Uniwersytet Śląski w Katowicach str. 1 Wydział

Transkrypt

1 Uniwersytet Śląski w Katowicach str. 1 Kierunek i poziom studiów: Chemia, drugi Sylabus modułu: Przedmiot B związany ze specjalnością (0310- CH-S2-002) Nazwa wariantu modułu: Biochemia z elementami genetyki (0310-CH-S2-L-057) 1. Informacje ogólne koordynator modułu prof. dr hab. Jerzy Silberring rok akademicki 2014/15 semestr letni forma studiów Studia drugiego stopnia stacjonarne sposób ustalania Ocena końcowa modułu ustalana jest na podstawie oceny z konwersatorium (0,5) oraz oceny końcowej oceny z kolokwium zaliczeniowego z wykładów (0,5). modułu Ocena z konwersatorium wystawiana jest na podstawie liczby uzyskanych punktów, maksymalnie 15 punktów, za przygotowanie i przedstawienie 3 prezentacji w grupach maksymalnie 2-osobowych (3 maksymalnie 5 pkt), zgodnie z kryteriami: 8-9 pkt - ocena dostateczna (3,0); 9, ocena plus dostateczna (3,5); 11,5-12,5 - ocena dobra (4,0); ocena plus dobra (4,5); 14, ocena bardzo dobra (5,0). Ocena z kolokwium z wykładów wystawiana jest na podstawie liczby uzyskanych punktów, maksymalnie 15 punktów, wg punktacji jak wyżej. Dopuszcza się uzyskania pozytywnej oceny końcowej modułu przy braku pozytywnego zaliczenia kolokwium z wykładów. 2. Opis dydaktycznych i pracy Wykład prowadzący treści 0310-CH-S2-L-057 _fs_1 Zagadnienia poruszane na wykładzie: 1. Podstawowe grupy związków: kwasy nukleinowe, białka, cukry i lipidy. Budowa komórek, tkanek i organizmów. 2. Aminokwasy jako podstawowe elementy budulcowe peptydów i białek. Leki peptydowe i białkowe 3. Wiązanie peptydowe, peptydy terapeutyczne. Białka proste i złożone struktura I-IVrzędowa, zależność pomiędzy strukturą i funkcją. 4. Hemoglobina allosteria, hemoglobiny patologiczne, mutacje genów a patofizjologia. 5. Enzymy i inhibitory enzymów mechanizm działania oraz ich inhibitory jako leki. 6. Węglowodany. Monosacharydy i disacharydy właściwości fizykochemiczne i znaczenie biologiczne. Polisacharydy struktura a własności, choroby spichrzeniowe, cukrzyca. 7. Lipidy. Podział lipidów. Błony biologiczne struktura i znaczenie, tratwy lipidowe. Rola lipidów w organizmie podstawowe przemiany. Defekty przemian lipidów lipidozy, lipidemie. 8. Przemiany energetyczne w komórkach zwierzęcych i roślinnych. 9. Techniki biochemiczne: ekstrakcja, homogenizacja, dializa, chromatografia (HPLC), elektroforeza, ultrawirowanie, spektrometria mas, metody obrazowania, zintegrowane systemy analityczne, mikro-tas).

2 Uniwersytet Śląski w Katowicach str. 2 metody prowadzenia dydaktycznych (kontaktowych) pracy własnej opis pracy własnej organizacja obowiązkowa uzupełniająca adres strony www Wykład z użyciem środków audiowizualnych Student pogłębia wiedzę zdobytą na wykładzie w oparciu o literaturę dodatkową i przygotowuje się do dyskusji i odpowiedzi na pytania dotyczące tematyki, poruszonej na wykładach. wykłady zblokowane J.M. Berg, J. L. Tymoczko i nowsze. Biochemia. PWN. Warszawa R.K. Murray i wsp i nowsze. Biochemia Harpera. PWN. Warszawa P. C. Turner, A. G. McLennen i in i nowsze. Krótkie wykłady Biologia molekularna. PWN. Warszawa B.D. Hames, N.M. Hooper, J.D. Houghton i nowsze. Biochemia. Krótkie wykłady. PWN. Warszawa neuro.agh.edu.pl Konwersatorium prowadzący treści 0310-CH-S2-L-057 _fs_2 Tematy do opracowania prezentacji i dyskusji do wystąpień:: Enzymy 1. Pojęcie optimum temperaturowego i optimum ph dla działania enzymu, omówienie na przykładach. 2. Inhibitory i aktywatory enzymów podstawy, zasada działania 3. Strategie regulacji aktywności katalitycznej enzymów 4. Allosteryczna regulacja działania enzymów na dowolnym przykładzie 5. Strategie proteaz na przykładzie chymotrypsyny, trypsyny i elastazy 6. Inhibitory proteaz jako leki (np. terapia HIV) 7. Izozymy definicja, przykłady, wykorzystanie w diagnostyce, metody analizy 8. Cyklooksygenaza budowa, mechanizm katalizy i znaczenie (inhibitory, stan zapalny); 9. Biochemiczne podstawy działania kwasu askorbinowego jako witaminy; 10. Anhydraza węglanowa jako przykład metaloenzymu. 11. Bakterie Gram + i Gram budowa komórki, charakterystyka ściany komórkowej 12. Lizozym naturalny antybiotyk - budowa, mechanizm katalizy i znaczenie; 13. Penicylina - znaczenie i mechanizm działania; 14. Mechanizmy oporności bakterii na antybiotyki; 15. Bakteriofagi i terapia fagowa jako alternatywa dla antybiotykoterapii Leki jako ligandy: 16. Budowa błony komórkowej i jej rola 17. Receptory G - Kofeina i teofilina substancje wpływające na przekaźnictwo sygnału z udziałem camp; 18. Receptorowe kinazy tyrozynowe - szlak sygnalizacji insuliny 19. Onkogeny (białka src i ras)

