genów w komórkach nowotworów tkanek hormonozależnych. Celem planowanych badań będzie określenie, w jaki sposób status receptorów estrogenowych i receptora androgenowego wpływa na aktywność wybranych białek Polycomb, w komórkach raka piersi i raka jajnika. Przewidywane techniki badawcze hodowle komórkowe, izolowanie kwasów nukleinowych i białek, real-time PCR, western blot, immunoprecypitacja chromatyny, wyciszanie/nadekspresja genów.

6 Studia Doktoranckie BIOCHEMICZNO-BIOFIZYCZNE Dr hab. Beata Olas, prof. nadzw. UŁ (1 miejsce) Katedra Biochemii Ogólnej, Instytut Biochemii UŁ ul. Pomorska 141/143, Pawilon Biologii Molekularnej (Budynek D), pokój Bch 52 Tel: ; Temat doktoratu: Składniki diety o aktywności antypłytkowej i ich rola w chorobach krążenia. Proponowany temat badawczy dotyczy określenia wpływu preparatów z owoców jagodowych (w tym owoców rokitnika) na proces hemostazy i określenie potencjalnej roli tych preparatów w prewencji i leczeniu chorób układu krążenia. Planowana jest ocena różnych markerów aktywacji płytek krwi i parametrów hemostazy z zastosowaniem różnych technik (m.in. cytometrii przepływowej). Dr hab. Joanna Saluk-Bijak, prof. nadzw. UŁ (2 miejsca) Katedra Biochemii Ogólnej, Instytut Biochemii UŁ ul. Pomorska 141/143, Pawilon Biologii Molekularnej (Budynek D), pokój Bch 32 Tel: ; joanna.saluk@biol.uni.lodz.pl Tematyka planowanych doktoratów: Molekularne mechanizmy wzmożonej aktywności prozakrzepowej płytek krwi w stwardnieniu rozsianym. Do realizacji badań stosowane będą następujące techniki eksperymentalne: izolowanie płytek krwi, izolowanie megakariocytów, cytometryczny pomiar agregacji płytek, mikroskopowa ocena agregatów, określanie stężenia fibrynogenu w osoczu metodą ELISA, izolowanie RNA z płytek krwi oraz z megakariocytów oraz analiza ekspresji mrna metodą real-time PCR.

7 Studia Doktoranckie GENETYKI MOLEKULARNEJ, CYTOGENETYKI I BIOFIZYKI MEDYCZNEJ Prof. dr hab. Janusz Błasiak (3 miejsca) Katedra Genetyki Molekularnej Ul. Pomorska 141/143, Pawilon Biologii Molekularnej (Budynek D), pokój Bch23 Tel ; janusz.blasiak@biol.uni.lodz.pl Relacje pomiędzy starzeniem, autofagią i reakcją komórki na uszkodzenia DNA w zwyrodnieniu plamki związanym z wiekiem co najmniej 2 rozprawy, temat realizowany z użyciem zwierzęcych modeli eksperymentalnych i komórek macierzystych człowieka we współpracy z Instytutem Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego w Warszawie i Uniwersytetem w Kuopio (Finlandia), aplikacja grantowa. Autofagia jako cel terapeutyczny w zwyrodnieniu plamki związanym z wiekiem temat realizowany we współpracy z Uniwersytetem w Kuopio (Finlandia), grant Fińskiej Akademii Nauk. Komórki macierzyste glejaka jako cel terapii przeciwnowotworowej temat we współpracy z Kliniką Neurochirurgii i Onkologii Centralnego Układu Nerwowego Uniwersytetu Medycznego w Łodzi aplikacja grantowa. Znaczenie białek p21 i PCNA dla proliferacji komórek rogówki w terapii chorób oczu temat realizowany we współpracy z Kliniką Okulistyki Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego aplikacja grantowa. Dr hab. Tomasz Popławski, prof. nadzw. UŁ (1 miejsce) Katedra Genetyki Molekularnej Ul. Pomorska 141/143, Pawilon Biologii Molekularnej (Budynek D), pokój Bch57 Tel ; tomasz.poplawski@biol.uni.lodz.pl Synteza i badanie właściwości biologicznych nowych związków zawierających siarkę, ukierunkowanych w stronę modulacji homeostazy redoks, o potencjalnym zastosowaniu w terapii przeciwnowotworowej. Prof. dr hab. Andrzej Kononowicz (1 miejsce) Katedra Genetyki Ogólnej, Biologii Molekularnej i Biotechnologii Roślin Ul. Banacha 12/16, Budynek A, pokój 304 Tel ; andrzej.kononowicz@biol.uni.lodz.pl Określenie odmian sałaty (Lactuca sativa) wrażliwych jak również chociaż częściowo odpornych na infekcję przez Sclerotinia. Praca będzie z pogranicza biotechnologii i genetyki roślin oraz fitopatologii. Część eksperymentalna doktoratu zostanie przeprowadzona na kilku odmianach sałaty (Lactuca sativa) uprawianych w warunkach polowych i naturalnie zainfekowanych grzybem nekrotroficznym z rodzaju Sclerotinia, który stanowi bardzo poważny problem epidemiologiczny w gospodarstwach rolnych, zajmujących się uprawami sałaty na potrzeby zarówno rynku lokalnego jak i ogólnopolskiego.

