INFORMACJE O ZMIENIANYM OGŁOSZENIU SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY SEKCJA II: ZMIANY W OGŁOSZENIU. Ogłoszenie nr N-2017 z dnia r.

Save this PDF as:
 WORD  PNG  TXT  JPG

Wielkość: px
Rozpocząć pokaz od strony:

Download "INFORMACJE O ZMIENIANYM OGŁOSZENIU SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY SEKCJA II: ZMIANY W OGŁOSZENIU. Ogłoszenie nr N-2017 z dnia r."

Transkrypt

1 Ogłoszenie nr N-2017 z dnia r. Skierniewice: OGŁOSZENIE O ZMIANIE OGŁOSZENIA OGŁOSZENIE DOTYCZY: Ogłoszenia o zamówieniu INFORMACJE O ZMIENIANYM OGŁOSZENIU Numer: N-2017 Data: SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY Instytut Ogrodnictwa, Krajowy numer identyfikacyjny , ul. ul. Konstytucji 3 Maja 1/3, Skierniewice, woj. łódzkie, państwo Polska, tel , faks Adres strony internetowej (url): SEKCJA II: ZMIANY W OGŁOSZENIU II.1) Tekst, który należy zmienić: Miejsce, w którym znajduje się zmieniany tekst: Numer sekcji: Załącznik - część nr 18 Punkt: 1 W ogłoszeniu jest: 2,4-Dimethylaniline (2,4-Xylidine) Reference Materials for Residue Analysis, czystość 99,5%, materiał referencyjny - wzorzec do chromatografii gazowej (GC) do badania pozostałości pestycydów. Planowana ilość: 1 opakowanie, 0,5 g. W ogłoszeniu powinno być: 2,4-Dimethylaniline (2,4-Xylidine) Reference Materials for Residue Analysis, czystość co najmniej 99,3%, materiał referencyjny - wzorzec do chromatografii gazowej (GC) do badania pozostałości pestycydów. Planowana ilość: 1 opakowanie, 0,5 g. Miejsce, w którym znajduje się zmieniany tekst: Numer sekcji: Załącznik - część nr 18 Punkt: 1

2 W ogłoszeniu jest: Bromfenvinfos Reference Materials for Residue Analysis, czystość 95,5% - materiał referencyjny - wzorzec do chromatografii gazowej (GC) do badania pozostałości pestycydów. Planowana ilość: 1 opakowanie, 0,1 g. W ogłoszeniu powinno być: Bromfenvinfos Reference Materials for Residue Analysis, czystość co najmniej 95,4% - materiał referencyjny - wzorzec do chromatografii gazowej (GC) do badania pozostałości pestycydów. Planowana ilość: 1 opakowanie, 0,1 g. Miejsce, w którym znajduje się zmieniany tekst: Numer sekcji: Załącznik - część nr 18 Punkt: 1 W ogłoszeniu jest: au-fluvalinate Reference Materials for Residue Analysis, czystość 99,0% - materiał referencyjny - wzorzec do chromatografii gazowej (GC) do badania pozostałości pestycydów. Planowana ilość: 1 opakowanie, 0,1 g. W ogłoszeniu powinno być: tau-fluvalinate Reference Materials for Residue Analysis, czystość co najmniej 94,9% - materiał referencyjny - wzorzec do chromatografii gazowej (GC) do badania pozostałości pestycydów.planowana ilość: 1 opakowanie, 0,1 g. Miejsce, w którym znajduje się zmieniany tekst: Numer sekcji: Załącznik - część nr 18 Punkt: 1 W ogłoszeniu jest: Nicarbazine Standard analityczny o minimalnej czystości 99,0%. Forma krystaliczne ciało stałe CAS: Planowana ilość: 1 opakowanie, 100 g. W ogłoszeniu powinno być: Nicarbazine Standard analityczny o minimalnej czystość co najmniej 98,7%. Forma krystaliczne ciało stałe CAS: Planowana ilość: 1 opakowanie, 100 g. Miejsce, w którym znajduje się zmieniany tekst: Numer sekcji: Załącznik - część nr 1 Punkt: 1 W ogłoszeniu jest: Zestaw do klonowania DNA OverLap Assembly, yestaw do wklonowzwania DNA do wektora. Planowana ilość: 1 W ogłoszeniu powinno być: Zestaw do klonowania DNA OverLap Assembly, zestaw do wklonowywania DNA do wektora.planowana ilość: 1, 50 reakcji.

3 Miejsce, w którym znajduje się zmieniany tekst: Numer sekcji: Załącznik - część nr 56 Punkt: 1 W ogłoszeniu jest: DreamTaq DNA Polymerase THERMO FISHER SCIENTIFIC lub równoważne* K1072 2x stężona gotowa mieszanina przeznaczona do rutynowej reakcji PCR z amplifikacją fragmentów DNA genomowego, RT-PCR, generowania fragmentów PCR do klonowania TA, genotypowania. Mieszanina powinna zawierać polimerazę charakteryzującą się najwyższą możliwą czułością wśród tradycyjnych i modyfikowanych polimeraz Taq, wysokowydajną amplifikacją przy minimalnej optymalizacji, częstotliwością błędów nie większą aniżeli 2,2 x 10-5 błędów/nukleotyd w każdym cyklu, amplifikacją fragmentów długich do 6kpz dla genomowego DNA oraz do 20kpz dla wirusowego DNA, generować końce 3'-dA, możliwością wbudowywania modyfikowanych nukleotydów z wyłączeniem dutp; mieszaninę datp, dctp, dgtp i dttp w stężeniu 0,4mM każdy; 4mM MgCl2; Produkt powinien zostać dostarczony w ilości wystarczającej na 1000 prób po 50µl każda wraz z wodą czystą od DNaz i RNaz. Planowana ilość: 2 opakowania, po 2500 U. DreamTaq Green Master Mix THERMO FISHER SCIENTIFIC lub równoważne*k1082 2x stężona gotowa mieszanina przeznaczona do rutynowej reakcji PCR z amplifikacją fragmentów DNA genomowego, RT-PCR, generowania fragmentów PCR do klonowania TA, genotypowania. Mieszanina powinna zawierać polimerazę charakteryzującą się najwyższą możliwą czułością wśród tradycyjnych i modyfikowanych polimeraz Taq, wysokowydajną amplifikacją przy minimalnej optymalizacji, częstotliwością błędów nie większą aniżeli 2,2 x 10-5 błędów/nukleotyd w każdym cyklu, amplifikacją fragmentów długich do 6kpz dla genomowego DNA oraz do 20kpz dla wirusowego DNA, generować końce 3'-dA, możliwością wbudowywania modyfikowanych nukleotydów z wyłączeniem dutp; mieszaninę datp, dctp, dgtp i dttp w stężeniu 0,4mM każdy; 4mM MgCl2; zielony obciążnik umożliwiający bezpośrednie nakładanie próby po reakcji na żel agarozowy. Obciążnik powinien zawierać barwniki umożliwiające kontrolę migracji próbki podczas elektroforezy: niebieski, migrujący na wysokości 3 5 kpz 1% żelu agarozowym oraz żółty migrujący szybciej aniżeli fragment DNA o wielkości 10pz. Maksymalna absorpcja barwników powinna być osiągana przy 424nm i 615nm. Produkt powinien zostać dostarczony w ilości wystarczającej na 1000 prób po 50µl każda wraz z wodą czystą od DNaz i RNaz. Planowana ilość: 4 opakowania, po 1000 reakcji. Enzym restrykcyjny Bsu15I, Koncentracja 10U/µL, Żródło: Bacillus subtilis 15, dostarczony z: _ml of 10X Buffer Tango, Przechowywany

4 w -20 C. 1X Tango Buffer (dla trawienia 100% Bsu15I) 33 mm Tris-acetate (ph 7.9), 10 mm octanu magnezu, 66 mm octanu potasu, 0.1 mg/ml BSA.Temperatura inkubacji 37 C. Jedna jednostka jest określona jako ilość enzymu potrzebna do strawienia 1 μg lambda DNA w ciągu 1 godziny w temp. 37 C w 50 μl zalecanego buforu do reakcji. Rozcieńczenie z buforem (#B19): 10 mm Tris-HCl (ph 7.4 at 25 C), 100 mm KCl, 1 mm EDTA, 1 mm DTT, 0.2mg/mL BSA i 50% glicerol. podwójne Digests Tango Buffer zapewnia uproszczony wybór buforów dla podwójnego trawienia. 98% enzymu restrykcyjnego jest aktywna w stężeniu 1X lub 2X Tango Buffer. Bufor do przechowywania Bsu15I jest dostarczony w: 10 mm Tris-HCl (ph 7.4 w 25 C), 100 mm KCl, 1mM EDTA, 1 mm DTT, 0.15% Triton X-100, 0.2 mg/ml BSA i 50% glicerol. Wpływ na trawienie metylacji Dam: mogą się pokrywać- zablokowane. Dcm: nigdy nie zachodzi na siebie -brak efektu. CpG: całkowicie nakłada się -blokuje. EcoKI: nigdy się nie pokrywajążadnego efektu. EcoBI: może się pokrywać-nieefektywne. Stabilność podczas przedłużonej inkubacji. Minimum 0.1 jednostki jest potrzebna do całkowitego strawienia 1 μg lambda DNA w ciągu 16 godzin w 37 C. Do całkowitego strawienia 1 μg DNA osadzonego w agarze potrzeba minimum 5 jednostek enzymu w ciągu 16 godzin.termiczna inaktywacja enzymu Bsu15I jest inaktywowana w 65 C przez 20 min. Planowana ilość: 2 opakowania, po 600 U. Enzym restrykcyjny Eco31I, Koncentracja: 10U/µL, Źródło: E. coli zawierający gen eco31ir z E.coli RFL31, dostarczony z 1mL 10X Buffer G, 1mL 10X Buffer Tango. Przechowywać w -20 C. 1X Buffer G (dla trawienia w 100% Eco31I) 10 mm Tris-HCl (ph 7.5), 10 mm MgCl2, 50 mm NaCl, 0.1 mg/ml BSA.Temperatura inkubacji 37 C. Jedna jednostka jest zdefiniowana jako ilość enzymu potrzebna do całkowitego strawienia 1 μg lambda DNA dcm -HindIII fragmentui w ciągu 1 godziny w 37 C w 50 μl zalecanego buforu do reakcji. Rozcieńczenie z buforem do rozcieńczenia (#B19): 10mM Tris-HCl (ph 7.4 w 25 C), 100 mm KCl, 1 mm EDTA, 1 mm DTT, 0.2 mg/ml BSA i 50% glicerol. Podwójne Digests Thermo Scientific Tango Bufferzapewnia uproszczony wybór buforów dfo podwójnego trawienia. 98% enzymów restrykcyjnych działa w stężeniu 1X lub 2X Tango Buffer. 1X Tango Buffer: 33 mm Trisacetate (ph 7.9 w 37 C), 10 mm octan magnezu, 66 mm octan potasu, 0.1 mg/ml BSA. Bufor do przechowywania Eco31I jest dostarczany w: 10 mm Tris-HCl (ph 7.5 at 25 C), 200 mm KCl, 1 mm DTT, 0.1 mm EDTA, 0.2 mg/ml BSA i 50% glicerol. Methylation Effects on Digestion Dam: never overlaps no effect. Dcm: may overlap cleavage impaired. CpG: may overlap cleavage impaired. EcoKI: never overlaps no effect. EcoBI: may overlap effect not determined. Stability during Prolonged Incubation A minimum of 0.3 units of the enzyme is required for complete digestion of 1 μg of lambda DNA dcm in 16 hours at 37 C. Digestion of