3 Uniwersytet Śląski w Katowicach str Wpływ agonistów i antagonistów na receptory (na przykładzie receptora opioidowego µ) 21. Metabolizm ksenobiotyków - faza Metabolizm ksenobiotyków - faza Problem uzależnienia i tolerancji na przykładzie morfiny 24. Mechanizmy przewodnictwa bodźców bólowych Immunologia 25. Budowa przeciwciał 26. Choroby autoimmunologiczne (przyczyny i przykłady ogólnie); 27. Stwardnienie rozsiane 28. Problemy z przeszczepami (omówienie HLA); 29. Alergie; 30. Szczepionki kiedy za, a kiedy przeciw? Genetyka 31. Koniugacja, transfekcja, transdukcja 32. Leki pozyskiwane z użyciem GMO; 33. Terapia genowa zasada terapii, za i przeciw. 34. PCR zasada działania i jego wykorzystanie w kryminalistyce i diagnostyce 35. Diagnostka z wykorzystaniem genetyki (Southern Blotting, FISH itd.) 36. Selektywne wyłączanie genów tworzenie organizmów knock-out i ich wykorzystanie 37. Choroby jako wynik mutacji punktowych 38. Choroby wynikające z aberracji chromosomów 39. Optogenetyka Metody stosowane w biochemii: 40. Proteomika 41. Metabolomika 42. Metody chromatograficzne w analizie białek 43. Elektroforeza żelowa i izoogniskowanie 44. Zasada działania i zastosowanie Western-Blottingu 45. Spektrometria mas metody prowadzenia dydaktycznych (kontaktowych) pracy własnej opis pracy własnej organizacja obowiązkowa uzupełniająca adres strony www Prezentacja, trwająca maksymalnie 10 minut, opracowanych tematów przez studentów i dyskusja prezentowanych treści, modulowana przez prowadzącego z pozostałymi uczestnikami konwersatorium Zebranie materiałów do prezentacji, ich analiza, przygotowanie prezentacji, jej przedstawienie i dyskusja z pozostałymi uczestnikami konwersatoriów. Jednostka zajęciowa: 2 godziny (po 45 minut) 6 razy w semestrze. Zajęcia odbywają się w salach Instytutu Chemii przy Bankowej 14. R.K. Murray i wsp i nowsze. Biochemia Harpera. PWN. Warszawa J.M. Berg, J. L. Tymoczko Biochemia. PWN. Warszawa T.A. Brown.2001 i nowsze. Genomy. PWN Warszawa Czasopisma fachowe polsko- i angielskojęzyczne

4 Uniwersytet Śląski w Katowicach str. 4 Konsultacje prowadzący treści metody prowadzenia dydaktycznych (kontaktowych) pracy własnej opis pracy własnej organizacja obowiązkowa uzupełniająca adres strony www 0310-CH-S2-L- 057_fs_3 Rozwiązywanie problemów z zakresu treści modułu, zgłaszanych przez studentów podczas przygotowania opracowywania tematów konwersatoriów. Indywidualne rozmowy ze mi 5 dowolna Student zapoznaje się z literaturą i zgłębia zagadnienia poruszane na wykładach oraz niezbędne do przygotowania prezentacji. Spotkania odbywająca się w pokojach konsultacyjnych w budynku WBiOŚ przy ulicy Jagiellońskiej 28 w terminach, uzgodnionych wcześniej z prowadzącym drogą elektroniczną. Dane kontaktowe przekazywane są studentom w trakcie spotkania organizacyjnego. J.M. Berg, J. L. Tymoczko i nowsze. Biochemia. PWN. Warszawa R.K. Murray i wsp i nowsze. Biochemia Harpera. PWN. Warszawa T.A. Brown.2001 i nowsze. Genomy. PWN Warszawa P. C. Turner, A. G. McLennen i in i nowsze. Krótkie wykłady Biologia molekularna. PWN. Warszawa 3. Opis sposobów weryfikacji efektów kształcenia modułu Prezentacja 0310-CH-S2-L-057 _w_ CH-S2-L-057 _fs_1 (-y) osoba(-y) przeprowadzająca(-e) weryfikację wymagania Każdy student przygotowuje w trakcie semestru 3 prezentacje w języku polskim, pracując merytoryczne w zespołach 2-osobowych. kryteria oceny Ocena każdej prezentacji w skali punktowej 0-5, z przeskokiem co 0,5. 5 punktów prezentacja jest prawidłowo przygotowana pod względem merytorycznym i graficznym, pozbawiona błędów ortograficznych, przedstawiane treści maksymalnie wyczerpują opracowywany temat (prezentacja obejmuje spis wykorzystanej w pracy literatury), student prezentuje przygotowany materiał bez posiłkowania się dodatkowymi

