BIOCENTRUM OCHOTA Program wykładów dla SD 2010 /2011

Transkrypt

1 BIOCENTRUM OCHOTA Program wykładów dla SD 2010 /2011 Lp. Tytuł Wykładowca Gdzie i kiedy Uwagi 1. Rola neuropatologii w diagnostyce nowotworów ośrodkowego układu nerwowego 2. Struktura i funkcje białek Eukaryotic Molecular Genetics: Transcription Regulation Eukaryotic Molecular Genetics: Transcription Regulation 5. Synteza białek 6. Basic Neuroscience 7. Eukaryotic Molecular Genetics: Transcription Regulation Ewa Matyja Sławomir Pikuła Eva Czarnecka- Verner Eva Czarnecka- Verner Dr Magdalena Dziembowska Dr Paweł Boguszewski Eva Czarnecka- Verner r r r. godz r. godz r r r. godz * konspekt wykładu znajduje się pod tabelką 1

2 8. Eukaryotic Molecular Genetics: Transcription Regulation Eva Czarnecka- Verner r. godz Eukaryotic Molecular Genetics: Transcription Regulation Eva Czarnecka- Verner r. godz Nauka 2.0 praktyczne aspekty rewolucji internetowej w nauce Część I komunikacja, współpraca, wizerunek Dr Paweł Szczęsny r. godz ** konspekt wykładu znajduje się pod tabelą Immunologia i immunoterapia nowotworów Modyfikacje potranslacyjne białek i ich znaczenie 13. Basic Neuroscience Marek Jakóbisiak Prof. dr. hab. Anna Filipek Dr Paweł Boguszewski r r r r. godz *** konspekt wykładu znajduje się pod tabelą 15. Nauka 2.0 praktyczne aspekty rewolucji internetowej w nauce Część 2 otwarta nauka w praktyce Dr Paweł Szczęsny r. godz

3 16. Zaburzenia genetyczne w patogenezie glejaków Dr Monika Szeliga r. 17. Enzymologia cz.1 Prof. Wojciech Rode 18. Basic Neuroscience Dr Paweł Boguszewski r. 19. Enzymologia cz. 2 Wojciech Rode r Electrophysiologic techniques in system neurophysiology Nauka 2.0 praktyczne aspekty rewolucji internetowej w nauce Część 3 wyszukiwanie informacji i zarządzanie wiedzą Andrzej Wróbel Dr Paweł Szczęsny r r r r. godz Biologia molekularna nowotworów Janusz Siedlecki r. 3

4 24. Proteomika Electrophysiologic techniques in system neurophysiology Od pomysłu do rejestracji leku Struktura i funkcje błony komórkowej Electrophysiologic techniques in system neurophysiology Badania kliniczne produktu badanego: cel, planowanie i przeprowadzenie Prof dr hab. Michał Dadlez Andrzej Wróbel Dr Rafał Derlacz (UW, ADAMED) Doc. dr hab Katarzyna Kwiatkowska Andrzej Wróbel Dr Teresa Brodniewicz (MTZ) r r r r r r r. 4

5 Przekazywanie sygnałów:fosfatydyloinozy tolo-4,5- bisfosforan:unikatowy, wielofunkcyjny lipid błony komórkowej Electrophysiologic techniques in system neurophysiology Katarzyna Kwiatkowska Andrzej Wróbel r r r Wymogi stawiane lekom generycznym Przekazywanie sygnałów : receptory metabotropowe związane z białkami G i kinazą tyrozynową-rys historyczny-wybrane aspekty działania Transcription regulation: techniques and concepts Dr Andrzej Tyrała (Polfa Warszawa) Jolanta Barańska Prof dr hab. Bożena Kamińska- Kaczmarek r r r r. 5