5 Agarose-embedded DNA A minimum of 5 units of the enzyme is required for complete digestion of 1 μg of agarose-embedded lambda DNA dcm in 16 hours. Planowana ilość: 1 opakowanie, 1000 U. Enzym restrykcyjny Esp3I, Koncentracja: 10U/µL, Źródło: E.coli, który przenosi sklonowany gen esp3ir z Hafnia alvei RFL3. Dostarczony z: 10mL of 10X Buffer Tango. Przechowywany w -20 C. [1X Thermo Scientific Tango Buffer]+DTT (dla 100% trawienia Esp3I)[33 mm Tris-acetate (ph 7.9), 10 mm octan magnezu, 66 mm octan potasu, 0.1 mg/ml BSA]+1.0 mm DTT. Temperatura inkubacji 37 C. Jedna jednostka jest zdefiniowana jako ilość Esp3I potrzebna do strawienia 1 μg lambda DNA w ciągu 1 godziny w 37 C w 50 μl zalecanego buforu do reakcji. Rozcieńczenie z buforem do rozcieńczenia (#B19): 10 mm Tris-HCl (ph 7.4 at 25 C), 100 mm KCl, 1 mm EDTA, 1 mm DTT, 0.2 mg/ml BSA i 50% glicerol.podwójne trawienie Tango Buffer upraszcza dobór buforów do podwójnego trawienia. 98% Thermo Scientific enzymów restrykcyjnych działa w stężeniu 1X lub 2X buforu Tango. Bufor do przechowywania Esp3I jest dostarczany w:10 mm fosforanu potasu (ph 7.4 w 25 C), 100 mm KCl, 1 mm EDTA, 7 mm 2-merkaptoetanolu, 0.5 mg/ml BSA i 50% (v/v) glicerol. Efekt metylacji - brak. Stabilność podczas przedłużonej inkubacji: Do całkowitego trawienia 1 μg DNA lambda w ciągu 16 godzin w temperaturze 37 C wymagane jest co najmniej 0,2 jednostki enzymu. Trawienie DNA osadzonego na bazie agaroz: W celu całkowitego trawienia 1 μg agarozowego osadzonego DNA lambda w ciągu 16 godzin wymagane jest co najmniej 5 jednostek enzymu. Planowana ilość: 1 opakowanie 200 U. Enzym restrykcyjny TaiI, Koncentracja: 10 U/μL Źródło: Thermus aquaticus Cc1-331 dostarczony z:1 ml 10X Buffer R, 1 ml 10X Buffer Tango, przechowywanie w -20 C. 1X Buffer R (dla 100% trawienia TaiI) 10 mm Tris-HCl (ph 8.5), 10 mm MgCl2, 100 mm KCl, 0.1 mg/ml BSA.Temperatura inkubacji 65 C. Jedna jednostka jest zdefiniowana jako ilość TaiI potrzebna do strawienia 1 μg lambda DNA w ciągu 1 godziny w 65 C w 50 μl rekomendowanego buforu do reakcji. Rozcieńczenie z buforem do rozcieńczenia (#B19): 10 mm Tris-HCl (ph 7.4 w 25 C), 100 mm KCl, 1 mm EDTA, 1 mm DTT, 0.2 mg/ml BSA i 50% glicerol. podwójne trawienie Thermo Scientific Tango Buffer zapewnia uproszczony wybór buforów do podwójnego trawienia. 98% Thermo Scientificenzymów restrykcyjnych działa w stężeniach 1X lub 2X Tango Buffer. 1X Tango Buffer: 33 mm Tris-acetate (ph 7.9 w 37 C), 10 mm octan magnezu, 66 mm octan potasu, 0.1 mg/ml BSA.Bufor do przechowywania enzymu TaiI dostarczono w: 10 mm Tris-HCl (ph 7.4 w 25 C), 100 mm KCl, 1 mm EDTA, 1 mm DTT, 0.2 mg/ml BSA and 50% glicerol. Planowana ilość: 2 opakowania, po 400 U. GeneRuler 100 bp DNA ladder Plus, GeneRuler 100 bp Plus, Drabinka DNA od 100 do 3000 bp jest zalecana do określania i przybliżania ilościowego

6 oznaczania dwuniciowego DNA na żelu agarozowym lub poliakrylamidowym. Drabina jest mieszaniną oczyszczonych chromatograficznie fragmentów DNA. rozmiar produktu: 50µg, gotowy do załadowania: nie, kompatybilność żelu: żele agarozowe, 6x DNA Loading Dye. Nie potrzebne rozcieńczenie, nie potrzebne podgrzewanie, 50µg jest wystarczającado 100 aplikacji na żelu agarozowym. Planowana ilość: 4 opakowania, po 50 µg. GeneRuler DNA ladder, low Rang Gene Ruller SM1191 Marker DNA; Specyfikacja: Drabinka DNA dedykowana do analizy elektroforetycznej małych fragmentów DNA w żelu agarozowym (2.5-3%) oraz poliakrylamidowym (5-10%). Zawiera: mieszaninę 10 chromatograficznie oczyszczonych fragmentów DNA (bp) 700, 500, 400, 300, 200, 150, 100, 75, 50, 25. Dwa prążki referencyjne: 100 i 300 bp Storage Buffer: 10 mm Tris-HCl (ph7.6), 1 mm EDTA. 6X DNA Loading Dye: 10 mm Tris-HCl (ph 7.6), 0.03% bromophenol blue, 0.03% xylene cyanol FF, 60%glycerol i 60 mm EDTA, zawartość 50 μg, 0.5 μg/μl". Planowana ilość: 2 opakowania, po 50 µg. MassRuler DNA ladder, low Rang Marker DNA: Specyfikacja: Drabinka DNA dedykowana do analizy elektroforetycznej. Zawiera mieszaninę 11 chromatogradicznie oczyszczonych fragmentów DNA (bp)1031, 900, 800, 700, 600, 500, 400, 300, 200, 100, 80. Zawiera Storage Buffer: 10 mm Tris- HCl (ph7.6), 10 mm EDTA oraz 0,005% bromofenol blue oraz 10% glicerol oraz 60mM EDTA 10 mm Tris-HCl (ph 7.6), 0.03% bromophenol blue, 60% glycerol and 60 mm EDTA. Planowana ilość: 6 opakowań, po 2x500 µl. Phire Hot Start II PCR Master Mix 200 x 50ul, Phire Hot Start II PCR Master Mix to wygodny mix 2X przeznaczony do zminimalizowania liczby etapów pipetowania. Master mix zawiera Phire Hot Start II DNA Polymerase, nukleotydy i zoptymalizowany bufor do reakcji zawierający MgCl2. Do reakcji PCR należy dodać tylko matrycę i startery. Phire Hot Start II Polimeraza DNA, włączona do mieszanki głównej, jest wzmocnionym enzymem PCR do rutynowych i wysokiej przepustowości aplikacji PCR. Jest lepsza niż każda polimeraza Taq na rynku. Phire Hot Start II DNA Polymerasejest szybsza, bardzo wytrzymała oraz zdolna do amplifikowania długich fragmentów DNA z wysoką wydajnością. Takie zdolności osiąga sie dzięki zaawansowanej technice białkowej polimerazy.zawiera unikatową dwuniciową domenę wiążącą DNA, która umożliwia krótki czas wydłużania (10 do 15 s / kb), poprawia wydajność i zwiększa wierność 2 razy w porównaniu do polimerazy DNA Taq. Najwaniejsze cechy: Szybki start brak etapu reaktywacji Szybki enzym. Minimalna optymalizacja reakcji ze względu na wysoką tolerancję inhibitorów. Wysoka wydajność - produkty obfite ze względu na wysoką sprawność. Dłuższe produkty PCR - znacznie dłuższe fragmenty DNA niż przy każdym rozruchu gorącego Taq. Polimeraza: Phire Hot Start II polimeraza DNA, gorący start: wbudowany gorący start, wierność (w porównaniu z Taq): 2

7 skuteczność PCR w układzie XGC: średnio, forma reakcji: supermix lub Master Mix, prędkość reakcji: Szybka linia produktów: Phire, rozmiar produktu: 200 reakcji, Phire Hot Start II PCR Master Mix dostarcza 1,5 mm MgCl2 w końcowym stężeniu 1X. Jest dostarczany z wodą bez nukleazy i DMSO. Przechowywać w temperaturze -20 C. Planowana ilość: 3 opakowania, po 200x50 µl. Płyny do elektrody jonoselektywnej r-ry referencyjne do elektrody typu Orion nr Planowana ilość: 1 opakowanie, 5x60 ml. Płyny do elektrody jonoselektywnej r-ry referencyjne do elektrody typu Orion nr Planowana ilość: 1 opakowanie, 5x60 ml. Płyny do elektrody jonoselektywnej r-ry referencyjne do elektrody typ Orion przy oz.form amonowych nr Planowana ilość: 1 opakowanie, 5x60 ml. AmpliTaq Gold DNA Polymerase with Buffer I - Polimeraza DNA z buforem I (100 mm Tris-HCl, ph 8.3, 500 mm KCl, 15 mm chlorku magnezu, 0.01% (w/v) żelatyny). Polimeraza DNA powinna być chemicznie zmodyfikowaną formą polimerazy, wymagającą termicznej aktywacji. Cechy tego enzymu: Zautomatyzowany chemiczny hot-start enzymu dla zwiększonej specyficzności, wrażliwości i wydajności reakcji Aktywacja termiczna uwalniana w czasie poprawia czułość przy niskim poziomie liczby kopii Przydatność do multiplex PCR, co oszczędza czas i odczynniki Opakowanie powinno zawierać bufor do PCR 10X zawierający 15 mm MgCl2. Aktywacja hotstart Zmodyfikowany enzym jest dostarczany w stanie nieaktywnym. Po aktywacji termicznej modyfikator jest trwale uwalniany, przyczyniając się do regeneracji aktywnego enzymu. Powstała w wyniku hot-start amplifikacja zapewnia większą czułość, specyficzność i wydajność w porównaniu z konwencjonalnymi technikami PCR. Polimeraza DNA może być aktywowana częściowo lub całkowicie w etapie ogrzewania przed PCR lub może być aktywowana powoli w sposób zwolniony podczas etapów denaturacji w cyklach termicznych PCR. W czasie wstępnego etapu aktywacji cieplnej lub bez tego etapu, aktywny enzym uwalnia się powoli podczas cyklu termicznego w celu dopasowania jego stężenia i zwiększenia specyficzności. Wydajność konkretnego produktu wzrasta, ponieważ odczynniki nie są marnotrawione w tworzeniu niepożądanych produktów. Ponieważ polimeraza DNA jest chemicznym enzymem hot-start, nie istnieje zagrożenie skażeniem biologicznym. Opakowanie powinno zawierać 250 jednostek polimerazy DNA oraz bufor I (100 mm Tris-HCl, ph 8.3, 500 mm KCl, 15 mm chlorku magnezu, 0.01% (w/v) żelatyny). Planowana ilość: Planowana ilość: 2 opakowania, po 250 jednostek. Polimeraza platinium Brazilian Platinium Taq THERMO FISHER SCIENTIFIC lub równoważne* Polimerazy DNA Platinum Taq to dogodna i niezawodna termostabilna polimeraza termoplastyczna "gorąca gorączka" dla PCR, która zapewnia większą swoistość niż polimeraza Taq DNA. Właściwość "gorącego startu" preparatu enzymatycznego

8 jest nadawana przez termolabilne przeciwciała monoklonalne, które powodują, że polimeraza Taq DNA jest nieaktywna aż do początkowego etapu denaturacji PCR. Właściwości polimerazy DNA Platinum Taq DNA obejmują. Planowana ilość: 3 opakowania, po 500 U. Taq DNA Polymerase, recombinant THERMO FISHER SCIENTIFIC lub równoważne* Taq DNA Polymeraza jest termostabilnym enzymem, który syntetyzuje DNA z szkieł jednoniciowych w obecności dntp i startera. Enzym składa się z pojedynczego polipeptydu o masie cząsteczkowej 94 kda. Ma on aktywność polimerazy DNA 5' 3 'i aktywność egzonukleazy 5' 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 500 U. TOPO TA Cloning Kit for Sequencing, with One Shot MAX Efficiency DH5α -T1R Competent Cells THERMO FISHER SCIENTIFIC lub równoważne* K Zestawy do sekwencjonowania TOPO TA Cloning zapewniają skuteczną, 5-minutową, jednokrotną strategię klonowania ("TOPO Cloning") do bezpośredniego wchłaniania produktów PCR z amplifikacją polimerazy Taq do wektora plazmidowego do sekwencjonowania. Każdy zestaw używa wektora pcr 4-TOPO TA ze specjalnie zaprojektowanymi miejscami starterów sekwencyjnych, które dostarczają więcej sekwencji insertów i mniej sekwencji wektora z każdej reakcji. Te zestawy zawierają wszystko, co niezbędne do klonowania i wybierania rekombinowanych wektorów zawierających wybrany fragment PCR. Planowana ilość: 1 opakowanie, 50 reakcji. Marker DNA do określania wielkości produktów PCR w zakresie od 100 do 3000 pz. zawierający fragmenty różniące się między sobą o 100 pz., z pogrubionymi niektórymi prążkami dla łatwiejszej identyfikacji, dostarczana wraz z obciążnikiem 6X Loading Dye; ilość: dwa opakowania po 50 µg Numer kat.: SM0321, producent: Thermo Scientific; lub równoważny. Planowana ilość: 1 opakowanie, 50 µg. Standard II siedmio (7) anionowy Wzorzec do IC - 7 anionowy w wodzie, z określoną niepewnością. Planowana ilość: 1 opakowanie, 2x100 ml. DreamTaq Green DNA Polymerase 5 u/μl, Wzmocniona Taq DNA polimeraza z zielonym barwnikiem obciążającym, z 20 mm jonami magnezu. Planowana ilość: 4 opakowania, po 5x500 U. 10mM dntp Mix, Wodny roztwór 4 nukleotydów, każdy po 10 mm, czystość powyżej 99%. Planowana ilość: 5 opakowań, po 1 ml. Taq DNA Polimeraza (rekombinowana) 5 u/μl, Taq DNA polimeraza używana do standardowych reakcji PCR. Planowana ilość: 4 opakowania, po 5x500 U. Luminaris Color HRM Master Mix, kompatybilne z aparatem LightCycler 480, Zestaw do Wysoko rozdzielczej analizy topnienia produktów PCR w czasie rzeczywistym (HRM) kompatybilny z aparatem Light Cycler 480 II firmy Roche Właściwości: Wysoka wydajność reakcji na większości platformach sprzętowych dedykowanych HRM. Podwójny system barwny do łatwiejszego przygotowania reakcji. Lepsze różnicowanie we wszystkich czterech klasach SNP. Wysoka czułość dokładne wyniki już przy 30 kopiach