5 Uniwersytet Śląski w Katowicach str. 5 przebieg procesu weryfikacji materiałami, umie precyzyjnie i jasno odpowiedzieć na zadawane dodatkowo pytania lub pojawiające się wątpliwości pozostałych uczestników dyskusji 4 punkty prezentacja jest prawidłowo przygotowana pod względem merytorycznym i graficznym, pozbawiona błędów ortograficznych, przedstawiane treści maksymalnie wyczerpują opracowywany temat (prezentacja obejmuje spis wykorzystanej w pracy literatury), student prezentuje przygotowany materiał czytając tekst wcześniej przygotowany, nie potrafi precyzyjnie i jasno odpowiedzieć na zadawane pytania lub pojawiające się wątpliwości pozostałych uczestników dyskusji 3 punkty prezentacja jest prawidłowo przygotowana pod względem merytorycznym, ale zawiera błędy ortograficzne i jakość graficzna jest obniżona,przedstawiane treści nie wyczerpują maksymalnie opracowywanego tematu, student prezentuje przygotowany materiał czytając tekst wcześniej przygotowany, nie potrafi precyzyjnie i jasno odpowiedzieć na zadawane pytania lub pojawiające się wątpliwości pozostałych uczestników dyskusji; 2 punkty prezentacja zawiera błędy merytoryczne, ewentualnie ortograficzne; jakość graficzna przygotowanych slajdów jest/nie jest obniżona; przedstawiane treści nie wyczerpują maksymalnie opracowywanego tematu, student prezentuje przygotowany materiał czytając tekst wcześniej przygotowany, potrafi/nie potrafi precyzyjnie i jasno odpowiedzieć na zadawane pytania lub pojawiające się wątpliwości pozostałych uczestników dyskusji 1-punkt - prezentacja zawiera liczne błędy merytoryczne i ortograficzne; jakość graficzna przygotowanych slajdów jest obniżona; prezentowane treści tylko w niewielkim stopniu odzwierciedlają dostępne dane literaturowe, student prezentuje przygotowany materiał czytając tekst wcześniej przygotowany, nie potrafi precyzyjnie i jasno odpowiedzieć na zadawane pytania lub pojawiające się wątpliwości pozostałych uczestników dyskusji 0 punktów brak przygotowania prezentacji multimedialnej i/lub jej przedstawienia. Ocena wygłoszonych prezentacji odbywa się bezpośrednio po ich wygłoszeniu oraz zakończeniu dyskusji. Oceny są przekazywane studentom w trakcie trwania konwersatoriów, a następnie przekazywane drogą elektroniczną na wskazanych przez studentów adres mailowy. Wybór tematów prezentacji jest dobrowolny i odbywa się na przynajmniej na 7 dni przed terminem ich wygłoszenia. Kolokwium zaliczeniowe z wykładów 0310-CH-S2-L- 057_w_2 (-y) 0310-CH-S2-L-057_fs_2 osoba(-y) przeprowadzająca(-e) weryfikację wymagania Na kolokwium pisemnym obowiązują treści, obejmujące głównie zagadnienia merytoryczne prezentowane podczas wykładów. Dopuszcza się możliwość włączenia do pytań treści, prezentowanych i omawianych podczas konwersatoriów. kryteria oceny Kolokwium pisemne składa się z 30 pytań zamkniętych, wśród których prawidłowa jest tylko jedna odpowiedź prawidłowa. Każde prawidłowa odpowiedź punktowana jest 0,5 punktem. przebieg procesu Test, stanowiący kolokwium pisemne z wykładów, trwa maksymalnie 60 minut. Studenci weryfikacji udzielają odpowiedzi na nartach odpowiedzi. Bezpośrednio po zakończeniu testu zliczane są punkty i przeliczane na ocenę zgodnie z kryteriami: 8-9 pkt - ocena dostateczna (3,0); 9, ocena plus dostateczna (3,5); 11,5-12,5 - ocena dobra (4,0); ocena plus dobra (4,5); 14, ocena bardzo dobra (5,0). Wyniki udostępniane są studentom

6 Uniwersytet Śląski w Katowicach str. 6 bezpośrednio po zakończeniu weryfikacji, a następnie przekazywane drogą elektroniczną na wskazanych przez studentów adres mailowy. Istnieje możliwość bezpośredniego obejrzenia pracy po zakończeniu testu i sprawdzenia zaproponowanych odpowiedzi, jak również konsultacji w związku z obecnością wszystkich prowadzących wykłady na kolokwium zaliczeniowym.