6 38. Blaski i cienie medycyny opartej na faktach Dr Mirosław Janowski r. 39. Transport przez błony biologiczne cz Human Genome Project Nobel 2010 z fizjologii i medycyny Transport przez błony biologiczne cz. 2 Imaging of the human brain Katarzyna Nałęcz Bożena Kamińska- Kaczmarek Katarzyna Nałęcz Anna Grabowska/mgr Marcel Falkiewicz r r r r. Sala wykładowa na I piętrze r r. 6

7 r. 46. Endocytoza cz.1 Dr hab. Marta Miączyńska 47. Imaging of the human brain Anna Grabowska/mgr Marcel Falkiewicz r r r. 49. Endocytoza cz Behavioral tests in neuroscience Elżbieta Wyroba Dr Robert Filipkowski r Budowa i funkcje cytoszkieletu M. Jolanta Rędowicz r r r. 7

8 53. Behavioral tests in neuroscience Dr Robert Filipkowski Molekularne podstawy generacji ruchu w komórce przez motory molekularne Behavioral tests in neuroscience Andrzej Kasprzak Dr Robert Filipkowski r r r Mechanizmy migracji komórek M. Jolanta Rędowicz r r r r r. 8

9 Bioenergetyka 64. Basic neuroanatomy 65. Mechanizmy regulacji metabolizmu 66. Basic neuroanatomy 67. Mechanizmy regulacji metabolizmu Prof. dr Lech Wojtczak Dr Monika Malinowska Doc. dr hab.krzysztof Zabłocki Dr Monika Malinowska Krzysztof Zabłocki r r r r r r r. 9

10 68. Basic neuroanatomy 69. Choroby metaboliczne: Mechanizmy patogenezy cukrzycy typu Basic neuroanatomy 71. Choroby metaboliczne: Lizosomalne choroby spichrzeniowe 72. Basic neuroanatomy 73. Choroby metaboliczne: Skutki zaburzeń funkcjonowania mitochondriów 74. Basic neuroanatomy Dr Monika Malinowska Agnieszka Dobrzyń Dr Monika Malinowska Joanna Bandorowicz- Pikuła Dr Monika Malinowska Dr hab. Joanna Szczepanowska Dr Monika Malinowska r r r r r r r. 10

11 Choroby metaboliczne: Zaburzenia kanałów jonowych jako przyczyna chorób Energy metabolizm in the brain Mechanizmy regulacji transkrypcji Epigenetyczne mechanizmy regulacji ekspresji genów 79. Kancerogeneza Microscopy in neuroscience Determinanty długowieczności i starzenie Krzysztof Zabłocki Dr Mariusz Więckowski Bożena Kamińska- Kaczmarek Bożena Kamińska- Kaczmarek Dr Katarzyna Piwocka Dr hab. Grzegorz Wilczyński Ewa Sikora/Dr Grażyna Mosieniak r r r r r r r. 11

12 Microscopy in neuroscience Obrazowanie struktur i procesów w komórkach i w tkankach(1) Animal models of neurological diseases Obrazowanie struktur i procesów w komórkach i w tkankach (2) Animal models of neurological diseases 87. Bioinformatyka 88. Animal models of neurological diseases Dr hab. Grzegorz Wilczyński Dr hab. Grzegorz Wilczyński Katarzyna Łukasiuk/Doc. dr hab. Grażyna Niewiadomska Dr hab. Grzegorz Wilczyński Katarzyna Łukasiuk/Doc. dr hab. Grażyna Niewiadomska Krzysztof Pawłowski Katarzyna Łukasiuk/Doc. dr hab. Grażyna Niewiadomska r r r r r r r. 12

13 *Konspekt wykładu: Eukaryotic Molecular Genetics: Transcription Regulation Course Outline - 14 hrs of lectures 1. Introduction to eukaryotic transcription: 2. Basal transcription factors: TFIID, SAGA, PCAF; TFIIA; TFIIB 3. Mediator as a co-activator 4. RNA Polymerase II holoenzyme 5. Basal transcription factors: TFIIF, TFIIE, TFIIH 6. Models for the activation of transcription; PIC formation; Transcription cycle 7. Activated transcription; domain structure of transcriptional activators 8. Heat shock (HS) response as an example of activated transcription a. Characteristics of the HS response b. Human heat shock transcription factor; domains and the mechanism of activation; protein:protein interactions with general transcription factors c. Heat shock promoters in animals; pre-priming of the HS promoters d. Plant heat shock transcription factors; classification, inducibility, diversity, nuclear localization, mapping of transcriptional activity e. The mechanism of activation in plants f. Types of heat shock promoters in plants g. The controversy of class B HSFs; repressors vs. synergistic coactivators h. HSF and the Mediator i. Engineering plants for thermal resistance 9. Strategies for genetic engineering of sentinel plants: a. For detection of explosives TNT/DNT b. For elimination of human pathogen-contaminated raw produce from the food supply Teaching Method- Lectures; students participate in discussions; students prepare brief class presentations on selected topics in eukaryotic gene regulation **Konspekt wykładu: Nauka praktyczne aspekty rewolucji internetowej w nauce CZĘŚĆ 1 KOMUNIKACJA, WSPÓŁPRACA, WIZERUNEK Nowe formy komunikacji naukowej (blogi, mikroblogi, agregatory, wirtualne konferencje i sesje posterowe) oraz przykłady skutecznego ich użycia. Opiniotwórcza rola blogów i otwarte komentowanie publikacji w ramach inicjatywy Research blogging. Wiki, Etherpad oraz aplikacje Google jako platformy współpracy nad manuskryptami. Inne formy współpracy i mechanizmy współpracy (nakierowane na pracę nad kodem źródłowym). Rola wizerunku badacza w internecie StackOverflow oraz ResearcherID. CZĘŚĆ 2 OTWARTA NAUKA W PRAKTYCE Spektrum otwartości definicje. Omówienie otwartych rozwiązao w nauce. Inicjatywy społecznościowego adnotowania genów/białek/struktur krystalograficznych i wyjaśnienie ich słabej popularności. Naukowy crowdsourcing i nauka obywatelska. Praktyczne aspekty mechanizmów Open Access i Open Notebook Science. Aktualne dyskusje na temat własności intelektualnej ze szczególnym uwzględnieniem elementów pracy naukowej nie podlegających ochronie. Domena publiczna. Cytowanie danych. Metryki efektywności naukowej, a otwartośd. CZĘŚĆ 3 WYSZUKIWANIE INFORMACJI I ZARZĄDZANIE WIEDZĄ Zalew informacji: fakt czy mit? Wyszukiwanie informacji w sieci: porównanie serwisów PubMed i Google Scholar. Analiza semantyczna danych literaturowych na przykładzie alternatywnych do PubMeda serwisów: GoPubMed i NovoSeek. Narzędzia to text-miningu. Gromadzenie literatury online (Connotea, CiteULike) i offline (Zotero, Mendeley) darmowe alternatywy dla programu EndNote. Automatyczne rekomendacje literaturowe. Internetowe dzienniki laboratoryjne. 13

14 ***Konspekt wykładu: 1. Basic chemistry of metal ions A. Thermodynamics and complex formation. 2. Basic chemistry of metal ions B. Reactivity and kinetics 3. Biomolecules as ligands for metal ions 4. Investigations of structures and reactivity of metal ion complexes with bioligands A. Spectroscopic methods. 5. Investigations of structures and reactivity of metal ion complexes with bioligands A. Thermodynamic methods. 6. Experimental strategies in biological chemistry of metal ions. 7. Main group metals: sodium, potassium, magnesium and calcium. 8. Transition group metals: iron, cobalt, nickel, copper. 9. d10 metals: zinc, cadmium, mercury 10. Essential and toxic metals 11. Hydrolytic metalloenzymes 12. Redox metalloenzymes and electron transfer proteins 13. Stuctural metal ions. Zinc fingers. 14. Interactions of metal ions with small biomolecules. 15. Toxicological chemistry of metal ions 14