9 gdna. Wyjątkowa stabilność przygotowanej mieszaniny reakcyjnej. Planowana ilość: 2 opakowania, po 250 reakcji. Enzym restrykcyjny SsiI (AciI), BSA w buforze reakcyjnym, 10U/µl, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję CCGC(-3/-1). Planowana ilość: 3 opakowania, po 200 U. Enzym restrykcyjny Tru1I (MseI), BSA w buforze reakcyjnym, 10U/µl, Enzym restrykcyjny rozpoznający sekwencję T^TAA. Planowana ilość: 2 opakowania, po 1500 U. Enzym restrykcyjny TaiI (MaeII), BSA w buforze reakcyjnym, 10U/µl, Enzym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' A C G T 3'. Planowana ilość: 2 opakowania, po 2000 U. Enzym restrykcyjny VspI, BSA w buforze reakcyjnym, 10U/µl, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' A T T A A T 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 1000 U. Enzym restrykcyjny BclI, BSA w buforze reakcyjnym, 10U/µl, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' T G A T C A 3' Planowana ilość: 3 opakowania, po 3000 U. Enzym restrykcyjny MnlI, BSA w buforze reakcyjnym, 10U/ul, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' C C T C N7 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 300 U. Enzym restrykcyjny HpyCH4III (TaaI), BSA w buforze reakcyjnym, 10U/ul, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' A C N G T 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 200 U. Enzym restrykcyjny BsaJI (BseDI), BSA w buforze reakcyjnym, 10U/ul, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' C C N N G G 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 300 U. Enzym restrykcyjny HincII (HindII), BSA w buforze reakcyjnym, 10U/ul, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' G T Y R A C 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 500 U. Enzym restrykcyjny BstUI (Bsh1236I), BSA w buforze reakcyjnym, 10U/ul, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' C G C G 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 500 U. Enzym restrykcyjny NdeI, BSA w buforze reakcyjnym, 10U/ul, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' C A T A T G 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 500 U. Enzym restrykcyjny PstI, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' C T G C A G 3' Planowana ilość: 5 opakowania, po 3000 U. Enzym restrykcyjny EcoRI (10U/µL), Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' G A A T T C 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 5000 U. Enzym restrykcyjny MspI (HpaII) (10 U/µL), Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' C C G G 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 3000 U. Enzym restrykcyjny Hin1I 10U/ul, Enzym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' G R C G Y C 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 300 U. Enzym restrykcyjny Eam1104I Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' C T C T T C N1 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 1000 U. Marker wielkości DNA, 10 bp DNA, gotowy do użycia, marker wielkości DNA używany do określenia wielkości produktów PCR. Planowana ilość: 3 opakowania, po 50 µg. Marker wielkości DNA,100bp DNA gotowy do użycia, marker wielkości DNA używany do określenia

10 wielkości produktów PCR. Planowana ilość: 15 opakowań, po 50 µg. Pierce Coomassie (Bradford) Protein Assay Kit, zestaw do oznaczania sężenia białka metodą Bradforda. Planowana ilość: 1 opakowanie, 950 ml. 50bp DNA ladder Ready-to-Use. Planowana ilość: 2 opakowania, po 50 µg/100 aplikacji. Taq DNA Polymerase, recombinant, 5 U/µl. Planowana ilość: 2 opakowania, po 500 U. enzym restrykcyjny Tru1I (MseI). Wielkość opakowania 300 jednostek. Stężenie 10U/uL. Enzym rozpoznający sekwencję T^TAA działający najwydajniej w temp. 65 C w buforze R. Wygodny oznaczony kolorami system buforowy (bufor B-blue, bufor G-green, bufor O-orange, bufor R-red, bufor Tango-yellow). Zestaw zawiera uniwersalny bufor Tango do podwójnego trawienia. BSA w buforach reakcyjnych. Niewrażliwy na inaktywację termiczną. Niewrażliwy na metylację. Planowana ilość: 3 opakowania, po 300 U. enzym restrykcyjny PstI. Wielkość opakowania 3000 jednostek. Stężenie 10U/uL. Enzym rozpoznający sekwencję CTGCA^G działający najwydajniej w temp. 37 C w buforze O. Wygodny oznaczony kolorami system buforowy (bufor B-blue, bufor G-green, bufor O-orange, bufor R-red, bufor Tangoyellow). Zestaw zawiera uniwersalny bufor Tango do podwójnego trawienia. BSA w buforach reakcyjnych. Niewrażliwy na inaktywację termiczną (inaktywacja możliwa w temp. 80 C przez 20min dla 10U). Niewrażliwy na metylację. Planowana ilość: 3 opakowania, po 3000 U. enzym restrykcyjny EcoRI (10U/µL). Wielkość opakowania 5000 jednostek. Stężenie 10U/uL. Enzym rozpoznający sekwencję G^AATTC działający najwydajniej w temp. 37 C w buforze EcoRI. Wygodny oznaczony kolorami system buforowy (bufor B-blue, bufor G-green, bufor O-orange, bufor R-red, bufor Tango-yellow). Zestaw zawiera uniwersalny bufor Tango do podwójnego trawienia. BSA w buforach reakcyjnych. Wrażliwy na inaktywację termiczną (temp. 65 C). Wrażliwy na metylację. Planowana ilość: 1 opakowanie, 5000 U. enzym restrykcyjny MspI (HpaII) (10 U/µL). Wielkość opakowania 3000 jednostek. Stężenie 10U/uL. Enzym rozpoznający sekwencję C^CGG działający najwydajniej w temp. 37 C w buforze Tango. Wygodny oznaczony kolorami system buforowy (bufor B-blue, bufor G-green, bufor O-orange, bufor R-red, bufor Tango-yellow). Zestaw zawiera uniwersalny bufor Tango do podwójnego trawienia. BSA w buforach reakcyjnych. Wrażliwy na inaktywację termiczną (temp. 65 C). Wrażliwy na metylację. Planowana ilość: 1 opakowanie, 3000 U. enzym restrykcyjny HpaII (Hpa II). Wielkość opakowania 1000 jednostek. Stężenie 10U/uL. Enzym rozpoznający sekwencję C^CGG działający najwydajniej w temp. 37 C w buforze Tango. Wygodny oznaczony kolorami system buforowy (bufor B-blue, bufor G-green, bufor O-orange, bufor R-red, bufor Tango-yellow). Zestaw zawiera uniwersalny bufor Tango do podwójnego trawienia. BSA w buforach reakcyjnych. Wrażliwy na inaktywację termiczną (temp. 65 C). Wrażliwy na metylację.

11 Planowana ilość: 1 opakowanie, 3000 U. T4 DNA Ligase. Wielkość opakowania 1000 jednostek. Stężenie 5U/uL. Enzym katalizujący powstawanie wiązań fosfodiestrowych w łańcuchach DNA i RNA. Wymaga ATP jako kofaktora. Szybka ligacja możliwa w ciągu 10 minut w temperaturze pokojowej. Dostarczany z roztworem PEG niezbędnym do wydajnej reakcji ligacji. Planowana ilość: 4 opakowania, po 1000 U. GeneRuler 100 bp DNA Ladder Plus. Wielkość produktu 50ug. Drabinka o wielkościach DNA od 100 do 3000 bp jest zalecana do określania i przybliżania ilościowego oznaczania ilościowego dwuniciowego DNA na żelu agarozowym lub poliakrylamidowym. Drabina jest mieszaniną oczyszczonych chromatograficznie fragmentów DNA. Może być oznaczana radioaktywnie przy użyciu T4 Polynucleotide Kinase. Dostarczana z 6X DNA Loading Dye. Planowana ilość: 4 opakowania, po 50 µg. GeneRuler 50 bp DNA Ladder, ready-to-use. Wielkość produktu 50ug. Drabina DNA 50 bp, gotowa do użycia, jest zalecana do sortowania i przybliżania ilościowego oznaczania ilościowego dwuniciowego DNA na żelu agarozowym lub poliakrylamidowym. Drabina jest mieszaniną oczyszczonych chromatograficznie fragmentów DNA. Gotowa do użycia, jest wstępnie zmieszana z 6X DNA Loading Dye do bezpośredniego ładowania na żel. Drabina jest dostarczana z 6X DNA Loading Yye. Planowana ilość: 1 opakowanie, 50 µg. O RangeRuler 10 bp DNA Ladder, ready-to-use. Drabina DNA bp jest przeznaczona do precyzyjnego sortowania produktów PCR i innych dwuniciowych fragmentów DNA w agarozie lub niedenaturowych żelach poliakrylamidowych. Schodkowa drabina o różnicy 10 bp między fragmentami DNA i składa się z oczyszczonych i ligowanych powtarzających się jednostek podstawowych o tępych końcach o wartości 10 bp. Nie zalecana do kwantyfikacji DNA. Dostarczany z 6X Pomarańczowym DNA Loading Dye dla próbki DNA. Barwnik Orange G może być stosowany do monitorowania migracji DNA w żelu agarozowym lub poliakrylamidowym i migruje przy 50 pz w 1% żelu agarozowym. Jest to korzystny barwnik do wizualizacji małych fragmentów DNA. Planowana ilość: 1 opakowanie, 50 µg. Zestaw nukleotydów dntp Set, 100mM Solution. Zestaw 100 mm wodnych roztworów każdego z datp, dctp, dgtp i dttp, dostarczanych w oddzielnych fiolkach (4 x 0,25mL). Roztwory tych nukleotydów miareczkuje się do ph 7,3-7,5 za pomocą NaOH. Nukleotydy mają czystość większą niż 99% (potwierdzona metodą HPLC), są wolne od aktywności nukleazy, DNA ludzkiego i E. coli. Przeznaczone do wielu różnych zastosowań biologii molekularnej (PCR, synteza cdna i RT-PCR, real-time PCR). Planowana ilość: 3 opakowania, po 4x0,25 ml. DreamTaq Green DNA Polymerase 5 x 500 U. Wielkość opakowania 5 x 500 jednostek. Stężenie 5U/uL. Połączenie polimerazy DNA DreamTaq i 10X DreamTaq Green Buffer. Polimeraza DNA DreamTaq jest wzmocnioną polimerazą Taq zoptymalizowaną pod kątem zastosowań PCR o

12 wysokiej przepustowości. Zapewnia większą czułość, dłuższe produkty PCR i wyższe wydajności w porównaniu z konwencjonalną polimerazą Taq DNA. Nie wymaga się obszernej optymalizacji warunków reakcji. 10X DreamTaq Green Buffer zawiera bufor obciążający i dwa barwniki do bezpośredniego ładowania produktów PCR na żel po reakcji PCR. Kolorowy bufor nie koliduje z wydajnością PCR i jest zgodny z dalszymi zastosowaniami, takimi jak sekwencjonowanie DNA, ligacja i trawienie restrykcyjne. Bufor 10X DreamTaq jest zoptymalizowany pod kątem wydajności w PCR i zawiera MgCl2 w stężeniu 20 mm. W opakowaniu 5 x 100 µl DreamTaq DNA Polymerase (5 U/µL) oraz 10 x 1.25 ml 10X DreamTaq Green Buffer (zawierający 20 mm MgCl2). Przechowywanie w -20 C. Planowana ilość: 1 opakowanie, 5x500 U. W ogłoszeniu powinno być: DreamTaq DNA Polymerase THERMO FISHER SCIENTIFIC lub równoważne* K1072 2x stężona gotowa mieszanina przeznaczona do rutynowej reakcji PCR z amplifikacją fragmentów DNA genomowego, RT-PCR, generowania fragmentów PCR do klonowania TA, genotypowania. Mieszanina powinna zawierać polimerazę charakteryzującą się najwyższą możliwą czułością wśród tradycyjnych i modyfikowanych polimeraz Taq, wysokowydajną amplifikacją przy minimalnej optymalizacji, częstotliwością błędów nie większą aniżeli 2,2 x 10-5 błędów/nukleotyd w każdym cyklu, amplifikacją fragmentów długich do 6kpz dla genomowego DNA oraz do 20kpz dla wirusowego DNA, generować końce 3'-dA, możliwością wbudowywania modyfikowanych nukleotydów z wyłączeniem dutp; mieszaninę datp, dctp, dgtp i dttp w stężeniu 0,4mM każdy; 4mM MgCl2; Produkt powinien zostać dostarczony w ilości wystarczającej na 1000 prób po 50µl każda wraz z wodą czystą od DNaz i RNaz. Planowana ilość: 2 opakowania, po 2500 U. DreamTaq Green Master Mix THERMO FISHER SCIENTIFIC lub równoważne*k1082 2x stężona gotowa mieszanina przeznaczona do rutynowej reakcji PCR z amplifikacją fragmentów DNA genomowego, RT-PCR, generowania fragmentów PCR do klonowania TA, genotypowania. Mieszanina powinna zawierać polimerazę charakteryzującą się najwyższą możliwą czułością wśród tradycyjnych i modyfikowanych polimeraz Taq, wysokowydajną amplifikacją przy minimalnej optymalizacji, częstotliwością błędów nie większą aniżeli 2,2 x 10-5 błędów/nukleotyd w każdym cyklu, amplifikacją fragmentów długich do 6kpz dla genomowego DNA oraz do 20kpz dla wirusowego DNA, generować końce 3'-dA, możliwością wbudowywania modyfikowanych nukleotydów z wyłączeniem dutp; mieszaninę datp, dctp, dgtp i dttp w stężeniu 0,4mM każdy; 4mM MgCl2; zielony obciążnik umożliwiający bezpośrednie nakładanie próby po reakcji na żel agarozowy. Obciążnik powinien zawierać barwniki umożliwiające kontrolę migracji próbki podczas elektroforezy: niebieski, migrujący na wysokości 3 5 kpz 1% żelu agarozowym oraz

