Zarządzanie populacjami zwierząt. Relacje między osobnikami w populacji spokrewnienie i inbred Depresja inbredowa Ocena efektów krzyżowania

Wielkość: px
Rozpocząć pokaz od strony:

Download "Zarządzanie populacjami zwierząt. Relacje między osobnikami w populacji spokrewnienie i inbred Depresja inbredowa Ocena efektów krzyżowania"

Transkrypt

1 Zarządzanie populacjami zwierząt Relacje między osobnikami w populacji spokrewnienie i inbred Depresja inbredowa Ocena efektów krzyżowania

2 Czym będziemy się zajmować Genetyczne relacje między osobnikami w populacji Efektywna wielkość populacji i sposoby jej maksymalizacji Konsekwencje fragmentacji i izolacji populacji Struktura genetyczna populacji, prawo równowagi, czynniki wpływające na zmiany struktury i skutki ich stosowania w populacji zależnie od celu jej prowadzenia Parametry genetyczne cech Ocena wartości hodowlanej, dokładność i cele Selekcja naturalna i sztuczna, metody, efekty, cele Kojarzenia i krzyżowanie cele, techniki, osiągane rezultaty. Heterozja a depresja inbredowa Przykłady prowadzenia populacji zwierząt gospodarskich zależnie od celu uzyskiwanie postępu hodowlanego, zachowanie zmienności Gospodarowanie populacjami naturalnymi zwierząt gatunków łownych i chronionych

3 Populacja Populacja zbiór organizmów żywych posiadających pewną własność np. zwierzęta danego gatunku lub rasy

4

5

6 Populacja aa Aa aa aa aa aa aa aa aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa aa aa aa aa aa aa aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa aa Aa aa aa aa aa aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa aa aa aa aa aa Aa Aa Aa

7 Struktura populacji Frekwencja genotypów genotyp liczba osobników 1 Aa 16 aa p = 1/50 = 0,4 p Aa = 16/50 = 0,3 P aa = /50 = 0,44 Frekwencja alleli: p A = (x1+16)/100 = 0,40 p a = (x+16)/100 = 0,60 p = 1/50 = 0,4 Liczba alleli w locus A obs =

8 Genetyka populacji ocenia genetyczną strukturę populacji oraz zmiany tej struktury pod wpływem różnych czynników uwzględniając znane zasady dziedziczenia Struktura genetyczna populacji opis alleli i genotypów w poszczególnych loci wraz z częstością (prawdopodobieństwem) ich występowania w populacji

9 Cechy ilościowe Opisywane rozkładem zmiennej losowej ciągłej - rozkład normalny Opisywane przy pomocy parametrów: średnia, wariancja, odchylenie standardowe

10 % 0,35 0,3 0,5 0, 0,15 0,1 0,

11 RELACJE MIĘDZY OSOBNIKAMI W POPULACJI SPOKREWNIENIE i INBRED

12 Rodowód uporządkowany zestaw przodków

13

14 PLATON II 4736 PLAMARUS 1469 PLAMA PLEWNIK PLATON II 6834 PLOTKARA 1367 PLOTKA PLUD PLAMBOR 558 PLESO 1994 PLACENTA PLUDKA PLATON II PLAŻA 1357 PLATYNA II PLATON II PLAWIANT 4736 PLAMARUS 1469 PLAMA PLEWNIK PLATON II 6055 PLOTKARA 1367 PLOTKA PLAWNA PLAMIEC 391 PLUTON 91 KAMIONKA PLEŚNA PLATON II PLOMBA 1367 PLOTKA PLAMBOR POTOMKA 5307 PLESO 1994 PLACENTA PLANUS PLATON II 8056 PLAŻA 1357 PLATYNA II PLARON PLESO 7050 PLANUS 678 PLAŻA PLATORA PLAMARUS PLOTA 1994 PLACENTA PLAMARUS PORCJA II 683 PLEWNIK 544 PLOTKARA POWAŻNIK PLESO 8308 POWAGA II 3057 PLINTA PONTKA PLAMARUS 687 PLEWNIK 544 PLOTKARA PONITA PLESO PONURA II 476 PODPINKA

