Zaburzenia procesu O-GlcNAcylacji w nowotworach. Alterations of O-GlcNAcylation process in cancers

Wielkość: px
Rozpocząć pokaz od strony:

Download "Zaburzenia procesu O-GlcNAcylacji w nowotworach. Alterations of O-GlcNAcylation process in cancers"

Transkrypt

1 Folia Medica Lodziensia, 2014, 41/1:65-91 Zaburzenia procesu O-GlcNAcylacji w nowotworach Alterations of O-GlcNAcylation process in cancers PIOTR CIESIELSKI 1, ANNA KRZEŚLAK 2 1 Katedra Cytobiochemii, Wydział Biologii i Ochrony Środowiska, Uniwersytet Łódzki, Pomorska 141/143, Łódź 2 Oddział Urologii Ogólnej, Onkologicznej i Czynnościowej, II Klinika Urologii, Uniwersytet Medyczny w Łodzi, Wojewódzki Szpital Specjalistyczny im. M. Kopernika w Łodzi, Pabianicka 62, Łódź Streszczenie O-GlcNAcylacja jest odwracalną potranslacyjną modyfikacją białek polegającą na przyłączeniu wiązaniem O-glikozydowym pojedynczych reszt β-n-acetyloglukozaminy (GlcNAc) do seryny lub treoniny. W proces O-GlcNAcylacji włączone są dwa enzymy: O-GlcNAc transferaza (OGT), enzym odpowiedzialny za przyłączanie reszt N-acetyloglukozaminy i β-n-acetyloglukozaminidaza (OGA), która katalizuje reakcję odłączania reszt GlcNAc. Dynamiczna i odwracalna O-GlcNAcylacja odgrywa istoną rolę w regulacji szeregu procesów komórkowych, takich jak przekazywanie sygnału, metabolizm, transkrypcja, translacja, degradacja białek w proteasomach i cykl komórkowy. Ponieważ O-GlcNAcylacja dotyczy reszt seryny lub treoniny, które znajdują się w miejscach rozpoznawanych przez kinazy białkowe, wpływa ona na poziom fosforylacji wielu białek i isnieje ścisła zależność pomiędzy tymi modyfikacjami. Ostanie badania wskazują, że w komórkach nowotworowych dochodzi do znacznego zwiększenia poziomu O-GlcNAcylacji. Hiper-O-GlcNAcylację stwierdzono w różnych typach nowotworów, włączając w to guzy lite np. płuc, prostaty, piersi, jelita grubego, trzustki, wątroby a także białaczki np. przewlekłą białaczkę limfatyczną. Zaburzenia O-GlcNAcylacji związane są ze zmianami w komórkach nowotworowych ekspresji enzymów odpowiedzialnych za ten proces, tj. OGT i OGA. Hiper-O-GlcNAcylacja wpływa na proliferację, przeżycie i metabolizm komórek nowotworowych, jak również zwiększa ich zdolność do inwazji i metastazy. Prezentowana praca stanowi przegląd aktualnych informacji dotyczących roli O-GlcNAcylacji w regulacji szlaków przekazywania sygnałów, cyklu komórkowego, czynników transkrypcyjnych oraz enzymów i innych białek związanych z metabolizmem komórek nowotworowych. Słowa kluczowe: O-GlcNAcylacja, nowotwory, cykl komórkowy, czynniki transkrypcyjne, transdukcja sygnału, glikoliza, metastaza. Adres do korespondencji: Piotr Ciesielski, Katedra Cytobiochemii, Wydział Biologii i Ochrony Środowiska, Uniwersytet Łódzki, ul. Pomorska 141/143, Łódź

2 66 O-GlcNAcylacja w nowotworach Abstract O-GlcNAcylation is a post-translational modification involving the addition of a N-acetylglucosamine moiety to the serine/threonine residues of cytosolic or nuclear proteins. Two enzymes are responsible for cyclic O-GlcNAcylation: O-GlcNAc transferase (OGT) which catalyzes the addition of the GlcNAc moiety from UDP-GlcNAc to target proteins and O-GlcNAcase (OGA) which catalyses the hydrolytic removal of the sugar moiety from proteins. Dynamic and reversible O-GlcNAcylation is emerging as an important regulator of diverse cellular processes, such as signal transduction, metabolism, transcription, translation, proteasomal degradation and cell cycle. O-GlcNAcylation occurs on serine or threonine residues of proteins at sites that may also be phosphorylated. Therefore, an extensive crosstalk exists between phosphorylation and O-GlcNAcylation. Recent studies indicate that increased O-GlcNAcylation is a general feature of cancer. Elevated O-GlcNAcylation (hyper-o- GlcNAcylation) occurs in many human malignancies including solid tumors such as lung, prostate, breast, colorectal, liver, pancreatic cancers as well as non-solid cancers such as chronic lymphocytic leukemia. The changes in O-GlcNAcylation are associated with the changes in OGT and OGA expression levels. Hyper-O-GlcNAcylation may be linked to the various hallmarks of cancer, including cancer cell proliferation, survival, invasion, metastasis and metabolism. This paper reviews recent findings related to O-GlcNAc-dependent regulation of signaling pathways, cell cycle, transcription factors, and metabolic enzymes in cancer cells. Key words: O-GlcNAcylation, cancers, cell cycle, transcription factors, signal transduction, glycolysis, metastasis. Wstęp O-GlcNAcylacja jest odwracalną, potranslacyjną modyfikacją białek polegającą na przyłączeniu pojedynczych reszt β-n-acetylo-d-glukozaminy (ang. N-acetylglucosamine - GlcNAc) do grupy hydroksylowej seryny i/lub treoniny wiązaniem O-glikozydowym [1, 2]. O-GlcNAcylacja jest modyfikacją bardzo powszechną i dotyczy zarówno białek jądrowych, jak i cytosolowych. Do chwili obecnej zidentyfikowano ponad tysiąc białek ulegających O-GlcNAcylacji. Liczba ta zwiększa się z roku na rok wraz z rozwojem metod i technologii pozwalających na detekcję reszt N-acetyloglukozaminy

3 Piotr Ciesielski, Anna Krześlak 67 w badanych białkach. Do O-GlcNAcylowanych białek zalicza się m.in. białka związane z chromatyną, enzymy glikolityczne, kinazy, czynniki transkrypcyjne, oraz białka cytoszkieletu komórki [3, 4]. O-GlcNAcylacja to proces enzymatyczny zachodzący przy udziale O-GlcNAc transferazy (ang. O-linked N-acetylglucosamine transferase - OGT). Natomiast za usuwanie reszt GlcNAc odpowiada β-n-acetylo-d-glukozaminidaza (ang. O-GlcNAcase - OGA) [5]. Niektóre reszty seryny i treoniny w białku mogą ulegać zarówno O-GlcNAcylacji, jak i fosforylacji, przy czym procesy te wzajemnie się wykluczają, co prowadzi do stanu, w którym dane reszty aminokwasów występują w jednej z trzech form: niezmodyfikowanej, glikozylowanej lub fosforylowanej. Przykładowym białkiem ulegającym zarówno O-GlcNAcylacji, jak i fosforylacji jest polimeraza RNA klasy II. W swojej domenie C-końcowej może zawierać reszty fosforanowe albo reszty O-GlcNAc lub być w formie niezmodyfikowanej. Obie te modyfikacje wywierają przeciwstawne efekty na aktywność tego enzymu. Uważa się, że w procesie transkrypcji po przyłączeniu polimerazy RNA klasy II do promotora genu docelowego, N-acetyloglukozaminidaza (OGA) usuwa reszty O-GlcNAc z C-końcowego regionu tego enzymu, umożliwiając tym samym jej fosforylację i aktywację [6, 7]. Interesujący wydaje się również fakt, że OGT oraz fosfatazy białkowe mogą tworzyć ze sobą kompleksy. Kompleksy takie przyłączają resztę O-GlcNAc, równocześnie usuwając resztę fosforanową z białka [8]. Podobnie jak fosforylacja, O-GlcNAcylacja odpowiada za regulację wielu ważnych procesów komórkowych. Do procesów tych możemy zaliczyć m.in. kontrolę cyklu komórkowego, regulację przekazywania sygnałów, regulację transkrypcji, czy też modulowanie odpowiedzi na stres komórkowy. Nieprawidłowy poziom O-GlcNAcylacji jest obserwowany w takich chorobach jak cukrzyca, choroby neurodegeneracyjne oraz nowotwory [9, 10]. Enzymy zaangażowane w proces O-GlcNAcylacji O-GlcNAc transferaza (OGT) Jedynym enzymem odpowiedzialnym za przyłączenie reszty β-n-acetylo- D-glukozaminy do grupy hydroksylowej seryny lub treoniny białek wewnątrzkomórkowych jest β-n-acetyloglukozaminylotransferaza UDP-N-acetylo-

4 68 O-GlcNAcylacja w nowotworach glukozamina: białko (EC 2.4.1) (O-GlcNAc transferaza, OGT). Enzym ten kodowany jest przez gen OGT zlokalizowany w pobliżu regionu centromerowego chromosomu X (Xq13.1). Substratem dla OGT, a zarazem czynnikiem limitującym aktywność tego enzymu jest UDP-GlcNAc (ang. uridine diphosphate N-acetylglucosamine), będąca końcowym produktem szlaku biosyntezy heksozamin (ang. hexosamine biosynthesis pathway - HBP) [11]. U człowieka, jak i u innych ssaków, stwierdzono występowanie trzech izoform OGT o masie cząsteczkowej 78, 103 i 110 kda, które powstają w wyniku alternatywnego składania mrna [12]. Izoformy o masie cząsteczkowej 78 kda (ang. short OGT - sogt) oraz 110 kda (ang. nucleocytoplasmic OGT - ncogt) tworzą heterotrimery (dwie podjednostki 110 kda oraz jedna podjednostka 78 kda), które mają lokalizację jądrowo-cytoplazmatyczną. Natomiast izoforma o masie cząsteczkowej 103 kda występuje wyłącznie w mitochondriach (ang. mitochondrial OGT - mogt). Każda z tych izoform posiada na N-końcu wiele tandemowo ułożonych powtórzeń motywów TPR (ang. tetratricopeptide repeats), odpowiadających za interakcje pomiędzy OGT, a innymi białkami. Najwięcej powtórzeń TPR zawiera ncogt, zaś najmniej sogt. Badania wykazały, że motywy TPR tworzą na N-końcu superhelisę i zawierają zachowane ewolucyjnie powtórzenia asparaginy [13]. W części środkowej enzymu występują sekwencje lokalizacji jądrowej (ang. nuclear localization sequence - NLS), a dodatkowo w N-terminalnej części izoformy mitochondrialnej znajdują się również sekwencje warunkujące lokalizację mitochondrialną (ang. mitochondrial localization sequence - MLS). Domena katalityczna o aktywności glikozylotransferazy typu GT-B znajduje się na C-końcu enzymu i wykazuje dużą homologię do fosforylazy glikogenu, z której najprawdopodobniej się wywodzi [5, 12, 14]. Mimo, że wiele białek ulega modyfikacji przez OGT, to sposób w jaki OGT rozpoznaje docelowe białka oraz mechanizm regulacji aktywności tego enzymu pozostają słabo poznane. W cząsteczce OGT znajdują się reszty seryny oraz tyrozyny, które ulegają fosforylacji. Przypuszcza się więc, że aktywność OGT jest regulowana poprzez potranslacyjne przyłączenie reszt fosforanowych do reszt seryny i/lub tyrozyny przez różne kinazy białkowe [4, 5].

5 Piotr Ciesielski, Anna Krześlak 69 Ryc. 1. Wpływ O-GlcNAcylacji na aktywność czynników transkrypcyjnych. Reszty seryny i treoniny ulegające O-GlcNAcylacji oznaczone zostały kolorem ciemnoszarym, natomiast te ulegające fosforylacji kolorem jasnoszarym [wg [40]; zmieniono]. Fig. 1. Impact of O-GlcNAcylation on transcription factors activity. The O-GlcNAcylated serine and threonine residues are labelled in dark grey and phosphorylated ones in light grey (modified after [40]). β-n-acetylo-d-glukozaminidaza (OGA) Enzymem odpowiedzialnym za odłączanie reszt O-GlcNAc zarówno od białek cytoplazmatycznych, jak i jądrowych jest β-n-acetylo-dglukozaminidaza (OGA). Białko OGA kodowane jest przez gen MGEA5 (ang. meningioma expressed antigen 5) składający się z 16 eksonów, którego locus znajduje się na chromosomie 10 (10q24). Początkowo uważano, że produkt tego genu posiada aktywność hialuronidazy, aczkolwiek przeprowadzone później badania struktury i aktywności enzymatycznej OGA nie potwierdziły tego przypuszczenia [5, 15, 16].