8 Studia Doktoranckie GENETYKI MOLEKULARNEJ, CYTOGENETYKI I BIOFIZYKI MEDYCZNEJ Prof. dr hab. Maria Bryszewska (łącznie 5 miejsc) Dr hab. Maksim Ionov, prof. nadzw. UŁ Dr hab. Katarzyna Miłowska Katedra Biofizyki Ogólnej ul. Pomorska 141/143, Pawilon Biologii Molekularnej (Budynek D), pokój Bfi 37 Tel: ; maria.bryszewska@biol.uni.lodz.pl Proponowana tematyka: możliwości zastosowania nanocząstek (dendrymery, nanocząstki złota i srebra, krzemionki mezoporowate, nanocząstki z tlenkiem tytanu): 1.jako potencjalnych leków w chorobach neurodegeneracyjnych 2.w przeciwnowotworowej terapii genowej 3.jako nośników leków i materiału genetycznego w terapii przeciwko wirusowi HIV-1 W Katedrze Biofizyki Ogólnej prowadzone są badania w ramach projektów międzynarodowych, więc istnieje możliwość odbycia staży naukowych w zagranicznych ośrodkach. Prof. dr hab. Bożena Bukowska (1 miejsce) Katedra Biofizyki Skażeń Środowiska Ul. Pomorska 141/143, Pawilon Biologii Molekularnej (Budynek D), pokój Bfi45 Tel ; bozena.bukowska@biol.uni.lodz.pl Ocena uszkodzeń i naprawy DNA oraz zmian epigenetycznych w jednojądrzastych komórkach krwi człowieka zachodzących pod wpływem glifosatu i jego metabolitów. Praca we współpracy z dr hab. Edytą Reszką z Instytutu Medycyny Pracy w Łodzi. Dr hab. Jaromir Michałowicz, prof. nadzw. UŁ (1 miejsce) Katedra Biofizyki Skażeń Środowiska Ul. Pomorska 141/143, Pawilon Biologii Molekularnej (Budynek D), pokój Bfi47 Tel ; jaromir.michalowicz@biol.uni.lodz.pl Oddziaływanie wybranych retardantów fenolowych, tj.: 2,4-dibromofenolu, pentabromofenolu, terabromobisphenolu A oraz tetrabromobisfenolu S na wybrane parametry jednojądrzastych komórek krwi człowieka. Dr hab. Alina Błaszczyk, prof. nadzw. UŁ (1 miejsce) Pracownia Cytogenetyki Ul. Banacha 12/16, Budynek A, pokój 308 Tel ; alina.blaszczyk@biol.uni.lodz.pl Biologiczne właściwości nowo syntetyzowanych związków o potencjalnych właściwościach przeciwnowotworowych, pochodnych kwasu rycynolowego. Analizowane będą właściwości dwóch form enancjomerowych badanych pochodnych. Oceniana będzie cytotoksyczność tych związków oraz badane będą mechanizmy ich cytotoksycznego działania. Badania prowadzone we współpracy z Politechniką Łódzką.

