Rola żelsoliny, białka wiążącego aktynę, w ruchu komórki Dr Antonina Mazur Uniwersytet Wrocławski Wydział Biotechnologii Wykaz opublikowanych prac naukowych oraz wskaźniki dokonań naukowych (załącznik 3) Wrocław, 2017 1
I. Wykaz publikacji stanowiących osiągnięcie naukowe, o którym mowa w art. 16 ust. 2 ustawy A) Tytuł osiągnięcia naukowego: Rola żelsoliny, białka wiążącego aktynę, w ruchu komórki B) Publikacje wchodzące w skład osiągnięcia naukowego: 1. Litwin, M., Mazur, A.J., Nowak, D., Mannherz, H.G., Malicka-Błaszkiewicz M.: Gelsolin in human colon adenocarcinoma cells with different metastatic potential. Acta Biochimica Polonica 56, 739-749, 2009 [IF2009 = 1,262] [15 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 20%. Opiekowałam się pierwszą autorką ówczesną doktorantką Zakładu Patologii Komórki (UWr) podczas jej kilkutygodniowego pobytu w Zakładzie, gdzie wykonywałam pracę doktorską (RUB, Niemcy). Polegało to na pomocy przy wykonywanych eksperymentach opisanych w pracy. Miałam także udział w dyskusji nad wynikami i manuskryptem. 2. Mazur, A.J., Gremm, D., Dansranjavin, T., Litwin, M., Jockusch, B.M., Wegner, A., Weeds, A.G., Mannherz, H.G.: Modulation of actin filament dynamics by actin binding proteins residing in lamellipodia. European Journal of Cell Biology 89, 402-413, 2010 [IF2010 = 3,630] [25 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 50%. Przygotowałam część plazmidów kodujących białka wiążące aktynę, uzyskałam oraz oczyściłam część rekombinowanych białek wykorzystanych w pracy, wykonałam eksperymenty polegające na transfekcji komórek, obserwacjach mikroskopowych i analizach Western blotting. Brałam udział w przygotowaniu rycin, pisaniu manuskryptu oraz jego korekcie zgodnie z uwagami recenzentów. 3. Mannherz, H.G., Mazur, A.J., Jockusch, B.: Repolymerisation of Actin from Actin:Thymosin beta 4 complex induced by diaphanous related formins and gelsolin. Annals of the New York Academy of Sciences 1194, 36-43, 2010 [IF2010 = 2,847] [40 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 40%. Przygotowałam część plazmidów kodujących białka wiążące aktynę, uzyskałam oraz oczyściłam część rekombinowanych białek wykorzystanych w pracy, uzyskałam -aktynę z mięśni szkieletowych królika, która była wykorzystana do testów polimeryzacji aktyny. Ponadto wykonałam eksperymenty polegające na transfekcji komórek i obserwacjach mikroskopowych. Miałam udział w 2
przygotowaniu rycin, pisaniu manuskryptu oraz jego korekcie zgodnie z uwagami recenzentów. 4. Litwin, M., Nowak, D., Mazur, A.J., Baczyńska D., Mannherz, H.G., Malicka-Blaszkiewicz, M.: Gelsolin affects the migratory ability of human colon adenocarcinoma and melanoma cells. Life Sci. 90, 851-61, 2012 [IF2012 = 2,555] [25 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 20%. Opiekowałam się pierwszą autorką ówczesną doktorantką Zakładu Patologii Komórki (UWr) podczas jej kilkutygodniowego pobytu w Zakładzie, gdzie wykonywałam pracę doktorską (RUB, Niemcy). Polegało to na pomocy przy wykonywanych eksperymentach opisanych w pracy. Ponadto dla celów pracy uzyskałam 2 plazmidy kodujące cytoplazmatyczną żelsolinę ze znacznikiem EGFP (zielone białko fluorescencyjne) na N- lub C-końcu. Miałam także udział w dyskusji nad wynikami i manuskryptem. 5. Mazur A.J.