15

16 Podobieństwo między rodzicem a potomkiem ½ ½ ½ ½ R RP = ½

17 Podobieństwo pełnego rodzeństwa (FS full sibs) 1 ½ ½ 0 ½ 1 0 ½ ½ 0 1 ½ 0 ½ ½ 1 R FS = ½

18 Podobieństwo pół rodzeństwa (HS half sibs) ½ 0 ½ 0 0 ½ 0 ½ ½ 0 ½ 0 0 ½ 0 ½ R HS = ¼

19 Co to jest inbred kojarzenie FS F = 1 / 4

20 Co to jest inbred kojarzenie HS F = 1 / 8

21 Inbred Miara wynikająca ze spokrewnienia (podobieństwa) gamet tworzących zygotę. Inbred to prawdopodobieństwo, że obydwie gamety na tym samym locus mają identyczne allele. Identyczne czyli stanowiące kopię allelu wspólnego przodka. Biorąc pod uwagę wiele loci liczba informująca o homozygotyczności o wartości od 0 do 1

22 Rodowód strzałkowy A B C E F H L N M

23 Współczynnik inbredu n n F X 1 F A

24 Współczynnik spokrewnienia R XY 1 (1 F n i X n j (1 F ) (1 F Y A ) ) Gdzie: F A - współczynnik inbredu wspólnego przodka F X (F Y ) współczynnik inbredu osobnika X (Y) n i (n j ) liczba ścieżek między osobnikiem X (Y) a wspólnym przodkiem

25 Relacja między współczynnikami inbredu i spokrewnienia Współczynnik inbredu jest połową spokrewnienia rodziców jeśli nie są oni zinbredowani F X F A n n ) (1 ) (1 ) (1 1 Y X A n n XY F F F R j i

26 Rodowód strzałkowy R AB = 0 A B C R AE = ½ E F H R CN = ¼ L N R AL ( 1 ) ( 1 ) (1 0) (1 0,5) 0,5 1,5 0,447 P

27 Rodowód strzałkowy A B C E L F N H Ścieżki P N P L E N P L E B H N P L F B H N P L F B E N P L F A E N P R PN ( 1 ) (1 0,15) ( (1 0,5) (1 0,15) 0,5 1,15 0,15 0,15 1,51,15 1 ) 3 4 ( 0,815 1, ) 5 0,685

28 Jeden plus połowa wartości na skrzyżowaniu H oraz E Połowa wartości w kolumnach A oraz B A B A B B C E F E H L N A B C E F H L N P A ,5 0,5 0 0,5 0,5 0,375 B ,5 0,5 0,5 0,5 0,5 0,5 C ,5 0 0,5 0,15 E 0,5 0, ,5 0,5 0,75 0,65 0,6875 F 0,5 0,5 0 0,5 1 0,5 0,75 0,375 0,565 H 0 0,5 0,5 0,5 0,5 1 0,5 0,65 0,4375 L 0,5 0,5 0 0,75 0,75 0,5 1,5 0,5 0,875 N 0,5 0,5 0,5 0,65 0,375 0,65 0,5 1,15 0,815 P 0,375 0,5 0,15 0,6875 0,565 0,4375 0,875 0,815 1,5

29 Średnie spokrewnienie osobników w stadzie R 0,3651 A B C F H L M N P A 0 0 0,5 0,5 0 0,447 0,36 0,335 B 0 0 0,5 0,5 0,5 0,447 0,471 0,447 C ,5 0 0,36 0,11 F 0,5 0,5 0 0,5 0,5 0,671 0,589 0,615 H 0,5 0,5 0 0,5 0,5 0,671 0,354 0,503 L 0 0,5 0,5 0,5 0,5 0,4 0,589 0,391 M 0,447 0, ,671 0,671 0,4 0,4 0,700 N 0,36 0,471 0,36 0,589 0,354 0,589 0,4 0,685 P 0,335 0,447 0,11 0,615 0,503 0,391 0,700 0,685