13 żółty migrujący szybciej aniżeli fragment DNA o wielkości 10pz. Maksymalna absorpcja barwników powinna być osiągana przy 424nm i 615nm. Produkt powinien zostać dostarczony w ilości wystarczającej na 1000 prób po 50µl każda wraz z wodą czystą od DNaz i RNaz. Planowana ilość: 4 opakowania, po 1000 reakcji. Enzym restrykcyjny Bsu15I, Koncentracja 10U/µL, Żródło: Bacillus subtilis 15, dostarczony z: _ml of 10X Buffer Tango, Przechowywany w -20 C. 1X Tango Buffer (dla trawienia 100% Bsu15I) 33 mm Tris-acetate (ph 7.9), 10 mm octanu magnezu, 66 mm octanu potasu, 0.1 mg/ml BSA.Temperatura inkubacji 37 C. Jedna jednostka jest określona jako ilość enzymu potrzebna do strawienia 1 μg lambda DNA w ciągu 1 godziny w temp. 37 C w 50 μl zalecanego buforu do reakcji. Rozcieńczenie z buforem (#B19): 10 mm Tris-HCl (ph 7.4 at 25 C), 100 mm KCl, 1 mm EDTA, 1 mm DTT, 0.2mg/mL BSA i 50% glicerol. podwójne Digests Tango Buffer zapewnia uproszczony wybór buforów dla podwójnego trawienia. 98% enzymu restrykcyjnego jest aktywna w stężeniu 1X lub 2X Tango Buffer. Bufor do przechowywania Bsu15I jest dostarczony w: 10 mm Tris-HCl (ph 7.4 w 25 C), 100 mm KCl, 1mM EDTA, 1 mm DTT, 0.15% Triton X-100, 0.2 mg/ml BSA i 50% glicerol. Wpływ na trawienie metylacji Dam: mogą się pokrywać- zablokowane. Dcm: nigdy nie zachodzi na siebie -brak efektu. CpG: całkowicie nakłada się -blokuje. EcoKI: nigdy się nie pokrywajążadnego efektu. EcoBI: może się pokrywać-nieefektywne. Stabilność podczas przedłużonej inkubacji. Minimum 0.1 jednostki jest potrzebna do całkowitego strawienia 1 μg lambda DNA w ciągu 16 godzin w 37 C. Do całkowitego strawienia 1 μg DNA osadzonego w agarze potrzeba minimum 5 jednostek enzymu w ciągu 16 godzin.termiczna inaktywacja enzymu Bsu15I jest inaktywowana w 65 C przez 20 min. Planowana ilość: 2 opakowania, po 600 U. Enzym restrykcyjny Eco31I, Koncentracja: 10U/µL, Źródło: E. coli zawierający gen eco31ir z E.coli RFL31, dostarczony z 1mL 10X Buffer G, 1mL 10X Buffer Tango. Przechowywać w -20 C. 1X Buffer G (dla trawienia w 100% Eco31I) 10 mm Tris-HCl (ph 7.5), 10 mm MgCl2, 50 mm NaCl, 0.1 mg/ml BSA.Temperatura inkubacji 37 C. Jedna jednostka jest zdefiniowana jako ilość enzymu potrzebna do całkowitego strawienia 1 μg lambda DNA dcm -HindIII fragmentui w ciągu 1 godziny w 37 C w 50 μl zalecanego buforu do reakcji. Rozcieńczenie z buforem do rozcieńczenia (#B19): 10mM Tris-HCl (ph 7.4 w 25 C), 100 mm KCl, 1 mm EDTA, 1 mm DTT, 0.2 mg/ml BSA i 50% glicerol. Podwójne Digests Thermo Scientific Tango Bufferzapewnia uproszczony wybór buforów dfo podwójnego trawienia. 98% enzymów restrykcyjnych działa w stężeniu 1X lub 2X Tango Buffer. 1X Tango Buffer: 33 mm Trisacetate (ph 7.9 w 37 C), 10 mm octan magnezu, 66 mm octan potasu, 0.1 mg/ml BSA. Bufor do przechowywania Eco31I jest dostarczany w: 10 mm Tris-HCl (ph 7.5 at 25 C), 200 mm KCl, 1

14 mm DTT, 0.1 mm EDTA, 0.2 mg/ml BSA i 50% glicerol. Methylation Effects on Digestion Dam: never overlaps no effect. Dcm: may overlap cleavage impaired. CpG: may overlap cleavage impaired. EcoKI: never overlaps no effect. EcoBI: may overlap effect not determined. Stability during Prolonged Incubation A minimum of 0.3 units of the enzyme is required for complete digestion of 1 μg of lambda DNA dcm in 16 hours at 37 C. Digestion of Agarose-embedded DNA A minimum of 5 units of the enzyme is required for complete digestion of 1 μg of agarose-embedded lambda DNA dcm in 16 hours. Planowana ilość: 1 opakowanie, 1000 U. Enzym restrykcyjny Esp3I, Koncentracja: 10U/µL, Źródło: E.coli, który przenosi sklonowany gen esp3ir z Hafnia alvei RFL3. Dostarczony z: 10mL of 10X Buffer Tango. Przechowywany w -20 C. [1X Thermo Scientific Tango Buffer]+DTT (dla 100% trawienia Esp3I)[33 mm Tris-acetate (ph 7.9), 10 mm octan magnezu, 66 mm octan potasu, 0.1 mg/ml BSA]+1.0 mm DTT. Temperatura inkubacji 37 C. Jedna jednostka jest zdefiniowana jako ilość Esp3I potrzebna do strawienia 1 μg lambda DNA w ciągu 1 godziny w 37 C w 50 μl zalecanego buforu do reakcji. Rozcieńczenie z buforem do rozcieńczenia (#B19): 10 mm Tris-HCl (ph 7.4 at 25 C), 100 mm KCl, 1 mm EDTA, 1 mm DTT, 0.2 mg/ml BSA i 50% glicerol.podwójne trawienie Tango Buffer upraszcza dobór buforów do podwójnego trawienia. 98% Thermo Scientific enzymów restrykcyjnych działa w stężeniu 1X lub 2X buforu Tango. Bufor do przechowywania Esp3I jest dostarczany w:10 mm fosforanu potasu (ph 7.4 w 25 C), 100 mm KCl, 1 mm EDTA, 7 mm 2-merkaptoetanolu, 0.5 mg/ml BSA i 50% (v/v) glicerol. Efekt metylacji - brak. Stabilność podczas przedłużonej inkubacji: Do całkowitego trawienia 1 μg DNA lambda w ciągu 16 godzin w temperaturze 37 C wymagane jest co najmniej 0,2 jednostki enzymu. Trawienie DNA osadzonego na bazie agaroz: W celu całkowitego trawienia 1 μg agarozowego osadzonego DNA lambda w ciągu 16 godzin wymagane jest co najmniej 5 jednostek enzymu. Planowana ilość: 1 opakowanie 200 U. Enzym restrykcyjny TaiI, Koncentracja: 10 U/μL Źródło: Thermus aquaticus Cc1-331 dostarczony z:1 ml 10X Buffer R, 1 ml 10X Buffer Tango, przechowywanie w -20 C. 1X Buffer R (dla 100% trawienia TaiI) 10 mm Tris-HCl (ph 8.5), 10 mm MgCl2, 100 mm KCl, 0.1 mg/ml BSA.Temperatura inkubacji 65 C. Jedna jednostka jest zdefiniowana jako ilość TaiI potrzebna do strawienia 1 μg lambda DNA w ciągu 1 godziny w 65 C w 50 μl rekomendowanego buforu do reakcji. Rozcieńczenie z buforem do rozcieńczenia (#B19): 10 mm Tris-HCl (ph 7.4 w 25 C), 100 mm KCl, 1 mm EDTA, 1 mm DTT, 0.2 mg/ml BSA i 50% glicerol. podwójne trawienie Thermo Scientific Tango Buffer zapewnia uproszczony wybór buforów do podwójnego trawienia. 98% Thermo Scientificenzymów restrykcyjnych działa w stężeniach 1X lub 2X Tango Buffer. 1X Tango

15 Buffer: 33 mm Tris-acetate (ph 7.9 w 37 C), 10 mm octan magnezu, 66 mm octan potasu, 0.1 mg/ml BSA.Bufor do przechowywania enzymu TaiI dostarczono w: 10 mm Tris-HCl (ph 7.4 w 25 C), 100 mm KCl, 1 mm EDTA, 1 mm DTT, 0.2 mg/ml BSA and 50% glicerol. Planowana ilość: 2 opakowania, po 400 U. GeneRuler 100 bp DNA ladder Plus, GeneRuler 100 bp Plus, Drabinka DNA od 100 do 3000 bp jest zalecana do określania i przybliżania ilościowego oznaczania dwuniciowego DNA na żelu agarozowym lub poliakrylamidowym. Drabina jest mieszaniną oczyszczonych chromatograficznie fragmentów DNA. rozmiar produktu: 50µg, gotowy do załadowania: nie, kompatybilność żelu: żele agarozowe, 6x DNA Loading Dye. Nie potrzebne rozcieńczenie, nie potrzebne podgrzewanie, 50µg jest wystarczającado 100 aplikacji na żelu agarozowym. Planowana ilość: 4 opakowania, po 50 µg. GeneRuler DNA ladder, low Rang Gene Ruller SM1191 Marker DNA; Specyfikacja: Drabinka DNA dedykowana do analizy elektroforetycznej małych fragmentów DNA w żelu agarozowym (2.5-3%) oraz poliakrylamidowym (5-10%). Zawiera: mieszaninę 10 chromatograficznie oczyszczonych fragmentów DNA (bp) 700, 500, 400, 300, 200, 150, 100, 75, 50, 25. Dwa prążki referencyjne: 100 i 300 bp Storage Buffer: 10 mm Tris-HCl (ph7.6), 1 mm EDTA. 6X DNA Loading Dye: 10 mm Tris-HCl (ph 7.6), 0.03% bromophenol blue, 0.03% xylene cyanol FF, 60%glycerol i 60 mm EDTA, zawartość 50 μg, 0.5 μg/μl". Planowana ilość: 2 opakowania, po 50 µg. MassRuler DNA ladder, low Rang Marker DNA: Specyfikacja: Drabinka DNA dedykowana do analizy elektroforetycznej. Zawiera mieszaninę 11 chromatogradicznie oczyszczonych fragmentów DNA (bp)1031, 900, 800, 700, 600, 500, 400, 300, 200, 100, 80. Zawiera Storage Buffer: 10 mm Tris- HCl (ph7.6), 10 mm EDTA oraz 0,005% bromofenol blue oraz 10% glicerol oraz 60mM EDTA 10 mm Tris-HCl (ph 7.6), 0.03% bromophenol blue, 60% glycerol and 60 mm EDTA. Planowana ilość: 6 opakowań, po 2x500 µl. Phire Hot Start II PCR Master Mix 200 x 50ul, Phire Hot Start II PCR Master Mix to wygodny mix 2X przeznaczony do zminimalizowania liczby etapów pipetowania. Master mix zawiera Phire Hot Start II DNA Polymerase, nukleotydy i zoptymalizowany bufor do reakcji zawierający MgCl2. Do reakcji PCR należy dodać tylko matrycę i startery. Phire Hot Start II Polimeraza DNA, włączona do mieszanki głównej, jest wzmocnionym enzymem PCR do rutynowych i wysokiej przepustowości aplikacji PCR. Jest lepsza niż każda polimeraza Taq na rynku. Phire Hot Start II DNA Polymerasejest szybsza, bardzo wytrzymała oraz zdolna do amplifikowania długich fragmentów DNA z wysoką wydajnością. Takie zdolności osiąga sie dzięki zaawansowanej technice białkowej polimerazy.zawiera unikatową dwuniciową domenę wiążącą DNA, która umożliwia krótki czas wydłużania (10 do 15 s / kb), poprawia wydajność i zwiększa wierność 2 razy w porównaniu do