*, Morosan-Puopolo G., Makowiecka A., Malicka-Błaszkiewicz M., Nowak D., Brand-Saberi B.: Analysis of gelsolin expression pattern in developing chicken embryo reveals high GSN expression level in tissues of neural crest origin Brain Structure and Function 221, 515-436, 2016 (online 2014) [IF2014 = 5,618] [45 punktów MNiSW] *autor korespondencyjny Mój udział procentowy szacuję na 80%. Praca była w całości finansowana z grantu HOMING Plus przyznanego przez Fundację na rzecz Nauki Polskiej, którego byłam kierowniczką. Pomysł i koncepcja badań były moje. Przeprowadziłam 80% eksperymentów, przygotowałam ryciny, napisałam w całości manuskrypt i przeprowadziłam jego korektę zgodnie z uwagami recenzentów. Sprawowałam opiekę nad trzecią autorką pracy magistrantką Aleksandrą Makowiecką. 6. Mazur A.J.*, Radaszkiewicz T., Makowiecka A., Malicka-Błaszkiewicz M., Mannherz H.G., Nowak D.: Gelsolin interacts with LamR, hnrnp U, nestin, Arp3 and β-tubulin in human melanoma cells as revealed by immunoprecipitation and mass spectrometry. European Journal of Cell Biology 95, 26-41, 2016 [IF2015/2016 = 4,011] [25 punktów MNiSW] *autor korespondencyjny Mój udział procentowy szacuję na 70%. Praca była w całości finansowana z grantu HOMING Plus przyznanego przez Fundację na rzecz Nauki Polskiej, którego byłam kierowniczką. Pomysł i koncepcja badań były moje. Przeprowadziłam 50% eksperymentów, przygotowałam ryciny, napisałam w całości manuskrypt i przeprowadziłam jego korektę zgodnie z uwagami recenzentów. Sprawowałam opiekę nad drugim autorem pracy magistrantem Tomaszem Radaszkiewiczem oraz trzecią autorką pracy magistrantką Aleksandrą Makowiecką. 3
7. Makowiecka A., Simiczyjew A., Nowak D., Mazur A.J.*: Varying effects of EGF, HGF and TGFβ on formation of invadopodia and invasiveness of melanoma cell lines of different origin. European Journal of Histochemistry 60, 230-238, 2016 [IF2015/2016 = 2,421] [15 punktów MNiSW] *autor korespondencyjny Mój udział procentowy szacuję na 60%. Praca była w połowie finansowana z grantu HOMING Plus przyznanego przez Fundację na rzecz Nauki Polskiej, którego byłam kierowniczką. Pomysł i koncepcja badań były moje. Przeprowadziłam część eksperymentów, przygotowałam wybrane ryciny, uczestniczyłam w pisaniu manuskryptu i jego korekcie zgodnie z uwagami recenzentów. Sprawowałam opiekę nad pierwszą autorką pracy doktorantką Aleksandrą Makowiecką. Sumaryczny Impact Factor (JCR): 22,344 Sumaryczna ilość punktów MNiSW: 190 II. Wykaz innych (nie wchodzących w skład osiągnięcia wymienionego w pkt I) opublikowanych prac naukowych oraz wskaźniki dokonań naukowych A) Publikacje naukowe w czasopismach znajdujących się w bazie Journal Citation Reports (JRC) 1. Dąbrowska K, Buś R., Mazur A., Weber-Dąbrowska B., Mulczyk M., Górski A.: Current clinical application of bacteriophages and perspectives for their genetic modifications. Pol Arch Med Wewn. 105, 85-90, 2001 [IF2001 = brak] [30 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 20%. Napisałam część podrozdziałów tej pracy przeglądowej. 2. Theiss C., Mazur A., Meller K., Mannherz H.G.: Changes in gap junction organization and decreased coupling during induced apoptosis in lens epithelial and NIH-3T3 cells. Experimental Cell Research 313, 28-52, 2007 [IF2007 = 3,695] [30 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 35%. Przeprowadziłam wszystkie analizy Western blotting oraz testy biochemiczne mające na celu zmierzenie aktywności kaspazy-3, a także wykonałam barwienia mające na celu detekcję relokacji fosfatydyloseryny w obrębie błony komórkowej. Brałam także udział w przygotowywaniu części rycin oraz pisaniu i korekcie manuskryptu zgodnie z uwagami recenzentów. 4
