Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologii

Transkrypt

1 Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologii dr hab. Piotr Ziółkowski Przegląd prac dyplomowych w Zakładach Instytutu Biologii Molekularnej i Biotechnologii

2 Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologii IBMiB Finansowanie badań

3 BIOLOGIA MOLEKULARNA BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Biochemii Z. Biotechnologii Z. Ekspresji Genów Z. Biologii Molekularnej i Z. Biotechnologii Z. Bioenergetyki Z. Eskpresji Genów Z. Genetyki Molekularnej Człowieka Z. Biochemii Z. Biologii Obliczeniowej Z. Ekspresji Genów Komórkowej Z. Genetyki Molekularnej Człowieka

4 Zakład Biologii Molekularnej i Komórkowej Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Przemysław Wojtaszek

5 Zakład Biologii Molekularnej i Komórkowej Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Przemysław Wojtaszek Skład osobowy: dr hab. Krzysztof Leśniewicz dr hab. Michał Rurek dr Anna Kasprowicz-Maluśki Kontakt tel przemow@amu.edu.pl Lokalizacja Pokoje:

6 Zakład Biologii Molekularnej i Komórkowej Tematyka badań: słowa kluczowe

7 Zakład Biologii Molekularnej i Komórkowej Przykładowe tematy prac dyplomowych Udział kompleksu gamma-sekretazy w regulacji endocytozy zwierzęcych receptorów błonowych Transformacja genetyczna organelli- osiągnięcia i perspektywy Lokalizacja tkankowa wybranych roślinnych nukleaz S1/P1

8 Zakład Ekspresji Genów Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Zofia Szweykowska-Kulińska

9 Laboratorium Ekspresji Genów Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Zofia Szweykowska-Kulińska Skład osobowy: prof. dr hab. Artur Jarmołowski dr Andrzej Pacak dr Katarzyna Kruszka dr Dorota Raczyńska dr Izabela Sierocka dr Aleksandra Świda-Barteczka dr Marcin Pieczyński dr Dawid Bielewicz dr Michał Taube dr Jakub Dolata Kontakt tel Lokalizacja Pokoje:

10 Laboratorium Ekspresji Genów Tematyka badań: słowa kluczowe

11 Zakład Ekspresji Genów Przykładowe tematy prac dyplomowych Badania nad mechanizmem regulującym alternatywny splicing. Rola splicingu w regulacji poziomu mikrorna znajdujących się w egzonach i intronach Oddziaływaniami wiążących RNA w regulacji biogenezy mikrorna Nowe elementy genetyczne odpowiedzi ziemniaka na stres suszy

12 Laboratorium Terapii Genowej Kierownik Laboratorium: dr hab. Krzysztof Sobczak, prof. UAM Skład osobowy: dr Ewa Stępniak-Konieczna dr Agnieszka Piasecka dr Patryk Konieczny Kontakt tel Lokalizacja Pokoje:

13 Laboratorium Terapii Genowej Kierownik Laboratorium: dr hab. Krzysztof Sobczak, prof. UAM Skład osobowy: dr Ewa Stępniak-Konieczna dr Agnieszka Piasecka dr Patryk Konieczny Kontakt tel Lokalizacja Pokoje:

14 Laboratorium Systemów Ewolucyjnych Kierownik Laboratorium: prof. dr hab. Borys Wróbel Kontakt tel

15 Laboratorium Systemów Ewolucyjnych Przykładowe tematy prac dyplomowych Stworzenie oprogramowania pozwalającego na analizę czynności elektrycznej mięśni Wykorzystanie sztucznych sieci genowych w robotyce ewolucyjnej Wykorzystanie analizy czynności elektrycznej mięśni w rehabilitacji Zastosowanie analizy sieci złożonych w badaniach społecznych Kontakt tel wrobel@evosys.org

16 Laboratorium Bioinformatyki Strukturalnej Kierownik Laboratorium: prof. dr hab. Janusz Bujnicki Kontakt tel

17 Laboratorium Bioinformatyki Strukturalnej Przykładowe tematy prac dyplomowych Zastosowanie potencjałów statystycznych do modelowania struktur kompleksów białkowych Rozbudowa narzędzia do wizualizacji zgodności modeli kompleksów makromolekularnych z więzami doświadczalnymi Rozwój i zastosowanie metod komputerowego modelowania struktur kompleksów białek i kwasów nukleinowych Kontakt tel iamb@genesilico.pl

18 Zakład Bioenergetyki Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Wiesława Jarmuszkiewicz

19 Zakład Bioenergetyki Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Wiesława Jarmuszkiewicz Skład osobowy: prof. dr hab. Hanna Kmita dr Nina Antos-Krzemińska dr Andonis Karachitos dr Olgierd Stobienia dr Małgorzata Wojtkowska dr Andrzej Woyda-Płoszczyca Kontakt tel Lokalizacja Pokoje:

20 Zakład Bioenergetyki Tematyka badań: słowa kluczowe

21 Zakład Bioenergetyki Przykładowe tematy prac dyplomowych Ocena statusu energetycznego komórek drożdży Saccharomyces cerevisiae pozbawionych funkcjonalnego białka YVDAC Ocena przepuszczalności błony zewnętrznej izolowanych mitochondriów drożdży Saccharomyces cerevisiae w warunkach braku funkcjonalnego białka YVDAC2 Nadekspresja CuZnSOD w komórkach drożdży Saccharomyces cerevisiae pozbawionych funkcjonalnego białka VDAC1

22 Zakład Biochemii Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Mikołaj Olejniczak

23 Zakład Biochemii Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Mikołaj Olejniczak Skład osobowy: dr Aneta Piechalak dr Joanna Wojtera dr Arleta Małecka dr Zuzanna Wróblewska Kontakt tel Lokalizacja Pokoje:

24 Zakład Biochemii Tematyka badań: słowa kluczowe

25 Zakład Biochemii Przykładowe tematy prac dyplomowych Przygotowanie konstruktów reporterowych do badań regulacji translacji białek błonowych przez niekodujące RNA bakterii Klonowanie, nadekspresja i oczyszczanie bakteryjnych białek opiekuńczych Mechanizm działania niekodujących RNA bakterii w regulacji translacji mrna wybranych genów reporterowych u E.coli

26 Zakład Biotechnologii Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Jan Sadowski

27 Laboratorium Inżynierii Białek Kierownik Laboratorium: dr hab. Agnieszka Ludwików Kontakt tel Lokalizacja Pokoje: 1.90 i 1.101

28 Laboratorium Inżynierii Białek Kierownik Laboratorium: dr hab. Agnieszka Ludwików Kontakt tel Lokalizacja Pokoje: 1.90 i 1.101

29 Laboratorium Inżynierii Białek Przykładowe tematy prac dyplomowych Mechanizmy degradacji kinazy kaskady MAP- MAPKKK18 przez proteasom 26S Rola modyfikacji potranslacyjnych w regulacji stabilności białek Charakterystyka procesu formowania łańcuchów poliubikwitynowych

30 Laboratorium Remodelowania Chromatyny i Rekombinacji Kierownik Laboratorium: dr hab. Piotr Ziółkowski Kontakt tel pzio@amu.edu.pl Lokalizacja Pokoje: 1.92 i

31 Laboratorium Remodelowania Chromatyny i Rekombinacji Kierownik Laboratorium: dr hab. Piotr Ziółkowski Kontakt tel pzio@amu.edu.pl Lokalizacja Pokoje: 1.92 i

32 Laboratorium Remodelowania Chromatyny i Rekombinacji Przykładowe tematy prac dyplomowych Edycja genomu przy wykorzystaniu techniki CRISPR/Cas9 do pozyskania mutantów w genach związanych z rekombinacją mejotyczną Mapowanie czynników kontrolujących częstość rekombinacji mejotycznej u Arabidopsis thaliana Antyrekombinacyjna funkcja genów systemu MMR (mismatch repair)

33 Zakład Genetyki Molekularnej Człowieka Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Hans Bluijssen

34 Zakład Genetyki Molekularnej Człowieka Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Hans Bluijssen Skład osobowy: Prof. UAM dr hab. Joanna Wesoły dr Katarzyna Kluzek dr Adrian Paul Silesian Kontakt tel Lokalizacja Pokoje:

35 Zakład Genetyki Molekularnej Człowieka Tematyka badań: słowa kluczowe

36 Zakład Genetyki Molekularnej Człowieka Przykładowe tematy pracy dyplomowych Mutacje w guzach jasnokomórkowego raka nerki Podstawy genetyczne pierwotnego nadciśnienia tętniczego Ekspresja genów STAT i SOCS u pacjentów z pierwotnym nadciśnieniem tętniczym

37 Zakład Biologii Obliczeniowej Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Wojciech Karłowski

38 Zakład Biologii Obliczeniowej Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Wojciech Karłowski Skład osobowy: dr Maciej Szymański dr Marek Żywicki dr Andrzej Zieleziński Kontakt tel Lokalizacja Pokoje:

39 Zakład Biologii Obliczeniowej Przykładowe tematy pracy dyplomowych Wykorzystanie technologii nowej generacji do analizy transkryptomów Identyfikacja genów uzyskanych na drodze Horyzontalnego Transferu Biologia strukturalna cząsteczek RNA Wizualizacja i przetwarzanie danych w biologii

40 PREZENTACJE ZNAJDZIESZ:

41 NOWA STRONA IBMiB: