Geny Hox jako regulatory rozwoju zarodkowego i markery molekularne w badaniach filogenetycznych u Heteroptera stan obecny i perspektywy dalszych badań
|
|
- Kornelia Bielecka
- 7 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Heteroptera Poloniae Acta Faunistica vol. 11: Opole, 31 VIII 2017 ISSN X Artykuł przeglądowy Review article Geny Hox jako regulatory rozwoju zarodkowego i markery molekularne w badaniach filogenetycznych u Heteroptera stan obecny i perspektywy dalszych badań ANNA ZIELIŃSKA Katedra Biosystematyki, Uniwersytet Opolski, Opole, ul. Oleska 22 aniaj88@gmail.com Abstract. [Hox genes as embryonic development regulators and phylogenetic markers in Heteroptera the current state of knowledge and future prospects]. The Homeotic Complex (Hox) genes are a group of genes, which expression along anteriorposterior body axis of the embryo is required to assign segmental identity. Comparison of wild-type individuals and those with homeotic phenotype has resulted in knowing of the functions of heteropteran Hox genes: Deformed gene expression is necessary for proper mandibular development, Sex combs reduced gene with Dfd specify the maxillae, and with pb the labium, Antennapedia gene is strongly expressed in thorax and it is required for segmentation of the medial region of the leg, while Ultrabithorax has a major influence on diversification of legs in the adaptive radiation of semi-aquatic bugs. Hox genes are also suitable molecular markers to resolve phylogenetic relationships in Heteroptera, however more studies are necessary. Key words: Hemiptera, Heteroptera, Hox genes, molecular marker, phylogeny, review. Wstęp Geny homeotyczne (Hox) to grupa genów, których ekspresja przebiega wzdłuż osi przednio-tylnej zarodka, określając na terenie komórek sposób, w jaki mają one formować struktury właściwe dla danego obszaru ciała owada (ryc. 1; Angelini i in. 2005). Odkąd odkryto zmutowane osobniki Drosophila melanogaster (Meigen, 1830), trwają intensywne badania nad poznaniem funkcji genów Hox (Lewis 1978). U Drosophila są one zgrupowane w dwa połączone ze sobą klastery, gdzie ich pozycja na chromosomie jest zgodna z kolejnością ekspresji wzdłuż osi przód-tył zarodka, mianowicie są to geny (rozpoczynając od najbardziej wysuniętego): labial (lab), proboscipedia (pb), Deformed (Dfd), Sex combs reduced (Scr), Antennapedia (Antp), Ultrabithorax (Ubx), abdominal-a (abd-a), Abdominal-B (Abd-B) (Hughes i Kaufman 2002). W trakcie analizy ortologów genów Hox wyizolowanych z różnych gatunków zwierząt (zarówno stawonogów, jak i kręgowców) odkryto, że kodują one wysoce konserwatywne czynniki transkrypcyjne zawierające homeodomenę. Natomiast badania funkcji genów Hox przeprowadzono głównie u przedstawicieli Holometabola (D. melanogaster, Tribolium castaneum (Herbst, 1979), Bombyx mori (Linnaeus, 1758)) zróżnicowanego kladu, obejmującego rzędy owadów, które osiągają postać dorosłą poprzez metamorfozę (Beeman i in. 1989; Hughes i Kaufman 2002; Nagata i in. 1996). Zastosowanie modelu gatunków holometabolicznych do badań nad funkcjami genów Hox u bardziej prymitywnych owadów wobec tego nie jest zasadne, możemy je jednak poznać dzięki możliwościom, jakie daje proces interferencji RNA (RNAi; Angelini i in. 2005). Mutacje w obrębie genów Hox prowadzą do zmiany właściwości danego obszaru ciała, dając tym samym fenotyp homeotyczny. Porównanie takiego fenotypu z typem dzikim uławia poznanie funkcji danego genu (Angelini i in. 2005; Hughes i Kaufman 2000), co pozwala na wykorzystanie sekwencji genów Hox w różnego typu badaniach u pluskwiaków różnoskrzydłych (Heteroptera). Gen labial Ekspresja genu labial u Oncopeltus fasciatus ogranicza się do segmentu interkalarnego głowy. Zastosowanie interferencji RNA tego genu nie wykazało żadnego efektu fenotypowego w trakcie rozwoju głowy tego pluskwiaka. Może to sugerować, że obecność genu lab nie jest warunkiem koniecznym do prawidłowego rozwoju głowy lub wynik jego ekspresji jest bardzo nieznaczny (Angelini i in. 2005).
2 38 Geny Hox Głowa Akron Segment antenalny Segment interkalarny Segment żuwaczkowy Segment szczękowy Segment wargi dolnej T1 (odnóża) lab pb Dfd Scr Antp Ubx abd-a Abd-B Of Np Of Np Of Np Of Np Of Np Of Np Of Np Of Np Tułów T2 (odnóża, hemelytra) T3 (odnóża, skrzydła) A1 (pleuro-podia) Odwłok A2 A3 A4 A5 A6 A7 A8 (segment genitalny) A9 (segment genitalny) A10 (segment terminalny) A11 (segment terminalny) Ryc. 1. Schemat ekspresji genów homeotycznych w początkowym stadium rozwoju zarodkowego pluskwiaków Oncopeltus fasciatus (Of) i Nysius plebeius (Np); na podstawie wyników badań Angelini i in. (2005) oraz Matsuura i in. (2015) [Fig. 1. Scheme of Oncopeltus fasciatus (Of) and Nysius plebeius (Np) Hox genes expression; based on Angelini et al. (2005) and Matsuura et al. (2015)]. Gen proboscipedia Ekspresja genu proboscipedia u O. fasciatus jest zauważalna jedynie w segmencie wargi dolnej. RNAi tego genu powoduje przekształcenie części dystalnej wargi dolnej w odnóża przedtułowia, natomiast stłumienie jednocześnie aktywności genów pb i Scr przekształca wargę dolną w parę czułków tego zjawiska nie obserwuje się podczas RNAi każdego z tych genów osobno (Hughes i Kaufman 2000). Badania Angelini i in. (2005) wykazały, że u godzinnych zarodków ekspresja genu pb jest zależna od obecności Scr, natomiast nie dotyczy to już zarodków 120 h, u których gen ten nie ma wpływu na aktywność proboscipedia. Gen Deformed Ekspresja genu Deformed ma miejsce w segmentach żuwaczkowym i szczękowym głowy O. fasciatus (Angelini i in. 2005).
3 39 RNAi genu Dfd prowadzi do przekształcenia żuwaczek w struktury przypominające części dystalne czułków z krótką, szeroką nasadą. Segment szczękowy natomiast po stłumieniu działania Dfd przypomina również części dystalne czułków, z tą różnicą, że są one krótkie i zakręcone do tyłu. Wynika z tego, że obecność genu Dfd jest konieczna do prawidłowego rozwoju żuwaczek (Hughes i Kaufman 2000). Gen Sex combs reduced Badania dotyczące aktywności genu Sex combs reduced wymagają kontynuacji do tej pory nie udało się ustalić jednoznacznie funkcji jaką sprawuje u pluskwiaków, ponieważ niezwykle trudne jest usunięcie go ze wszystkich komórek ciała owada (Angelini i in. 2005; Hughes i Kaufman 2000). Niemniej jednak, poznano jego wpływ na inne geny Hox. Scr jest konieczny do aktywności genu proboscipedia u godzinnych zarodków O. fasciatus (Angelini i in. 2005). Gen Scr wraz z genem Dfd odpowiada za prawidłowe wykształcenie segmentu szczękowego, natomiast z genem pb współdziała przy rozwoju wargi dolnej zastosowanie metody RNAi w obu przypadkach prowadzi do przekształcenia w czułki odpowiednio szczęk (Dfd Scr) i wargi dolnej (pb Scr) (Hughes i Kaufman 2000). Gen Antennapedia Gen Antennapedia wykazuje silną ekspresję w obrębie tułowia pluskwiaków O. fasciatus i Nysius plebeius (Distant, 1883), zwłaszcza w jego tylnej części, a słabszą w przednich segmentach odwłoka (Angelini i in. 2005; Matsuura i in. 2015). Aktywność tego genu jest czynnikiem koniecznym w procesie segmentacji środkowych części odnóży oraz specyfikacji ich części proksymalnej, środkowej i dystalnej (Herke i in. 2005). W części środkowe i dystalnej dochodzi do niej poprzez hamowanie aktywności kofaktora transkrypcyjnego homothorax (hth) (Casares i Mann 2001; Yao i in. 1999). RNAi genu Antp prowadzi do wielu transformacji przydatków tułowia. Przykładowo, gdy Antp jest hamowany, aktywuje się hth wówczas rozbudowywana jest część dystalna odnóża i rozwijają się przydatki przypominające czułki, jednak posiadające na końcu przedstopie zakończone pazurami (Casares i Mann 2001; Struhl 1981, 1982). Badania Herke i in. (2005) wykazały, że aktywność genu Antennapedia jest konieczna do rozwoju segmentów dystalnych i środkowych odnóży, jednak nie jest wymagana w przypadku części proksymalnej i przedstopia. Analizowano również wpływ genów Hox na rozwój bakteriocytów u N. plebeius, gdzie wykazano, że tłumienie genu Antp wpływa na lokalizację bakteriomu z endosymbiotycznymi bakteriami w organizmie tego pluskwiaka. Bakteriomy były zlokalizowane w segmencie T3 tułowia, w tylnych odnóżach oraz w segmentach A1 i A2 odwłoka. Może to świadczyć o tym, że gen Antp ujemnie reguluje różnicowanie bakteriocytów w segmentach T3 i A1 w trakcie embriogenezy N. plebeius (Matsuura i in. 2015). Gen Ultrabithorax Gen Ultrabithorax odpowiada za różnice morfologiczne pomiędzy segmentami tułowia owadów oraz reguluje długość odnóży wielu gatunków (Khila i in. 2009; Khila i in. 2014). U O. fasciatus ekspresja genu Ubx jest najsilniejsza w segmentach T3 i A1, a im bliżej końca odwłoka, tym jest ona słabsza (Angelini i in. 2005; Liu i Kaufman 2004; Khila i in. 2009), natomiast u N. plebeius największą aktywność Ubx odnotwano w segmencie A1 (Matsuura i in., 2015). Gen Ultrabithorax odgrywa bardzo ważną rolę zwłaszcza w rozwoju pluskwiaków infrarzędu Gerromorpha. Główną różnicą pomiędzy tymi pluskwiakami, a blisko spokrewnionymi z nimi Heteroptera lądowymi jest aktywność genu Ubx w drugim segmencie tułowia i znaczna jego ekspresja w segmencie trzecim. Zmiany te są powiązane z długością odnóży pluskwiaków infarzędu Gerromorpha (Armisen i in. 2015). Ubx pełni istotną funkcję w różnicowaniu się odnóży tych pluskwiaków w procesie radiacji adaptacyjnej (Khila i in. 2014). Ekspresja tego genu znacznie zwiększa długość odnóży środkowych, co w dużym stopniu przyczynia się do umiejętności tych owadów w poruszaniu się po powierzchni wody. Dalsze zmiany będące efektem działania tego genu powodują, że odnóża te pełnią funkcje wioseł, a tylne steru (Khila i in. 2014; Refki i in. 2014). Wykształcone w ten sposób odnóża są odpowiednie do skakania, co umożliwia pluskwiakom z infrarzędu Gerromorpha ucieczkę przed drapieżnikami (Armisen i in. 2015). Badania przeprowadzone przez Matsuurę i in. (2015) wykazały, że obecność genu Ultrabithorax jest kluczowa dla rozwoju bakteriocytów u pluskwiaka N. plebeius. Supresja Ubx skutkowała zniknięciem czerwono napigmentowanych bakteriocytów i powiązanej z nimi lokalizacji symbiontów. U osobników kontrolnych symbionty skupiały się w części brzusznej, skąd migrowały do bakteriocytów. Natomiast w zarodkach z wytłumionym genem Ubx symbionty były rozproszone, po czym zanikały (Matsuura i in. 2015).
4 40 Gen Abdominal-A Ekspresja genu Abdominal-A u O. fasciatus przebiega od tylnej części segmentu A1 do segmentu A10, przy czym jest ona najsilniejsza w segmentach A2-A7. Ten wzór ekspresji jest bardziej zbliżony do tego występującego u gatunków Thermobia domestica (Packard, 1873) i Tribolium castaneum (Herbst, 1797), niż do D. melanogaster (Angelini i in. 2005). Usunięcie genu abd-a u Oncopeltus prowadzi do całkowitej utraty pigmentacji po stronie brzusznej odwłoka (Sharma i in. 2016), natomiast u N. plebeius zaburza organizację przestrzenną bakteriocytów w odwłoku tego pluskwiaka (Matsuura i in. 2015). Gen Abdominal-B Ekspresja genu Abdominal-B u O. fasciatus jest najsilniejsza w segmencie A10 i w przedniej części A11. Jej natężenie jest słabsze w segmentach A4-A9. Interferencja RNA tego genu prowadzi do utraty wielu cech charakterystycznych dla tylnej części odwłoka na rzecz tych właściwych dla jego części przedniej, między innymi występuje brak pigmentacji w segmencie A10, a odwłok ma zmieniony kształt w porównaniu z osobnikami nie poddanymi RNAi (Angelini in. 2005). Gen Abd-B wpływa na określenie segmentów odwłoka, w których zajdzie melanizacja, a proces ten jest niewrażliwy na zmiany temperatury, jednak częściowo wykształcają się fenokopie właściwe dla tych wymuszonych przez niskie temperatury (Sharma i in. 2016). Geny Hox jako markery molekularne w badaniach nad filogenezą Heteroptera Geny Hox są konserwatywne już na poziomie zwierząt dwubocznie symetrycznych, a ich przydatność jako markerów molekularnych w rekonstrukcji filogenezy na wyższych poziomach taksonomicznych wykazywano wielokrotnie (np., de Rosa i in. 1999; Peterson 2004). Ewolucja sekwencji i funkcji genów homeotycznych odpowiada zmianom w budowie ciała zwierząt, co pozwala sądzić, że mutacje tych genów i odpowiadające im zmiany w morfologii zwierząt mogą być ewolucyjnie powiązane (Tian i in. 2011). Użyteczność genów Hox w rekonstrukcji filogenezy Heteroptera sprawdzono do tej pory jedynie dla dwóch infrarzędów, tzn. Pentatomomorpha (w oparciu o 6 genów Hox; Tian i in. 2011) i Nepomorpha (4 geny Hox; Li i in. 2012). Do badań pokrewieństwa u Pentatomomorpha wybrano eksony sześciu genów: abd-a, Dfd, pb, Scr i Ubx o wielkości pz. Otrzymane wyniki (ryc. 2) pozwoliły na wyodrębnienie każdej analizowanej nadrodziny, co jest zgodne z drzewami opartymi na danych morfologicznych, w wielu przypadkach również tych uzyskanych na podstawie innych markerów molekularnych (różnice najprawdopodobniej wynikają z tego, że w badaniach część nadrodzin nie została uwzględniona). Ryc. 2. Relacje filogenetyczne w obrębie Pentatomomorpha w oparciu o fragmenty sześciu genów Hox, z Cimicomorpha jako grupą zewnętrzną (na podstawie wyników badań Tian i in. 2011) [Fig. 2. Phylogenetic relationships within Pentatomomorpha based on six Hox gene fragments, with Cimicomorpha as outgroup (based on Tian et al. 2011)]. Gatunki należące do Aradoidea tworzą nierozwiązane politomie, jednak nie zaprzecza to określeniu Pentatomomorpha jako taksonu monofiletycznego, natomiast podkreśla szczególny charakter Aradoidea, która posiada liczne autapomorfie (Tian i in. 2011). Otrzymany wynik pokrewieństwa w kladzie Trichophora jest zgodny z wcześniejszymi badaniami nad jego filogenezą (wyraźne rozgałęzienie pomiędzy Pentatomoidea i pozostałymi nadrodzinami), natomiast wśród Eutrichophora układ ((Pyrrhocoroidea + Coreoidea) + Lygaeoidea) potwierdza hipotezę, że obecność czteropłatowego gruczołu ślinowego jest morfologiczną synapomorfią łączącą nadrodziny Pyrrhocoroidea i Coreoidea. Powyższe wnioski wskazują, że sekwencje genów Hox są użytecznym markerem w badaniach nad pokrewieństwem pluskwiaków, a skuteczne zastosowanie u Heteroptera starterów zaprojektowanych zgodnie z modelem uzyskiwania sekwencji genów Hox u Endopterygota sugeruje, że ta metoda może być wykorzystywana do badań nad filogenezą pozostałych grup owadów (Tian i in. 2011). Rekonstrukcję filogenezy Nepomorpha przeprowadzono w oparciu o cztery geny homeotyczne: abd-a, Dfd, Ubx i pb. Wyniki tych analiz jednoznacznie wydzielały Nepomorpha jako takson monofiletyczny, jednak ze względu na zbyt dużą liczbę indeli i miejsc zmiennych wykorzystanie sekwencji nukleotydowych do przedstawienia pokrewieństwa w obrębie Nepo-
5 41 morpha byłoby mało wiarygodne. Obiecujące wyniki otrzymano jednak w oparciu o sekwencje aminokwasowe (ryc. 3). (4 geny Hox), bazując na genomach niewielkiej liczby gatunków. Zasadnym wydaje się więc przeprowadzenie badań z zastosowaniem sekwencji wszystkich genów homeotycznych do analiz filogenetycznych w obrębie podrzędu Heteroptera z wykorzystanie dużej liczby gatunków reprezentujących wszystkie jego infrarzędy. Podziękowania Autorka pragnie podziękować Panu prof. Jerzemu Lisowi (Samodzielna Katedra Biosystematyki, Uniwersytet Opolski) oraz anonimowemu recenzentowi za uwagi do tekstu. Piśmiennictwo References Angelini D., Liu P., Hughes C., Kaufman T Hox gene function and interaction in the milkweed bug Oncopeltus fasciatus (Hemiptera). Developmental Biology 287: Armisen D., Refki P., Crumiere A., Viala S., Toubiana W., Khila A Predator strike shapes antipredator phenotype through new genetic interactions in water striders. Nature Communications 6:8153. Ryc. 3. Relacje filogenetyczne w obrębie Nepomorpha w oparciu o fragmenty czterech genów Hox, z Cimicomorpha, Leptopodomorpha i Cicadomorpha jako grupą zewnętrzną (na podstawie Min i in. 2012) [Fig. 3. Phylogenetic relationships within Nepomorpha based on four Hox gene fragments, with Cimicomorpha, Leptopodomorpha and Cicadomorpha as outgroup (based on Tian et al., 2011)]. Każda z badanych nadrodzin na otrzymanym drzewie filogenetycznym cechuje się monofiletyzmem (Li i in. 2012). Topologia drzewa pokrywa się z wieloma wcześniejszymi badaniami (Mahner 1993; Štys i Jannson 1988). Nowością jest tutaj obecność w Notonectoidea jedynie rodziny Notonectidae i wyodrębnienie kladu Pleoidea + Naucoroidea jako jej grupy siostrzanej. Powyższe rezultaty wskazują na to, że geny Hox mogą być wykorzystywane do rekonstrukcji filogenezy Neopomorpha na poziomie rodziny i nadrodziny (Li i in. 2012), a w połączeniu z wynikami uzyskanymi przez Tian i in. (2011) dla Pentatomomorpha można przypuszczać, że będą odpowiednie do analiz filogenetycznych w obrębie całego podrzędu Heteroptera. Perspektywy Do tej pory nie wykorzystano w pełni potencjału genów Hox jako markerów molekularnych do badań nad pokrewieństwem w obrębie podrzędu pluskwiaków różnoskrzydłych próbowano dokonać rekonstrukcji filogenezy jedynie infrarzędów Pentatomomorpha (na podstawie fragmentów 6 genów Hox) i Nepomorpha Beeman R., Stuart J., Haas M., Denell R Genetic analysis of the homeotic gene complex (HOM-C) in the beetle Tribolium castaneum. Developmental Biology 133: Casares F., Mann R The ground state of the ventral appendage in Drosophila. Science 293: de Rosa R., Grenier J., Andreeva T., Cook C., Adoutte A., Akam M., Carroll S., Balavoine G Hox genes in brachiopods and priapulids and protostome evolution. Nature 399: Herke S., Serio N., Rogers B Functional analyses of tiptop and Antennapedia in the embryonic development of Oncopeltus fasciatus sugests an evolutionary pathway from ground state to insect legs. Development 132: Hughes C., Kaufman T RNAi analysis of Deformed, proboscipedia and Sex combs reduced in the milkweed bug Oncopeltus fasciatus: novel roles for Hox genes in the Hemipteran head. Development 127: Hughes C., Kaufman T Hox genes and the evolution of the arthropod body plan. Evolution & Development 4: Khila A., Abouheif E., Rowe L Evolution of a novel appendage ground plan in water striders is driven by changes in the Hox gene Ultrabithorax. PLoS Genetics 5(7): e
6 42 Khila A., Abouheif E., Rowe L Comparative functional analyses of Ultrabithorax reveal multiple steps and paths to diversification of legs in the adaptive radiation of semi-aquatic insects. Evolution 68: Lewis E A gene controlling segmentation in Drosophila. Nature 276: Li M., Wang J., Tian X., Xie Q., Liu H., Bu W Phylogeny of the true bugs (Hemiptera Heteroptera: Nepomorpha) based on four Hox genes. Entomotaxonomia 34: Liu P., Kaufman T Krüppel is the gap gene in the intermediate germband insect Oncopeltus fasciatus and is required for development of both blastoderm and germband-derived segments. Development 131: Ma hner M Systema cryptoceratum phylogeneticum (Insecta, Heteroptera). Zoologica 143: Matsuura Y., Kikuchi Y., Miura T., Fukatsu T Ultrabithorax is essential for bacteriocyte development. Proceedings of the National Academy of Sciences 112: Nagata T., Suzuki Y., Ueno K., Kokubo H., Xu X., Hui C., Ha ra W., F ukuta M Developmental expression of the Bombyx Antennapedia homologue and homeotic changes in the Nc mutant. Genes Cells 1: Peterson K Isolation of Hox and Parahox genes in the hemichordate Ptychodera flava and the evolution of deuterostome Hox genes. Molecular Phylogenetics and Evolution 31: Sharma A., Yanes K., Jin L., Garvey S., Taha S., Suzuki Y The phenotypic plasticity of developmental modules. EvoDevo 7: 15. Struhl G A homeotic mutation transforming leg to antenna in Drosophila. Nature 292: Struhl G Genes controlling the segmental specification in the Drosophila thorax. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States 79: Štys P., Ja nsson A Check-list of recent familygroup and genus-group names of Nepomorpha (Heteroptera) of the world. Acta Entomologica Fennica 50: Tian X., Xie Q., Li M., Gao C., Cui Y., Xi L., Bu W Phylogeny of pentatomomorphan bugs (Hemiptera Heteroptera: Pentatomomorpha) based on six Hox gene fragments. Zootaxa 2888: Yao L., Liaw G., Pai C., Sun Y A common mechanism for Antenna to leg transformation in Drosophila: Suppression of homothorax transcription by four HOM-C genes. Developmental Biology 211: This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License SUMMARY Hox genes as embryonic development regulators and phylogenetic markers in Heteroptera the current state of knowledge and future prospects The Homeotic Complex (Hox) genes are a group of genes, which expression along anterior-posterior body axis of the embryo is required to assign segmental identity. Starting with the most anterior: labial (lab), proboscipedia (pb), Deformed (Dfd), Sex combs reduced (Scr), Antennapedia (Antp), Ultrabithorax (Ubx), Abdominal-A (abd-a), Abdominal-B (Abd-B). Comparison of wild-type individuals and those with homeotic phenotype has resulted into knowing of the functions of heteropteran Hox genes. In Oncopeltus fasciatus labial expression is restricted to the intercalary segment and probably has a very subtle phenotype. Proboscipedia is expressed only in labial segment and its RNAi transforms the distal labium to prothoracic legs. Deformed gene expression is present in mandibular and maxillary segment. It is necessary for proper mandibular development. Sex combs reduced gene with Dfd specify the maxillae, and with pb the labium. Antennapedia gene is strongly expressed in thorax and it is required for segmentation of the medial region of the leg and for the specification of leg identities. Suppression of Abdominal-A leads to a complete loss of ventral abdominal pigmentation. Abdominal-B gene appears to play a role in specifying the segments where abdominal melanic bands develop. Ultrabithorax has a major influence on diversification of legs in the adaptive radiation of semi-aquatic bugs. Ubx expression much increased mid-legs length, thereby enhancing their role in water surface walking and helps using quick jump to escape predators. Hox genes were also used as phylogenetic markers to study evolutionary relationships between Pentatomomorphan species (studies based on six Hox genes) and Nepomorphan species (based on four Hox genes). The results show that Hox genes are suitable molecular markers to resolve phylogenetic relationships in Heteroptera, however more studies are necessary.
Konstruowanie drzew filogenetycznych. Magda Mielczarek Katedra Genetyki Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu
Konstruowanie drzew filogenetycznych Magda Mielczarek Katedra Genetyki Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu Drzewa filogenetyczne ukorzenione i nieukorzenione binarność konstrukcji topologia (sposób rozgałęziana
Nowe stanowisko Pinthaeus sanguinipes (Fabricius, 1781) (Hemiptera: Heteroptera: Pentatomidae) w południowo-wschodniej Polsce
Nowe stanowisko Pinthaeus sanguinipes (Fabricius, 1781) (Hemiptera: Heteroptera: Pentatomidae) w południowo-wschodniej Polsce JAROSŁAW BURY Markowa 1498, 37-120 Markowa e-mail: jarekbury2@wp.pl Abstract.
ZMIANY MIĘDZYPOKOLENIOWE WYBRANYCH CECH STUDENTEK PEDAGOGIKI UNIWERSYTETU ŁÓDZKIEGO W LATACH
S ł u p s k i e P r a c e B i o l o g i c z n e 1 2005 Małgorzata Roślak, Henryk Stolarczyk Uniwersytet Łódzki, Łódź ZMIANY MIĘDZYPOKOLENIOWE WYBRANYCH CECH STUDENTEK PEDAGOGIKI UNIWERSYTETU ŁÓDZKIEGO
Public gene expression data repositoris
Public gene expression data repositoris GEO [Jan 2011]: 520 k samples 21 k experiments Homo, mus, rattus Bos, sus Arabidopsis, oryza, Salmonella, Mycobacterium et al. 17.01.11 14 17.01.11 15 17.01.11 16
Phylum Arthropoda stawonogi Nadgromada Myriapoda wije
Phylum Arthropoda stawonogi Nadgromada Myriapoda wije Podział systematyczny stawonogów Typ Arthropoda - stawonogi dzieli się na 4 podtypy: TRILOBITOMORPHA TRYLOBITOWCE CHELICERATA (CHELICERIFORMES) SZCZĘKOCZUŁKOWCE
Mechanizmy kontroli rozwoju roślin. Rafał Archacki
Mechanizmy kontroli rozwoju roślin Rafał Archacki Drzewo życia pozycja roślin i zwierząt http://5e.plantphys.net/article.php?ch=t&id=399 Ewolucja roślin ewolucja procesu rozmnażania i rozwoju http://5e.plantphys.net/article.php?ch=t&id=399
plezjomorfie: podobieństwa dziedziczone po dalszych przodkach (c. atawistyczna)
Podobieństwa pomiędzy organizmami - cechy homologiczne: podobieństwa wynikające z dziedziczenia - apomorfie: podobieństwa dziedziczone po najbliższym przodku lub pojawiająca się de novo (c. ewolucyjnie
gen - odcinek DNA niosący informację o budowie jednego polipeptydu (czasem rodziny blisko spokrewnionych polipeptydów tzw. izoform) lub jednego
gen - odcinek DNA niosący informację o budowie jednego polipeptydu (czasem rodziny blisko spokrewnionych polipeptydów tzw. izoform) lub jednego rodzaju funkcjonalnego RNA (rrna, trna, snrna, snorna,...)
Temat: Stawonogi zwierzęta o członowanych odnóżach.
Temat: Stawonogi zwierzęta o członowanych odnóżach. Stawonogi to najliczniejsza gatunkowo grupa zwierząt występujących na Ziemi. Organizmy te żyją w wodach słodkich i słonych oraz niemal we wszystkich
Bioinformatyka Laboratorium, 30h. Michał Bereta
Bioinformatyka Laboratorium, 30h Michał Bereta mbereta@pk.edu.pl www.michalbereta.pl 1 Często dopasować chcemy nie dwie sekwencje ale kilkanaście lub więcej 2 Istnieją dokładne algorytmy, lecz są one niewydajne
Urszula Poziomek, doradca metodyczny w zakresie biologii Materiał dydaktyczny przygotowany na konferencję z cyklu Na miarę Nobla, 14 stycznia 2010 r.
Ćwiczenie 1 1 Wstęp Rozważając możliwe powiązania filogenetyczne gatunków, systematyka porównuje dane molekularne. Najskuteczniejszym sposobem badania i weryfikacji różnych hipotez filogenetycznych jest
Network Services for Spatial Data in European Geo-Portals and their Compliance with ISO and OGC Standards
INSPIRE Conference 2010 INSPIRE as a Framework for Cooperation Network Services for Spatial Data in European Geo-Portals and their Compliance with ISO and OGC Standards Elżbieta Bielecka Agnieszka Zwirowicz
Załącznik nr 2 Autoreferat Jolanta Brożek
INFORMACJE NAUKOWE O WYKSZTAŁCENIU I PRZEBIEGU ZATRUDNIENIA IMIONA: NAZWISKO: ADRES SŁUŻBOWY: Jolanta, Teresa Brożek Katedra Zoologii Wydział Biologii i Ochrony Środowiska Uniwersytet Śląski Bankowa 9,
Filogenetyka molekularna. Dr Anna Karnkowska Zakład Filogenetyki Molekularnej i Ewolucji
Filogenetyka molekularna Dr Anna Karnkowska Zakład Filogenetyki Molekularnej i Ewolucji Co to jest filogeneza? Filogeneza=drzewo filogenetyczne=drzewo rodowe=drzewo to rozgałęziający się diagram, który
Bioinformatyka wykład I.2009
Bioinformatyka wykład 13 20.I.2009 biologia systemów biologiczne dane wielowymiarowe Krzysztof Pawłowski Krzysztof_Pawlowski@sggw.pl 2009-01-22 1 Plan wykładu Biologia systemów Bazy danych ekspresji genów
ZGŁOSZENIE WSPÓLNEGO POLSKO -. PROJEKTU NA LATA: APPLICATION FOR A JOINT POLISH -... PROJECT FOR THE YEARS:.
ZGŁOSZENIE WSPÓLNEGO POLSKO -. PROJEKTU NA LATA: APPLICATION FOR A JOINT POLISH -... PROJECT FOR THE YEARS:. W RAMACH POROZUMIENIA O WSPÓŁPRACY NAUKOWEJ MIĘDZY POLSKĄ AKADEMIĄ NAUK I... UNDER THE AGREEMENT
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
ZALEŻNOŚĆ MIĘDZY WYSOKOŚCIĄ I MASĄ CIAŁA RODZICÓW I DZIECI W DWÓCH RÓŻNYCH ŚRODOWISKACH
S ł u p s k i e P r a c e B i o l o g i c z n e 1 2005 Władimir Bożiłow 1, Małgorzata Roślak 2, Henryk Stolarczyk 2 1 Akademia Medyczna, Bydgoszcz 2 Uniwersytet Łódzki, Łódź ZALEŻNOŚĆ MIĘDZY WYSOKOŚCIĄ
Budowanie drzewa filogenetycznego
Szkoła Festiwalu Nauki 134567 Wojciech Grajkowski Szkoła Festiwalu Nauki, ul. Ks. Trojdena 4, 02-109 Warszawa www.sfn.edu.pl sfn@iimcb.gov.pl Budowanie drzewa filogenetycznego Cel Ćwiczenie polega na budowaniu
PODSTAWY BIOINFORMATYKI WYKŁAD 4 DOPASOWANIE SEKWENCJI
PODSTAWY BIOINFORMATYKI WYKŁAD 4 DOPASOWANIE SEKWENCJI DOPASOWANIE SEKWENCJI 1. Dopasowanie sekwencji - definicja 2. Wizualizacja dopasowania sekwencji 3. Miary podobieństwa sekwencji 4. Przykłady programów
GENY Z SEKWENCJĄ HOMEOBOKSU A EWOLUCJA ZWIERZĄT
KOSMOS 1993,42 (3/4): str 509-522 HALINA KRZANOWSKA Zakład Genetyki i Ewolucjonizmu Instytut Zoologii UJ Kraków GENY Z SEKWENCJĄ HOMEOBOKSU A EWOLUCJA ZWIERZĄT Genetyka rozwoju przez dłljgi czas nie nadążała
OSI Transport Layer. Network Fundamentals Chapter 4. Version Cisco Systems, Inc. All rights reserved. Cisco Public 1
OSI Transport Layer Network Fundamentals Chapter 4 Version 4.0 1 OSI Transport Layer Network Fundamentals Rozdział 4 Version 4.0 2 Objectives Explain the role of Transport Layer protocols and services
1. KEGG 2. GO. 3. Klastry
ANALIZA DANYCH 1. Wykład wstępny 2. Charakterystyka danych 3. Analiza wstępna genomiczna charakterystyka cech 4. Prezentacje grup roboczych analiza wstępna 5. Prezentacje grup roboczych analiza wstępna
BAZIE KWALIFIKACJI ZAGRANICZNYCH
BAZIE KWALIFIKACJI ZAGRANICZNYCH O przewodniku Niniejszy przewodnik zawiera informacje na temat kwalifikacji uzyskanych zagranicą i porady na temat ich nostryfikacji. Dowiesz się jak korzystać z bazy danych
Recenzja rozprawy doktorskiej. mgr Marcina Jana Kamińskiego. pt. Grupa rodzajowa Ectateus (Coleoptera: Tenebrionidae) filogeneza i klasyfikacja.
Dr hab. Grzegorz Paśnik Instytut Systematyki i Ewolucji Zwierząt Polska Akademia Nauk ul. Sławkowska 17, 31-016 Kraków Recenzja rozprawy doktorskiej mgr Marcina Jana Kamińskiego pt. Grupa rodzajowa Ectateus
Ewolucja genów i genomów
Ewolucja genów i genomów The Revised Classification of Eukaryotes SAR Stramenopila Alveolata Rhizaria 2 Journal of Eukaryotic Microbiology Volume 59, Issue 5, pages 429-514, 28 SEP 2012 DOI: 10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x
ZGŁOSZENIE WSPÓLNEGO POLSKO -. PROJEKTU NA LATA: APPLICATION FOR A JOINT POLISH -... PROJECT FOR THE YEARS:.
ZGŁOSZENIE WSPÓLNEGO POLSKO -. PROJEKTU NA LATA: APPLICATION FOR A JOINT POLISH -... PROJECT FOR THE YEARS:. W RAMACH POROZUMIENIA O WSPÓŁPRACY NAUKOWEJ MIĘDZY POLSKĄ AKADEMIĄ NAUK I... UNDER THE AGREEMENT
DOI: / /32/37
. 2015. 4 (32) 1:18 DOI: 10.17223/1998863 /32/37 -,,. - -. :,,,,., -, -.,.-.,.,.,. -., -,.,,., -, 70 80. (.,.,. ),, -,.,, -,, (1886 1980).,.,, (.,.,..), -, -,,,, ; -, - 346, -,.. :, -, -,,,,,.,,, -,,,
Podstawy genetyki. Genetyka klasyczna, narzędzia badawcze genetyki
Podstawy genetyki Genetyka klasyczna, narzędzia badawcze genetyki Podręczniki } Podstawy biologii molekularnej L.A. Allison } Genomy TA Brown, wyd. 3 } Genetyka molekularna P Węgleński (red.), wyd. 2 2
Badania doświadczalne wielkości pola powierzchni kontaktu opony z nawierzchnią w funkcji ciśnienia i obciążenia
WALUŚ Konrad J. 1 POLASIK Jakub 2 OLSZEWSKI Zbigniew 3 Badania doświadczalne wielkości pola powierzchni kontaktu opony z nawierzchnią w funkcji ciśnienia i obciążenia WSTĘP Parametry pojazdów samochodowych
Dopasowanie sekwencji (sequence alignment)
Co to jest alignment? Dopasowanie sekwencji (sequence alignment) Alignment jest sposobem dopasowania struktur pierwszorzędowych DNA, RNA lub białek do zidentyfikowanych regionów w celu określenia podobieństwa;
WYDZIAŁ NAUK EKONOMICZNYCH. Studia II stopnia niestacjonarne Kierunek Międzynarodowe Stosunki Gospodarcze Specjalność INERNATIONAL LOGISTICS
Studia II stopnia niestacjonarne Kierunek Międzynarodowe Stosunki Gospodarcze Specjalność INERNATIONAL LOGISTICS Description Master Studies in International Logistics is the four-semesters studies, dedicate
BADANIA ZRÓŻNICOWANIA RYZYKA WYPADKÓW PRZY PRACY NA PRZYKŁADZIE ANALIZY STATYSTYKI WYPADKÓW DLA BRANŻY GÓRNICTWA I POLSKI
14 BADANIA ZRÓŻNICOWANIA RYZYKA WYPADKÓW PRZY PRACY NA PRZYKŁADZIE ANALIZY STATYSTYKI WYPADKÓW DLA BRANŻY GÓRNICTWA I POLSKI 14.1 WSTĘP Ogólne wymagania prawne dotyczące przy pracy określają m.in. przepisy
Planning and Cabling Networks
Planning and Cabling Networks Network Fundamentals Chapter 10 Version 4.0 1 Projektowanie okablowania i sieci Podstawy sieci Rozdział 10 Version 4.0 2 Objectives Identify the basic network media required
Nowe stanowisko Tritomegas sexmaculatus (Rambur, 1839) (Hemiptera: Heteroptera: Cydnidae) na Górnym Śląsku
Acta entomologica silesiana Vol. 23 (online 027): 1 5 ISSN 1230-7777, ISSN 2353-1703 (online) Bytom, November 30, 2015 Nowe stanowisko Tritomegas sexmaculatus (Rambur, 1839) (Hemiptera: Heteroptera: Cydnidae)
46 Olimpiada Biologiczna
46 Olimpiada Biologiczna Pracownia statystyczno-filogenetyczna Łukasz Banasiak i Jakub Baczyński 22 kwietnia 2017 r. Statystyka i filogenetyka / 30 Liczba punktów (wypełnia KGOB) PESEL Imię i nazwisko
archivist: Managing Data Analysis Results
archivist: Managing Data Analysis Results https://github.com/pbiecek/archivist Marcin Kosiński 1,2, Przemysław Biecek 2 1 IT Research and Development Grupa Wirtualna Polska 2 Faculty of Mathematics, Informatics
1 Instytut Biologii, Uniwersytet Opolski, ul. Oleska 22, Bielsko-Biała, ul. Doliny Miętusiej 27/44;
FRAGMENTA NA FORMERLY NATURE JOURNAL Opole Scientific Society ATURAE VOL. 5 51: 84 89 (2018) ISSN 2544-3941 ARADUS RIBAUTI WAGNER, 1956 (HEMIPTERA: HETEROPTERA: ARADIDAE) GATUNEK PLUSKWIAKA NOWY DLA POLSKI
Wydział Biologii Zakład Taksonomii Roślin
Recenzja pracy doktorskiej Pani mgr Katarzyny Krawczyk, stanowiącej zbiór publikacji nt. Ewolucja i taksonomia molekularna rodzaju Lamium L. w oparciu o analizę trzech genomów wykonanej w Katedrze Botaniki
Mitochondrialna Ewa;
Mitochondrialna Ewa; jej sprzymierzeńcy i wrogowie Lien Dybczyńska Zakład genetyki, Uniwersytet Warszawski 01.05.2004 Milion lat temu Ale co dalej??? I wtedy wkracza biologia molekularna Analiza różnic
DUAL SIMILARITY OF VOLTAGE TO CURRENT AND CURRENT TO VOLTAGE TRANSFER FUNCTION OF HYBRID ACTIVE TWO- PORTS WITH CONVERSION
ELEKTRYKA 0 Zeszyt (9) Rok LX Andrzej KUKIEŁKA Politechnika Śląska w Gliwicach DUAL SIMILARITY OF VOLTAGE TO CURRENT AND CURRENT TO VOLTAGE TRANSFER FUNCTION OF HYBRID ACTIVE TWO- PORTS WITH CONVERSION
Biologia molekularna z genetyką
Biologia molekularna z genetyką P. Golik i M. Koper Konwersatorium 2: Analiza genetyczna eukariontów Drosophilla melanogaster Makrokierunek: Bioinformatyka i Biologia Systemów; 2016 Opracowano na podstawie
Narzędzia programistyczne - GIT
Narzędzia programistyczne - GIT Kamil Maraś kamil.maras@gmail.com @KamilMaras Agenda Zintegrowane środowisko programistyczne Systemy kontroli wersji Narzędzia wspomagające wytwarzanie aplikacji Narzędzia
Phylum Arthropoda stawonogi
Phylum Arthropoda stawonogi Phylum Arthropoda przewyższa wszystkie inne typy pod względem: 1. różnorodności gatunkowej; 2. liczby gatunków ok. 80% wszystkich gatunków znanych zwierząt; 3. liczby osobników.
Jaki koń jest nie każdy widzi - genomika populacji polskich ras koni
Jaki koń jest nie każdy widzi - genomika populacji polskich ras koni Gurgul A., Jasielczuk I., Semik-Gurgul E., Pawlina-Tyszko K., Szmatoła T., Bugno-Poniewierska M. Instytut Zootechniki PIB Zakład Biologii
Ćwiczenie 5/6. Informacja genetyczna i geny u różnych grup organizmów. Porównywanie sekwencji nukleotydowych w bazie NCBI z wykorzystaniem BLAST.
Ćwiczenie 5/6 Informacja genetyczna i geny u różnych grup organizmów. Porównywanie sekwencji nukleotydowych w bazie NCBI z wykorzystaniem BLAST. Prof. dr hab. Roman Zieliński 1. Informacja genetyczna u
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Technologia rekombinowanego DNA jest podstawą uzyskiwania genetycznie zmodyfikowanych organizmów 2. Medycyna i ochrona zdrowia
Nowe stanowiska pluskwiaków różnoskrzydłych (Hemiptera: Heteroptera) w Polsce
Nowe stanowiska pluskwiaków różnoskrzydłych (Hemiptera: Heteroptera) w Polsce DARIUSZ J. TARNAWSKI ul. Ciasna 7/11, 80-111 Gdańsk e-mail: d.tarnawski@wp.pl Abstract. [New localities of true-bugs (Hemiptera:
IMPLIKACJE ZASTOSOWANIA KODOWANIA OPARTEGO NA LICZBACH CAŁKOWITYCH W ALGORYTMIE GENETYCZNYM
IMPLIKACJE ZASTOSOWANIA KODOWANIA OPARTEGO NA LICZBACH CAŁKOWITYCH W ALGORYTMIE GENETYCZNYM Artykuł zawiera opis eksperymentu, który polegał na uyciu algorytmu genetycznego przy wykorzystaniu kodowania
BADANIA PORÓWNAWCZE PAROPRZEPUSZCZALNOŚCI POWŁOK POLIMEROWYCH W RAMACH DOSTOSOWANIA METOD BADAŃ DO WYMAGAŃ NORM EN
PRACE INSTYTUTU TECHNIKI BUDOWLANEJ - KWARTALNIK nr 1 (137) 2006 BUILDING RESEARCH INSTITUTE - QUARTERLY No 1 (137) 2006 ARTYKUŁY - REPORTS Anna Sochan*, Anna Sokalska** BADANIA PORÓWNAWCZE PAROPRZEPUSZCZALNOŚCI
PL Zjednoczona w różnorodności PL A8-0206/136. Poprawka 136 Marita Ulvskog w imieniu Komisji Zatrudnienia i Spraw Socjalnych
21.6.2018 A8-0206/136 136 Artykuł 2 ustęp 4 e (nowy) 4e. Aby ocenić zgodność z przepisami dyrektyw 96/71/WE i 2014/67/UE, właściwe organy przyjmującego państwa członkowskiego sprawdzają następujące elementy
Porównywanie i dopasowywanie sekwencji
Porównywanie i dopasowywanie sekwencji Związek bioinformatyki z ewolucją Wraz ze wzrostem dostępności sekwencji DNA i białek pojawiła się nowa możliwość śledzenia ewolucji na poziomie molekularnym Ewolucja
Alicja Drohomirecka, Katarzyna Kotarska
ZESZYTY NAUKOWE UNIWERSYTETU SZCZECIŃSKIEGO NR 384 PRACE INSTYTUTU KULTURY FIZYCZNEJ NR 20 2003 ALICJA DROHOMIRECKA KATARZYNA KOTARSKA SPRAWNOŚĆ FIZYCZNA DZIECI PRZEDSZKOLNYCH ZE STARGARDU SZCZECIŃSKIEGO
SYMULACYJNA OCENA POTENCJAŁU ROZWOJOWEGO MIAST WOJEWÓDZTWA LUBUSKIEGO W KONTEKŚCIE WSPÓŁPRACY TRANSGRANICZNEJ Z BRANDENBURGIĄ
Streszczenie SYMULACYJNA OCENA POTENCJAŁU ROZWOJOWEGO MIAST WOJEWÓDZTWA LUBUSKIEGO W KONTEKŚCIE WSPÓŁPRACY TRANSGRANICZNEJ Z BRANDENBURGIĄ Celem analiz było wskazanie miast i obszarów w województwie lubuskim,
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (1) GENOMY I ICH ADNOTACJE
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (1) GENOMY I ICH ADNOTACJE Podstawy Bioinformatyki wykład 2 PODSTAWY BIOINFORMATYKI 2018/2019 MAGDA MIELCZAREK 1 GENOMY I ICH ADNOTACJE NCBI Ensembl UCSC PODSTAWY BIOINFORMATYKI
Śledź (Clupea harengus) jest ważnym gatunkiem z punktu widzenia funkcjonowania ekosystemu (Varpe et al., 2005, Pikitch et al., 2014), a także odgrywa
Śledź (Clupea harengus) jest ważnym gatunkiem z punktu widzenia funkcjonowania ekosystemu (Varpe et al., 2005, Pikitch et al., 2014), a także odgrywa istotną rolę ekonomiczną, stanowiąc znaczną część połowów
PODSTAWY BIOINFORMATYKI WYKŁAD 4 DOPASOWANIE SEKWENCJI
PODSTAWY BIOINFORMATYKI WYKŁAD 4 DOPASOWANIE SEKWENCJI DOPASOWANIE SEKWENCJI 1. Dopasowanie sekwencji - definicja 2. Wizualizacja dopasowania sekwencji 3. Miary podobieństwa sekwencji 4. Przykłady programów
Zmienność. środa, 23 listopada 11
Zmienność http://ggoralski.com Zmienność Zmienność - rodzaje Zmienność obserwuje się zarówno między poszczególnymi osobnikami jak i między populacjami. Różnice te mogą mieć jednak różne podłoże. Mogą one
WPŁYW SZYBKOŚCI STYGNIĘCIA NA WŁASNOŚCI TERMOFIZYCZNE STALIWA W STANIE STAŁYM
2/1 Archives of Foundry, Year 200, Volume, 1 Archiwum Odlewnictwa, Rok 200, Rocznik, Nr 1 PAN Katowice PL ISSN 1642-308 WPŁYW SZYBKOŚCI STYGNIĘCIA NA WŁASNOŚCI TERMOFIZYCZNE STALIWA W STANIE STAŁYM D.
http://www.rcin.org.pl
Archeologia Polski, t. XXXVIII : 1993, z. I PL ISSN 0003-8180 MAŁGORZATA WINIARSKA-KABACIŃSKA ANALIZA FUNKCJONALNA OSTRZA KOŚCIANEGO ZBROJONEGO KRZEMIENNYMI WKŁADKAMI Z TŁOKOWA, WOJ. OLSZTYŃSKIE 1 Analizę
1
1 2 3 4 5 6 Najbardziej kompletna analiza ponad połowy gatunków ptaków świata; potwierdza znane tendencje do powiększania się wielkości lęgu wraz z szerokością geograficzną, co przypisuje się wpływowi
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (2) GENOMY I ICH ADNOTACJE. Podstawy Bioinformatyki wykład 4
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (2) GENOMY I ICH ADNOTACJE Podstawy Bioinformatyki wykład 4 GENOMY I ICH ADNOTACJE NCBI Ensembl UCSC PODSTAWY BIOINFORMATYKI 2017/2018 MAGDA MIELCZAREK 2 GENOMY I ICH ADNOTACJE
DZIAŁALNOŚĆ GOSPODARCZA W ASPEKCIE TYPÓW FUNKCJONALNYCH GMIN GÓRSKICH
INFRASTRUKTURA I EKOLOGIA TERENÓW WIEJSKICH Nr 4/2005, POLSKA AKADEMIA NAUK, Oddział w Krakowie, s. 29 38 Komisja Technicznej Infrastruktury Wsi Anna Krakowiak-Bal DZIAŁALNOŚĆ GOSPODARCZA W ASPEKCIE TYPÓW
OSI Network Layer. Network Fundamentals Chapter 5. ITE PC v4.0 Chapter Cisco Systems, Inc. All rights reserved.
OSI Network Layer Network Fundamentals Chapter 5 1 Network Layer Identify the role of the Network Layer, as it describes communication from one end device to another end device Examine the most common
Plan wykładu: Budowa chromatyny - nukleosomy. Wpływ nukleosomów na replikację i transkrypcję
Nukleosomy 1 Plan wykładu: Budowa chromatyny - nukleosomy Wpływ nukleosomów na replikację i transkrypcję Metody pozwalające na wyznaczanie miejsc wiązania nukleosomów Charakterystyka obsadzenia nukleosomów
Przełączniki genetyczne. Genetyczne podstawy rozwoju i różnicowania
Przełączniki genetyczne Genetyczne podstawy rozwoju i różnicowania Brown, r. 14 Literatura Ekspresja genów a rozwój Zmiany ekspresji genu odpowiadają na czynniki środowiskowe i wewnętrzne Utrzymanie homeostazy
OSI Physical Layer. Network Fundamentals Chapter 8. Version Cisco Systems, Inc. All rights reserved. Cisco Public 1
OSI Physical Layer Network Fundamentals Chapter 8 Version 4.0 1 Warstwa fizyczna modelu OSI Network Fundamentals Rozdział 8 Version 4.0 2 Objectives Explain the role of Physical layer protocols and services
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad Takao Ishikawa Faculty of Biology, University of Warsaw, Poland Performance of Polish students at IBO Gold Silver Bronze Merit
MODELOWANIE STANÓW CZYNNOŚCIOWYCH W JĘZYKU SIECI BAYESOWSKICH
Inżynieria Rolnicza 7(105)/2008 MODELOWANIE STANÓW CZYNNOŚCIOWYCH W JĘZYKU SIECI BAYESOWSKICH Katedra Podstaw Techniki, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Streszczenie. Zastosowanie sieci bayesowskiej
Towards Stability Analysis of Data Transport Mechanisms: a Fluid Model and an Application
Towards Stability Analysis of Data Transport Mechanisms: a Fluid Model and an Application Gayane Vardoyan *, C. V. Hollot, Don Towsley* * College of Information and Computer Sciences, Department of Electrical
OSI Network Layer. Network Fundamentals Chapter 5. Version Cisco Systems, Inc. All rights reserved. Cisco Public 1
OSI Network Layer Network Fundamentals Chapter 5 Version 4.0 1 OSI Network Layer Network Fundamentals Rozdział 5 Version 4.0 2 Objectives Identify the role of the Network Layer, as it describes communication
Chrońmy owady! http://gallery.photo.net/photo/4318247-md.jpg
Chrońmy owady! http://gallery.photo.net/photo/4318247-md.jpg Systematyka Królestwo: zwierzęta Podkrólestwo: tkankowce Typ: stawonogi Gromada: owady (Insecta) Systematyka Królestwo: zwierzęta Podkrólestwo:
ROZKŁAD WIELKOŚCI WYDZIELEŃ GRAFITU W GRUBYM ODLEWIE ŻELIWNYM
49/15 Archives of Foundry, Year 2005, Volume 5, 15 Archiwum Odlewnictwa, Rok 2005, Rocznik 5, Nr 15 PAN Katowice PL ISSN 1642-5308 ROZKŁAD WIELKOŚCI WYDZIELEŃ GRAFITU W GRUBYM ODLEWIE ŻELIWNYM J. SUCHOŃ
PODSTAWY BIOINFORMATYKI WYKŁAD 5 ANALIZA FILOGENETYCZNA
PODSTAWY BIOINFORMATYKI WYKŁAD 5 ANALIZA FILOGENETYCZNA ANALIZA FILOGENETYCZNA 1. Wstęp - filogenetyka 2. Struktura drzewa filogenetycznego 3. Metody konstrukcji drzewa 4. Etapy konstrukcji drzewa filogenetycznego
Ograniczenia środowiskowe nie budzą wielu kontrowersji, co nie znaczy że rozumiemy do końca proces powstawania adaptacji fizjologicznych.
1 Ograniczenia środowiskowe nie budzą wielu kontrowersji, co nie znaczy że rozumiemy do końca proces powstawania adaptacji fizjologicznych. Wiadomo, że ściśle powiązane z zagadnieniem interakcji kompetencje
Genomika Porównawcza. Agnieszka Rakowska Instytut Informatyki i Matematyki Komputerowej Uniwersytet Jagiellooski
Genomika Porównawcza Agnieszka Rakowska Instytut Informatyki i Matematyki Komputerowej Uniwersytet Jagiellooski 1 Plan prezentacji 1. Rodzaje i budowa drzew filogenetycznych 2. Metody ukorzeniania drzewa
Historia informacji genetycznej. Jak ewolucja tworzy nową informację (z ma ą dygresją).