3. Mazur, A.J., Nowak, D., Mannherz, H.G., Malicka-Blaszkiewicz, M.: Methotrexate induces apoptosis in CaSki and NRK and influences the organization of their actin cytoskeleton. European Journal of Pharmacology 613, 24-33, 2009 [IF2009 = 2,585] [30 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 45%. Wraz z dr hab. Dorotą Nowak wykonałam eksperymenty zawarte w pracy, uczestniczyłam w formułowaniu celów badawczych, pisaniu manuskryptu oraz jego korekcie zgodnie z uwagami recenzentów. 4. Nowak, D., Mazur, A.J., Popow-Woźniak, A., Radwańska, A., Mannherz, H.G., Malicka- Blaszkiewicz, M.: Subcellular distribution and expression of cofilin and ezrin in human colon adenocarcinoma cell lines with different metastatic potential. European Journal of Histochemistry 54, 59-66, 2010 [IF2010 = 1,809] [15 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 15%. Polegał on na pomocy w przeprowadzeniu badań mikroskopowych zawartych w pracy, uczestnictwie w pisaniu manuskryptu oraz jego korekcie. 5. Machaidze, G., Sokoll, A., Shimada, A., Lustig, A., Mazur, A.J., Wittinghofer, A., Aebi, U., Mannherz H.G.: Actin Filament Bundling and Different Nucleating Effects of Mouse Diaphanous-Related Formin FH2 Domains on Actin:ADF and Actin:Cofilin Complexes. Journal of Molecular Biology 403, 529-45, 2010 [IF2010 = 4,008] [30 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 15%. Uczestniczyłam w wykonaniu części eksperymentów polegających na obserwacjach mikroskopowych oraz analizie Western blotting. 6. Bechara, F.G., Mannherz, H.G., Jacob, M., Mazur A.J., Sand, M., Altmeyer, P., Hoffmann, K.: Induction of fat cell necrosis in human fat tissue after treatment with phosphatidylcholine and deoxycholate. Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology 26, 180-185, 2012 [IF2012 = 2,694] [35 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 15%. Wykonałam eksperymenty mające na celu oszacowanie poziomu aktywności kaspazy-3. 7. Müller M.*, Mazur A.J.*, Behrmann E., Diensthuber R.P., Radke M.B., Qu Z., Littwitz C., Raunser S., Schoenenberger C.A., Manstein D.J., Mannherz H.G.: "Functional characterization of the human α-cardiac actin mutations Y166C and M305L involved in hypertrophic cardiomyopathy. Cell Mol Life Sci. 69, 3457-79, 2012 *-autorzy równorzędni [IF2012 = 5,615] [40 punktów MNiSW] 5
Mój udział procentowy szacuję na 40%. Uczestniczyłam w formułowaniu celów badawczych, wykonałam eksperymenty polegające na uzyskaniu konstruktów plazmidowych i adenowirusowych kodujących wyznakowane znacznikiem hemaglutyninowym warianty -aktyny z mięśnia sercowego. Wszystkie eksperymenty na hodowlach komórkowych były wykonane przeze mnie. Brałam również udział w pisaniu manuskryptu oraz jego korekcie zgodnie z uwagami recenzentów. 