Inżynieria Biomedyczna studia stacjonarne drugiego stopnia

Transkrypt

1 Lista wygenerowania w dniu: [#4368] Katedra Poza EAIiIB- dla Kierunku prof. dr hab. inż. Andrzej Chwojnowski Zbadanie właściwości membran półprzepuszczalnych ulegających częściowej biodegradacji (Examine the properties of semi-permeable membranes undergoing partial biodegradation) Wykonanie membran półprzepuszczalnych według przyjętego protokołu. Zbadanie właściwości transportowych membran przed i po degradacji: przepuszczalność hydrauliczna punkt odcięcia, oraz określenie konta zwilżania. Wykonanie dokumentacji SEM membran. Opracowanie statystyczne otrzymanych ów Podstawowa umiejętność pracy w laboratorium chemicznym. Kandydat/ka nie może być uczulony/a na rozpuszczalniki organiczne. Praca w laboratorium chemicznym co najmniej 3 dni w tygodniu przez 6-7 miesięcy.

2 [#4369] Katedra Poza EAIiIB- dla Kierunku dr inż. Małgorzata Dębowska Analiza parametrów organizmu pacjenta poddawanego dializom na podstawie pomiarów bioimpedancyjnych (Body composition in patients on hemodialysis: analysis based on bioimpedance measurements) W ramach pracy dyplomowej należy przeanalizować pomiary dokonane urządzeniem Body Composition Monitor(BCM, Fresenius, Germany). Obecnie Pracownia Modelowania Matematycznego Systemów Biomedycznych, przy której będzie realizowana praca dyplomowa, jest w posiadaniu ponad 00 pomiarów BCM u pacjentów hemodializowanych. Należy zbadać korelacje pomiędzy wieloczęstotliwościową bioimpedancją mierzoną przez BCM, a innymi parametrami, jak objętość wody pozakomórkowej i całkowitej, parametry składu organizmu(masa chudej tkanki, masa tkanki tłuszczowej, i in.) przed i po zabiegu hemodializy dla dializy po długiej(3-dniowej) i krótkiej(2- dniowej) przerwie między dializami. Należy również przebadać zależności między parametrami raportowanymi przez BCM, a innymi parametrami pacjenta, jak wiek, płeć, czas na dializie i in. Szczególny nacisk będzie położony na opis zmian stanu przewodnienia pacjenta przed i po zabiegu hemodializy przy pomocy bezpośrednio mierzonej bioimpedancji. Od oczekuje się podstawowej wiedzy z zakresu bioimpedancji(zasady pomiaru, działania na liczbach zespolonych) oraz podstawowej wiedzy z zakresu statystyki(badanie korelacji, regresja). Praca może być napisana również w języku angielskim.

3 [#4370] [#4285] Katedra Poza EAIiIB- dla Kierunku dr inż. Annamonika Dulewicz Ocena wpływu uwzględnienia hiperchromazji jąder komórek nowotworowych na wzrost czułości i specyficzności onkologicznej diagnostyki komputerowej w urologii (The impact assessment of taking into account hyperchromasia of nuclei tumor cells on increase of the sensitivity and specificity of cancer computer diagnostics in urology) - należy zdefiniować sposób pomiaru wielkości hiperchromazji jąder komórkowych, - pomierzyć zdefiniowany parametr hyperchromazji w jądrach komórek nowotworowych i jądrach komórek nienowotworowych, - zaimplementować sposób pomiaru zdefiniowanego parametru w systemie komputerowym i zintegrować pomiar zdefiniowanego parametru z systemem klasyfikującym, - ocenić wpływ uwzględnienia nowego parametru na czułość i specyficzność diagnostycznego systemu komputerowego Bardzo dobra znajomość programowania w języku C/ C ++, C#,NETFramework4.0. Niezbędny co najmniej dwumiesięczny pobyt w Warszawie w celu wykonania pomiarów mikroskopowych i przeprowadzenia integracji opracowanego algorytmu z system komputerowym. Katedra Automatyki i Inżynierii Biomedycznej dr inż. Adam Głowacz Rozpoznawanie obrazów dwóch ran ciętych ręki z zastosowaniem wybranych metod przetwarzania (Recognitionofimagesoftwoincisedwoundsofarmwithapplication of selected processing methods) W pracy zostanie zrealizowany system rozpoznawania obrazów dwóch ran ciętych ręki człowieka. Zaproponowany system będzie oparty na metodach ekstrakcji cech i klasyfikacji. Wyniki pracy powinny zawierać analizę skuteczności rozpoznawania proponowanego systemu. Umiejętność posługiwania się programem MATLAB