Historia informacji genetycznej. Jak ewolucja tworzy nową informację (z ma ą dygresją). Czym jest życie? metabolizm + informacja (replikacja) 2 Cząsteczki organiczne mog y powstać w atmosferze pierwotnej
Modyfikacje epigenetyczne w czasie wzrostu oocytów związane z rozszerzeniem rozwoju partenogenetycznego u myszy. Małgorzata Karney
Modyfikacje epigenetyczne w czasie wzrostu oocytów związane z rozszerzeniem rozwoju partenogenetycznego u myszy. Małgorzata Karney Epigenetyka Epigenetyka zwykle definiowana jest jako nauka o dziedzicznych
Algorytm Genetyczny. zastosowanie do procesów rozmieszczenia stacji raportujących w sieciach komórkowych
Algorytm Genetyczny zastosowanie do procesów rozmieszczenia stacji raportujących w sieciach komórkowych Dlaczego Algorytmy Inspirowane Naturą? Rozwój nowych technologii: złożone problemy obliczeniowe w
NATĘŻENIE POLA ELEKTRYCZNEGO PRZEWODU LINII NAPOWIETRZNEJ Z UWZGLĘDNIENIEM ZWISU
POZNAN UNIVE RSITY OF TE CHNOLOGY ACADE MIC JOURNALS No 85 Electrical Engineering 016 Krzysztof KRÓL* NATĘŻENIE POLA ELEKTRYCZNEGO PRZEWODU LINII NAPOWIETRZNEJ Z UWZGLĘDNIENIEM ZWISU W artykule zaprezentowano
Wiesław Maik. Theoretical-methodological foundations of geographical-urban studies. A study of urban geography methodology.
Wiesław Maik Theoretical-methodological foundations of geographical-urban studies. A study of urban geography methodology. Bydgoszcz 2012 Wiesław Maik Podstawy teoretyczno - metodologiczne studiów geograficzno
Kierunek i poziom studiów: Biologia, poziom drugi Sylabus modułu: Filogenetyka i taksonomia roślin i zwierząt dla EKOP
Uniwersytet Śląski w Katowicach str. 1 Kierunek i poziom studiów: Biologia, poziom drugi Sylabus modułu: Filogenetyka i taksonomia roślin i zwierząt dla EKOP kod modułu: 2BL_12 1. Informacje ogólne koordynator
Filogenetyka molekularna I. Krzysztof Spalik
Filogenetyka molekularna I Krzysztof Spalik Literatura Krzysztof Spalik, Marcin Piwczyński (2009), Rekonstrukcja filogenezy i wnioskowanie filogenetyczne w badaniach ewolucyjnych, Kosmos 58(3-4): 485-498
WPŁYW TECHNICZNEGO UZBROJENIA PROCESU PRACY NA NADWYŻKĘ BEZPOŚREDNIĄ W GOSPODARSTWACH RODZINNYCH
Inżynieria Rolnicza 4(102)/2008 WPŁYW TECHNICZNEGO UZBROJENIA PROCESU PRACY NA NADWYŻKĘ BEZPOŚREDNIĄ W GOSPODARSTWACH RODZINNYCH Sławomir Kocira Katedra Eksploatacji Maszyn i Zarządzania w Inżynierii Rolniczej,
ZASTOSOWANIE SPLOTU FUNKCJI DO OPISU WŁASNOŚCI NIEZAWODNOŚCIOWYCH UKŁADÓW Z REZERWOWANIEM
1-2011 PROBLEMY EKSPLOATACJI 205 Zbigniew ZDZIENNICKI, Andrzej MACIEJCZYK Politechnika Łódzka, Łódź ZASTOSOWANIE SPLOTU FUNKCJI DO OPISU WŁASNOŚCI NIEZAWODNOŚCIOWYCH UKŁADÓW Z REZERWOWANIEM Słowa kluczowe
Biologia medyczna, materiały dla studentów
Jaka tam ewolucja. Zanim trafię na jednego myślącego, muszę stoczyć bitwę zdziewięcioma orangutanami Carlos Ruis Zafon Wierzbownica drobnokwiatowa Fitosterole, garbniki, flawonoidy Właściwości przeciwzapalne,
Nowoczesne systemy ekspresji genów
Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą
Wpływ struktury krajobrazu na przestrzenną zmienność genetyczną populacji myszy leśnej Apodemus flavicollis w północno wschodniej Polsce
Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii Sylwia Czarnomska Wpływ struktury krajobrazu na przestrzenną zmienność genetyczną populacji myszy leśnej Apodemus flavicollis w północno wschodniej Polsce Autoreferat
deep learning for NLP (5 lectures)
TTIC 31210: Advanced Natural Language Processing Kevin Gimpel Spring 2019 Lecture 6: Finish Transformers; Sequence- to- Sequence Modeling and AJenKon 1 Roadmap intro (1 lecture) deep learning for NLP (5
Machine Learning for Data Science (CS4786) Lecture11. Random Projections & Canonical Correlation Analysis
Machine Learning for Data Science (CS4786) Lecture11 5 Random Projections & Canonical Correlation Analysis The Tall, THE FAT AND THE UGLY n X d The Tall, THE FAT AND THE UGLY d X > n X d n = n d d The
Przykładowe zadania egzaminacyjne do eksperymentalnej klasy przyrodniczej PRZYRODA
Przykładowe zadania egzaminacyjne do eksperymentalnej klasy przyrodniczej PRZYRODA Zadanie 1. (0 4 pkt.) Przekreśl w drugiej i trzeciej kolumnie tabeli niewłaściwe określenia, aby wykazać różnice między
46 Olimpiada Biologiczna
46 Olimpiada Biologiczna Pracownia statystyczno-filogenetyczna Łukasz Banasiak i Jakub Baczyński 22 kwietnia 2017 r. Zasady oceniania rozwiązań zadań Zadanie 1 1.1 Kodowanie cech (5 pkt) 0,5 pkt za poprawne
Inżynieria Rolnicza 5(93)/2007
Inżynieria Rolnicza 5(9)/7 WPŁYW PODSTAWOWYCH WIELKOŚCI WEJŚCIOWYCH PROCESU EKSPANDOWANIA NASION AMARANTUSA I PROSA W STRUMIENIU GORĄCEGO POWIETRZA NA NIEZAWODNOŚĆ ICH TRANSPORTU PNEUMATYCZNEGO Henryk
WPŁYW ŹRÓDEŁ FINANSOWANIA RYNKU MIESZKANIOWEGO
NOWE TENDENCJE W GOSPODARCE NIERUCHOMOŚCIAMI 10-11 CZERWCA 2014, SZCZECIN Artykuł opublikowany w Folia Oeconomica Stetinensia Bełej M., Kulesza S., 2014. The influence of financing on the dynamics of housing
Przyrównanie sekwencji. Magda Mielczarek Katedra Genetyki Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu
Przyrównanie sekwencji Magda Mielczarek Katedra Genetyki Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu Sequence alignment - przyrównanie sekwencji Poszukiwanie ciągów znaków (zasad nukleotydowych lub reszt aminokwasowych),
Acknowledgement. Drzewa filogenetyczne
Wykład 8 Drzewa Filogenetyczne Lokalizacja genów Some figures from: Acknowledgement M. Zvelebil, J.O. Baum, Introduction to Bioinformatics, Garland Science 2008 Tradycyjne drzewa pokrewieństwa Drzewa oparte
Epigenetyczna regulacja ekspresji genów w trakcie rozwoju zwierząt i roślin
Epigenetyczna regulacja ekspresji genów w trakcie rozwoju zwierząt i roślin Rozwój jest z natury epigenetyczny te same geny w różnych tkankach i komórkach utrzymywane są w stanie aktywnym lub wyciszonym
Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny
Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny Zadanie 1 1 pkt. za prawidłowe podanie typów dla obydwu zwierząt oznaczonych literami A oraz B. A. ramienionogi, B. mięczaki A.
Genetyczne podłoże mechanizmów zdolności adaptacyjnych drzew leśnych
Genetyczne podłoże mechanizmów zdolności adaptacyjnych drzew leśnych dr Małgorzata Sułkowska Zakład Hodowli i Genetyki Drzew Leśnych Instytut Badawczy Leśnictwa Podstawowym czynnikiem decydującym o przystosowaniach
BADANIA SYMULACYJNE PROCESU HAMOWANIA SAMOCHODU OSOBOWEGO W PROGRAMIE PC-CRASH
BADANIA SYMULACYJNE PROCESU HAMOWANIA SAMOCHODU OSOBOWEGO W PROGRAMIE PC-CRASH Dr inż. Artur JAWORSKI, Dr inż. Hubert KUSZEWSKI, Dr inż. Adam USTRZYCKI W artykule przedstawiono wyniki analizy symulacyjnej