6 70 O-GlcNAcylacja w nowotworach W N-końcowym regionie białka OGA znajduje się domena o aktywności N-acetyloglukozaminidazy, charakterystyczna dla rodziny glukozydaz GH84 (ang. glycoside hydrolase family 84). Odpowiada ona za odłączenie reszty O-GlcNAc od docelowego białka. Z kolei w C-końcu enzymu zlokalizowana jest domena wykazująca homologię do rodziny acetylotransferaz histonowych GNAT (ang. Gcn5-related N-acetyltransferase) [5, 16]. Do tej pory nie potwierdzono, czy OGA ma aktywność acetylotransferazy histonowej. Uważa się, że OGA może uczestniczyć w interakcjach z czynnikami transkrypcyjnymi, chociaż białko to nie posiada pętli P (ang. P-loop), zachowanej ewolucyjnie domeny charakterystycznej dla acetylotransferaz GNAT. Pomiędzy wyżej opisanymi domenami OGA znajduje się miejsce, które jest rozpoznawane i cięte przez kaspazę 3 podczas apoptozy [5, 14]. W wyniku alternatywnego składania transkryptu genu MGEA5 powstają dwie izoformy OGA, tj. OGA-L (ang. OGA long form) i OGA-S (ang. OGA short form). W wyniku translacji wszystkich 16 eksonów genu MGEA5 powstaje długa izoforma enzymu (OGA-L) składająca się z 916 aminokwasów. Białko OGA-L zlokalizowane jest w cytosolu, a w jego strukturze wyróżnia się obie opisane powyżej domeny o aktywności enzymatycznej zlokalizowane odpowiednio w N- i C-końcu. Natomiast w wyniku alternatywnego składania mrna MGEA5 nie dochodzi do usunięcia intronu 11, w którym znajduje się alternatywny kodon stop, co prowadzi do powstania izoformy OGA-S składającej się z 677 aminokwasów. Izoforma OGA-S pozbawiona jest domeny o potencjalnej aktywności acetylotransferazy histonowej, której obecność jest charakterystyczna dla OGA-L. Natomiast C-koniec białka OGA-S stanowi fragment składający się z 14 reszt aminokwasowych, których brak jest w izoformie OGA-L [16, 17]. Izoforma OGA-S zlokalizowana jest w jądrze komórkowym. Aktywność obu izoform jest w podobny sposób hamowana poprzez inhibitory OGA. Natomiast zauważono, że OGA-L wykazuje mniejszą aktywność enzymatyczną w badaniach in vitro. Możliwe, że obecność pewnych czynników komórkowych jest niezbędna dla prawidłowego działania tej izoformy [5].

7 Piotr Ciesielski, Anna Krześlak 71 Zaburzenia poziomu O-GlcNAcylacji w nowotworach Zmiany w poziomie O-GlcNAcylacji, które stwierdzono w wielu typach nowotworów, związane są ze zmianą poziomu ekspresji genów kodujących enzymy zaangażowane w ten proces. Zaobserwowano, że zależnie od stopnia zaawansowania nowotworu zmienia się poziom ekspresji OGT i MGEA5. W przypadku komórek słabo zróżnicowanych nowotworów piersi, czyli o wyższym stopniu złośliwości histologicznej (G2 i G3), obserwuje się znaczny spadek poziomu mrna dla MGEA5 oraz wzrost poziomu mrna dla OGT w porównaniu z nowotworami o niskim stopniu złośliwości histologicznej (G1) [18]. Globalny poziom O-GlcNAcylacji białek w mniej zróżnicowanych komórkach raka piersi jest dużo wyższy niż w komórkach prawidłowych [19]. Gu i wsp. [20] zauważyli, że zmiany poziomu O-GlcNAcylacji białek, wywołane zmianą ekspresji genów kodujących OGT i OGA, mają wpływ na wzrost zdolności komórek raka piersi do przerzutowania. W komórkach raka prostaty, podobnie jak w przypadku raka piersi, wraz ze wzrostem zaawansowania nowotworu obserwuje się wzrost ekspresji OGT oraz spadek ekspresji MGEA5. Również poziom mrna dla OGT ulega zwiększeniu w komórkach raka prostaty w porównaniu z komórkami prawidłowymi. Zwiększony poziom OGT, prowadzący do wzrostu stopnia O-GlcNAcylacji białek w komórkach raka prostaty, przyczynia się do przyspieszonego wzrostu nowotworu oraz prowadzi do przerzutowania [21, 22]. W przypadku raka endometrium o wysokim stopniu złośliwości histologicznej stwierdzono wzrost poziomu mrna zarówno dla OGT, jak i dla OGA w porównaniu do dobrze zróżnicowanych komórek raka błony śluzowej trzonu macicy. Ponadto wykazano istnienie zależności pomiędzy ekspresją genów kodujących enzymy uczestniczące w procesie O-GlcNAcylacji, a głębokością naciekania mięśniówki macicy. Natomiast nie obserwuje się zależności pomiędzy ekspresją OGT i MGEA5, a zdolnością komórek raka endometrium do przerzutowania do węzłów chłonnych [23].

8 72 O-GlcNAcylacja w nowotworach Ryc. 2. Wpływ O-GlcNAcylacji na progresję cyklu komórkowego. Poziom O-GlcNAcylacji zmienia się w poszczególnych fazach cyklu. Wzrost poziomu O-GlcNAcylacji obserwowany jest w fazach G0, G1 oraz G2, natomiast do spadku O-GlcNAcylacji dochodzi tuż przed fazą S oraz w samej fazie S. Poziom O-GlcNAcylacji w fazie M pozostaje do tej pory niezbadany, aczkolwiek wiadomo, że odpowiedni poziom enzymów OGT i OGA w fazie M jest niezbędny do prawidłowej progresji cyklu komórkowego [wg [40]; zmieniono]. Fig. 2. Impact of O-GlcNAcylation on cell cycle progression. O-GlcNAcylation level changes during the cell cycle progression. The level of protein O-GlcNAcylation is higher in G0, G1 and G2 than in S phase. The pattern of O-GlcNAcylation levels in the M phase remains unknown. However, the proper expression of OGT and OGA in M phase is necessary for cell cycle progression (modified after [40]).

9 Piotr Ciesielski, Anna Krześlak 73 Zwiększony poziom O-GlcNAcylacji białek obserwowano również w takich typach nowotworów, jak rak trzustki [24], wątroby [25], płuc, jelita grubego [26] oraz w przewlekłej białaczce limfatycznej [27]. Rożanski i wsp. [28] zaobserwowali wzrost poziomu mrna dla OGT oraz spadek poziomu mrna dla MGEA5 w próbkach moczu pacjentów z rakiem pęcherza moczowego w porównaniu z próbkami pobranymi od osób zdrowych. Ekspresja OGT wzrastała, natomiast MGEA5 malała wraz ze stopniem złośliwości histologicznej nowotworu. Wyniki te wskazują, że analiza poziomu mrna dla OGT w moczu może być wykorzystana jako marker diagnostyczny raka pęcherza moczowego [28]. Sugeruje się również, że OGT może być brana pod uwagę jako potencjalny cel terapii przeciwnowotworowej. Zmniejszony poziom O-GlcNAcylacji spowodowany inhibicją OGT jest skorelowany ze zmniejszeniem wzrostu, inwazji oraz przerzutowania nowotworów [21, 26]. Wpływ O-GlcNAcylacji na szlaki przekazywania sygnałów W komórkach nowotworowych często dochodzi do zaburzeń szlaków przekazywania sygnałów, które związane są z regulacją wzrostu, przeżycia i proliferacji komórek. Przykładami szlaków, których elementy ulegają regulacji przez O-GlcNAcylację są m.in. szlak kinaz aktywowanych mitogenami (ang. mitogen-activated protein kinases - MAPK), szlak kinazy mtor (ang. mammalian target of rapamycin kinase) oraz szlak kinazy aktywowanej 5 AMP (ang. 5 adenosine monophosphate-activated protein kinase - AMPK). Ze względu na udział tych szlaków w procesie nowotwotworzenia mogą być one potencjalnym celem terapii przeciwnowotworowej [1, 29]. Szlak MAPK uczestniczy w regulacji wzrostu, różnicowania i przeżycia komórki. Wpływa również na proces apoptozy i przerzutowania komórek nowotworowych. Jego nadmierna aktywacja jest obserwowana w wielu typach nowotworów [30]. Wysokie stężenie glukozy lub glukozaminy w komórce prowadzące do hiper-o-glcnacylacji przyczynia się do aktywacji kinaz z rodziny MAPK. Fosforylacji i aktywacji podlegają m.in. p38 (ang. p38 mitogen activated protein kinase), Erk1/2 (ang. extracellular signalregulated kinases 1/2 - p44/42), MKK3/6 (ang. mitogen-activated protein kinase kinase 3/6) oraz MEKK1/2 (ang. mitogen-activated protein kinase kinase 1/2). Efektem aktywacji tych białek jest wzmożona aktywacja całego szlaku

10 74 O-GlcNAcylacja w nowotworach MAPK [31]. Zaobserwowano, że wyciszenie ekspresji OGT przyczynia się do spadku aktywności szlaku MAPK w skutek zmniejszenia fosforylacji kinaz Erk1/2 [32, 33]. Głównym regulatorem metabolizmu i wzrostu komórki jest szlak mtor. Szlak ten może być aktywowany w wyniku działania czynników wzrostu, insuliny, czy też substancji odżywczych. Najlepiej poznanym mechanizmem aktywacyjnym mtor jest kaskada kinaz PI3K/Akt (ang. phosphoinositide 3-kinase/protein kinase B). Kinazy te mogą ulegać O-GlcNAcylacji przyczyniając się do regulacji aktywności szlaku mtor [34]. Podczas stymulowania komórki insuliną OGT przemieszcza się w okolice błony komórkowej, po czym łączy się z cząsteczkami fosfatydyloinozytolo-3,4,5- trifosforanu (ang. phosphatidylinositol (3,4,5)-triphosphate - PIP3) i ulega fosforylacji przez receptor insuliny, który posiada aktywność kinazy tyrozynowej. OGT wówczas przyłącza resztę N-acetyloglukozaminy do Akt, blokując tym samym fosforylację treoniny 308 przeprowadzaną przez PDK1 (ang. phosphoinositide-dependent kinase 1). Fosforylacja Thr308 jest niezbędna do aktywacji Akt, tak więc jej brak skutkuje zahamowaniem przekazywania sygnału w komórce [35] Szlak kinazy AMPK odpowiada za utrzymanie równowagi energetycznej w komórce. Jest on aktywowany wzrostem stosunku AMP/ATP i przyczynia się do zwiększenia katabolizmu i zmniejszenia anabolizmu w komórce [36]. Traktowanie adipocytów 3T3L1 glukozaminą, która powodowała zwiększenie aktywności HBP, szlaku którego końcowym produktem jest UDP-GlcNAc stanowiąca substrat dla OGT, wpłynęło pozytywnie na wzrost aktywności kinazy AMPK. Z drugiej strony, zmniejszenie poziomu reszt O-GlcNAc w komórkach przyczyniło się do obniżenia aktywności AMPK. Eksperyment ten dowiódł, że O-GlcNAcylacja wywiera znaczący wpływ na aktywność AMPK [37]. Ostatnie badania Bullen i wsp. [38] potwierdziły, że podjednostki α i γ AMPK są O-GlcNAcylowane. O-GlcNAcylacja podjednostki γ1 znacząco zwiększa aktywność AMPK [38].