9 Studia Doktoranckie GENETYKI MOLEKULARNEJ, CYTOGENETYKI I BIOFIZYKI MEDYCZNEJ Dr hab. Aleksandra Rodacka (1 miejsce) Katedra Biofizyki Molekularnej, Zakład Radiobiologii Ul. Pomorska 141/143, Pawilon Biologii Molekularnej (Budynek D), pokój Bfi10 Tel ; aleksandra.rodacka@biol.uni.lodz.pl Rola naturalnie występujących związków polifenolowych w przeciwdziałaniu agregacji białek zaangażowanych w patofizjologię choroby Alzheimera. Celem pracy będzie określenie skuteczności wybranych związków polifenolowych w przeciwdziałaniu i hamowaniu agregacji białek i peptydów (GAPDH, alfasynukleina, amyloid beta) związanych z procesami neurodegeneracyjnymi charakterystycznymi w patofizjologii choroby Alzheimera. Dr hab. Anita Krokosz, prof. nadzw. UŁ (1 miejsce) Katedra Biofizyki Molekularnej, Zakład Radiobiologii Ul. Pomorska 141/143, Pawilon Biologii Molekularnej (Budynek D), pokój Bfi10 Tel ; anita.krokosz@biol.uni.lodz.pl Biologiczna aktywność nanocząstek węglowych: fulerenu C60 i jego hydroksylowych pochodnych. Właściwości radioprotekcyjne. Badania realizowane we współpracy z Wydziałem Chemii UŁ i MITR PŁ. Dr hab. Paweł Stączek, prof. nadzw. UŁ (1 miejsce) Zakład Genetyki Drobnoustrojów Ul. Banacha 12/16, Budynek A, pokój 387/388 Tel ; pawel.staczek@biol.uni.lodz.pl Aktywność antydrobnoustrojowa nowo syntetyzowanych związków, będących pochodnymi hydrazyny, w tym zwłaszcza tiosemikarbazydów. Oznaczenie ich aktywności cytotoksycznej, genotoksycznej i mutagennej. Poznanie mechanizmów lekooporności drobnoustrojów na tę klasę związków. Planowane są także badania związków pod kątem ich aktywności antynowotworowej. Badania prowadzone we współpracy z Wydziałem Farmaceutycznym Uniwersytetu Medycznego w Lublinie oraz Wydziałem Chemii UŁ. Dr hab. Joanna Boncela, prof. nadzw. IBM PAN (2 miejsca) Opiekun pomocniczy (kierownik SONATA BIS): dr Patrycja Przygodzka Instytut Biologii Medycznej PAN, ul. Lodowa 106, Łódź, Tel ; pprzygodzka@cbm.pan.pl 1.Neuromedyna U, jako potencjalny regulator modelowania mikrośrodowiska nowotworu w procesie progresji raka jelita grubego i odbytnicy. 2.Neuromedyna U, jako potencjalny regulator procesu uzłośliwiania komórek raka jelita grubego i odbytnicy. Prace doktorskie będą realizowane w ramach projektu badawczego Sonata Bis finansowanego przez NCN.

10 Studia Doktoranckie MIKROBIOLOGII, BIOTECHNOLOGII I BIOLOGII EKSPERYMENTALNEJ Dr hab. Katarzyna Dzitko, prof. nadzw. UŁ (1 miejsce) Instytut Mikrobiologii, Biotechnologii i Immunologii, Katedra Immunologii i Biologii Infekcyjnej, Zakład Immunoparazytologii Ul. Banacha 12/16, pokój A/279 Tel ; katarzyna.dzitko@biol.uni.lodz.pl Temat rozprawy: Aktywność przeciwpasożytnicza pochodnych triazolu i tiosemikarbazydu. Interdyscyplinarna praca doktorska będzie dotyczyła badań podstawowych, mających na celu wyselekcjonowanie nowych, efektywnych środków leczniczych do zwalczania zarażeń Toxoplasma i Neospora w grupie pochodnych tiosemikarbazydu oraz triazolu. Praca obejmować będzie dwa zasadnicze etapy badawcze: 1. ocenę aktywności przeciwpasożytniczej pochodnych tiosemikarbazydu oraz triazolu (in vitro i in vivo), 2. badania teoretyczne (kwantowo-mechaniczne oraz dokowania molekularne) mające na celu wyznaczenie zależności pomiędzy strukturą molekularną a aktywnością biologiczną oraz wytypowanie potencjalnych celów molekularnych. Charakterystyka problemu badawczego: Wysoka ekstensywność zarażenia Toxoplasma gondii zarówno u ludzi, jak i zwierząt hodowlanych pozostaje wciąż problemem globalnym. Nosicielstwo T. gondii może korelować z występowaniem takich schorzeń jak schizofrenia, choroba Parkinsona czy epilepsja. Najpoważniejsze postaci choroby, a nawet zgon, pierwotniak ten powoduje u osób z dysfunkcją układu odpornościowego. Ponadto toksoplazmoza jest szczególnie niebezpieczna dla rozwijającego się płodu. Transmisja pasożyta przez łożysko może być bowiem przyczyną nie tylko poronienia czy zgonu noworodka, lecz również trwałych wad rozwojowych, głównie w obrębie tkanki nerwowej mózgu i siatkówki. Z racji możliwości zarażania szerokiego rezerwuaru zwierząt stałocieplnych toksoplazmoza, jak również neosporoza wywołana przez pierwotniaka Neospora caninum (morfologicznie i życiowo zbliżonego do Toxoplasma gondii) stanowią poważny problem weterynaryjny; podczas gdy toksoplazma jest uważana za jedną z głównych przyczyn strat reprodukcyjnych w hodowli zwierząt, głównie owiec, kóz czy trzody chlewnej, neosporoza bydła stanowi główną przyczynę ronienia krów. Skutki uboczne obecnej terapii, lekooporność, brak skutecznych szczepionek chroniących zarówno przed rozwojem zarażeń Toxoplasma gondii, jak i Neospora caninum wymuszają potrzebę poszukiwania nowych, efektywnych środków leczniczych.

