Seminarium Wpływ realizacji studyjnych wizyt na rozwój kompetencji zawodowych kadry akademickiej

Transkrypt

1 Seminarium Wpływ realizacji studyjnych wizyt na rozwój kompetencji zawodowych kadry akademickiej Projekt POKL /09 pt. Rozszerzenie i udoskonalenie oferty edukacyjnej skierowanej do osób spoza uczelni oraz podwyższanie jakości nauczania i kompetencji kadry akademickiej w ramach PO Kapitał Ludzki współfinansowany ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego Małgorzata Dmitryjuk 13 wrzesień 2011 rok sala Rady Wydziału Biologii, ul. Oczapowskiego 1A

2 Zadanie 6. "Studyjne wizyty krajowe i zagraniczne dla kadry naukowej Wydziału Biologii UWM" Celem wizyt studyjnych było poznanie nowoczesnych metod kształcenia, poszerzenie wiedzy teoretycznej i praktycznej o najnowsze osiągnięcia w zakresie dziedzin nauczanych na Wydziale Biologii, na terenie krajowych i zagranicznych ośrodków akademickich oraz naukowo-badawczych. Wydział Biologii, Katedra Biochemii Liczba wizyt studyjnych krajowych i zagranicznych pracowników Katedry Biochemii w ramach zad. 6: Rodzaj wyjazdu Wyjazd 1- tygodniowy Wyjazd 2- tygodniowy Krajowe 5 2 Zagraniczne 0 5

3 Tematyka wizyt studyjnych pracowników Katedry Biochemii 1. Metody izolacji, analizy i sekwencjonowania kwasów nukleinowych: - dr Regina Frączek- Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie oraz Laboratoria CDC w Atlancie (USA); - dr Elżbieta Łopieńska-Biernat i dr Małgorzata Dmitryjuk Uniwersytet Medyczny w Łodzi oraz Berry College (USA). 2. Spekrometria masowa: - analiza lipofilowych tiakwasów karboksylowych - dr Janusz Wasilewski Czeska Akademia Nauk, Praga; - połączenie kapilarnej chromatografii cieczowej oraz spektrometrii masowej - dr Edyta Sienkiewicz- Szłapka Akademia Górniczo- Hutniczna w Krakowie; - analiza proteomów roślinnych - dr Ewa Szypulska Politechnika Łódzka oraz University of Cordoba, Hiszpania. 3. Chromatografia kwasów tłuszczowych i związków lipofilowych: - prof. dr hab. Kazimierz Zalewski Politechnika Gdańska; - dr Janusz Wasilewski Uniwersytet Marii Curie-Skłodowskiej w Lublinie.

4 Wyjazdy krajowe 1-tygodniowe Zakład Zoologii, Uniwersytet Marii Curie- Skłodowskiej w Lublinie Specyfika badań -pomiary lipofilowe związków organicznych za pomocą chromatografii cienkowarstwowej z odwróconym układem faz. Katedra Chemii, Technologii i Biotechnologii Żywności, Wydział Chemiczny, Politechnika Gdańska Specyfika badań - ekstrakcja lipidów z różnego typu matryc biologicznych (tkanki roślinne i zwierzęce, mleko ludzkie, produkty spożywcze). Pracownia Biologii Molekularnej i Farmakogenomiki, Zakład Biochemii Farmaceutycznej, Wydział Farmaceutyczny Uniwersytetu Medycznego w Łodzi Specyfika badań - diagnostyka medyczna w oparciu nowoczesne metody biologii molekularnej, Real Time PCR, sekwencjonowanie autmatyczne i analiza mikromacierzy. Katedra Biochemii i Neurobiologii, Akademia Górniczo-Hutnicza w Krakowie Specyfika badań chemia peptydów i białek, spektrometria mas, neurofarmakologia.

5 Dr Janusz Wasilewski Poznane/stosowane metody: pomiary lipofilowe związków organicznych za pomocą chromatografii cienkowarstwowej z odwróconym układem faz: - aplikacja próbek na warstwę chromatograficzną (wykonanie chromatogramów dla 15 związków lipofilowych) - metody rozwijania chromatogramu (testowanie różnych płytek chromatograficznych oraz rozpuszczalników organicznych) - obsługa densytometru Shimadzu CS obsługa wideokamery do archiwizacji chromatogramów Reprostar 3 z oprogramowaniem wincats i VideoScan firmy CAMAG Efekty: - wzbogacenie oferty dydaktycznej przedmiotu CHEMIA ORGANICZNA na kierunku biologia, biotechnologia oraz CHEMIA ANALITYCZNA I SRODOWISKOWA i CHEMIA ORGANICZNA na specjalności Zarządzanie Zasobami Przyrody; - nabycie umiejętności wykorzystywanych w pracy badawczej. Zakład Zoologii, Uniwersytet Marii Curie-Skłodowskiej w Lublinie

6 Prof. dr hab. Kazimierz Zalewski Poznane/stosowane metody: 1. Metylacja kwasów tłuszczowych wg polskiej normy PN-EN:ISO-5509 z użyciem trifluorku boru. 2. Oznaczanie kwasów tłuszczowych metodą wysokorozdzielczej chromatografii gazowej (HR-GC). Katedra Chemii, Technologii i Biotechnologii Żywności, Wydział Chemiczny, Politechnika Gdańska Spodziewane efekty: poszerzenie warsztatu badawczego o nowoczesne metody analizy kwasów tłuszczowych oraz wzbogacenie oferty dydaktycznej przedmiotu PRACOWNIA LIPIDÓW na kierunku Biologia oraz CHEMIA OGÓLNA I SRODOWISKOWA oraz CHEMIA ORGANICZNA na specjalności Zarządzanie Zasobami Przyrody.

7 Dr Elżbieta Łopieńska-Biernat Dr Małgorzata Dmitryjuk Uniwersytet Medyczny w Łodzi Poznane/stosowane metody kształcenia; zagadnienia poszerzające wiedzę teoretyczną i/lub praktyczną: 1. Real-time PCR z wykorzystaniem SYBR GREEN: - metoda z wykorzystaniem krzywej standardowej; - metoda podwójnej delty. 2. Real-time PCR z wykorzystaniem specyficznych sond molekularnych. 3. Sekwencjonowanie automatyczne produktów PCR za pomocą sekwenatora płytowego. Spodziewane efekty: zastosowanie powyższych metod w badaniach własnych oraz wzbogacenie oferty dydaktycznej przedmiotu BIOCHEMIA na kierunku Biologia, Biotechnologia i przedmiotu BIOCHEMIA Środowiskowa na specjalności Zarządzanie Zasobami Przyrody. dr Ewa Balcerczak Pracownia Biologii Molekularnej i Farmakogenomiki, Zakład Biochemii Farmaceutycznej, Wydział Farmaceutyczny Uniwersytetu Medycznego w Łodzi ul. Muszyńskiego Łódź

8 Dr Edyta Sienkiwicz-Szłapka Katedra Biochemii i Neurobiologii, Akademia Górniczo-Hutnicza w Krakowie Poznane/stosowane metody: połączone metody kapilarnej chromatografii cieczowej oraz spektrometrii masowej. Efekty: wprowadzenie lub modyfikacja technik wysokosprawnej chromatografii cieczowej i/lub spekroskopii mas w zakresie kształcenia praktycznego studentów w ramach kursów: BIOCHEMII, BIOCHEMII w KOSMETOLOGII, PRACOWNI PEPTYDÓW I BIAŁEK, PROTEOMIKI oraz PRACOWNI MAGISTERSKIEJ realizowanych w Katedrze Biochemii (kierunki: Biologia, Biotechnologia, Lekarski) oraz przedmiotu BIOCHEMIA ŚRODOWISKOWA na specjalności Zarządzanie Zasobami Przyrody.

9 Wyjazdy krajowe 2-tygodniowe Wydział Biologii i Hodowli Zwierząt Katedra Biologicznych Podstaw Produkcji Zwierzęcej, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Specyfika -badania molekularne dotyczące m. in. polimorfizmu wybranych sekwencji mikrosatelitarnych oraz analizy PCR- RFLP genów u zwierząt i owadów użytkowych (głównie pszczół). Zakład Biofizyki, Instytut Inżynierii Materiałowej, Politechnika Łódzka Specyfika badań - ocena skutków wywołanych przez produkty nanotechnologii w żywych organizmach - zastosowanie technik proteomiki i genomiki.

10 Dr Regina Frączek Poznane/stosowane metody: 1. Izolacja DNA z krwi pełnej, piór i tkanek organizmów zwierzęcych. 2. Reakcja PCR-RAPD. 3. Sekwencjonowanie genomów, EST. Efekty: wzbogacenie własnego warsztatu badawczego oraz oferty dydaktycznej przedmiotu BIOCHEMIA na kierunku Biologia, Biotechnologia i przedmiotu BIOCHEMIA ŚRODOWISKOWA na specjalności Zarządzanie Zasobami Przyrody. Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Wydział Biologii i Hodowli Zwierząt Katedra Biologicznych Podstaw Produkcji Zwierzęcej,

11 Dr Ewa Szupulska Poznane/stosowane metody: 1. Sposoby oczyszczania materiału biologicznego przed rozdziałem 2D. 2. Znakowanie białek barwnikami fluorescencyjnymi (Cy3 i Cy5). 3. Róznicowa elektroforeza żelowa (Difference Gel Electrophoresis DIGE). 4. Analiza proteomu z zastosowaniem tandemowego spektrometru mas ESI-Q-TOF. Zakład Biofizyki, Instytut Inżynierii Materiałowej, Politechnika Łódzka Efekty: zdobycie wiedzy teoretycznej i praktycznej, która zostanie wykorzystana w realizacji wykładów i ćwiczeń w ramach przedmiotu PROTEOMIKA na kierunku Biotechnologia oraz specjalności Zarządzanie Zasobami Przyrody.

12 Wyjazdy zagraniczne 2-tygodniowe Berry College School of Mathematical and Natural Science, Mount Berry, Georgia, USA Departament Parazytologiczny Federalnego Laboratorium CDC w Atlancie, USA Instytut Chemii Organicznej i Biochemii,Czeska Akademia Nauk, Praga, Czechy Department of Biochemistry and Molecular Biology,University of Cordoba,Cordoba, Spain

13 Uczestnictwo w konferencji The 71st Annual Meeting of the Association of Southeastern Biologists, Southeastern Society of Parasitologists w Asheville (North Carolina) Dr Elżbieta Łopieńska-Biernat Dr Małgorzata Dmitryjuk Berry College School of Mathematical and Natural Science, Mount Berry, Georgia 30149, USA Poznane/stosowane metody: 1. Izolacja RNA i DNA z tkanek organizmów zwierzęcych. 2. Reakcja odwróconej transkrypcji pozyskiwanie cdna. 3. Reakcja PCR oraz klonowanie, RDA. 5. Hodowle in vitro Trypanosoma, Malaria. 6. Metody immunofluorescencji w parazytologii. Efekty: - Doniesienie: Małgorzata Dmitryjuk and Elżbieta Łopieńska- Biernat. April The expression of trehalose 6- phosphate synthase gene in Ascaris suum tissues. Southeastern Biology Vol. 57, Number 2, p Nawiązanie współpracy z pracownikami laboratorium CDC w Atlancie dr Normanem Pieniążkiem. - Zaproszenie prof. Davida Bruce a Conn a do przeprowadzenia cyklu wykładów na Wydziale Biologii w 2011 roku. - wzbogacenie własnego warsztatu badawczego oraz oferty dydaktycznej przedmiotu BIOCHEMIA na kierunku Biologia, Biotechnologia i przedmiotu BIOCHEMIA ŚRODOWISKOWA NA specjalności Zarządzanie Zasobami Przyrody. Wizyta w Departamencie Parazytologicznym Federalnego Laboratorium CDC w Atlancie i udział w seminarium prof. Davida, Bruce a Conn a "Potential Roles of Insects and Bivalve Molluscs in the Epidemiology of Cryptosporidium, Giardia, and Microsporidia" Staż w laboratorium Dr Christopher a Hall a izolacja tkanek śledziony, serca i mięśni myszy zarażonych Trypanosoma cruzi, metody izolacji DNA, reakcja PCR, wizualizacja w żelu agarozowym produktów reakcji PCR, interpretacja uzyskanych wyników; hodowla in vitro Trypanosoma cruzi. Staż w laboratorium Dr Michael a Morgan a ekstrakcja RNA koralowców Trizolem, przeprowadzanie reakcji odwróconej transkrypcji, PCR, RDA- analiza różnicowa, klonowanie, EST, wizualizacja produktów reakcji PCR oraz interpretacja wyników.