16 polimerazy DNA Taq. Najwaniejsze cechy: Szybki start brak etapu reaktywacji Szybki enzym. Minimalna optymalizacja reakcji ze względu na wysoką tolerancję inhibitorów. Wysoka wydajność - produkty obfite ze względu na wysoką sprawność. Dłuższe produkty PCR - znacznie dłuższe fragmenty DNA niż przy każdym rozruchu gorącego Taq. Polimeraza: Phire Hot Start II polimeraza DNA, gorący start: wbudowany gorący start, wierność (w porównaniu z Taq): 2 skuteczność PCR w układzie XGC: średnio, forma reakcji: supermix lub Master Mix, prędkość reakcji: Szybka linia produktów: Phire, rozmiar produktu: 200 reakcji, Phire Hot Start II PCR Master Mix dostarcza 1,5 mm MgCl2 w końcowym stężeniu 1X. Jest dostarczany z wodą bez nukleazy i DMSO. Przechowywać w temperaturze -20 C. Planowana ilość: 3 opakowania, po 200x50 µl. AmpliTaq Gold DNA Polymerase with Buffer I - Polimeraza DNA z buforem I (100 mm Tris-HCl, ph 8.3, 500 mm KCl, 15 mm chlorku magnezu, 0.01% (w/v) żelatyny). Polimeraza DNA powinna być chemicznie zmodyfikowaną formą polimerazy, wymagającą termicznej aktywacji. Cechy tego enzymu: Zautomatyzowany chemiczny hot-start enzymu dla zwiększonej specyficzności, wrażliwości i wydajności reakcji Aktywacja termiczna uwalniana w czasie poprawia czułość przy niskim poziomie liczby kopii Przydatność do multiplex PCR, co oszczędza czas i odczynniki Opakowanie powinno zawierać bufor do PCR 10X zawierający 15 mm MgCl2. Aktywacja hot-start Zmodyfikowany enzym jest dostarczany w stanie nieaktywnym. Po aktywacji termicznej modyfikator jest trwale uwalniany, przyczyniając się do regeneracji aktywnego enzymu. Powstała w wyniku hot-start amplifikacja zapewnia większą czułość, specyficzność i wydajność w porównaniu z konwencjonalnymi technikami PCR. Polimeraza DNA może być aktywowana częściowo lub całkowicie w etapie ogrzewania przed PCR lub może być aktywowana powoli w sposób zwolniony podczas etapów denaturacji w cyklach termicznych PCR. W czasie wstępnego etapu aktywacji cieplnej lub bez tego etapu, aktywny enzym uwalnia się powoli podczas cyklu termicznego w celu dopasowania jego stężenia i zwiększenia specyficzności. Wydajność konkretnego produktu wzrasta, ponieważ odczynniki nie są marnotrawione w tworzeniu niepożądanych produktów. Ponieważ polimeraza DNA jest chemicznym enzymem hot-start, nie istnieje zagrożenie skażeniem biologicznym. Opakowanie powinno zawierać 250 jednostek polimerazy DNA oraz bufor I (100 mm Tris-HCl, ph 8.3, 500 mm KCl, 15 mm chlorku magnezu, 0.01% (w/v) żelatyny). Planowana ilość: Planowana ilość: 2 opakowania, po 250 jednostek. Polimeraza platinium Brazilian Platinium Taq THERMO FISHER SCIENTIFIC lub równoważne* Polimerazy DNA Platinum Taq to dogodna i niezawodna termostabilna polimeraza termoplastyczna "gorąca gorączka" dla PCR, która zapewnia większą swoistość niż polimeraza Taq DNA. Właściwość "gorącego startu" preparatu

17 enzymatycznego jest nadawana przez termolabilne przeciwciała monoklonalne, które powodują, że polimeraza Taq DNA jest nieaktywna aż do początkowego etapu denaturacji PCR. Właściwości polimerazy DNA Platinum Taq DNA obejmują. Planowana ilość: 3 opakowania, po 500 U. Taq DNA Polymerase, recombinant THERMO FISHER SCIENTIFIC lub równoważne* Taq DNA Polymeraza jest termostabilnym enzymem, który syntetyzuje DNA z szkieł jednoniciowych w obecności dntp i startera. Enzym składa się z pojedynczego polipeptydu o masie cząsteczkowej 94 kda. Ma on aktywność polimerazy DNA 5' 3 'i aktywność egzonukleazy 5' 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 500 U. TOPO TA Cloning Kit for Sequencing, with One Shot MAX Efficiency DH5α -T1R Competent Cells THERMO FISHER SCIENTIFIC lub równoważne* K Zestawy do sekwencjonowania TOPO TA Cloning zapewniają skuteczną, 5-minutową, jednokrotną strategię klonowania ("TOPO Cloning") do bezpośredniego wchłaniania produktów PCR z amplifikacją polimerazy Taq do wektora plazmidowego do sekwencjonowania. Każdy zestaw używa wektora pcr 4-TOPO TA ze specjalnie zaprojektowanymi miejscami starterów sekwencyjnych, które dostarczają więcej sekwencji insertów i mniej sekwencji wektora z każdej reakcji. Te zestawy zawierają wszystko, co niezbędne do klonowania i wybierania rekombinowanych wektorów zawierających wybrany fragment PCR. Planowana ilość: 1 opakowanie, 50 reakcji. Marker DNA do określania wielkości produktów PCR w zakresie od 100 do 3000 pz. zawierający fragmenty różniące się między sobą o 100 pz., z pogrubionymi niektórymi prążkami dla łatwiejszej identyfikacji, dostarczana wraz z obciążnikiem 6X Loading Dye; ilość: dwa opakowania po 50 µg Numer kat.: SM0321, producent: Thermo Scientific; lub równoważny. Planowana ilość: 1 opakowanie, 50 µg. DreamTaq Green DNA Polymerase 5 u/μl, Wzmocniona Taq DNA polimeraza z zielonym barwnikiem obciążającym, z 20 mm jonami magnezu. Planowana ilość: 4 opakowania, po 5x500 U. 10mM dntp Mix, Wodny roztwór 4 nukleotydów, każdy po 10 mm, czystość powyżej 99%. Planowana ilość: 5 opakowań, po 1 ml. Taq DNA Polimeraza (rekombinowana) 5 u/μl, Taq DNA polimeraza używana do standardowych reakcji PCR. Planowana ilość: 4 opakowania, po 5x500 U. Luminaris Color HRM Master Mix, kompatybilne z aparatem LightCycler 480, Zestaw do Wysoko rozdzielczej analizy topnienia produktów PCR w czasie rzeczywistym (HRM) kompatybilny z aparatem Light Cycler 480 II firmy Roche Właściwości: Wysoka wydajność reakcji na większości platformach sprzętowych dedykowanych HRM. Podwójny system barwny do łatwiejszego przygotowania reakcji. Lepsze różnicowanie we wszystkich czterech klasach SNP. Wysoka czułość dokładne wyniki już przy 30 kopiach gdna. Wyjątkowa stabilność przygotowanej mieszaniny reakcyjnej. Planowana ilość: 2

18 opakowania, po 250 reakcji. Enzym restrykcyjny SsiI (AciI), BSA w buforze reakcyjnym, 10U/µl, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję CCGC(-3/-1). Planowana ilość: 3 opakowania, po 200 U. Enzym restrykcyjny Tru1I (MseI), BSA w buforze reakcyjnym, 10U/µl, Enzym restrykcyjny rozpoznający sekwencję T^TAA. Planowana ilość: 2 opakowania, po 1500 U. Enzym restrykcyjny TaiI (MaeII), BSA w buforze reakcyjnym, 10U/µl, Enzym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' A C G T 3'. Planowana ilość: 2 opakowania, po 2000 U. Enzym restrykcyjny VspI, BSA w buforze reakcyjnym, 10U/µl, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' A T T A A T 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 1000 U. Enzym restrykcyjny BclI, BSA w buforze reakcyjnym, 10U/µl, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' T G A T C A 3' Planowana ilość: 3 opakowania, po 3000 U. Enzym restrykcyjny MnlI, BSA w buforze reakcyjnym, 10U/ul, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' C C T C N7 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 300 U. Enzym restrykcyjny HpyCH4III (TaaI), BSA w buforze reakcyjnym, 10U/ul, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' A C N G T 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 200 U. Enzym restrykcyjny BsaJI (BseDI), BSA w buforze reakcyjnym, 10U/ul, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' C C N N G G 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 300 U. Enzym restrykcyjny HincII (HindII), BSA w buforze reakcyjnym, 10U/ul, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' G T Y R A C 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 500 U. Enzym restrykcyjny BstUI (Bsh1236I), BSA w buforze reakcyjnym, 10U/ul, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' C G C G 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 500 U. Enzym restrykcyjny NdeI, BSA w buforze reakcyjnym, 10U/ul, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' C A T A T G 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 500 U. Enzym restrykcyjny PstI, Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' C T G C A G 3' Planowana ilość: 5 opakowania, po 3000 U. Enzym restrykcyjny EcoRI (10U/µL), Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' G A A T T C 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 5000 U. Enzym restrykcyjny MspI (HpaII) (10 U/µL), Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' C C G G 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 3000 U. Enzym restrykcyjny Hin1I 10U/ul, Enzym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' G R C G Y C 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 300 U. Enzym restrykcyjny Eam1104I Eznym restrykcyjny rozpoznający sekwencję 5' C T C T T C N1 3'. Planowana ilość: 3 opakowania, po 1000 U. Marker wielkości DNA, 10 bp DNA, gotowy do użycia, marker wielkości DNA używany do określenia wielkości produktów PCR. Planowana ilość: 3 opakowania, po 50 µg. Marker wielkości DNA,100bp DNA gotowy do użycia, marker wielkości DNA używany do określenia wielkości produktów PCR. Planowana ilość: 15 opakowań, po 50 µg. Pierce Coomassie

19 (Bradford) Protein Assay Kit, zestaw do oznaczania sężenia białka metodą Bradforda. Planowana ilość: 1 opakowanie, 950 ml. 50bp DNA ladder Ready-to-Use. Planowana ilość: 2 opakowania, po 50 µg/100 aplikacji. Taq DNA Polymerase, recombinant, 5 U/µl. Planowana ilość: 2 opakowania, po 500 U. enzym restrykcyjny Tru1I (MseI). Wielkość opakowania 300 jednostek. Stężenie 10U/uL. Enzym rozpoznający sekwencję T^TAA działający najwydajniej w temp. 65 C w buforze R. Wygodny oznaczony kolorami system buforowy (bufor B-blue, bufor G-green, bufor O-orange, bufor R-red, bufor Tango-yellow). Zestaw zawiera uniwersalny bufor Tango do podwójnego trawienia. BSA w buforach reakcyjnych. Niewrażliwy na inaktywację termiczną. Niewrażliwy na metylację. Planowana ilość: 3 opakowania, po 300 U. enzym restrykcyjny PstI. Wielkość opakowania 3000 jednostek. Stężenie 10U/uL. Enzym rozpoznający sekwencję CTGCA^G działający najwydajniej w temp. 37 C w buforze O. Wygodny oznaczony kolorami system buforowy (bufor B-blue, bufor G-green, bufor O-orange, bufor R-red, bufor Tangoyellow). Zestaw zawiera uniwersalny bufor Tango do podwójnego trawienia. BSA w buforach reakcyjnych. Niewrażliwy na inaktywację termiczną (inaktywacja możliwa w temp. 80 C przez 20min dla 10U). Niewrażliwy na metylację. Planowana ilość: 3 opakowania, po 3000 U. enzym restrykcyjny EcoRI (10U/µL). Wielkość opakowania 5000 jednostek. Stężenie 10U/uL. Enzym rozpoznający sekwencję G^AATTC działający najwydajniej w temp. 37 C w buforze EcoRI. Wygodny oznaczony kolorami system buforowy (bufor B-blue, bufor G-green, bufor O-orange, bufor R-red, bufor Tango-yellow). Zestaw zawiera uniwersalny bufor Tango do podwójnego trawienia. BSA w buforach reakcyjnych. Wrażliwy na inaktywację termiczną (temp. 65 C). Wrażliwy na metylację. Planowana ilość: 1 opakowanie, 5000 U. enzym restrykcyjny MspI (HpaII) (10 U/µL). Wielkość opakowania 3000 jednostek. Stężenie 10U/uL. Enzym rozpoznający sekwencję C^CGG działający najwydajniej w temp. 37 C w buforze Tango. Wygodny oznaczony kolorami system buforowy (bufor B-blue, bufor G-green, bufor O-orange, bufor R-red, bufor Tango-yellow). Zestaw zawiera uniwersalny bufor Tango do podwójnego trawienia. BSA w buforach reakcyjnych. Wrażliwy na inaktywację termiczną (temp. 65 C). Wrażliwy na metylację. Planowana ilość: 1 opakowanie, 3000 U. enzym restrykcyjny HpaII (Hpa II). Wielkość opakowania 1000 jednostek. Stężenie 10U/uL. Enzym rozpoznający sekwencję C^CGG działający najwydajniej w temp. 37 C w buforze Tango. Wygodny oznaczony kolorami system buforowy (bufor B-blue, bufor G-green, bufor O-orange, bufor R-red, bufor Tango-yellow). Zestaw zawiera uniwersalny bufor Tango do podwójnego trawienia. BSA w buforach reakcyjnych. Wrażliwy na inaktywację termiczną (temp. 65 C). Wrażliwy na metylację. Planowana ilość: 1 opakowanie, 3000 U. T4 DNA Ligase. Wielkość opakowania 1000 jednostek.

TaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R

TaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R TaqNova-RED Polimeraza DNA RP20R, RP100R RP20R, RP100R TaqNova-RED Polimeraza DNA Rekombinowana termostabilna polimeraza DNA Taq zawierająca czerwony barwnik, izolowana z Thermus aquaticus, o przybliżonej

Bardziej szczegółowo

TaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925

TaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 TaqNovaHS RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 TaqNovaHS Polimeraza TaqNovaHS jest mieszaniną termostabilnej polimerazy DNA

Bardziej szczegółowo

ODCZYNNIKI DO BIOLOGII MOLEKULARNEJ

ODCZYNNIKI DO BIOLOGII MOLEKULARNEJ www.cytogen.com.pl ODCZYNNIKI DO BIOLOGII MOLEKULARNEJ 3 Spis treści 4 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 22 22 Stabilność technologii TAG Specifikacja qpcr Mix-ów Kompatybilność kitów qpcr

Bardziej szczegółowo

Powodzenie reakcji PCR wymaga właściwego doboru szeregu parametrów:

Powodzenie reakcji PCR wymaga właściwego doboru szeregu parametrów: Powodzenie reakcji PCR wymaga właściwego doboru szeregu parametrów: dobór warunków samej reakcji PCR (temperatury, czas trwania cykli, ilości cykli itp.) dobór odpowiednich starterów do reakcji amplifikacji

Bardziej szczegółowo

W związku z wydzieleniem pakietów i dodaniem nowych zmianie ulegają zapisy SIWZ.