11 Studia Doktoranckie MIKROBIOLOGII, BIOTECHNOLOGII I BIOLOGII EKSPERYMENTALNEJ Dr hab. Tomasz Kowalczyk, prof. nadzw. UŁ (1 miejsce) Katedra Neurobiologii Ul. Pomorska 141/143, Pawilon Biologii Molekularnej (Budynek D), pokój Neu8d Tel ; tomasz.kowalczyk1@biol.uni.lodz.pl Tematyka rozprawy: Korelacje tylnopodwzgórzowego rytmu theta z zachowaniem zwierzęcia oraz dalsza charakterystyka neurofizjologiczna tego wzorca EEG Badania prowadzone w ramach pracy doktorskiej dotyczyć będą dalszej charakterystyki neurofizjologicznej odkrytej niedawno, przez pracowników Katedry Neurobiologii, aktywności oscylacyjnej theta rejestrowanej, lokalnie w obszarze tylnego podwzgórza (PHa). W planowanym cyklu doświadczalnym zamierzamy: - określić zdolność obszaru tylnego podwzgórza do generowania aktywności oscylacyjnej w wyniku pobudzenia różnego typu receptorów glutaminergicznych; - zbadać wpływ drażnienia receptorów kortykosteroidowych na rytm theta w obszarze PHa; - ustalić korelacje pomiędzy tylnopodwzgórzowym rytmem theta a zachowaniem zwierzęcia. Badania prowadzone będą w trzech niezależnych modelach doświadczalnych in vitro, in vivo w eksperymencie ostrym oraz in vivo w eksperymencie chronicznym.

12 Studia Doktoranckie EKOLOGI I OCHRONY ŚRODOWISKA dr hab. Michał Grabowski, prof. nadzw. UŁ (2 miejsca) Katedra Zoologii Bezkręgowców i Hydrobiologii, Zakład Biogeografii i Ekologii Bezkręgowców Ul. Banacha 12/16, Budynek A, pokój 530 Tel ; michal.grabowski@biol.uni.lodz.pl Tematyka rozprawy: Plejstoceńskie zmiany klimatyczne a ewolucja różnorodności pancerzowców wód słodkich regionu śródziemnomorskiego Rekonstrukcja filogenezy i zmian demografii modelowych gatunków skorupiaków na podstawie danych molekularnych (DNA) oraz ich interpretacja w kontekście lokalnych zmian klimatu oraz sieci hydrologicznej. Praca w ramach projektu NCN OPUS 8 "Neogeńskie i czwartorzędowe wahania poziomu morza a pochodzenie epigeicznej słodkowodnej fauny pancerzowców (Malacostraca) regionu peryadriatyckiego. Tematyka rozprawy: Wykorzystanie nowoczesnych metod taksonomii integratywnej w identyfikacji, opisie oraz klasyfikacji kryptycznych gatunków skorupiaków obunogich z Europy południowej Wykorzystanie wciąż rozwijanych metod molekularnej delimitacji gatunków w połączeniu z morfometrią geometryczną oraz analizą ultrastruktury powierzchni ciała (Scanning Electron Microscopy) w celu klasyfikacji oraz opisu dotychczas kryptycznych gatunków skorupiaków obunogich zasiedlających wody słodkie Europy południowej. Praca w ramach projektu NCN OPUS 8 "Neogeńskie i czwartorzędowe wahania poziomu morza a pochodzenie epigeicznej słodkowodnej fauny pancerzowców (Malacostraca) regionu peryadriatyckiego

13 Studia Doktoranckie EKOLOGI I OCHRONY ŚRODOWISKA dr hab. Anna Drozd, prof. nadz. UŁ (1 miejsce) Katedra Zoologii Bezkręgowców i Hydrobiologii, Zakład Biogeografii i Ekologii Bezkręgowców Ul. Banacha 12/16, Budynek A, pokój 532 Tel ; anna.drozd@biol.uni.lodz.pl Tematyka rozprawy: Ewolucja uzbrojenia muszli w liniach filogenetycznych świdrzyków z Południowo-wschodniej Azji Analiza muszli ślimaków metodami morfometrii geometrycznej oraz wizualizacje 3D na podstawie mikrotomografii komputerowej (CT). Praca w ramach projektu NCN Opus Alternatywne strategie rozrodcze (jajorodność/żyworodność) w filogenezie zróżnicowanej grupy ślimaków lądowych

14 Jeśli już wiesz, że chcesz być doktorantem - wybierz dla siebie odpowiednie miejsce, które pozwoli Ci rozwijać Twoje zainteresowania naukowe Jeśli wciąż zastanawiasz się jak pokierować swoją dalszą drogą - przyjdź i porozmawiaj; może okaże się, że studia doktoranckie to właśnie to miejsce, gdzie najlepiej zrealizujesz swoje marzenia i uzyskasz nowe umiejętności, kwalifikacje i wiedzę