8. Popow-Woźniak, A., Mazur A.J., Mannherz H.G., Malicka-Błaszkiewicz M., Nowak, D.: Cofilin overexpression affects actin cytoskeleton organization and migration of human colon adenocarcinoma cells. Histochemistry and Cell Biology 138, 725-36, 2012 [IF2012 = 2,613] [30 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 20%. Polegał on na pomocy merytorycznej w trakcie eksperymentów mających na celu transfekcje komórek raka jelita grubego LS180 plazmidami zawierającymi konstrukty EGFP-kofilina, uczestnictwie w dyskusji nad manuskryptem oraz jego korekcie. 9. Schönichen A., Mannherz H.G., Behrmann E., Mazur A.J., Kühn S., Silván U., Schoenenberger C.A., Fackler O.T, Raunser S., Dehmelt L., Geyer M.: FHOD1 is a combined actin filament capping and bundling factor that selectively associates with actin arcs and stress fibers Journal of Cell Science 126, 189-1901, 2013 [IF2013 = 5,325] [35 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 10%. Wykonałam część eksperymentów zaprezentowanych w pracy polegających na transfekcji komórek i obserwacjach mikroskopowych. Uczestniczyłam także w dyskusji nad manuskryptem. 10. Al Haj A., Mazur A.J., App C., Theiss C., Silván U., Schonenberger C.-A., Jockusch B.M., Hannappel E., Weeds A.G. and Mannherz H.G: Thymosin beta4 inhibits ADF/cofilin stimulated F-actin cycling and HeLa cell migration: Reversal by active Arp2/3 complex. Cytoskeleton 71, 95-107, 2014 [IF2014 = 3,116] [20 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 25%. Przeprowadziłam część eksperymentów polegających na transfekcjach komórek nowotworowych, obserwacjach mikroskopowych oraz testach zarastania rysy. Przygotowałam również część rycin i uczestniczyłam w korekcie manuskryptu zgodnie z uwagami recenzentów. 11. Simiczyjew A., Mazur A.J., Popow-Woźniak A., Malicka-Błaszkiewicz M., Nowak D.: Effect of overexpression of - and -actin isoforms on actin cytoskeleton organization and migration of human colon cancer cells. Histochemistry and Cell Biology 142, 307-322, 2014 [IF2014 = 3,054] [30 punktów MNiSW] 6
Mój udział procentowy szacuję na 30%. Uzyskałam część konstruktów DNA kodujących białka fuzyjne AcGFP- i AcGFP- aktynę. Przeprowadziłam reakcje PCR w czasie rzeczywistym, których rezultaty znalazły się na rycinach 1 i 2. Ponadto uczestniczyłam w przygotowaniu części rycin, pisaniu manuskryptu oraz jego korekcie zgodnie z uwagami recenzentów. 12. Chelmońska-Soyta A., M. Ozgo M., Lepczynski A., Herosimczyk A., Buska-Pisarek K., Kedzierska A., Nowak D., Mazur A.J.: Proteome of Spleen CD4 Lymphocytes in Mouse Preimplantation Pregnancy. Journal of Physiology and Pharmacology 65, 719-731, 2014 [IF2014 = 2,386] [25 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 10%. Brałam udział w interpretacji części wyników oraz pisaniu fragmentu dyskusji manuskryptu. 13. Al Haj A., Mazur A.J., Radaszkiewicz K., Radaszkiewicz T., Makowiecka A., Stopschinski B.E., Schönichen A., Geyer M., Mannherz H.G: Distribution of formins in cardiac muscle: FHOD1 is a component of intercalated discs and costameres. European Journal of Cell Biology 94, 101-113 2015 [IF2015 = 4,011] [25 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 35%. Uczestniczyłam w uzyskiwaniu i oczyszczaniu przeciwciał skierowanych przeciwko FHOD1, wykonałam eksperymenty polegające na transfekcji komórek nowotworowych oraz fibroblastycznych, obserwacjach mikroskopowych i analizie Western blotting. Brałam udział w formułowaniu celów badawczych, przygotowałam część rycin oraz uczestniczyłam w korekcie manuskryptu zgodnie z uwagami recenzentów. 