W związku z wydzieleniem pakietów i dodaniem nowych zmianie ulegają zapisy SIWZ. Poznań, dnia 06.06.2016 EZ/350/30/2016/928 Wg rozdzielnika: do wszystkich zainteresowanych i uczestników postępowania o zamówienie publiczne. dotyczy: przetargu nieograniczonego nr EZ/350/30/2016 Zakup

Bardziej szczegółowo

RT31-020, RT , MgCl 2. , random heksamerów X 6

RT31-020, RT , MgCl 2. , random heksamerów X 6 RT31-020, RT31-100 RT31-020, RT31-100 Zestaw TRANSCRIPTME RNA zawiera wszystkie niezbędne składniki do przeprowadzenia syntezy pierwszej nici cdna na matrycy mrna lub całkowitego RNA. Uzyskany jednoniciowy

Bardziej szczegółowo

ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków)

ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków) ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków) Celem ćwiczenia jest wprowadzenie mutacji punktowej do genu

Bardziej szczegółowo

2. Przedmiot zamówienia: Odczynniki chemiczne do izolacji DNA i reakcji PCR, wymienione w Tabeli 1. Nazwa odczynnika Specyfikacja Ilość*

2. Przedmiot zamówienia: Odczynniki chemiczne do izolacji DNA i reakcji PCR, wymienione w Tabeli 1. Nazwa odczynnika Specyfikacja Ilość* Poznao, 6 lutego 2012 r. Zapytanie ofertowe nr 001 /2012 dotyczące zakupu odczynników chemicznych do izolacji DNA i reakcji PCR GENESIS Polska Sp. z o.o Ul. Za Cytadelą 19, 61-659 Poznao NIP 778 13 56

Bardziej szczegółowo

PCR - ang. polymerase chain reaction

PCR - ang. polymerase chain reaction PCR - ang. polymerase chain reaction łańcuchowa (cykliczna) reakcja polimerazy Technika PCR umożliwia otrzymywanie dużej liczby kopii specyficznych fragmentów DNA (czyli amplifikację zwielokrotnienie fragmentu

Bardziej szczegółowo

PCR - ang. polymerase chain reaction

PCR - ang. polymerase chain reaction PCR - ang. polymerase chain reaction łańcuchowa (cykliczna) reakcja polimerazy Technika PCR umożliwia otrzymywanie dużej liczby kopii specyficznych fragmentów DNA (czyli amplifikację zwielokrotnienie fragmentu

Bardziej szczegółowo

Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP

Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP Klonowanie molekularne Kurs doskonalący Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP Etapy klonowania molekularnego 1. Wybór wektora i organizmu gospodarza Po co klonuję (do namnożenia DNA [czy ma być metylowane

Bardziej szczegółowo

PCR - ang. polymerase chain reaction

PCR - ang. polymerase chain reaction PCR - ang. polymerase chain reaction Technika PCR umożliwia otrzymywanie dużej liczby kopii specyficznych fragmentów DNA (czyli amplifikację zwielokrotnienie fragmentu DNA) Jest to reakcja powielania (replikacji)

Bardziej szczegółowo

PCR łańcuchowa reakcja polimerazy

PCR łańcuchowa reakcja polimerazy PCR łańcuchowa reakcja polimerazy PCR - ang. polymerase chain reaction Technika PCR umożliwia otrzymywanie dużej liczby kopii specyficznych fragmentów DNA (czyli amplifikację zwielokrotnienie fragmentu

Bardziej szczegółowo

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa IZOLACJA DNA Z HODOWLI KOMÓRKOWEJ.

Bardziej szczegółowo

Definicje. Białka rekombinowane (ang. recombinant proteins, r-proteins) Ukierunkowana mutageneza (ang. site-directed/site-specific mutagenesis)

Definicje. Białka rekombinowane (ang. recombinant proteins, r-proteins) Ukierunkowana mutageneza (ang. site-directed/site-specific mutagenesis) Definicje Białka rekombinowane (ang. recombinant proteins, r-proteins) Białka, które powstały w żywych organizmach (lub liniach komórkowych) w wyniku ekspresji rekombinowanego DNA. Rekombinowany DNA jest

Bardziej szczegółowo

Optymalizacja warunków reakcji PCR w gradiencie temperatury i magnezu

Optymalizacja warunków reakcji PCR w gradiencie temperatury i magnezu Protokół pochodzi ze strony molekularnie.wordpress.com Kopiowanie i rozpowszechnianie wyłącznie w całości, z zachowaniem praw autorskich zgodnie z zasadami licencji GNU Dziękuję za uszanowanie mojej pracy,

Bardziej szczegółowo

PYTANIE Pakiet nr 1- Pozycja nr 52 Czy Zamawiający akceptuje kuwetę plastikową UV o pomiarze zawierającym się pomiędzy nm?

PYTANIE Pakiet nr 1- Pozycja nr 52 Czy Zamawiający akceptuje kuwetę plastikową UV o pomiarze zawierającym się pomiędzy nm? Poznań, dnia 16.06.2014 EZ/350/51/2014/780 Wg rozdzielnika: do wszystkich zainteresowanych i uczestników postępowania o zamówienie publiczne.nr EZ/350/51/2014 dotyczy: Zakup i dostawa odczynników, materiałów

Bardziej szczegółowo

Zestaw do wykrywania Babesia spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych

Zestaw do wykrywania Babesia spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych Nr kat. PK25N Wersja zestawu: 1.2012 Zestaw do wykrywania spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Zestaw

Bardziej szczegółowo

Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16

Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16 Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16 Ćwiczenie 3 Identyfikacja genetycznie modyfikowanych roślin w produktach spożywczych - jakościowe badanie obecności

Bardziej szczegółowo

Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów. Rozdział 9

Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów. Rozdział 9 Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów Rozdział 9 Wykrywanie jakościowe kukurydzy MON810, kukurydzy Bt-176 i soi Roundup Ready metodą PCR M. Querci, M. Maretti, M. Mazzara

Bardziej szczegółowo

Mieszanina trójfosforanów deoksyrybonukleotydów (dntp: datp, dgtp, dctp, dttp) Bufor reakcyjny zapewniający odpowiednie warunki reakcji

Mieszanina trójfosforanów deoksyrybonukleotydów (dntp: datp, dgtp, dctp, dttp) Bufor reakcyjny zapewniający odpowiednie warunki reakcji Uniwersytet Gdański, Wydział Biologii Biologia i Biologia medyczna II rok Katedra Biologii Molekularnej Przedmiot: Biologia Molekularna z Biotechnologią =================================================================

Bardziej szczegółowo

Autor: dr Mirosława Staniaszek

Autor: dr Mirosława Staniaszek Zakład Hodowli Roślin Ogrodniczych Pracownia Genetyki i Hodowli Roślin Warzywnych Fot. J. Sobolewski Procedura identyfikacji genu Frl warunkującego odporność pomidora na Fusarium oxysporum f.sp. radicis-lycopersici

Bardziej szczegółowo

Farmakogenetyka Biotechnologia Medyczna I o

Farmakogenetyka Biotechnologia Medyczna I o ĆWICZENIE 2 Oznaczanie polimorfizmu cytochromu CYP2D6 za pomocą tradycyjnych metod biologii molekularnej: PCR-RFLP I. Łańcuchowa reakcja polimerazy PCR (polymerase chain reaction) Technika PCR rozwinęła

Bardziej szczegółowo

CENNIK PRODUKTÓW BIOLINE 2013

CENNIK PRODUKTÓW BIOLINE 2013 CENNIK PRODUKTÓW BIOLINE 2013 MASTER MIXY REAL-TIME PCR MASTER MIXY REAL-TIME PCR Najnowszej Generacji SensiFAST SYBR No-ROX m.in. SmartCycler (Cepheid), Rotor-Gene (Qiagen), Eco (Illumina), Opticon TM,

Bardziej szczegółowo

Ćwiczenie 3 PCR i trawienie DNA enzymami restrykcyjnymi

Ćwiczenie 3 PCR i trawienie DNA enzymami restrykcyjnymi Uniwersytet Gdański, Wydział Biologii Katedra Genetyki Molekularnej Bakterii Katedra Biologii i Genetyki Medycznej Katedra Biologii Molekularnej Biologia i Biologia Medyczna II rok Przedmiot: Biologia

Bardziej szczegółowo

PL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W LUBLINIE, Lublin, PL BUP 26/11

PL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W LUBLINIE, Lublin, PL BUP 26/11 PL 214501 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 214501 (13) B1 (21) Numer zgłoszenia: 391458 (51) Int.Cl. C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/29 (2006.01) Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej

Bardziej szczegółowo

O trawieniu restrykcyjnym

O trawieniu restrykcyjnym O trawieniu restrykcyjnym Enzymy II klasy, Mg 2+, dsdna z rozpoznawaną sekwencją, tępe, lepkie (kohezyjne) końce, warunki reakcji bufor o różnym stężeniu NaCl i określonym ph BSA -stabilizator 37 o C /lub

Bardziej szczegółowo

ANALIZA MOLEKULARNA BIOCENOZ BAKTERYJNYCH Ćwiczenia 2017/18

ANALIZA MOLEKULARNA BIOCENOZ BAKTERYJNYCH Ćwiczenia 2017/18 ANALIZA MOLEKULARNA BIOCENOZ BAKTERYJNYCH Ćwiczenia 2017/18 A. Rybotypowanie bakterii w osadzie czynnym techniką ARDRA (ang. Amplified rdna Restriction Analysis) Informacje dotyczące analizowanych prób:

Bardziej szczegółowo

SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY SEKCJA II: PRZEDMIOT ZAMÓWIENIA. Zamieszczanie ogłoszenia: obowiązkowe. Ogłoszenie dotyczy:

SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY SEKCJA II: PRZEDMIOT ZAMÓWIENIA. Zamieszczanie ogłoszenia: obowiązkowe. Ogłoszenie dotyczy: Adres strony internetowej, na której Zamawiający udostępnia Specyfikację Istotnych Warunków Zamówienia: www.iczmp.edu.pl Łódź: ZP/105/2015 - Dostawa odczynników diagnostycznych do badań genetycznych dla

Bardziej szczegółowo

Najważniejsze z nich to: enzymy restrykcyjne wektory DNA inne enzymy np. ligazy, fosfatazy, polimerazy, kinazy, nukleazy

Najważniejsze z nich to: enzymy restrykcyjne wektory DNA inne enzymy np. ligazy, fosfatazy, polimerazy, kinazy, nukleazy Aby manipulować genami niezbędne są odpowiednie narzędzia molekularne, które pozwalają uzyskać tzw. zrekombinowane DNA (umożliwiają rekombinację materiału genetycznego in vitro czyli w próbówce) Najważniejsze

Bardziej szczegółowo

Zestaw do oczyszczania DNA po reakcjach enzymatycznych. Nr kat. EM03 Wersja zestawu:

Zestaw do oczyszczania DNA po reakcjach enzymatycznych. Nr kat. EM03 Wersja zestawu: Zestaw do oczyszczania DNA po reakcjach enzymatycznych Nr kat. EM03 Wersja zestawu: 1.2012 I. PRZEZNACZENIE ZESTAWU Zestaw EXTRACTME DNA CLEAN-UP przeznaczony jest do szybkiego i wydajnego oczyszczania

Bardziej szczegółowo

PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific

PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific Specjalnie dla Was przetestowaliśmy w naszym laboratorium odczynniki firmy Thermo Scientific umożliwiające przeprowadzanie reakcji

Bardziej szczegółowo

Ampli-LAMP Babesia canis

Ampli-LAMP Babesia canis Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego pierwotniaka Babesia canis canis techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-Bc-200 AML-Bc-400

Bardziej szczegółowo

Ćwiczenie numer 6. Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO

Ćwiczenie numer 6. Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO Ćwiczenie numer 6 Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO 1. Informacje wstępne -screening GMO -metoda CTAB -qpcr 2. Izolacja DNA z soi metodą CTAB 3. Oznaczenie ilościowe i jakościowe DNA

Bardziej szczegółowo

Zestaw do oczyszczania DNA po reakcjach enzymatycznych

Zestaw do oczyszczania DNA po reakcjach enzymatycznych Nr kat. EM07 Wersja zestawu: 1.2014 Zestaw do oczyszczania DNA po reakcjach enzymatycznych EXTRACTME jest zastrzeżonym znakiem towarowym firmy BLIRT S.A. www.dnagdansk.com Nr kat. EM07 I. PRZEZNACZENIE

Bardziej szczegółowo

Polimeraza Taq (1U/ l) 1-2 U 1 polimeraza Taq jako ostatni składniki mieszaniny końcowa objętość

Polimeraza Taq (1U/ l) 1-2 U 1 polimeraza Taq jako ostatni składniki mieszaniny końcowa objętość Ćwiczenie 6 Technika PCR Celem ćwiczenia jest zastosowanie techniki PCR do amplifikacji fragmentu DNA z bakterii R. leguminosarum bv. trifolii TA1 (RtTA1). Studenci przygotowują reakcję PCR wykorzystując

Bardziej szczegółowo

Zestaw dydaktyczny. genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP

Zestaw dydaktyczny. genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP 2014-07-17 Zestaw dydaktyczny EasyGenotyping PCR-RFLP - S. aureus genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP Celem ćwiczenia jest przeprowadzenie typowania genetycznego dostarczonych

Bardziej szczegółowo

INSTYTUT GENETYKI i HODOWLI ZWIERZĄT POLSKIEJ AKADEMII NAUK ul. POSTĘPU 36A, JASTRZĘBIEC, 05-552 Magdalenka

INSTYTUT GENETYKI i HODOWLI ZWIERZĄT POLSKIEJ AKADEMII NAUK ul. POSTĘPU 36A, JASTRZĘBIEC, 05-552 Magdalenka Jastrzębiec, 12. 03. 2014 r. Dotyczy przetargu DAZ-2401/ 7 / 14 na dostawę odczynników laboratoryjnych. Do zamawiającego wpłynęły następujące pytania na które odpowiedzi publikuje poniŝej: Dotyczy części

Bardziej szczegółowo

SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU PCR sposób na DNA.

SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU PCR sposób na DNA. SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU PCR sposób na DNA. SPIS TREŚCI: 1. Wprowadzenie. 2. Części lekcji. 1. Część wstępna. 2. Część realizacji. 3. Część podsumowująca. 3. Karty pracy. 1. Karta

Bardziej szczegółowo

Ligazy. Zastosowanie ligazy w inżynierii genetycznej:

Ligazy. Zastosowanie ligazy w inżynierii genetycznej: Ligazy Katalizują tworzenie wiązań fosfodiestrowych między sąsiednimi grupami 3 OH i 5 PO 4 w kwasach nukleinowych DNA lub RNA. W reakcji tworzą się wysokoenergetyczne pośredniki z udziałem NAD + lub ATP

Bardziej szczegółowo

Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych

Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych Wstęp teoretyczny Technika RAPD (ang. Random Amplification of Polymorphic DNA) opiera się na prostej reakcji PCR, przeprowadzanej na genomowym

Bardziej szczegółowo

PCR. Aleksandra Sałagacka

PCR. Aleksandra Sałagacka PCR Aleksandra Sałagacka Reakcja PCR naśladuje proces replikacji DNA in vitro pozwala na amplifikację określonego krótkiego (kilkadziesiąt kilka tys.pz) fragmentu DNA obecnie najważniejsze narzędzie biologii

Bardziej szczegółowo

Spis treści. spis treści. 2 syngen.pl. Polimerazy PCR i real-time PCR

Spis treści. spis treści. 2 syngen.pl. Polimerazy PCR i real-time PCR spis treści Spis treści Polimerazy PCR i real-time PCR 6 Klasyczny PCR Hot Start PCR Real-time PCR i analiza HRM Polimerazy specjalne (long range, proofreading) 6 8 10 13 Odwrotna transkrypcja 15 Izolacja

Bardziej szczegółowo

Poradnik: Optymalizacja reakcji PCR algorytm postępowania

Poradnik: Optymalizacja reakcji PCR algorytm postępowania Poradnik: Optymalizacja reakcji PCR algorytm postępowania Jak przeprowadzić optymalizację reakcji PCR? Co zmienić w metodyce, by pozbyć się produktów niespecyficznych? Jak poprawić plon reakcji? Od czego

Bardziej szczegółowo

METODY MOLEKULARNE STOSOWANE W TAKSONOMII

METODY MOLEKULARNE STOSOWANE W TAKSONOMII METODY MOLEKULARNE STOSOWANE W TAKSONOMII AUTOR: MAGDALENA DUDEK Taksonomia jest nauką, której głównym celem jest badanie, opisywanie oraz klasyfikacja organizmów. W oparciu o różnice i podobieństwa łączy

Bardziej szczegółowo

7. Metody molekularne jako źródło informacji botanicznej i lichenologicznej

7. Metody molekularne jako źródło informacji botanicznej i lichenologicznej 7. Metody molekularne jako źródło informacji botanicznej i lichenologicznej 7.2. Metody biologii molekularnej (technika PCR, sekwencjonowanie DNA) wykorzystywane w taksonomii roślin Autor: Magdalena Dudek

Bardziej szczegółowo

Zestaw do izolacji DNA z żeli agarozowych. Nr kat. EM08 Wersja zestawu:

Zestaw do izolacji DNA z żeli agarozowych. Nr kat. EM08 Wersja zestawu: Zestaw do izolacji DNA z żeli agarozowych Nr kat. EM08 Wersja zestawu: 1.2014 www.dnagdansk.com 2 Nr kat. EM08 I. PRZEZNACZENIE ZESTAWU Zestaw EXTRACTME DNA GEL OUT przeznaczony jest do szybkiej i wydajnej

Bardziej szczegółowo

Program ćwiczeń z inżynierii genetycznej KP-III rok Biologii

Program ćwiczeń z inżynierii genetycznej KP-III rok Biologii Program ćwiczeń z inżynierii genetycznej KP-III rok Biologii Ćwiczenie 1 i 2: Metody izolacji, oczyszczania DNA kolokwium wstępne: sprawdzenie podstawowych wiadomości z zakresu genetyki, i biologii molekularnej

Bardziej szczegółowo

Metody badania ekspresji genów

Metody badania ekspresji genów Metody badania ekspresji genów dr Katarzyna Knapczyk-Stwora Warunki wstępne: Proszę zapoznać się z tematem Metody badania ekspresji genów zamieszczonym w skrypcie pod reakcją A. Lityńskiej i M. Lewandowskiego

Bardziej szczegółowo

Zestaw do izolacji DNA z żeli agarozowych. Nr kat. EM08 Wersja zestawu:

Zestaw do izolacji DNA z żeli agarozowych. Nr kat. EM08 Wersja zestawu: Zestaw do izolacji DNA z żeli agarozowych Nr kat. EM08 Wersja zestawu: 1.2012 www.dnagdansk.com Nr kat. EM08 I. PRZEZNACZENIE ZESTAWU Zestaw EXTRACTME DNA GEL OUT przeznaczony jest do szybkiej i wydajnej

Bardziej szczegółowo

Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)

Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Cel ćwiczenia Amplifikacja fragmentu genu amelogeniny, znajdującego się na chromosomach X i Y, jako celu molekularnego przydatnego

Bardziej szczegółowo

Biologia Molekularna Podstawy

Biologia Molekularna Podstawy Biologia Molekularna Podstawy Budowa DNA Budowa DNA Zasady: Purynowe: adenina i guanina Pirymidynowe: cytozyna i tymina 2 -deoksyryboza Grupy fosforanowe Budowa RNA Budowa RNA Zasady: purynowe: adenina

Bardziej szczegółowo

Elektroforeza kwasów nukleinowych

Elektroforeza kwasów nukleinowych Elektroforeza kwasów nukleinowych Elektroforeza jest podstawową techniką wizualizacji kwasów nukleinowych pozwala bezpośrednio identyfikować cząsteczki DNA i jest stosunkowo czuła (po odpowiednim wybarwieniu

Bardziej szczegółowo

PAŃSTWOWY INSTYTUT WETERYNARYJNY

PAŃSTWOWY INSTYTUT WETERYNARYJNY PAŃSTWOWY INSTYTUT WETERYNARYJNY - PAŃSTWOWY INSTYTUT BADAWCZY DYREKTOR dr Krzysztof Niemczuk Uczestnicy postępowania o udzielenie zamówienia publicznego na sukcesywną dostawę odczynników do biologii molekularnej

Bardziej szczegółowo

Zestawy do izolacji DNA i RNA

Zestawy do izolacji DNA i RNA Syngen kolumienki.pl Gotowe zestawy do izolacji i oczyszczania kwasów nukleinowych Zestawy do izolacji DNA i RNA Katalog produktów 2012-13 kolumienki.pl Syngen Biotech Sp. z o.o., 54-116 Wrocław, ul. Ostródzka

Bardziej szczegółowo

innovating life science

innovating life science innovating life science Cennik produktów 2018 Jeśli mają Państwo jakiekolwiek pytania chętnie na nie odpowiemy. Służymy również pomocą przy wyborze naszych produktów, tak aby optymalnie odpowiadały one

Bardziej szczegółowo

PL 217144 B1. Sposób amplifikacji DNA w łańcuchowej reakcji polimerazy za pomocą starterów specyficznych dla genu receptora 2-adrenergicznego

PL 217144 B1. Sposób amplifikacji DNA w łańcuchowej reakcji polimerazy za pomocą starterów specyficznych dla genu receptora 2-adrenergicznego PL 217144 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 217144 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 391926 (22) Data zgłoszenia: 23.07.2010 (51) Int.Cl.

Bardziej szczegółowo

Elektroforeza kwasów nukleinowych

Elektroforeza kwasów nukleinowych Elektroforeza kwasów nukleinowych Elektroforeza jest podstawową techniką wizualizacji kwasów nukleinowych pozwala bezpośrednio identyfikować cząsteczki DNA ze stosunkowo wysoką czułością (po odpowiednim

Bardziej szczegółowo

innovating life science

innovating life science innovating life science Cennik produktów 2016 Jeśli mają Państwo jakiekolwiek pytania chętnie na nie odpowiemy. Służymy również pomocą przy wyborze naszych produktów, tak aby optymalnie odpowiadały one

Bardziej szczegółowo

Biochemia: Ćw. 11 Metoda RT-PCR

Biochemia: Ćw. 11 Metoda RT-PCR Ćwiczenie 11 METODA RT-PCR Wyciąg z kart charakterystyki substancji niebezpiecznych: bromek etydyny T+ EDTA Xi etanol, 96% F kwas octowy, 96% C -merkaptoetanol N, T Tris Xi UWAGI WSTĘPNE Praca z kwasami

Bardziej szczegółowo

Elektroforeza kwasów nukleinowych

Elektroforeza kwasów nukleinowych Elektroforeza kwasów nukleinowych Elektroforeza jest podstawową techniką wizualizacji kwasów nukleinowych pozwala bezpośrednio identyfikować cząsteczki DNA i jest stosunkowo czuła (po odpowiednim wybarwieniu

Bardziej szczegółowo

Izolacja i oczyszczanie DNA jest kluczowym etapem większości. procedur stosowanych w biologii molekularnej, diagnostyce i innych

Izolacja i oczyszczanie DNA jest kluczowym etapem większości. procedur stosowanych w biologii molekularnej, diagnostyce i innych izolacja DNA Izolacja i oczyszczanie DNA jest kluczowym etapem większości procedur stosowanych w biologii molekularnej, diagnostyce i innych badaniach. Głównym celem tego etapu badań jest uzyskanie wysokiej

Bardziej szczegółowo

Maks ilość. nr katalogowy/ okres gwarancji

Maks ilość. nr katalogowy/ okres gwarancji Załacznik nr 1, znak sprawy DZ-2501/28/14/1 FORMULARZ OPISU PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA - FORMULARZ CENOWY lp. nazwa jedn. miary Mini ilość Maks ilość nr katalogowy/ okres gwarancji cena jedn. netto stawka VAT

Bardziej szczegółowo

ENZYMY RESTRYKCYJNE ENZYMY RESTRYKCYJNE CZYM RÓŻNIĄ SIĘ POSZCZEGÓLNE ENZYMY? nazewnictwo: EcoRV

ENZYMY RESTRYKCYJNE ENZYMY RESTRYKCYJNE CZYM RÓŻNIĄ SIĘ POSZCZEGÓLNE ENZYMY? nazewnictwo: EcoRV ENZYMY RESTRYKCYJNE Enzymy z klasy endonukleaz (hydrolaz), wykazujące powinowactwo do specyficznych fragmentów dwuniciowych cząsteczek DNA i hydrolizujące wiązania fosfodiestrowe w obu niciach Naturalnie

Bardziej szczegółowo

Karta charakterystyki produktu

Karta charakterystyki produktu 1.Identyfikacja substancji/preparatu i identyfikacja producenta: Nazwa produktu: Zestaw enzym VivaTaq DNA Polimerase stężenie (5u/µl) z buforem reakcyjnym Aplikacja: Produkt został zaprojektowany i wykonany

Bardziej szczegółowo

Adres strony internetowej, na której Zamawiający udostępnia Specyfikację Istotnych Warunków Zamówienia: www.imp.sosnowiec.pl

Adres strony internetowej, na której Zamawiający udostępnia Specyfikację Istotnych Warunków Zamówienia: www.imp.sosnowiec.pl Strona 1 z 7 Adres strony internetowej, na której Zamawiający udostępnia Specyfikację Istotnych Warunków Zamówienia: www.imp.sosnowiec.pl Sosnowiec: Sukcesywna dostawa odczynników dla Instytutu Medycyny

Bardziej szczegółowo

2015-11-18. DNA i RNA ENZYMY MODYFIKUJĄCE KOŃCE CZĄSTECZEK. DNA i RNA. DNA i RNA

2015-11-18. DNA i RNA ENZYMY MODYFIKUJĄCE KOŃCE CZĄSTECZEK. DNA i RNA. DNA i RNA Fosfataza alkaliczna CIP Calf Intestine Phosphatase- pochodzenie: jelito cielęce BAP Bacterial Alcaline Phosphatase- pochodzenie: E. coli SAP Shrimp Alcaline Phosphatase- pochodzenie: krewetki Pandalus