11 Piotr Ciesielski, Anna Krześlak 75 Wpływ O-GlcNAcylacji na aktywność czynników transkrypcyjnych Proces transkrypcji genów regulowany jest, między innymi, przez szereg czynników transkrypcyjnych, które mogą ulegać różnym typom modyfikacji potranslacyjnych, w tym również modyfikacji przez reszty O-GlcNAc. O-GlcNAcylacja czynników transkrypcyjnych może oddziaływać na ich aktywność transkrypcyjną poprzez zmianę ich stabilności, wewnątrzkomórkowej lokalizacji, zdolności do wiązania się z DNA, czy też interakcji z innymi białkami. Duża liczba czynników transkrypcyjnych ulega O-GlcNAcylacji, ale tylko niektóre z nich w sposób istotny mają wpływ na proces nowotworzenia. Do czynników tych zaliczamy m.in. NF-κB (ang. nuclear factor kappa-lightchain-enhancer of activated B cells), YY1 (ang. yin yang 1), p53, c-myc (ang. myelocytomatosis), FoxO1 (ang. forkhead box protein O1), FoxM1 (ang. forkhead box protein M1) [39, 40]. NF-κB jest dimerem białkowym, składającym się z dwóch podjednostek: p65 (RelA) oraz p50. Występuje we wszystkich komórkach zwierząt i bierze udział w odpowiedzi komórki na bodźce stresowe, a ponadto reguluje proliferację limfocytów T i produkcję cytokin [41]. W cytoplazmie występuje w formie nieaktywnej transkrypcyjnie w połączeniu z inhibitorem IκB (ang. inhibitor of kappa B), który uniemożliwia transport NF-κB do jądra komórkowego. NF-κB może być aktywowany przez O-GlcNAcylację w dwojaki sposób. Pierwszy z nich to O-GlcNAcylacja Ser733 w kinazie IKKβ (ang. IκB kinase β), która staje się aktywna i fosforyluje IκB. Fosforylowany IκB odłącza się od sekwencji lokalizacji jądrowej NF-κB, a następnie ulega ubikwitynozależnej degradacji w proteasomie. Dzięki temu NF-κB może ulec translokacji do jądra komórkowego, gdzie działa jako czynnik transkrypcyjny. Drugim sposobem jest O-GlcNAcylacja samej cząsteczki NF-κB. W warunkach wysokiego stężenie glukozy, reszty O-GlcNAc przyłączane są do Thr322 i Thr352 podjednostki p65 czynnika transkrypcyjnego NF-κB. Nie zaobserwowano występowania O-GlcNAcylacji w podjednostce p50 [42, 43]. W badaniach na komórkach gruczolakoraka trzustki wykazano, że podstawienie Thr322 oraz Thr352 resztą alaniny wpływa na obniżenie zdolności komórek do wzrostu. Niemniej jednak, konieczne są dalsze badania nad wpływem O-GlcNAcylacji NF-κB na rozwój nowotworów [44].

12 76 O-GlcNAcylacja w nowotworach Białko YY1 jest czynnikiem transkrypcyjnym o strukturze palca cynkowego, który reguluje transkrypcję wielu genów, przez co wpływa na wzrost oraz różnicowanie komórek. Może zachowywać się zarówno jako aktywator, jak i represor transkrypcji. Podczas fazy G1 cyklu komórkowego YY1 tworzy kompleks z białkiem supresorowym Rb (ang. retinoblastoma). W kompleksie tym YY1 nie jest zdolny do wiązania się z DNA. O-GlcNAcylacja białka YY1 powoduje jego odłączenie od Rb, dzięki czemu białko to może wiązać się z DNA i pełnić funkcję regulatora ekspresji genów. W warunkach niskiego stężenia glukozy białko YY1 nie ulega O-GlcNAcylacji, co wpływa na zwiększenie liczby powstających kompleksów YY1-Rb. Widać więc, że O-GlcNAcylacja odgrywa ważną rolę w regulacji aktywności tego czynnika transkrypcyjnego, jednakże dokładny mechanizm przyłączenia reszt O-GlcNAc do YY1, jak i sposób, w jaki wpływa to na rozpad kompleksu YY1-Rb nie został jak do tej pory wyjaśniony [45, 46]. p53 jest najbardziej znanym białkiem supresorowym, którego gen ulega mutacji w ponad 50% nowotworów. Aktywność p53 kontrolowana jest przez różne modyfikacje potranslacyjne. Podczas działania na komórkę rozmaitych czynników stresowych, takich jak uszkodzenie DNA czy hipoksja, poziom p53 jest regulowany przez ubikwityno-zależną degradację w proteasomie, która zależna jest od fosforylacji Thr155. Fosforylacja w tej pozycji może być blokowana poprzez O-GlcNAcylację Ser149, co skutkuje zwiększoną stabilnością i aktywnością p53. Mogłoby to sugerować, że O-GlcNAcylacja p53 prowadzi do wzrostu aktywności supresorowej tego białka, a w konsekwencji do apoptozy. Aczkolwiek pojawiły się doniesienia o zwiększeniu pro-onkogennej aktywności O-GlcNAcylowanego p53. Dokładny mechanizm aktywacji p53 przez O-GlcNAcylację nie został jak dotąd poznany [47, 48]. Białko c-myc jest czynnikiem transkrypcyjnym, który jest wytwarzany w małych ilościach w większości prawidłowych komórek. Natomiast do jego nadmiernej ekspresji dochodzi w komórkach silnie proliferujących i komórkach nowotworowych. Pod wpływem czynników wzrostu dochodzi do fosforylacji Ser62 białka c-myc, co skutkuje wzrostem aktywności tego czynnika transkrypcyjnego. Fosforylacja Ser62 jest rozpoznawana przez kinazę GSK3β (ang. glycogen synthase kinase 3 beta), która fosforyluje Thr58 w pobliżu domeny transaktywacyjnej c-myc, co prowadzi do inaktywacji i w konsekwencji

13 Piotr Ciesielski, Anna Krześlak 77 do degradacji tego białka. Dowiedziono, że Thr58 może ulegać również O-GlcNAcylacji. O-GlcNAcylacja Thr58 sama w sobie nie zwiększa stabilności c-myc, lecz blokuje fosforylację Thr58 przez GSK3β, co zapobiega degradacji tego białka. Skutkuje to zwiększeniem aktywności c-myc oraz może prowadzić do nowotworzenia [49-51]. FoxO1 jest ważnym czynnikiem transkrypcyjnym mającym wpływ na regulację aktywności genów związanych z procesem apoptozy, cyklem komórkowym, metabolizmem komórki oraz odpowiedzią komórki na stres oksydacyjny. Ekspresja FoxO1 jest zwiększona w wielu typach nowotworów, wskazując na ważny udział tego czynnika w procesie nowotworzenia [52]. Kinaza Akt, aktywowana insuliną, fosforyluje Thr24, Ser256 oraz Ser319 FoxO1, co prowadzi do zmiany jego wewnątrzkomórkowej lokalizacji z jądrowej na cytoplazmatyczną. W cytoplazmie FoxO1 ulega ubikwitynozależnej degradacji [53]. Przy wysokim stężeniu glukozy w komórce, FoxO1 ulega O-GlcNAcylacji, która prowadzi do wzrostu aktywności tego czynnika transkrypcyjnego. Zaobserwowano, że modyfikacja ta może zachodzić w czterech różnych miejscach łańcucha polipeptydowego FoxO1, aczkolwiek tylko przyłączenie reszty O-GlcNAc do treoniny w pozycji 317 (Thr317) wpływa na zwiększenie aktywności transkrypcyjnej FoxO1 [54, 55]. Lynch i wsp. [21] zaobserwowali, że inhibicja aktywności OGT w komórkach raka prostaty PC3-ML skutkowała zwiększeniem degradacji FoxO1. Natomiast zwiększenie ekspresji OGT prowadziło do wzrostu aktywności FoxO1 [21]. FoxM1 jest czynnikiem transkrypcyjnym, którego głównym zadaniem jest regulacja cyklu komórkowego i proliferacji komórek. Oprócz tego, może również brać udział w naprawie DNA, różnicowaniu komórek, przerzutowaniu komórek nowotworowych, angiogenezie, czy też apoptozie. Ekspresja FoxM1 w komórkach prawidłowych kształtuje się na bardzo niskim poziomie, natomiast w komórkach silnie proliferujących oraz komórkach nowotworowych dochodzi do nadekspresji FoxM1 [56, 57]. Białko FoxM1 może ulegać O-GlcNAcylacji, aczkolwiek konkretne miejsca przyłączenia reszt O-GlcNAc nie zostały jak dotąd poznane. Zauważono, że obniżenie ekspresji OGT w komórkach raka piersi przy użyciu interferencji RNA powoduje znaczny spadek poziomu FoxM1. Obniżenie poziomu FoxM1 wpływa na zmniejszenie aktywności białka Skp2 (ang. S-phase kinase-associated protein 2) wchodzącego w skład

14 78 O-GlcNAcylacja w nowotworach kompleksu SCFSKP2 (ang. Skp, Cullin, F-box containing complex) mającego aktywność ligazy ubikwitynowej E3. Kompleks ten jest zaangażowany w degradację białka p27kip1 (ang. cyclin-dependent kinase inhibitor 1B) będącego inhibitorem cyklu komórkowego. Dochodzi więc do progresji cyklu komórkowego i wzrostu nowotworu [58]. Zaobserwowano również, że hipo-o- GlcNAcylacja w komórkach raka piersi i raka prostaty, prowadząca do spadku poziomu FoxM1, prowadziła do zmniejszenia zdolności komórek do przerzutowania oraz zahamowania angiogenezy. Było to związane ze spadkiem ekspresji metaloproteinazy 2 i 9 (ang. matrix metaloproteinases 2 and 9 MMP-2, -9) [21, 58]. Wpływ O-GlcNAcylacji na cykl komórkowy Zaobserwowano, że O-GlcNAcylacja wywiera istotny wpływ na progresję cyklu komórkowego w komórkach nowotworowych. Znaczący wzrost poziomu O-GlcNAcylacji białek ma miejsce we wszystkich fazach cyklu komórkowego, oprócz fazy S, w której dochodzi do spadku O-GlcNAcylacji. Natomiast poziom O-GlcNAcylacji pod koniec fazy M i po całkowitym zakończeniu cyklu komórkowego pozostaje, jak do tej pory, niezbadany. W zależności od fazy cyklu komórkowego O-GlcNAcylowane są różne białka, jednak przede wszystkim modyfikacji tej ulegają cykliny D, E, A, B oraz różnego typu kinazy. Generalnie, ogólny wzrost O-GlcNAcylacji jest skorelowany z progresją cyklu komórkowego oraz wzmożoną proliferacją komórek nowotworowych [59]. Większość komórek w organizmie człowieka znajduje się w fazie spoczynkowej (G0). Wejście w fazę G1, czyli pierwszą fazę cyklu komórkowego wymaga obecności zewnątrzkomórkowych sygnałów mitotycznych, które prowadzą do aktywacji szlaków kinaz MAPK i PI3K oraz do ekspresji cykliny D1, kluczowego regulatora fazy G1. Olivier-Van Stichelen i wsp. [60] zaobserwowali, że zablokowanie aktywności OGT przy użyciu inhibitora tego enzymu (Ac-5SGlcNAc) lub zmniejszenie ekspresji OGT w wyniku interferencji RNA, skutkowało zmniejszeniem aktywności kinaz MAPK i PI3K, co prowadziło do zmniejszenia ekspresji cykliny D1 i zahamowania proliferacji komórek. Ta sama grupa zaobserwowała, że podobny wpływ na zatrzymanie cyklu komórkowego w punkcie kontrolnym G0/G1 miało zmniejszenie aktywności szlaku HBP, w którym powstaje substrat dla OGT.

15 Piotr Ciesielski, Anna Krześlak 79 Natomiast zahamowanie aktywności OGA, a co za tym idzie wzrost O-GlcNAcylacji białek, prowadziło do przyspieszenia wejścia w fazę G1. Doniesienia te sugerują istotny udział O-GlcNAcylacji w przejściu komórki z fazy G0 do fazy G1 [60]. Faza S jest fazą cyklu komórkowego, podczas której DNA ulega replikacji. Punkt kontrolny G1/S odpowiada za sprawdzenie czy DNA nie jest uszkodzony. Tutaj, odwrotnie niż w fazie G0 i G1, obserwuje się spadek aktywności OGT oraz większą ekspresję i aktywność OGA, a co za tym idzie zmniejszenie ogólnego poziomu O-GlcNAcylacji. W fazie S obserwujemy spadek O-GlcNAcylacji histonów, co umożliwia dostęp do DNA dla kompleksu prereplikacyjnego. Ponadto zmniejsza się O-GlcNAcylacja kompleksów MCM3, 6 i 7 (ang. minichromosome maintenance). Poprzez regulację aktywności helikazy kompleksy te spełniają istotną rolę w procesie replikacji DNA [61, 62]. Dodatkowo, w fazie S dochodzi do zwiększonej ekspresji cykliny E aktywującej kinazę Cdk2 (ang. cyclin dependent kinase 2), która fosforyluje kompleksy MCM, co prowadzi do wzrostu ich aktywności [63]. Po fazie S następuje faza G2, w której komórka rośnie i przygotowuje się do wejścia w fazę M. Punkt kontrolny G2/M odpowiada za sprawdzenie czy DNA został całkowicie zreplikowany i czy nie jest uszkodzony. Istotną rolę odgrywają tutaj kompleksy: cyklina A-kinaza Cdk1/2 oraz cyklina B-kinaza Cdk1. Nie pozwalają one wejść komórce w fazę M, gdy materiał genetyczny zawiera uszkodzenia [64]. W fazie G2 ponownie dochodzi do znacznego wzrostu poziomu O-GlcNAcylacji, który niezbędny jest do przejścia z fazy G2 do M. W fazie M, OGT i OGA tworzą kompleks razem z kinazą Aurora B i białkową fosfatazą 1 (ang. protein phosphatase 1 - PP1). Kompleks ten odpowiada za utrzymanie stabilności ciałka pośredniego. Co ciekawe, zarówno wyciszenie ekspresji OGT, jak i OGA skutkuje zmniejszeniem ekspresji cykliny B1, co wskazuje na to, że odpowiedni poziom obu tych enzymów jest niezbędny dla prawidłowej progresji cyklu komórkowego [59, 65].

16 80 O-GlcNAcylacja w nowotworach O-GlcNAcylacja a metabolizm komórek nowotworowych Cechą charakterystyczną komórek nowotworowych jest zwiększone zapotrzebowanie na glukozę wynikające z intensywnej glikolizy. W komórkach prawidłowych podstawowym źródłem energii jest fosforylacja oksydacyjna, natomiast w komórkach nowotworowych dochodzi do glikolizy beztlenowej, w której powstający pirogronian zamiast trafiać do mitochondriów, gdzie ulegałby przekształceniu w acetylo-coa, jest przekształcany w mleczan. Istotnym jest fakt, że glikoliza w komórkach nowotworowych zachodzi nawet w obecności tlenu. Zjawisko to nazywane jest efektem Warburga. Nasilona glikoliza jest korzystna dla komórek nowotworowych ponieważ produkty pośrednie tego procesu zasilają szlaki biosyntezy nukleotydów, aminokwasów i lipidów. Zwiększona produkcja prekursorów do biosyntezy tych cząsteczek pozwala na szybki wzrost i proliferację komórek nowotworowych [66, 67]. Uważa się, że istotną rolę w zmianie metabolizmu komórek nowotworowych odgrywa proces O-GlcNAcylacji poprzez modyfikację czynników transkrypcyjnych, regulację aktywności enzymów metabolicznych oraz poprzez wpływ na szlaki sygnalizacyjne związane z onkogenezą [68, 69]. Cząsteczka UDP-GlcNAc, będąca substratem dla OGT, jest końcowym produktem szlaku biosyntezy heksozamin. Komórki nowotworowe cechują się zwiększonym zapotrzebowaniem na glukozę i glutaminę oraz nasilonym pobieraniem tych substratów, ze względu na zwiększoną liczbę ich transporterów na powierzchni komórki. Zwiększenie wewnątrzkomórkowego stężenia glukozy i glutaminy przyczynia się do pobudzenia szlaku biosyntezy heksozamin, co w konsekwencji prowadzi do hiper-o-glcnacylacji [70]. Nasilenie glikolizy w komórkach nowotworowych może być związane z O-GlcNAcylacją, a co za tym idzie aktywacją czynników transkrypcyjnych regulujących ekspresję genów kodujących enzymy glikolityczne, a także może wynikać z O-GlcNAcylacji samych enzymów. Badania wskazują, że wszystkie enzymy zaangażowane w glikolizę mogą być modyfikowane przez przyłączenie reszt O-GlcNAc, aczkolwiek tylko w przypadku trzech z nich stosunkowo dokładnie opisano wpływ tej modyfikacji na ich aktywność. Enzymami tymi są fosfofruktokinaza 1 (ang. phosphofructokinase 1 - PFK1), izoforma M2 kinazy pirogronianowej (ang. pyruvate kinase isoform M2 - PKM2) oraz heksokinaza (ang. hexokinase - HK) [71-74].

17 Piotr Ciesielski, Anna Krześlak 81 PFK1 katalizuje kluczowy etap w glikolizie, w którym fruktozo-6-fosforan zostaje ufosforylowany do fruktozo-1,6-bisfosforanu. Aktywna forma PFK1 tworzy oligomery w wyniku działania modulatora jakim jest fruktozo-2,6- bisfosforan (F-2,6-BP), a kluczową rolę w tej allosterycznej aktywacji odgrywa reszta seryny w pozycji 529 (Ser529) łańcucha polipeptydowego. O-GlcNAcylacja Ser529 PFK1 w komórkach nowotworowych prowadzi do zahamowania oligomeryzacji PFK1, a w konsekwencji do inhibicji aktywności tego enzymu. Powoduje to powstanie zwiększonej liczby produktów pośrednich glikolizy, które wywierają wpływ na aktywację szlaków bocznych glikolizy. Nadmiernej aktywacji ulega szlak pentozofosforanowy (ang. pentose phosphate pathway - PPP), co prowadzi do zwiększonej biosyntezy nukleotydów. Dodatkowo NADPH powstający w PPP wspomaga utrzymanie glutationu (GSH) w formie zredukowanej, przyczyniając się tym samym do wzrostu ochrony komórki przed stresem oksydacyjnym. Aktywacji ulega również szlak biosyntezy heksozamin, w którym powstaje UDP-GlcNAc będący substratem dla OGT. Przyczynia to się tym samym do zwiększenia procesu O-GlcNAcylacji białek w komórkach nowotworowych. Należy tutaj zaznaczyć, że zwiększona O-GlcNAcylacja PFK1 jest charakterystyczna tylko dla komórek nowotworowych, ale nie dla komórek prawidłowych o wysokim indeksie proliferacyjnym [74]. PKM2 jest enzymem charakterystycznym dla komórek nowotworowych, podczas gdy izoforma PKM1 (ang. pyruvate kinase isoform M1) ulega ekspresji głównie w komórkach dobrze zróżnicowanych. PKM2 katalizuje przemianę fosfoenolopirogronianu do pirogronianu. PKM2 wykazuje niską aktywność enzymatyczną w porównaniu do PKM1. Ta niska aktywność powoduje zmniejszenie wytwarzania pirogronianu w komórkach nowotworowych, natomiast sprzyja pobudzeniu aktywności szlaków bocznych glikolizy dzięki zwiększonej ilości produktów pośrednich. O-GlcNAcylacja PKM2 dodatkowo obniża aktywność tego enzymu zwiększając tym samym ilość powstających produktów pośrednich glikolizy. Do tej pory nie ustalono dokładnego miejsca przyłączenia reszty O-GlcNAc do PKM2 [19, 74]. O-GlcNAcylacji ulega również heksokinaza, która w przeciwieństwie do wcześniej omówionych enzymów, ulega aktywacji wskutek przyłączenia reszt O-GlcNAc. HK katalizuje pierwszy etap glikolizy, zwiększając tym samym ilość

18 82 O-GlcNAcylacja w nowotworach substratów dla PPP i HBP, które już i tak występują w dużych ilościach ze względu na zaburzenie funkcji PFK1 i PKM2. Widać więc, że wzrost O-GlcNAcylacji w komórkach nowotworowych jest nie tylko skutkiem zmiany metabolizmu komórki, lecz powoduje również przyśpieszenie rozwoju nowotworów poprzez regulację aktywności kluczowych enzymów metabolicznych [71, 75]. Wiele czynników transkrypcyjnych odgrywających ważną rolę w zmianie metabolizmu komórek nowotworowych ulega modyfikacji przez reszty O-GlcNAc. Ważniejszymi czynnikami transkrypcyjnymi wpływającymi na metabolizm komórki, które ulegają O-GlcNAcylacji są c-myc, NF-κB oraz ChREBP (ang. carbohydrate responsive element-binding protein). O-GlcNAcylacja wpływa na ich aktywność i stabilność [29]. Białko c-myc wpływa na glikolizę poprzez zwiększenie ekspresji białka wiążącego motywy polipirymidynowe (ang. polypyrimidin tract binding protein - PTB) oraz heterogennej jądrowej nukleoproteiny A1 i A2 (ang. heterogeneus nuclear ribonucleoprotein A1/A2 - hnrnp A1/A2), które sprzyjają zwiększonemu wytwarzaniu izoformy M2 kinazy pirogronianowej (PKM2) [76]. Uczestniczy również w transaktywacji dehydrogenazy A kwasu mlekowego (ang. lactate dehydrogenase-a - LDH-2), co zwiększa produkcję kwasu mlekowego [77]. c-myc przyczynia się również do zwiększonego napływu glukozy do wnętrza komórki poprzez zwiększenie ekspresji transportera glukozy GLUT1 (ang. glucose transporter 1) [78] oraz pobudzenia metabolizmu glutaminy poprzez zwiększenie ekspresji transporterów dla glutaminy oraz mitochondrialnej glutaminazy [79]. NF-κB może ulegać aktywacji przez O-GlcNAcylację w dwojaki sposób. Reszty O-GlcNAc mogą modyfikować podjednostkę p65 czynnika transkrypcyjnego NF-κB lub pośrednio wpływać na aktywację NF-κB poprzez O-GlcNAcylację kinazy IKKβ [44]. Przy braku p53, czynnik transkrypcyjny NF-κB powoduje zmniejszenie ekspresji genów mitochondrialnych, co przyczynia się do zmniejszenia fosforylacji oksydacyjnej i przełączenia metabolizmu komórkowego na glikolizę beztlenową [80]. Aktywacja NF-κB powoduje również zwiększenie ekspresji transportera glukozy GLUT3 (ang. glucose transporter 3) na powierzchni komórek skutkując tym samym

19 Piotr Ciesielski, Anna Krześlak 83 zwiększeniem napływu glukozy do wnętrza komórki, a co za tym idzie pobudzeniem glikolizy beztlenowej [43]. Czynnik transkrypcyjny ChREBP odgrywa kluczową rolę w pobudzeniu biosyntezy nukleotydów i kwasów tłuszczowych w komórkach nowotworowych. Hiper-O-GlcNAcylacja stabilizuje i powoduje zwiększenie aktywności ChREBP, co prowadzi do zwiększenia ekspresji genów kodujących enzymy metaboliczne, takich jak wątrobowa kinaza pirogronianowa (ang. liver pyruvate kinase - L-PK), karboksylaza acetylo-coa (ang. acetyl-coa carboxylase - ACC) oraz syntaza kwasów tłuszczowych (ang. fatty acid synthase - FAS) [81]. Zmniejszenie aktywności ChREBP prowadzi do zmiany metabolizmu komórki z glikolizy beztlenowej z powrotem na fosforylację oksydacyjną, co skutkuje zmniejszeniem proliferacji komórek nowotworowych i spowolnieniem wzrostu nowotworu [82]. O-GlcNAcylacja a progresja nowotworów Angiogeneza jest jednym z charakterystycznych procesów w czasie rozwoju nowotworu i polega na wytwarzaniu nowych naczyń krwionośnych z już istniejących. Przyczynia się to nie tylko do zaspokojenia potrzeb komórek nowotworowych na tlen i substancje odżywcze, ale także zwiększa zdolność komórek nowotworowych do przerzutowania [83]. O-GlcNAcylacja może wpływać na angiogenezę poprzez modyfikację czynnika wzrostu śródbłonka naczyniowego (ang. vascular endothelial growth factor - VEGF) oraz czynnika wzrostu fibroblastów (ang. fibroblast growth factor - FGF). Zmniejszenie poziomu O-GlcNAcylacji w komórkach raka prostaty PC3-ML, wywołane wyciszeniem ekspresji OGT, spowodowało spadek ekspresji VEGF, a w konsekwencji zahamowanie procesu angiogenezy [21, 84]. Istotną rolę w regulacji angiogenezy odgrywają cytoplazmatyczne metaloproteinazy. Zmniejszony poziom O-GlcNAcylacji wpływa negatywnie na ekspresję MMP-2 i MMP-9. Z kolei inhibicja OGA powoduje wzrost aktywności MMP-2 i -9 [25].

20 84 O-GlcNAcylacja w nowotworach Ryc. 3. Różnice w metabolizmie komórek prawidłowych i komórek nowotworowych. Uważa się, że istotną rolę w zmianie metabolizmu komórek nowotworowych odgrywa proces O-GlcNAcylacji poprzez modyfikację czynników transkrypcyjnych oraz regulację aktywności enzymów metabolicznych. O-GlcNAcylcja PFK i PKM2 zmniejszaja aktywność tych enzymów, natomiast O-GlcNAcylacja HK zwiększa. Prowadzi to do zwiększenia powstawania G-6-P oraz F-6-P, które są substratami dla szlaków bocznych glikolizy. O-GlcNAcylacji mogą ulegać również onkogeny takie jak NF-κB, ChREBP czy c-myc. Modyfikacja ta w pływa na ich stabilność i aktywność [wg [75]; zmieniono]. Fig. 3. Differences in metabolism between normal and cancer cells. It is suggested that O-GlcNAcylation promotes cancer cell metabolic reprogramming by the modification of transcription factors and the regulation of metabolic enzymes activity. O-GlcNAcylation reduces PFK and PKM activity and increases HK activity leading to the increased levels of glycolytic intermediates G-6-P and F-6-P. O-GlcNAcylation regulates also the stability and activity of oncogenes such as NF-κB, ChREBP and c-myc (modified after [75]).

21 Piotr Ciesielski, Anna Krześlak 85 Hiper-O-GlcNAcylacja w komórkach nowotworowych jest również czynnikiem przyczyniającym się do procesu przerzutowania nowotworów. Ważnym procesem prowadzącym do przerzutowania jest przejście epitelialnomezenchymalne (ang. epithelial-mesenchymal transition - EMT), w wyniku którego komórki epitelialne nabierają fenotypu mezenchymalnego. Przejście to jest charakterystyczne dla nowotworów złośliwych, a w jego trakcie dochodzi do zmniejszenia ilości E-kadheryny (marker epitelialny) w błonie komórkowej, natomiast zwiększa się ilość wimentyny (marker mezenchymalny) [85, 86]. O-GlcNAcylacja wpływa na zmniejszenie ilości E-kadheryny w błonie komórkowej poprzez blokowanie interakcji tego białka z jego partnerami, czyli białkiem p120 oraz β-kateniną. Dodatkowo, O-GlcNAcylacja wpływa na stabilizację Snail1 (ang. snail family zinc finger 1), czynnika transkrypcyjnego będącego represorem transkrypcyjnym E-kadheryny [87]. NF-κB, który ulega O-GlcNAcylacji w czasie rozwoju nowotworów, może wywierać pośredni wpływ na wzrost przerzutowania komórek nowotworowych poprzez jego wpływ na stabilizację Snail1 [24]. Podsumowanie O-GlcNAcylacja jest powszechną i dynamiczną modyfikacją białek cytoplazmatycznych i jądrowych, która jest włączona w regulację przekazywania sygnału, cyklu komórkowego, metabolizmu oraz procesów transkrypcji i translacji. Cechą charakterystyczną komórek nowotworowych jest zwiększenie poziomu O-GlcNAcylacji, wynikające przede wszystkim z deregulacji ekspresji enzymów związanych z tą modyfikacją. Hiper-O- GlcNAcylacja wpływa na proliferację, przeżycie i metabolizm komórek nowotworowych, jak również zwiększa ich zdolność do inwazji i metastazy. Wyniki szeregu badań wskazują, że analiza poziomu ekspresji enzymów zaangażowanych w proces O-GlcNAcylacji może zostać wykorzystana w diagnostyce nowotworów, a O-GlcNAc transferaza może być brana pod uwagę jako potencjalny cel terapii przeciwnowotworowej.

22 86 O-GlcNAcylacja w nowotworach Piśmiennictwo 1. Hanover JA, Krause MW, Love DC. The hexosamine signaling pathway: O-GlcNAc cycling in feast or famine. Biochim Biophys Acta. 2010; 1800: Slawson C, Hart GW. O-GlcNAc signalling: implications for cancer cell biology. Nat Rev Cancer. 2011; 11: Comer FI, Hart GW. O-Glycosylation of nuclear and cytosolic proteins. Dynamic interplay between O-GlcNAc and O-phosphate. J Biol Chem. 2000; 275: Hart GW, Slawson C, Ramirez-Correa G, Lagerlof O. Cross talk between O-GlcNAcylation and phosphorylation: roles in signaling, transcription, and chronic disease. Annu Rev Biochem. 2011; 80: Vocadlo DJ. O-GlcNAc processing enzymes: catalytic mechanisms, substrate specificity, and enzyme regulation. Curr Opin Chem Biol. 2012; 16: Egloff S, Murphy S. Cracking the RNA polymerase II CTD code. Trends Genet. 2008; 24: Butkinaree C, Park K, Hart GW. O-linked beta-n-acetylglucosamine (O-GlcNAc): Extensive crosstalk with phosphorylation to regulate signaling and transcription in response to nutrients and stress. Biochim Biophys Acta. 2010; 1800: Wells L, Kreppel LK, Comer FI, Wadzinski BE, Hart GW. O-GlcNAc transferase is in a functional complex with protein phosphatase 1 catalytic subunits. J Biol Chem. 2004; 279: Hu P, Shimoji S, Hart GW. Site-specific interplay between O-GlcNAcylation and phosphorylation in cellular regulation. FEBS Lett. 2010; 584: Zeidan Q, Hart GW. The intersections between O-GlcNAcylation and phosphorylation: implications for multiple signaling pathways. J Cell Sci. 2010; 123: Lazarus MB, Nam Y, Jiang J, Sliz P, Walker S. Structure of human O-GlcNAc transferase and its complex with a peptide substrate. Nature. 2011; 469: Hurtado-Guerrero R, Dorfmueller HC, van Aalten DM. Molecular mechanisms of O-GlcNAcylation. Curr Opin Struct Biol. 2008; 18: Iyer SP, Hart GW. Roles of the tetratricopeptide repeat domain in O-GlcNAc transferase targeting and protein substrate specificity. J Biol Chem. 2003; 278: Wrabl JO, Grishin NV. Homology between O-linked GlcNAc transferases and proteins of the glycogen phosphorylase superfamily. J Mol Biol. 2001; 314: Gao Y, Wells L, Comer FI, Parker GJ, Hart GW. Dynamic O-glycosylation of nuclear and cytosolic proteins: cloning and characterization of a neutral, cytosolic beta-n-acetylglucosaminidase from human brain. J Biol Chem. 2001; 276:

23 Piotr Ciesielski, Anna Krześlak Li J, Huang CL, Zhang LW, Lin L, Li ZH, Zhang FW, Wang P. Isoforms of human O-GlcNAcase show distinct catalytic efficiencies. Biochemistry (Mosc). 2010; 75: Keembiyehetty CN, Krzeslak A, Love DC, Hanover JA. A lipid-droplet-targeted O-GlcNAcase isoform is a key regulator of the proteasome. J Cell Sci. 2011; 124: Krześlak A, Forma E, Bernaciak M, Romanowicz H, Bryś M. Gene expression of O-GlcNAc cycling enzymes in human breast cancers. Clin Exp Med. 2012; 12: Champattanachai V, Netsirisawan P, Chaiyawat P, Phueaouan T, Charoenwattanasatien R, Chokchaichamnankit D i wsp. Proteomic analysis and abrogated expression of O-GlcNAcylated proteins associated with primary breast cancer. Proteomics. 2013; 13: Gu Y, Mi W, Ge Y, Liu H, Fan Q, Han C i wsp. GlcNAcylation plays an essential role in breast cancer metastasis. Cancer Res. 2010; 70: Lynch TP, Ferrer CM, Jackson SR, Shahriari KS, Vosseller K, Reginato MJ. Critical role of O-Linked β-n-acetylglucosamine transferase in prostate cancer invasion, angiogenesis, and metastasis. J Biol Chem. 2012; 287: Kamigaito T, Okaneya T, Kawakubo M, Shimojo H, Nishizawa O, Nakayama J. Overexpression of O-GlcNAc by prostate cancer cells is significantly associated with poor prognosis of patients. Prostate Cancer Prostatic Dis. 2014; 17: Krześlak A, Wójcik-Krowiranda K, Forma E, Bieńkiewicz A, Bryś M. Expression of genes encoding for enzymes associated with O-GlcNAcylation in endometrial carcinomas: clinicopathologic correlations. Ginekol Pol. 2012; 83: Ma Z, Vocadlo DJ, Vosseller K. Hyper-O-GlcNAcylation is anti-apoptotic and maintains constitutive NF-κB activity in pancreatic cancer cells. J Biol Chem. 2013; 288: Zhu Q, Zhou L, Yang Z, Lai M, Xie H, Wu L i wsp. O-GlcNAcylation plays a role in tumor recurrence of hepatocellular carcinoma following liver transplantation. Med Oncol. 2012; 29: Mi W, Gu Y, Han C, Liu H, Fan Q, Zhang X, Cong Q, Yu W. O-GlcNAcylation is a novel regulator of lung and colon cancer malignancy. Biochim Biophys Acta. 2011; 1812: Shi Y, Tomic J, Wen F, Shaha S, Bahlo A, Harrison R i wsp. Aberrant O-GlcNAcylation characterizes chronic lymphocytic leukemia. Leukemia. 2010; 24: Rozanski W, Krzeslak A, Forma E, Brys M, Blewniewski M, Wozniak P, Lipinski M. Prediction of bladder cancer based on urinary content of MGEA5 and OGT mrna level. Clin Lab. 2012; 58: Li Z, Yi W. Regulation of cancer metabolism by O-GlcNAcylation. Glycoconj J. 2014; 31:

24 88 O-GlcNAcylacja w nowotworach 30. Leelahavanichkul K, Amornphimoltham P, Molinolo AA, Basile JR, Koontongkaew S, Gutkind JS. A role for p38 MAPK in head and neck cancer cell growth and tumor-induced angiogenesis and lymphangiogenesis. Mol Oncol. 2014; 8: Kneass ZT, Marchase RB. Protein O-GlcNAc modulates motility-associated signaling intermediates in neutrophils. J Biol Chem. 2005; 280: Goldberg H, Whiteside C, Fantus IG. O-linked β-n-acetylglucosamine supports p38 MAPK activation by high glucose in glomerular mesangial cells. Am J Physiol Endocrinol Metab. 2011; 301: E Ding F, Yu L, Wang M, Xu S, Xia Q, Fu G. O-GlcNAcylation involvement in high glucose-induced cardiac hypertrophy via ERK1/2 and cyclin D2. Amino Acids. 2013; 45: Slawson C, Copeland RJ, Hart GW. O-GlcNAc signaling: a metabolic link between diabetes and cancer? Trends Biochem Sci. 2010; 35: Yang X, Ongusaha PP, Miles PD, Havstad JC, Zhang F, So WV i wsp. Phosphoinositide signalling links O-GlcNAc transferase to insulin resistance. Nature. 2008; 451: Fay JR, Steele V, Crowell JA. Energy homeostasis and cancer prevention: the AMP-activated protein kinase. Cancer Prev Res (Phila). 2009; 2: Luo B, Parker GJ, Cooksey RC, Soesanto Y, Evans M, Jones D, McClain DA. Chronic hexosamine flux stimulates fatty acid oxidation by activating AMPactivated protein kinase in adipocytes. J Biol Chem. 2007; 282: Bullen JW1, Balsbaugh JL, Chanda D, Shabanowitz J, Hunt DF, Neumann D, Hart GW. Cross-talk between two essential nutrient-sensitive enzymes: O-GlcNAc transferase (OGT) and AMP-activated protein kinase (AMPK).J Biol Chem. 2014; 289: Ozcan S, Andrali SS, Cantrell JE. Modulation of transcription factor function by O-GlcNAc modification. Biochim Biophys Acta. 2010; 1799: Fardini Y, Dehennaut V, Lefebvre T, Issad T. O-GlcNAcylation: A New Cancer Hallmark? Front Endocrinol (Lausanne). 2013; 4: Dolcet X, Llobet D, Pallares J, Matias-Guiu X. NF-kB in development and progression of human cancer. Virchows Arch. 2005; 446: Yang WH, Park SY, Nam HW, Kim do H, Kang JG, Kang ES i wsp. NFkappaB activation is associated with its O-GlcNAcylation state under hyperglycemic conditions. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008; 105: Kawauchi K, Araki K, Tobiume K, Tanaka N. p53 regulates glucose metabolizm through an IKK-NF-kappaB pathway and inhibits cell transformation. Nat Cell Biol. 2008; 10: Ma Z, Vocadlo DJ, Vosseller K. Hyper-O-GlcNAcylation is anti-apoptotic and maintains constitutive NF-κB activity in pancreatic cancer cells. J Biol Chem. 2013; 288:

THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE

THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE Anna Czarnecka Źródło: Intercellular signaling from the endoplasmatic reticulum to the nucleus: the unfolded protein response in yeast and mammals Ch. Patil & P. Walter The

Bardziej szczegółowo

Profil metaboliczny róŝnych organów ciała

Profil metaboliczny róŝnych organów ciała Profil metaboliczny róŝnych organów ciała Uwaga: tkanka tłuszczowa (adipose tissue) NIE wykorzystuje glicerolu do biosyntezy triacylogliceroli Endo-, para-, i autokrynna droga przekazu informacji biologicznej.

Bardziej szczegółowo

The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna

The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna Streszczenie rozprawy doktorskiej pt. The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna mgr Tomasz Turowski, promotor prof. dr hab.

Bardziej szczegółowo

Nukleotydy w układach biologicznych

Nukleotydy w układach biologicznych Nukleotydy w układach biologicznych Schemat 1. Dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy Schemat 2. Dinukleotyd NADP + Dinukleotydy NAD +, NADP + i FAD uczestniczą w procesach biochemicznych, w trakcie których

Bardziej szczegółowo

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza dr hab. Beata Schlichtholz Gdańsk, 20 października 2015 r. Katedra i Zakład Biochemii Gdański Uniwersytet Medyczny ul. Dębinki 1 80-211 Gdańsk Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza pt.

Bardziej szczegółowo

Przemiana materii i energii - Biologia.net.pl

Przemiana materii i energii - Biologia.net.pl Ogół przemian biochemicznych, które zachodzą w komórce składają się na jej metabolizm. Wyróżnia się dwa antagonistyczne procesy metabolizmu: anabolizm i katabolizm. Szlak metaboliczny w komórce, to szereg

Bardziej szczegółowo

Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany

Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany 1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy

Bardziej szczegółowo

MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN

MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN Jaka jest rola kinaz MA (generalnie)? Do czego służy roślinom (lub generalnie) fosfolipaza D? Czy u roślin występują hormony peptydowe? Wymień znane Ci rodzaje receptorów

Bardziej szczegółowo

Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego

Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego Aleksandra Sałagacka Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego Pracownia Biologii Molekularnej i Farmakogenomiki

Bardziej szczegółowo

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do

Bardziej szczegółowo

TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe

TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów

Bardziej szczegółowo

Do moich badań wybrałam przede wszystkim linię kostniakomięsaka 143B ze względu na jej wysoki potencjał przerzutowania. Do wykonania pracy

Do moich badań wybrałam przede wszystkim linię kostniakomięsaka 143B ze względu na jej wysoki potencjał przerzutowania. Do wykonania pracy Streszczenie Choroby nowotworowe stanowią bardzo ważny problem zdrowotny na świecie. Dlatego, medycyna dąży do znalezienia nowych skutecznych leków, ale również rozwiązań do walki z nowotworami. Głównym

Bardziej szczegółowo

Wykład 14 Biosynteza białek

Wykład 14 Biosynteza białek BIOCHEMIA Kierunek: Technologia Żywności i Żywienie Człowieka semestr III Wykład 14 Biosynteza białek WYDZIAŁ NAUK O ŻYWNOŚCI I RYBACTWA CENTRUM BIOIMMOBILIZACJI I INNOWACYJNYCH MATERIAŁÓW OPAKOWANIOWYCH

Bardziej szczegółowo

WYBRANE SKŁADNIKI POKARMOWE A GENY

WYBRANE SKŁADNIKI POKARMOWE A GENY WYBRANE SKŁADNIKI POKARMOWE A GENY d r i n ż. Magdalena Górnicka Zakład Oceny Żywienia Katedra Żywienia Człowieka WitaminyA, E i C oraz karotenoidy Selen Flawonoidy AKRYLOAMID Powstaje podczas przetwarzania

Bardziej szczegółowo

ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI

ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI Michał M. Dyzma PLAN REFERATU Historia badań nad wapniem Domeny białek wiążące wapń Homeostaza wapniowa w komórce Komórkowe rezerwuary wapnia Białka buforujące Pompy wapniowe

Bardziej szczegółowo

TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów

TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja

Bardziej szczegółowo

TRANSLACJA II etap ekspresji genów

TRANSLACJA II etap ekspresji genów TRANSLACJA II etap ekspresji genów Tłumaczenie informacji genetycznej zawartej w mrna (po transkrypcji z DNA) na aminokwasy budujące konkretne białko. trna Operon (wg. Jacob i Monod) Zgrupowane w jednym

Bardziej szczegółowo

października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II

października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II 10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona

Bardziej szczegółowo

Integracja metabolizmu

Integracja metabolizmu Integracja metabolizmu 1 Kluczowe związki w metabolizmie Glukozo- 6 -fosforan Pirogronian AcetyloCoA 2 Glukoza po wejściu do komórki ulega fosforylacji Metaboliczne przemiany glukozo- 6-fosforanu G-6-P

Bardziej szczegółowo

Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane. Genetyczne podłoże nowotworzenia

Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane. Genetyczne podłoże nowotworzenia Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Genetyczne podłoże nowotworzenia Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Połączenia komórek

Bardziej szczegółowo

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny

Bardziej szczegółowo

CHOROBY NOWOTWOROWE. Twór składający się z patologicznych komórek

CHOROBY NOWOTWOROWE. Twór składający się z patologicznych komórek CHOROBY NOWOTWOROWE Twór składający się z patologicznych komórek Powstały w wyniku wielostopniowej przemiany zwanej onkogenezą lub karcinogenezą Morfologicznie ma strukturę zbliżoną do tkanki prawidłowej,

Bardziej szczegółowo

Bliskie spotkania z biologią METABOLIZM. dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW. Instytut Biologii Eksperymetalnej, Zakład Biochemii i Biologii Komórki

Bliskie spotkania z biologią METABOLIZM. dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW. Instytut Biologii Eksperymetalnej, Zakład Biochemii i Biologii Komórki Bliskie spotkania z biologią METABOLIZM dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW Instytut Biologii Eksperymetalnej, Zakład Biochemii i Biologii Komórki Metabolizm całokształt przemian biochemicznych i towarzyszących

Bardziej szczegółowo

Wykład 13. Regulacja cyklu komórkowego w odpowiedzi na uszkodzenia DNA. Mechanizmy powstawania nowotworów

Wykład 13. Regulacja cyklu komórkowego w odpowiedzi na uszkodzenia DNA. Mechanizmy powstawania nowotworów Wykład 13 Regulacja cyklu komórkowego w odpowiedzi na uszkodzenia DNA Mechanizmy powstawania nowotworów Uszkodzenie DNA Wykrycie uszkodzenia Naprawa DNA Zatrzymanie cyklu kom. Apoptoza Źródła uszkodzeń

Bardziej szczegółowo

Kinaza Akt: kluczowy regulator metabolizmu i progresji nowotworów* Akt kinase: a key regulator of metabolism and progression of tumors

Kinaza Akt: kluczowy regulator metabolizmu i progresji nowotworów* Akt kinase: a key regulator of metabolism and progression of tumors Postepy Hig Med Dosw (online), 2010; 64: 490-503 e-issn 1732-2693 www.phmd.pl Review Received: 2010.03.11 Accepted: 2010.09.03 Published: 2010.10.19 Kinaza Akt: kluczowy regulator metabolizmu i progresji

Bardziej szczegółowo

Regulacja Ekspresji Genów

Regulacja Ekspresji Genów Regulacja Ekspresji Genów Wprowadzenie o Ekspresja genu jest to złożony proces jego transkrypcji do mrna, o Obróbki tego mrna, a następnie o Translacji do białka. 4/17/2019 2 4/17/2019 3 E 1 GEN 3 Promotor

Bardziej szczegółowo

Prokariota i Eukariota

Prokariota i Eukariota Prokariota i Eukariota W komórkach organizmów żywych ilość DNA jest zazwyczaj stała i charakterystyczna dla danego gatunku. ILOŚĆ DNA PRZYPADAJĄCA NA APARAT GENETYCZNY WZRASTA WRAZ Z BARDZIEJ FILOGENETYCZNIE

Bardziej szczegółowo

INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA

INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA 2007 by National Academy of Sciences Kornberg R D PNAS 2007;104:12955-12961 Struktura chromatyny pozwala na różny sposób odczytania informacji zawartej w DNA. Możliwe staje

Bardziej szczegółowo

Zgodnie z tzw. modelem interpunkcji trna, cząsteczki mt-trna wyznaczają miejsca

Zgodnie z tzw. modelem interpunkcji trna, cząsteczki mt-trna wyznaczają miejsca Tytuł pracy: Autor: Promotor rozprawy: Recenzenci: Funkcje białek ELAC2 i SUV3 u ssaków i ryb Danio rerio. Praca doktorska wykonana w Instytucie Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii UW Lien Brzeźniak

Bardziej szczegółowo

Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji?

Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji? WYKŁAD: 4 Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji? Prof. dr hab. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej 1 Dieta niskokaloryczna (calorie restriction,cr) 2 3 4 Zdjęcie 2. Stuletnia mieszkanka

Bardziej szczegółowo

B) podział (aldolowy) na 2 triozy. 2) izomeryzacja do fruktozo-6-p (aldoza w ketozę, dla umoŝliwienia kolejnych przemian)

B) podział (aldolowy) na 2 triozy. 2) izomeryzacja do fruktozo-6-p (aldoza w ketozę, dla umoŝliwienia kolejnych przemian) Glikoliza (Przegląd kluczowych struktur i reakcji) A) przygotowanie heksozy do podziału na dwie triozy: 1)fosforylacja glukozy (czyli przekształcenie w formę metabolicznie aktywną) 2) izomeryzacja do fruktozo-6-p

Bardziej szczegółowo

Składniki diety a stabilność struktury DNA

Składniki diety a stabilność struktury DNA Składniki diety a stabilność struktury DNA 1 DNA jedyna makrocząsteczka, której synteza jest ściśle kontrolowana, a powstałe błędy są naprawiane DNA jedyna makrocząsteczka naprawiana in vivo Replikacja

Bardziej szczegółowo

Biochemia Oddychanie wewnątrzkomórkowe

Biochemia Oddychanie wewnątrzkomórkowe Państwowa Wyższa Szkoła Zawodowa w Krośnie Biochemia Oddychanie wewnątrzkomórkowe Dr n. biol. Henryk Różański Laboratorium Biologii Przemysłowej i Eksperymentalnej Oddychanie Glikoliza beztlenowy, wewnątrzkomórkowy

Bardziej szczegółowo

Nowe terapie choroby Huntingtona. Grzegorz Witkowski Katowice 2014

Nowe terapie choroby Huntingtona. Grzegorz Witkowski Katowice 2014 Nowe terapie choroby Huntingtona Grzegorz Witkowski Katowice 2014 Terapie modyfikujące przebieg choroby Zahamowanie produkcji nieprawidłowej huntingtyny Leki oparte o palce cynkowe Małe interferujące RNA

Bardziej szczegółowo

Cykl komórkowy. Rozmnażanie komórek G 1, S, G 2. (powstanie 2 identycznych genetycznie komórek potomnych): podwojenie zawartości (interfaza)

Cykl komórkowy. Rozmnażanie komórek G 1, S, G 2. (powstanie 2 identycznych genetycznie komórek potomnych): podwojenie zawartości (interfaza) Rozmnażanie komórek (powstanie 2 identycznych genetycznie komórek potomnych): podwojenie zawartości (interfaza) G 1, S, G 2 podział komórki (faza M) Obejmuje: podwojenie zawartości komórki (skopiowanie

Bardziej szczegółowo

Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski. Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T. Joanna Frąckowiak

Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski. Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T. Joanna Frąckowiak Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T Joanna Frąckowiak Rozprawa doktorska Praca wykonana w Katedrze i Zakładzie Fizjopatologii Gdańskiego

Bardziej szczegółowo

Źródła energii dla mięśni. mgr. Joanna Misiorowska

Źródła energii dla mięśni. mgr. Joanna Misiorowska Źródła energii dla mięśni mgr. Joanna Misiorowska Skąd ta energia? Skurcz włókna mięśniowego wymaga nakładu energii w postaci ATP W zależności od czasu pracy mięśni, ATP może być uzyskiwany z różnych źródeł

Bardziej szczegółowo

Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna

Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:

Bardziej szczegółowo

Komórka eukariotyczna

Komórka eukariotyczna Komórka eukariotyczna http://pl.wikipedia.org/w/index.php?title=plik:hela_cells_stained_with_hoechst_33258.jpg cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii,

Bardziej szczegółowo

PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej)

PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej) PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej) Nadzieja Drela ndrela@biol.uw.edu.pl Konspekt do wykładu

Bardziej szczegółowo

Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF

Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF Agnieszka Gładysz Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF Katedra i Zakład Biochemii i Chemii Klinicznej Akademia Medyczna Prof.

Bardziej szczegółowo

Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna

Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:

Bardziej szczegółowo

starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg

starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg STRESZCZENIE Przewlekła białaczka limfocytowa (PBL) jest najczęstszą białaczką ludzi starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg kliniczny, zróżnicowane rokowanie. Etiologia

Bardziej szczegółowo

Geny i działania na nich

Geny i działania na nich Metody bioinformatyki Geny i działania na nich prof. dr hab. Jan Mulawka Trzy królestwa w biologii Prokaryota organizmy, których komórki nie zawierają jądra, np. bakterie Eukaryota - organizmy, których

Bardziej szczegółowo

Interakcje między abiotycznymi i biotycznymi czynnikami stresowymi: od teorii do praktyki Elżbieta Kuźniak Joanna Chojak

Interakcje między abiotycznymi i biotycznymi czynnikami stresowymi: od teorii do praktyki Elżbieta Kuźniak Joanna Chojak Katedra Fizjologii i Biochemii Roślin Uniwersytetu Łódzkiego Interakcje między abiotycznymi i biotycznymi czynnikami stresowymi: od teorii do praktyki Elżbieta Kuźniak Joanna Chojak Plan wykładu Przykłady

Bardziej szczegółowo

BIOENERGETYKA cz. I METABOLIZM WĘGLOWODANÓW I LIPIDÓW. dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny

BIOENERGETYKA cz. I METABOLIZM WĘGLOWODANÓW I LIPIDÓW. dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny BIOENERGETYKA cz. I METABOLIZM WĘGLOWODANÓW I LIPIDÓW dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny METABOLIZM/ENERGIA WĘGLOWODANY i LIPIDY WYKŁAD 6 Trawienie i wchłanianie WĘGLOWODANY TŁUSZCZE BIAŁKA Katabolizm

Bardziej szczegółowo

WYKŁAD: Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Klasyczny przepływ informacji. Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach

WYKŁAD: Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Klasyczny przepływ informacji. Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach WYKŁAD: Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach Prof. hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Białka Retrowirusy Białka Klasyczny

Bardziej szczegółowo

Spis treści. 1. Wiadomości wstępne Skład chemiczny i funkcje komórki Przedmowa do wydania czternastego... 13

Spis treści. 1. Wiadomości wstępne Skład chemiczny i funkcje komórki Przedmowa do wydania czternastego... 13 Przedmowa do wydania czternastego... 13 Częściej stosowane skróty... 15 1. Wiadomości wstępne... 19 1.1. Rys historyczny i pojęcia podstawowe... 19 1.2. Znaczenie biochemii w naukach rolniczych... 22 2.

Bardziej szczegółowo

Mgr Dorota Przybylska

Mgr Dorota Przybylska Mgr Dorota Przybylska Dziedzina: nauki biologiczne Dyscyplina: biochemia Wszczęcie: 11.12.2015 Temat: Rola oksydazy NADPH 4 oraz szlaku odpowiedzi na uszkodzenia DNA w starzeniu ludzkich komórek mięśni

Bardziej szczegółowo

Oddychanie komórkowe. Pozyskiwanie i przetwarzanie energii w komórkach roślinnych. Oddychanie zachodzi w mitochondriach Wykład 7.

Oddychanie komórkowe. Pozyskiwanie i przetwarzanie energii w komórkach roślinnych. Oddychanie zachodzi w mitochondriach Wykład 7. Wykład 7. Pozyskiwanie i przetwarzanie energii w komórkach roślinnych Literatura dodatkowa: Oddychanie to wielostopniowy proces utleniania substratów związany z wytwarzaniem w komórce metabolicznie użytecznej

Bardziej szczegółowo

Plan działania opracowała Anna Gajos

Plan działania opracowała Anna Gajos Plan działania 15.09-15.10 opracowała Anna Gajos Jakie zagadnienia trzeba opanować z następujących działów: 1. Budowa chemiczna organizmów. 2. Budowa i funkcjonowanie komórki 3. Cykl komórkowy 4. Metabolizm

Bardziej szczegółowo

Dr hab. Anna Bębenek Warszawa,

Dr hab. Anna Bębenek Warszawa, Dr hab. Anna Bębenek Warszawa, 14.01. 2018 Instytut Biochemii i Biofizyki PAN Ul. Pawińskiego 5a 02-106 Warszawa Recenzja pracy doktorskiej Pana mgr Michała Płachty Pod Tytułem Regulacja funkcjonowania

Bardziej szczegółowo

Wykład 5. Remodeling chromatyny

Wykład 5. Remodeling chromatyny Wykład 5 Remodeling chromatyny 1 Plan wykładu: 1. Przebudowa chromatyny 2. Struktura, funkcje oraz mechanizm działania kompleksów remodelujących chromatynę 3. Charakterystyka kompleksów typu SWI/SNF 4.

Bardziej szczegółowo

SEMINARIUM 8:

SEMINARIUM 8: SEMINARIUM 8: 24.11. 2016 Mikroelementy i pierwiastki śladowe, definicje, udział w metabolizmie ustroju reakcje biochemiczne zależne od aktywacji/inhibicji przy udziale mikroelementów i pierwiastków śladowych,

Bardziej szczegółowo

Bliskie spotkania z biologią. METABOLIZM część II. dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW

Bliskie spotkania z biologią. METABOLIZM część II. dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW Bliskie spotkania z biologią METABOLIZM część II dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW Instytut Biologii Eksperymetalnej, Zakład Biochemii i Biologii Komórki METABOLIZM KATABOLIZM - rozkład związków chemicznych

Bardziej szczegółowo

cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma Jądro komórkowe

cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma Jądro komórkowe Komórka eukariotyczna http://pl.wikipedia.org/w/index.php?title=plik:hela_cells_stained_with_hoechst_33258.jpg cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii,

Bardziej szczegółowo

Recenzja rozprawy doktorskiej

Recenzja rozprawy doktorskiej Prof. n. tech. dr hab. n. fiz. inż. lek. med. Halina Podbielska Katedra Inżynierii Biomedycznej i Pomiarowej Wydział Podstawowych Problemów Techniki Politechnika Wrocławska 50-370 Wrocław Wybrzeże Wyspiańskiego

Bardziej szczegółowo

IMMUNOHISTOCHEMICZNA OCENA MERKERÓW PROLIFERACJI KOMÓRKOWEJ W RAKU JELITA GRUBEGO

IMMUNOHISTOCHEMICZNA OCENA MERKERÓW PROLIFERACJI KOMÓRKOWEJ W RAKU JELITA GRUBEGO IMMUNOHISTOCHEMICZNA OCENA MERKERÓW PROLIFERACJI KOMÓRKOWEJ W RAKU JELITA GRUBEGO EWA STĘPIEŃ ZAKŁAD PATOMORFOLOGII OGÓLNEJ AKADEMII MEDYCZNEJ W BIAŁYMSTOKU KIEROWNIK I OPIEKUN PRACY: Dr KATARZYNA GUZIŃSKA-USTYMOWICZ

Bardziej szczegółowo

Zarówno u organizmów eukariotycznych, jak i prokariotycznych proces replikacji ma charakter semikonserwatywny.

Zarówno u organizmów eukariotycznych, jak i prokariotycznych proces replikacji ma charakter semikonserwatywny. HIPTEZY WYJAŚIAJĄCE MECHAIZM REPLIKACJI C. Model replikacji semikonserwatywnej zakłada on, że obie nici macierzystej cząsteczki DA są matrycą dla nowych, dosyntetyzowywanych nici REPLIKACJA każda z dwóch

Bardziej szczegółowo

Białka szoku termicznego jako pozytywne i negatywne regulatory w raku piersi

Białka szoku termicznego jako pozytywne i negatywne regulatory w raku piersi Marta Klimczak Studium Medycyny Molekularnej Warszawski Uniwersytet Medyczny Białka szoku termicznego jako pozytywne i negatywne regulatory w raku piersi Praca wykonana w Zakładzie Biologii Molekularnej

Bardziej szczegółowo

BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO

BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i

Bardziej szczegółowo

Terapia celowana. Część I. Mechanizmy przesyłania sygnałów przy udziale receptorów o aktywności kinazy tyrozynowej

Terapia celowana. Część I. Mechanizmy przesyłania sygnałów przy udziale receptorów o aktywności kinazy tyrozynowej Współczesna Onkologia (2007) vol. 11; 7 (331 336) Prawidłowe funkcjonowanie komórki jest uzależnione od ścisłej kontroli przekazywania informacji. W proces przenoszenia sygnałów zaangażowane są substancje

Bardziej szczegółowo

prof. dr hab. Maciej Ugorski Efekty kształcenia 2 Posiada podstawowe wiadomości z zakresu enzymologii BC_1A_W04

prof. dr hab. Maciej Ugorski Efekty kształcenia 2 Posiada podstawowe wiadomości z zakresu enzymologii BC_1A_W04 BIOCHEMIA (BC) Kod przedmiotu Nazwa przedmiotu Kierunek Poziom studiów Profil Rodzaj przedmiotu Semestr studiów 2 ECTS 5 Formy zajęć Osoba odpowiedzialna za przedmiot Język Wymagania wstępne Skrócony opis

Bardziej szczegółowo

Translacja i proteom komórki

Translacja i proteom komórki Translacja i proteom komórki 1. Kod genetyczny 2. Budowa rybosomów 3. Inicjacja translacji 4. Elongacja translacji 5. Terminacja translacji 6. Potranslacyjne zmiany polipeptydów 7. Translacja a retikulum

Bardziej szczegółowo

Toruń, dnia r.