4 [#4402] [#333] Katedra Automatyki i Inżynierii Biomedycznej dr inż. Adam Głowacz Rozpoznawanie obrazów rany szarpanej palca serdecznego z zastosowaniem wybranych metod przetwarzania (Recognition of images of laceration of ring finger with application of selected processing methods) W pracy zostanie zrealizowany system rozpoznawania obrazów rany szarpanej palca serdecznego człowieka. Zaproponowany system będzie oparty na metodach ekstrakcji cech i klasyfikacji. Wyniki pracy powinny zawierać analizę skuteczności rozpoznawania proponowanego systemu. Umiejętność posługiwania się programem MATLAB Katedra Automatyki i Inżynierii Biomedycznej dr inż. Adam Głowacz Rozpoznawanie obrazów siniaka mięśnia zginacza promieniowego nadgarstka z zastosowaniem wybranych metod przetwarzania (Recognition of images of bruise of flexor carpi radialis muscle with application of selected processing methods) W pracy zostanie zrealizowany system rozpoznawania obrazów siniaka mięśnia zginacza promieniowego nadgarstka. Zaproponowany system będzie oparty na metodach ekstrakcji cech i klasyfikacji. Wyniki pracy powinny zawierać analizę skuteczności rozpoznawania proponowanego systemu. Umiejętność posługiwania się programem MATLAB

5 [#4288] [#4289] Katedra Automatyki i Inżynierii Biomedycznej dr inż. Adam Głowacz Rozpoznawanie obrazów termowizyjnych stłuczenia mięśnia piszczelowego przedniego z zastosowaniem wybranych metod przetwarzania (Recognition of thermal images of bruise of tibialis anterior muscle with application of selected processing methods) W pracy zostanie zrealizowany system rozpoznawania obrazów termowizyjnych mięśnia piszczelowego przedniego człowieka. Zaproponowany system będzie oparty na metodach ekstrakcji cech i klasyfikacji. Wyniki pracy powinny zawierać analizę skuteczności rozpoznawania proponowanego systemu. Umiejętność posługiwania się programem MATLAB Katedra Automatyki i Inżynierii Biomedycznej dr inż. Adam Głowacz Rozpoznawanie obrazów zakażenia mięśnia naramiennego przedniego z zastosowaniem wybranych metod przetwarzania (Recognition of images of infection of deltoid muscle with application of selected processing methods) W pracy zostanie zrealizowany system rozpoznawania obrazów zakażenia mięśnia naramiennego przedniego człowieka. Zaproponowany system będzie oparty na metodach ekstrakcji cech i klasyfikacji. Wyniki pracy powinny zawierać analizę skuteczności rozpoznawania proponowanego systemu. Umiejętność posługiwania się programem MATLAB

6 [#437] [#437] Katedra Poza EAIiIB- dla Kierunku dr Elżbieta Olejarczyk Badania architektury połączeń funkcjonalnych w mózgu u osób chorych na depresję lub schizofrenię: analiza sygnałów EEG przy użyciu liniowych i nieliniowych miar oraz indeksów opartych na teorii grafów (Functional brain connectivity analysis in persons with depression or schizophrenia: analysis of EEG signals using linear and nonlinear methods and indexes based on graph theory). Zapoznanie się z metodami rejestracji i wstępnego przetwarzania sygnałów EEG- szkolenia, seminaria, konsultacje z neurofizjologiem. 2. Zapoznanie się z metodami analizy EEG pod kierunkiem opiekuna pracy i wykonanie obliczeń korzystając z danych rejestrowanych u osób chorych na depresję lub schizofrenię oraz w grupie kontrolnej. 3. Wykonanie analizy statystycznej otrzymanych ów przy użyciu programu STATISTICA. 4. Przygotowanie pracy magisterskiej. 5. Wygłoszenie seminarium w IBIB PAN. Umiejętność programowania w środowisku Matlab, umiejętność posługiwania się programem STATISTICA. Katedra Poza EAIiIB- dla Kierunku dr inż. Kinga Pielichowska Akrylanowe cementy kostne o obniżonej temperaturze wiązania (Acrylic bone cements with reduced curing temperature) W ramach proponowanej pracy planuje się zbadanie wpływu wybranych materiałów fazowo-zmiennych na podstawowe właściwości akrylanowych cementów kostnych(temperatura i czas wiązania, ciepło wiązania, mikrostruktura, właściwości mechaniczneitd.). -