14 Dr Regina Frączek Poznane/stosowane metody: 1. Izolacja RNA i DNA z tkanek organizmów zwierzęcych. 2. Reakcja odwróconej transkrypcji pozyskiwanie cdna. 3. Reakcja PCR oraz klonowanie, RDA. 4. Sekwencjonowanie genomów, EST. Centrs for Disease Control and Prevention (CDC), Atlanta, USA Efekty: - Wzbogacenie własnego warsztatu badawczego oraz oferty dydaktycznej przedmiotu BIOCHEMIA na kierunku Biologia, Biotechnologia i przedmiotu BIOCHEMIA ŚRODOWISKOWA na specjalności Zarządzanie Zasobami Przyrody. - Nawiązanie współpracy z pracownikami laboratorium CDC (dr Normanem Pieniążkiem).

15 Dr Janusz Wasilewski Poznane/stosowane metody: 1. Wykonywanie widm masowych (przygotowywanie próbek, obsługa spektrometru masowego Reflex IV z analizatorem czasu przelotu jonów -TOF). 2. Obsługa chromatografu gazowego 6890N Agilent wyposażonego w detektor masowy 5975B MSD. 3. Obróbka i analiza widm masowych (programy: Bruker Daltonics flex Analysis 3.0 oraz MSD Chem Station 2006). 4. Zastosowanie metody MALDI-TOF do badania związków małocząsteczkowych na przykładzie lipofilowych tiakwasów karboksylowych. Instytut Chemii Organicznej i Biochemii, Czeska Akademia Nauk, Praga, Czechy Efekty: - wzbogacenie oferty dydaktycznej przedmiotu CHEMIA ORGANICZNA na kierunku Biologia, Biotechnologia i przedmiotach CHEMIA OGÓLNA I ŚRODOWISKOWA oraz CHEMIA ORGANICZNA na specjalności Zarządzanie Zasobami Przyrody oraz nabycie umiejętności wykorzystywanych w pracy badawczej - Wykorzystanie spektrometru masowego Autoflex III Maldi-TOF/TOF w Laboratorium diagnostyki molekularnej Wydziału Biologii UWM do wspomagania nauczania studentów Wydziału Biologii oraz w badaniach własnych.

16 Dr Ewa Szupulska Poznane/stosowane metody: 1. Metody izolowania i oczyszczania proteomu roślinnego (hodowla w warunkach stresu biotycznego). 2. Rozdział 2D proteomu. 3. Barwienie fluorescencyjne Sypro ruby. 4. Analiza spektrometrii mas : TOF, kwadrupol i pułapka jonowa, techniki jonizacji: Maldi i ESI. Department of Biochemistry and Molecular Biology, University of Cordoba, Cordoba, Spain Efekty: zdobycie wiedzy teoretycznej i praktycznej, która zostanie wykorzystana w realizacji wykładów i ćwiczeń w ramach przedmiotu PROTEOMIKA na kierunku Biotechnologia, specjalność Biotechnologia Roślin oraz specjalności Zarządzanie Zasobami Przyrody.

17 Projekt POKL /09 pt. Rozszerzenie i udoskonalenie oferty edukacyjnej skierowanej do osób spoza uczelni oraz podwyższanie jakości nauczania i kompetencji kadry akademickiej w ramach PO Kapitał Ludzki współfinansowany ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego DZIĘKUJĘ ZA UWAGĘ