Toruń, dnia r. dr hab. Dariusz Jan Smoliński Zakład Biologii Komórki Wydział Biologii i Ochrony Środowiska Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu Toruń, dnia 24.06.2013 r. RECENZJA rozprawy doktorskiej Pana magistra

Bardziej szczegółowo

Immunoterapia w praktyce rak nerki

Immunoterapia w praktyce rak nerki Immunoterapia w praktyce rak nerki VII Letnia Akademia Onkologiczna dla Dziennikarzy Warszawa 09 sierpień 2018 Piotr Tomczak Uniwersytet Medyczny Poznań Katedra i Klinika Onkologii Leczenie mrcc - zalecenia

Bardziej szczegółowo

Anna Markowska Klinika Perinatologii i Chorób Kobiecych

Anna Markowska Klinika Perinatologii i Chorób Kobiecych Anna Markowska Klinika Perinatologii i Chorób Kobiecych Epidemiologia zachorowalności na raka endometrium Na świecie W Polsce 2008 >288.000 4820 2012 >319.000 5426 Globocan 2012 Krajowy Rejestr Nowotworów

Bardziej szczegółowo

ROZPRAWA DOKTORSKA STRESZCZENIE

ROZPRAWA DOKTORSKA STRESZCZENIE Uniwersytet Medyczny w Lublinie Katedra i Zakład Patomorfologii Klinicznej ROZPRAWA DOKTORSKA STRESZCZENIE Lek. Joanna Irla-Miduch WERYFIKACJA HISTOPATOLOGICZNA I OCENA EKSPRESJI BIAŁKA p16 INK4A ORAZ

Bardziej szczegółowo

Onkogeneza i zjawisko przejścia nabłonkowomezenchymalnego. Gabriel Wcisło Klinika Onkologii Wojskowego Instytutu Medycznego, CSK MON, Warszawa

Onkogeneza i zjawisko przejścia nabłonkowomezenchymalnego. Gabriel Wcisło Klinika Onkologii Wojskowego Instytutu Medycznego, CSK MON, Warszawa Onkogeneza i zjawisko przejścia nabłonkowomezenchymalnego raka jajnika Gabriel Wcisło Klinika Onkologii Wojskowego Instytutu Medycznego, CSK MON, Warszawa Sześć diabelskich mocy a komórka rakowa (Gibbs

Bardziej szczegółowo

Związek szlaku pentozofosforanowego z regulacją replikacji DNA w ludzkich fibroblastach Karolina Fornalewicz

Związek szlaku pentozofosforanowego z regulacją replikacji DNA w ludzkich fibroblastach Karolina Fornalewicz Związek szlaku pentozofosforanowego z regulacją replikacji DNA w ludzkich fibroblastach Karolina Fornalewicz Replikacja DNA jest jednym z najważniejszych procesów zachodzących we wszystkich żywych organizmach

Bardziej szczegółowo

Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad

Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad Takao Ishikawa Faculty of Biology, University of Warsaw, Poland Performance of Polish students at IBO Gold Silver Bronze Merit

Bardziej szczegółowo

Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2

Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH

Bardziej szczegółowo

(węglowodanów i tłuszczów) Podstawowym produktem (nośnikiem energii) - ATP

(węglowodanów i tłuszczów) Podstawowym produktem (nośnikiem energii) - ATP śycie - wymaga nakładu energii źródłem - promienie świetlne - wykorzystywane do fotosyntezy - magazynowanie energii w wiązaniach chemicznych Wszystkie organizmy (a zwierzęce wyłącznie) pozyskują energię

Bardziej szczegółowo

dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ

dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ KOMÓRKI SATELITARNE (ang. stem cells) potencjał regeneracyjny mięśni HIPERTROFIA MIĘŚNI University College London,

Bardziej szczegółowo

DNA musi współdziałać z białkami!

DNA musi współdziałać z białkami! DNA musi współdziałać z białkami! Specyficzność oddziaływań między DNA a białkami wiążącymi DNA zależy od: zmian konformacyjnych wzdłuż cząsteczki DNA zróżnicowania struktury DNA wynikającego z sekwencji

Bardziej szczegółowo

USG Power Doppler jest użytecznym narzędziem pozwalającym na uwidocznienie wzmożonego przepływu naczyniowego w synovium będącego skutkiem zapalenia.

USG Power Doppler jest użytecznym narzędziem pozwalającym na uwidocznienie wzmożonego przepływu naczyniowego w synovium będącego skutkiem zapalenia. STRESZCZENIE Serologiczne markery angiogenezy u dzieci chorych na młodzieńcze idiopatyczne zapalenie stawów - korelacja z obrazem klinicznym i ultrasonograficznym MIZS to najczęstsza przewlekła artropatia

Bardziej szczegółowo

The Mos/mitogen-activated protein kinase (MAPK) pathway regulates the size and degradation of the first polar body in maturing mouse oocytes

The Mos/mitogen-activated protein kinase (MAPK) pathway regulates the size and degradation of the first polar body in maturing mouse oocytes The Mos/mitogen-activated protein kinase (MAPK) pathway regulates the size and degradation of the first polar body in maturing mouse oocytes TAESAENG CHOI*, KENJI FUKASAWA*, RENPING ZHOUt, LINO TESSAROLLO*,

Bardziej szczegółowo

Organizacja tkanek - narządy

Organizacja tkanek - narządy Organizacja tkanek - narządy Architektura skóry tkanki kręgowców zbiór wielu typów komórek danej tkanki i spoza tej tkanki (wnikają podczas rozwoju lub stale, w trakcie Ŝycia ) neurony komórki glejowe,

Bardziej szczegółowo

SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA

SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA SPIS TREŚCI: I. Wprowadzenie. II. Części lekcji. 1. Część wstępna. 2. Część realizacji. 3. Część podsumowująca. III. Karty pracy. 1. Karta

Bardziej szczegółowo

WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS

WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS KOLOKWIA; 15% KOLOKWIA-MIN; 21% WEJŚCIÓWKI; 6% WEJŚCIÓWKI-MIN; 5% EGZAMIN; 27% EGZAMIN-MIN; 26% WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS kolokwium I 12% poprawa kolokwium

Bardziej szczegółowo

OPTYMALNY POZIOM SPOŻYCIA BIAŁKA ZALECANY CZŁOWIEKOWI JANUSZ KELLER STUDIUM PODYPLOMOWE 2011

OPTYMALNY POZIOM SPOŻYCIA BIAŁKA ZALECANY CZŁOWIEKOWI JANUSZ KELLER STUDIUM PODYPLOMOWE 2011 OPTYMALNY POZIOM SPOŻYCIA BIAŁKA ZALECANY CZŁOWIEKOWI JANUSZ KELLER STUDIUM PODYPLOMOWE 2011 DLACZEGO DOROSŁY CZŁOWIEK (O STAŁEJ MASIE BIAŁKOWEJ CIAŁA) MUSI SPOŻYWAĆ BIAŁKO? NIEUSTAJĄCA WYMIANA BIAŁEK

Bardziej szczegółowo

Nowoczesne systemy ekspresji genów

Nowoczesne systemy ekspresji genów Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą

Bardziej szczegółowo

Biologiczne podstawy radioterapii Wykład 4 podstawy radioterapii

Biologiczne podstawy radioterapii Wykład 4 podstawy radioterapii Biologiczne podstawy radioterapii Wykład 4 podstawy radioterapii czyli dlaczego komórki nowotworowe są bardziej wrażliwe na działanie promieniowania jonizującego od komórek prawidłowych? A tumor is a conglomerate

Bardziej szczegółowo

MECHANIZM DZIAŁANIA HERBICYDÓW

MECHANIZM DZIAŁANIA HERBICYDÓW Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu Grzegorz Skrzypczak MECHANIZM DZIAŁANIA HERBICYDÓW metabolizm herbicydów Nowe technologie uprawy wymagają aby herbicyd był: - skuteczny biologicznie i efektywny ekonomicznie

Bardziej szczegółowo

Transport przez błony

Transport przez błony Transport przez błony Transport bierny Nie wymaga nakładu energii Transport aktywny Wymaga nakładu energii Dyfuzja prosta Dyfuzja ułatwiona Przenośniki Kanały jonowe Transport przez pory w błonie jądrowej

Bardziej szczegółowo

Właściwości szlaku sygnalizacyjnego białka p53 ujawnione podczas analizy skutków traktowania komórek rezweratrolem.

Właściwości szlaku sygnalizacyjnego białka p53 ujawnione podczas analizy skutków traktowania komórek rezweratrolem. Właściwości szlaku sygnalizacyjnego białka p53 ujawnione podczas analizy skutków traktowania komórek rezweratrolem. Streszczenie Ogólnym celem niniejszej pracy było lepsze zrozumienie funkcjonowania szlaku

Bardziej szczegółowo

Fizjologia człowieka

Fizjologia człowieka Fizjologia człowieka Wykład 2, część A CZYNNIKI WZROSTU CYTOKINY 2 1 Przykłady czynników wzrostu pobudzających proliferację: PDGF - cz.wzrostu z płytek krwi działa na proliferację i migrację fibroblastów,

Bardziej szczegółowo

Joanna Bereta, Aleksander Ko j Zarys biochemii. Seria Wydawnicza Wydziału Bio chemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego

Joanna Bereta, Aleksander Ko j Zarys biochemii. Seria Wydawnicza Wydziału Bio chemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego Joanna Bereta, Aleksander Ko j Zarys biochemii Seria Wydawnicza Wydziału Bio chemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego Copyright by Wydział Bio chemii, Biofizyki i Biotechnologii

Bardziej szczegółowo

Interfaza to niemal 90% cyklu komórkowego. Dzieli się na 3 fazy: G1, S i G2.

Interfaza to niemal 90% cyklu komórkowego. Dzieli się na 3 fazy: G1, S i G2. W wyniku podziału komórki powstaje komórka potomna, która ma o połowę mniej DNA od komórki macierzystej i jest o połowę mniejsza. Aby komórka potomna była zdolna do kolejnego podziału musi osiągnąć rozmiary

Bardziej szczegółowo

Wykład 1. Od atomów do komórek

Wykład 1. Od atomów do komórek Wykład 1. Od atomów do komórek Skład chemiczny komórek roślinnych Składniki mineralne (nieorganiczne) - popiół Substancje organiczne (sucha masa) - węglowodany - lipidy - kwasy nukleinowe - białka Woda

Bardziej szczegółowo

wielkość, kształt, typy

wielkość, kształt, typy Mitochondria 0,5-1µm wielkość, kształt, typy 1-7µm (10µm) Filmowanie poklatkowe (w mikroskopie fluorescencyjnym) sieci mitochondrialnej w komórkach droŝdŝy (krok czasowy 3 min) Mitochondria liczebność,

Bardziej szczegółowo

NUTRIGENOMIKA na co mają geny apetyt. Ewa Róg - Zielińska

NUTRIGENOMIKA na co mają geny apetyt. Ewa Róg - Zielińska NUTRIGENOMIKA na co mają geny apetyt Ewa Róg - Zielińska NUTRIGENOMIKA badanie zależności między żywieniem a odpowiedzią organizmu na poziomie ekspresji genów dieta ma wpływ na każdy etap ekspresji - na

Bardziej szczegółowo

Bezpośrednia embriogeneza somatyczna

Bezpośrednia embriogeneza somatyczna Bezpośrednia embriogeneza somatyczna Zarodki somatyczne formują się bezpośrednio tylko z tych komórek roślinnych, które są kompetentne już w momencie izolowania z rośliny macierzystej, czyli z proembriogenicznie

Bardziej szczegółowo

Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej

Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI () ćwiczenie prowadzone we współpracy z Pracownią Biofizyki Komórki Badanie dynamiki białek

Bardziej szczegółowo

Regulacja transkrypcji genów eukariotycznych

Regulacja transkrypcji genów eukariotycznych Regulacja transkrypcji genów eukariotycznych Dr hab. Marta Koblowska, prof. UW Zakład Biologii Systemów, Wydział Biologii UW Pracownia Analiz Mikromacierzy i Sekwencjonowania UW/IBB PAN Klasyczne wyobrażenie

Bardziej szczegółowo

Dane mikromacierzowe. Mateusz Markowicz Marta Stańska

Dane mikromacierzowe. Mateusz Markowicz Marta Stańska Dane mikromacierzowe Mateusz Markowicz Marta Stańska Mikromacierz Mikromacierz DNA (ang. DNA microarray) to szklana lub plastikowa płytka (o maksymalnych wymiarach 2,5 cm x 7,5 cm) z naniesionymi w regularnych

Bardziej szczegółowo

Mechanizmy kontroli rozwoju roślin. Rafał Archacki

Mechanizmy kontroli rozwoju roślin. Rafał Archacki Mechanizmy kontroli rozwoju roślin Rafał Archacki Drzewo życia pozycja roślin i zwierząt http://5e.plantphys.net/article.php?ch=t&id=399 Ewolucja roślin ewolucja procesu rozmnażania i rozwoju http://5e.plantphys.net/article.php?ch=t&id=399

Bardziej szczegółowo

Transport makrocząsteczek (białek)

Transport makrocząsteczek (białek) Transport makrocząsteczek (białek) Transport makrocząsteczek sortowanie białek - sekwencje sygnałowe lata 70-te XX w. - Günter Blobel - hipoteza sygnałowa; 1999r - nagroda Nobla Sekwencja sygnałowa: A

Bardziej szczegółowo

DNA superhelikalny eukariota DNA kolisty bakterie plazmidy mitochondria DNA liniowy wirusy otrzymywany in vitro

DNA superhelikalny eukariota DNA kolisty bakterie plazmidy mitochondria DNA liniowy wirusy otrzymywany in vitro DNA- kwas deoksyrybonukleinowy: DNA superhelikalny eukariota DNA kolisty bakterie plazmidy mitochondria DNA liniowy wirusy otrzymywany in vitro RNA- kwasy rybonukleinowe: RNA matrycowy (mrna) transkrybowany

Bardziej szczegółowo