7 [#4270] [#427] Katedra Metrologii i Elektroniki dr inż. Andrzej Skalski Dopasowanie obrazów medycznych przy brakujących lub niekompletnych danych (Medical image registration with partial or missing data) W pracy planuje się wykonanie przeglądu literaturowego dotyczącego problematyki dopasowania obrazów medycznych w sytuacji niekompletności danych. Niekompletność danych może być związana przykładowo z usunięciem zmiany nowotworowej. Wybrane algorytmy zostaną zaimplementowane i przetestowane na rzeczywistych danych tomograficznych pacjentek z nowotworem piersi. bierna znajomość języka angielskiego, podstawy przetwarzania obrazów, umiejętność programowania Matlab i/lub C++ Katedra Metrologii i Elektroniki dr inż. Andrzej Skalski Wyodrębnianie cech charakterystycznych dla potrzeb detekcji zmian nowotworowych z obrazowych danych medycznych (Feature Extraction for cancer detection in medical images) W pracy planuje się wykonanie przeglądu literaturowego dotyczącego cech charakterystycznych w kontekście detekcji zmian nowotworowych w obrazowych danych medycznych. Wybrane cechy zostaną zaimplementowane i wykorzystane w procesie klasyfikacji wokseli. Finalnym efektem będzie system informatyczny umożliwiający np. detekcję zmian nowotworowych w obrębie nerki. bierna znajomość języka angielskiego, umiejętność programowania w języku Matlab i/lub C++ i/lub Python

8 [#4373] Katedra Poza EAIiIB- dla Kierunku dr Joanna Stachowska-Piętka Matematyczne modelowanie transportu wody i substancji w tkance nowotworowej (Mathematical modeling of water and solute transport in solid tumors) W u pracy powstanie opis matematyczny umożliwiający badanie właściwości transportowych w tkance nowotworowej, w tym między innymi głębokości wnikania cząsteczek wody oraz substancji o znaczeniu medycznym jak np. leków, w zależności od lokalnej fizjologii tkanki. Opis matematyczny powstanie w oparciu o istniejące modele transportu w tkance uwzględniające lokalną fizjologię tkanki, oraz bazując na dostępnych danych literaturowych dotyczących różnic w lokalnej fizjologii tkanki nowotworowej oraz zdrowej. Zaproponowany model zostanie zaimplementowany w środowisku umożliwiających symulacje równań różniczkowych cząstkowych. Otrzymane i numeryczne dotyczące transportu w wybranych guzach zostaną scharakteryzowane oraz porównane z dostępnymi danymi eksperymentalnymi. Model umożliwi zrozumienie lokalnej fizjologii transportu w tkance nowotworowej, oraz wpływu poszczególnych czynników na efektywny transport wody oraz substancji. Modele bazujące na lokalnej fizjologii mogą być również wykorzystywane do poprawy efektywności badanej terapii. Znajomość języka angielskiego, podstawowa wiedza dotyczącą implementacji modelu matematycznego, mile widziana znajomość środowiska Matlab. Możliwa jest również praca w języku angielskim.

9 [#4374] Katedra Poza EAIiIB- dla Kierunku dr Joanna Stachowska-Piętka Matematyczny model transportu wody i substancji przez ścianę naczynia krwionośnego pod wpływem różnicy ciśnienia osmotycznego (Mathematical model of fluid and solute transport across the capillary wall due to the osmotic pressure difference) W u pracy powstanie model matematyczny opisujący transport wody oraz substancji pomiędzy krwią płynącą w naczyniu włosowatym, a otaczającą je tkanką(model Krogh a). Opis matematyczny powstanie w oparciu o istniejący model przepływu pomiędzy krwią, a otaczającą je tkanką. Zaproponowany model zostanie zaimplementowany w środowisku umożliwiającym symulacje numeryczne, a parametry modelu zostaną wybrane na podstawie dostępnych danych literaturowych. Otrzymane i numeryczne dotyczące transportu wody oraz substancji zostaną porównane z danymi eksperymentalnymi. Model umożliwi zrozumienie lokalnej fizjologii transportu przez ścianę naczynia krwionośnego, oraz wpływu poszczególnych czynników na efektywny transport wody oraz substancji pomiędzy krwioobiegiem a otaczające je tkanką. Uzyskane dzięki niemu i mogą przyczynić się do wyjaśnienia zjawisk fizjologicznych obserwowanych eksperymentalnie. Znajomość języka angielskiego, podstawowa wiedza dotyczącą implementacji modelu matematycznego, w pracy konieczne będzie wykorzystanie programu Comsol lub innego podobnego środowiska. Możliwa jest również praca w języku angielskim.

10 [#4375] Katedra Poza EAIiIB- dla Kierunku dr inż. Beata Toczyłowska Automatyczna analiza widm NMR płynów ustrojowych (Automatic analysis of NMR spectra of biofluids) Zakres prac: - zaproponowanie algorytmu identyfikacji metabolitów w widmie NMR, - przygotowanie aplikacji działającej w środowisku Windows, - sprawdzenie poprawności działania aplikacji. Wynikiem pracy powinien być przegląd dostępnych rozwiązań problemu, działająca aplikacja dokonujący automatycznej analizy wybranych metabolitów. Umiejętność programowania. Wymagane podpisanie umowy przekazania praw własności na przygotowaną aplikację.