14. Migocka-Patrzałek, Makowiecka A., Nowak D., Mazur A.J., Hofmann W.A., Malicka- Błaszkiewicz M.: - and -Actins in the nucleus of human melanoma A375 cells. Histochemistry and Cell Biology 144, 417-428, 2015 [IF2015 = 2,780] [30 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 20%. Zaprojektowałam schemat uzyskania plazmidów kodujących aktyny ze znacznikiem hemaglutyninowym w wariantach bez i z sekwencją kierującą do jądra komórkowego. Brałam udział w dyskusji nad manuskryptem i jego korekcie zgodnie z uwagami recenzentów. 15. Simiczyjew A., Mazur A.J., Ampe Ch., Malicka-Błaszkiewicz M., Van Troys M., Nowak D.: Active invadopodia of mesenchymally migrating cancer cells contain both and actin cytoplasmic actin isoforms. Experimental Cell Research 339(2), 206-219, 2015 [IF2015 = 3,378] [30 punktów MNiSW] 7
Mój udział procentowy szacuję na 15%. Mój udział polegał na uczestnictwie w dyskusji nad manuskryptem oraz jego korekcie zgodnie z uwagami recenzentów. 16. Simiczyjew A., Mazur A.J., Dratkiewicz D., Nowak D.: Involvement of - and -actin isoforms in actin cytoskeleton organization and migration abilities of bleb-forming human colon cancer cells. PLoS One, doi.org/10.1371/journal.pone.0173709, 2017 [IF2015/2016 = 3,057] [35 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 15%. Wykonałam eksperymenty polegające na reakcji PCR w czasie rzeczywistym. Brałam także udział w dyskusji nad manuskryptem i jego korekcie zgodnie z uwagami recenzentów. 17. Simiczyjew A., Pietraszek-Gremplewicz K., Mazur A.J., Nowak D.: "Are non-muscle actin isoforms functionally equivalent?" Histology and Histopathology, DOI: 10.14670/HH-11-896, 2017 [IF2015/2016 = 1,875] [25 punktów MNiSW] Mój udział procentowy szacuję na 25%. Napisałam rozdział dotyczący nowoodkrytej izoformy aktyny, actbl2 oraz przygotowałam część rycin. Brałam także udział w dyskusji nad manuskryptem. Ponadto praca ta była w części finansowana z grantu (2015/17/B/NZ3/03604) w ramach programu Opus 9 Narodowego Centrum Nauki, którego jestem Kierowniczką. Sumaryczny Impact Factor prac nie wchodzących w skład osiągnięcia (JCR): 52,001 Sumaryczna ilość punktów MNiSW prac nie wchodzących w skład osiągnięcia: 495 B) Udzielone patenty międzynarodowe i krajowe Brak C) Wynalazki oraz wzory użytkowe i przemysłowe, które uzyskały ochronę i zostały wystawione na międzynarodowych lub krajowych wystawach lub targach Brak D) Monografie, publikacje naukowe w czasopismach międzynarodowych lub krajowych innych niż znajdujące się w bazie, o której mowa w pkt II A: 1. Mannherz H.G., Mach M., Nowak D., Malicka-Blaszkiewicz M., Mazur A.: Lamellipodial and amoeboid cell locomotion: the role of actin-cycling and bleb formation. Biophysical Reviews and Letters 2, 5-22, 2007 Mój udział procentowy szacuję na 30%. Napisałam część podrozdziałów tej pracy przeglądowej. 8