Bardziej szczegółowo

Elektroforeza kwasów nukleinowych

Elektroforeza kwasów nukleinowych Elektroforeza kwasów nukleinowych Elektroforeza jest podstawową techniką wizualizacji kwasów nukleinowych pozwala bezpośrednio identyfikować cząsteczki DNA i jest stosunkowo czuła (po odpowiednim wybarwieniu

Bardziej szczegółowo

Ćwiczenia 1 Wirtualne Klonowanie Prowadzący: mgr inż. Joanna Tymeck-Mulik i mgr Lidia Gaffke. Część teoretyczna:

Ćwiczenia 1 Wirtualne Klonowanie Prowadzący: mgr inż. Joanna Tymeck-Mulik i mgr Lidia Gaffke. Część teoretyczna: Uniwersytet Gdański, Wydział Biologii Katedra Biologii Molekularnej Przedmiot: Biologia Molekularna z Biotechnologią Biologia II rok ===============================================================================================

Bardziej szczegółowo

innovating life science

innovating life science innovating life science Cennik produktów 2016 Jeśli mają Państwo jakiekolwiek pytania chętnie na nie odpowiemy. Służymy również pomocą przy wyborze naszych produktów, tak aby optymalnie odpowiadały one

Bardziej szczegółowo

Biologia Molekularna z Biotechnologią ===============================================================================================

Biologia Molekularna z Biotechnologią =============================================================================================== Uniwersytet Gdański, Wydział Biologii Biologia i Biologia Medyczna II rok Katedra Genetyki Molekularnej Bakterii Katedra Biologii i Genetyki Medycznej Przedmiot: Katedra Biologii Molekularnej Biologia

Bardziej szczegółowo

PL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W LUBLINIE, Lublin, PL BUP 04/14. SYLWIA OKOŃ, Dąbrowica, PL KRZYSZTOF KOWALCZYK, Motycz, PL

PL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W LUBLINIE, Lublin, PL BUP 04/14. SYLWIA OKOŃ, Dąbrowica, PL KRZYSZTOF KOWALCZYK, Motycz, PL PL 220315 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 220315 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 400252 (22) Data zgłoszenia: 06.08.2012 (51) Int.Cl.

Bardziej szczegółowo

Glimmer umożliwia znalezienie regionów kodujących

Glimmer umożliwia znalezienie regionów kodujących Narzędzia ułatwiające identyfikację właściwych genów GLIMMER TaxPlot Narzędzia ułatwiające amplifikację tych genów techniki PCR Primer3, Primer3plus PrimerBLAST Reverse Complement Narzędzia ułatwiające

Bardziej szczegółowo

Endonukleazy restrykcyjne molekularne nożyczki

Endonukleazy restrykcyjne molekularne nożyczki Endonukleazy restrykcyjne molekularne nożyczki Inżynieria genetyczna nauka o technikach (narzędziach) biologii molekularnej pozwalających na świadomą i zamierzoną ingerencję w materiał genetyczny organizmów

Bardziej szczegółowo

Inżynieria genetyczna Ćwiczenie 3

Inżynieria genetyczna Ćwiczenie 3 Inżynieria genetyczna Ćwiczenie 3 Metoda PCR została opracowana w 1987 r. przez grupę Naukowców z Cetus Corporation w USA. Firma Roche odkupiła od Cetus Corp. prawa do PCR za 300 mln $ Autor K. Mullis

Bardziej szczegółowo

Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan

Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan Klasyczna metoda PCR jest metodą jakościową, nie ilościową co np.

Bardziej szczegółowo

Ampli-LAMP Goose Parvovirus

Ampli-LAMP Goose Parvovirus Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego parwowirusa GPV u gęsi techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-GPV-200 AML-GPV-400 Wydanie

Bardziej szczegółowo

ul. Brzozowa 10 83-200 Rokocin www.genoplast.pl

ul. Brzozowa 10 83-200 Rokocin www.genoplast.pl ul. Brzozowa 10 83-200 Rokocin www.genoplast.pl Spis treści BBI IOMOLLEECCULLAARR... 4 ENZYMY I ODCZYNNIKI DO PCR... 4 TERMOSTABILNE POLIMERAZY I MIKSY DO PCR... 4 DNTP-Y... 5 MARKERY (WZORCE) WIELKOŚCI

Bardziej szczegółowo

CENNIK PRODUKTÓW DNA-GDAŃSK 2014

CENNIK PRODUKTÓW DNA-GDAŃSK 2014 CENNIK PRODUKTÓW DNA-GDAŃSK 2014 ZESTAWY DO IZOLACJI I OCZYSZCZANIA DNA I RNA NAZWA PRODUKTU ILOŚĆ NR KAT. EXTRACTME PLASMID DNA KIT izolacja plazmidowego DNA EXTRACTME DNA BACTERIA KIT izolacja genomowego

Bardziej szczegółowo

Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, Warszawa. Zakład Biologii Molekularnej

Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, Warszawa. Zakład Biologii Molekularnej Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa 1 Ćwiczenie 1 Izolacja oraz

Bardziej szczegółowo

dostawa odczynników chemicznych oraz akcesoriów laboratoryjnych

dostawa odczynników chemicznych oraz akcesoriów laboratoryjnych dostawa odczynników chemicznych oraz akcesoriów laboratoryjnych Polsko-Japońska Wyższa Szkoła Technik Komputerowych 02-008 Warszawa Koszykowa 86 Tel. (22) 58 44 536 Fax. 022 58 44 502 E-mail trampczynska@pjwstk.edu.pl

Bardziej szczegółowo

Prowadzący: dr Lidia Boss znacznik fluorescencyjny (np. SYBR Green II)

Prowadzący: dr Lidia Boss znacznik fluorescencyjny (np. SYBR Green II) Uniwersytet Gdański, Wydział Biologii Biologia i Biologia Medyczna II rok Katedra Biologii Molekularnej Przedmiot: Biologia Molekularna z Biotechnologią ============================================================================

Bardziej szczegółowo

Załacznik nr 1, znak sprawy DZ-2501/18/16/1 FORMULARZ OPISU PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA - FORMULARZ CENOWY

Załacznik nr 1, znak sprawy DZ-2501/18/16/1 FORMULARZ OPISU PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA - FORMULARZ CENOWY Załacznik nr 1, znak sprawy DZ-2501/18/16/1 FORMULARZ OPISU PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA - FORMULARZ CENOWY lp. nazwa jedn. miary Maks. ilość Min. ilość Zadanie 12.1.3 Startery/sondy oligonukleotydowe Vysis lub

Bardziej szczegółowo

Ćwiczenie 1 Plazmidy bakteryjne izolacja plazmidowego DNA

Ćwiczenie 1 Plazmidy bakteryjne izolacja plazmidowego DNA Ćwiczenie 1 Plazmidy bakteryjne izolacja plazmidowego DNA Plazmidy stanowią pozachromosomalny materiał genetyczny bakterii. Warunkują one szereg cech fenotypowych jak oporność na leki, syntezę substancji

Bardziej szczegółowo

Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów:

Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów: Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów: 1. Otrzymanie pożądanego odcinka DNA z materiału genetycznego dawcy 2. Wprowadzenie obcego DNA do wektora 3. Wprowadzenie wektora, niosącego w sobie

Bardziej szczegółowo

Metody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie, PCR-RLFP, PCR-Multiplex, PCR-ASO

Metody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie, PCR-RLFP, PCR-Multiplex, PCR-ASO Diagnostyka molekularna Dr n.biol. Anna Wawrocka Strategia diagnostyki genetycznej: Aberracje chromosomowe: Metody:Analiza kariotypu, FISH, acgh, MLPA, QF-PCR Gen(y) znany Metody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie,

Bardziej szczegółowo

Gel-Out. 50 izolacji, 250 izolacji. Nr kat , Zestaw do izolacji DNA z żelu agarozowego. wersja 0617

Gel-Out. 50 izolacji, 250 izolacji. Nr kat , Zestaw do izolacji DNA z żelu agarozowego. wersja 0617 Gel-Out Zestaw do izolacji DNA z żelu agarozowego. wersja 0617 50 izolacji, 250 izolacji Nr kat. 023-50, 023-250 Pojemność kolumny do izolacji DNA - do 20 µg DNA, minimalna pojemność - 2 µg DNA (przy zawartości

Bardziej szczegółowo

CENNIK PRODUKTÓW DNA-GDAŃSK 2013

CENNIK PRODUKTÓW DNA-GDAŃSK 2013 CENNIK PRODUKTÓW DNA-GDAŃSK 2013 ZESTAWY DO IZOLACJI I OCZYSZCZANIA DNA I RNA EXTRACTME PLASMID DNA KIT Nowość! izolacja plazmidowego DNA EXTRACTME DNA BACTERIA KIT Nowość! izolacja genomowego DNA z bakterii

Bardziej szczegółowo

SubDNA. Zestaw do elektroforezy horyzontalnej w żelu agarozowym z chłodzeniem* Instrukcja Obsługi

SubDNA. Zestaw do elektroforezy horyzontalnej w żelu agarozowym z chłodzeniem* Instrukcja Obsługi * SubDNA Zestaw do elektroforezy horyzontalnej w żelu agarozowym z chłodzeniem* Instrukcja Obsługi Numer katalogowy: 130-100 Numer katalogowy: 131-100* Aby uzys k ać pomoc techniczną (+48) 22 668 71 47

Bardziej szczegółowo

Novabeads Food DNA Kit

Novabeads Food DNA Kit Novabeads Food DNA Kit Novabeads Food DNA Kit jest nowej generacji narzędziem w technikach biologii molekularnej, umożliwiającym izolację DNA z produktów spożywczych wysoko przetworzonych. Metoda oparta

Bardziej szczegółowo

PathogenFree DNA Isolation Kit Zestaw do izolacji DNA Instrukcja użytkownika

PathogenFree DNA Isolation Kit Zestaw do izolacji DNA Instrukcja użytkownika PathogenFree DNA Isolation Kit Zestaw do izolacji DNA Instrukcja użytkownika Spis treści 1. Zawartość 2 1.1 Składniki zestawu 2 2. Opis produktu 2 2.1 Założenia metody 2 2.2 Instrukcja 2 2.3 Specyfikacja

Bardziej szczegółowo

CENNIK PRODUKTÓW BIOLINE 2016

CENNIK PRODUKTÓW BIOLINE 2016 RNA PROBE RNA SYBR DNA PROBE DNA SYBR CENNIK PRODUKTÓW BIOLINE 2016 MASTER MIXY REAL-TIME PCR UWAGA JESZCZE NIŻSZE CENY! MASTER MIXY REAL-TIME PCR SensiFAST SYBR No-ROX m.in. SmartCycler (Cepheid), Rotor-Gene

Bardziej szczegółowo

umożliwiający wyl<rywanie oporności na HIV przy użyciu

umożliwiający wyl<rywanie oporności na HIV przy użyciu Zestaw dydaktyczny Nr kat. OY255 Wersja zestawu: 1.2015 Zestaw dydaktyczny umożliwiający wyl

Bardziej szczegółowo

Endonukleazy restrykcyjne molekularne nożyczki

Endonukleazy restrykcyjne molekularne nożyczki Endonukleazy restrykcyjne molekularne nożyczki Inżynieria genetyczna nauka o technikach badawczych pozwalających na ingerencję w materiał genetyczny organizmów w celu wyizolowania i charakterystyki określonych

Bardziej szczegółowo

Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV

Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności

Bardziej szczegółowo

PROJEKT WSPÓŁFINANSOWANY PRZEZ UNIĘ EUROPEJSKĄ Z EUROPEJSKIEGO FUNDUSZU ROZWOJU REGIONALNEGO 1 z 7

PROJEKT WSPÓŁFINANSOWANY PRZEZ UNIĘ EUROPEJSKĄ Z EUROPEJSKIEGO FUNDUSZU ROZWOJU REGIONALNEGO 1 z 7 Poznań, dnia 28.04.2014 r. BioVentures Institute Spółka z ograniczoną odpowiedzialnością ul. Promienista 83 60 141 Poznań Zapytanie ofertowe nr 01/2014 Projekt Nowa technologia wytwarzania szczepionek

Bardziej szczegółowo

PAŃSTWOWY INSTYTUT WETERYNARYJNY

PAŃSTWOWY INSTYTUT WETERYNARYJNY PAŃSTWOWY INSTYTUT WETERYNARYJNY - PAŃSTWOWY INSTYTUT BADAWCZY DYREKTOR dr Krzysztof Niemczuk Uczestnicy postępowania o udzielenie zamówienia publicznego na sukcesywną dostawę odczynników do biologii molekularnej

Bardziej szczegółowo

AmpliTest TBEV (Real Time PCR)

AmpliTest TBEV (Real Time PCR) AmpliTest TBEV (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji RNA specyficznych dla TBEV (Tick-borne encephalitis virus) techniką Real Time PCR Nr kat.: RV03-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość pojedynczej

Bardziej szczegółowo

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa Ćwiczenie 3 Izolacja i rozdział

Bardziej szczegółowo