E) Opracowania zbiorowe, katalogi zbiorów, dokumentacja prac badawczych, ekspertyz, utworów i dzieł artystycznych Brak F) Sumaryczny Impact Factor według listy Journal Citation Reports (JCR), zgodnie z rokiem opublikowania: 74,345 G) Liczba cytowań (bez autocytowań) publikacji według bazy Web of Science (WoS): 171 H) Indeks Hirscha (bez autocytowań) według bazy Web of Science (WoS): 10 I) Kierowanie międzynarodowymi i krajowymi projektami badawczymi oraz udział w takich projektach 1. Wykonawczyni grantu FoRUM w trakcie realizacji pracy doktorskiej, Uniwersytet Ruhry w Bochum (Niemcy), 2005 2. Kierowniczka projektu The role of nuclear localized gelsolin in cell migration, Program HOMING Plus Fundacji na rzecz Nauki Polskiej, projekt współfinansowany przez Unię Europejską z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego, 2011-2013 3. Kierowniczka projektu Charakterystyka actbl2 nowoodkrytej izoformy aktyny i jej rola w migracji i inwazji komórek ludzkiego czerniaka, Program Opus 9 Narodowego Centrum Nauki, 2016-2019 4. Kierowniczka projektu Badanie roli żelsoliny i tworzonych przez nią kompleksów z LamR i ILK w adhezji do lamininy i migracji/adhezji komórek prawidłowych i nowotworowych, Program Sonata Bis 6 Narodowego Centrum Nauki, 2017-2022 J) Międzynarodowe i krajowe nagrody za działalność naukową albo artystyczną 1. Dwukrotnie FEBS Bursary Winner stypendium na udział w konferencjach FEBS (Federation of European Biochemical Societies): Integrated Approaches in Cytoskeleton Research, Luxemburg, Luxemburg, 2005 i FEBS Congress: Mechanisms in Biology, St. Petersburg, Rosja, 2013 2. Stypendium DAAD (German Academic Exchange Service) na pobyt w laboratorium Prof. Hansa Georga Mannherza, Zakład Anatomii i Embriologii, Uniwersytet Ruhry w Bochum, Niemcy, 2004-2005 9
3. 2-gie miejsce w konkursie na najlepszy plakat na warsztatach FEBS/ECF: Mechanics and dynamics of the cytoskeleton, Potsdam, Niemcy, 22-26.06.2008 4. Stypendium Fundacji na rzecz Nauki Polskiej w ramach programu HOMING PLUS, współfinansowanego ze środków Unii Europejskiej z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego, 2011-2013 5. Stypendium SKILLS Fundacji na Rzecz Nauki Polskiej. Celem projektu było doskonalenie kwalifikacji w zakresie zarządzania projektami i zespołami badawczymi, rozwój umiejętności z zakresu komunikacji naukowej i kształtowanie postaw proinnowacyjnych. 2012 6. 2 stypendia naukowe otrzymywane w ramach projektu Rozwój potencjału i oferty edukacyjnej Uniwersytetu Wrocławskiego szansą zwiększenia konkurencyjności Uczelni, współfinansowanego ze środków Unii Europejskiej z Europejskiego Funduszu Społecznego, 2012 i 2013 7. Nagroda zespołowa za osiągnięcia naukowe w 2014r. przyznana przez Rektora UWr w 2015r. 8. Finalistka nagrody Iuvenes Wratislaviae w 2016r. Nagrody Wrocławskiego Oddziału Polskiej Akademii Nauk za wybitne osiągnięcie naukowe lub artystyczne. K) Wygłoszenie referatów na międzynarodowych i krajowych konferencjach tematycznych 1. Cardiovascular Seminar, Uniwersytet Ruhry w Bochum, Niemcy. Tytuł prezentacji ustnej brzmiał: Behaviour of mutant cardiac actins after transfection into various cell lines. 11.07.2005 2. 29-te coroczne spotkanie German Society for Cell Biology, Braunschweig, Niemcy. Tytuł prezentacji ustnej brzmiał: Transfected cardiac actin mutants cause nuclear actin aggregates. 30.03.2006 3. Konferencja naukowa Science polish perspectives, reprezentowanie polskiego środowiska naukowego z ramienia Fundacji na rzecz Nauki Polskiej z dziedziny Nauk Przyrodniczych, Oxford University, Wielka Brytania. Tytuł prezentacji ustnej brzmiał: On the way to understand what gelsolin does in the cell nucleus. 20.10.2012 10
11