30 inbred kinship hodowla 8567 POLWITA F 0,377 0,350 Białowieża 8568 PONTYJKA F 0,383 0, POKRYWKA F 0,399 0, POKUTNA F 0,377 0, PODPAŁKA F 0,346 0, POCHODNA F 0,330 0, POLSPAN M 0,334 0, PODLASIANKA II F 0,37 0, POWOJNA F 0,367 0, PODPAŁA F 0,356 0, PORWANKA F 0,385 0, PODJESIONEK M 0,360 0, POMPIER M 0,453 0,337 0,37 0, PORODNA F 0,360 0,334 Hardehausen 9945 POLIANNA II F 0,506 0,37 0,433 0, CLIMAT M 0,353 0,336 Margeride 9334 CLAQUE F 0,35 0,343 0,353 0, PLISTA F 0,586 0,441 Pszczyna 8544 PLATURA F 0,589 0, PODPINKA F 0,516 0, PLUGONKA F 0,596 0, PLAWIANT M 0,607 0, PLASTYKA F 0,607 0, POTAWA F 0,63 0, PORCJA II F 0,560 0, POLUCJA F 0,588 0, PLISZAJ M 0,617 0, PONTIA F 0,560 0, PLEO M 0,660 0, PORUSZA F 0,590 0, PLADORA F 0,633 0, PODRYW II M 0,595 0, PLAWAN M 0,65 0, PLUGO M 0,600 0, PLATYNKA F 0,65 0, PLAMISTA F 0,691 0, POTOMKA F 0,583 0, PLASTYK M 0,631 0,44 0,607 0,44 Współczynnik inbredu prawdopodobieństwo homozygotyczności w konsekwencji kojarzeń w pokrewieństwie Współczynnik kinship (wspólnego pochodzenia) dotyczy dwóch osobników i oznacza inbred hipotetycznego potomka Mean Kinship Średnia wsp. kinship osobnika ze wszystkimi innymi w populacji Mierzy podobieństwo osobnika do całej populacji

31 Udział założycieli Proporcja genów założycieli w genotypie osobnika A B C A 1 B 1 C 1 E 0,5 0,5 F 0,5 0,5 H 0,5 0,5 L 0,5 0,5 N 0,5 0,5 0,5 P 0,375 0,5 0,15

32 POLWITA 4,5 9,0 6, 48,7 3,6 3,6 4, PONTYJKA 3,9 7,8 7,5 49,1 3,9 3,9 3, POKRYWKA 4,0 8,0 7,5 48,3 4,1 4,1 4, POKUTNA 4,5 9,0 6, 48,7 3,6 3,6 4, PODPAŁKA 5,0 10,0 7,3 43,9 4,5 4,5 5, POCHODNA 4,7 9,4 6,0 48,1 3,6 3,6 4, POLSPAN 4,9 9,8 7,1 44,4 4,5 4,5 4,9 917 PODLASIANKA II 5,3 10,6 7,4 41,8 4,9 4,9 5, POWOJNA 4,6 9, 7,3 45,7 4,3 4,3 4,6 970 PODPAŁA 4,5 8,9 7,3 46,8 4,1 4,1 4, PORWANKA 4,8 9,6 6,8 45,8 4, 4, 4, PODJESIONEK 4,9 9,8 6,7 45,5 4, 4, 4, POMPIER 4,9 9,7 7,4 44,3 4,5 4,5 4, PORODNA 4,9 9,8 6,7 45,5 4, 4, 4, POLIANNA II 5, 10,4 7,4 4,3 4,8 4,8 5, 933 CLIMAT 4,5 9,0 7,3 46,5 4,1 4,1 4, CLAQUE 3,6 7, 7,9 49,5 4,1 4,1 3, PLISTA ,5 69, PLATURA ,5 69, PODPINKA 0,4 0,8 30,5 67, 0,4 0,4 0, PLUGONKA ,5 69, PLAWIANT ,6 69, PLASTYKA ,6 69, POTAWA 0, 0,4 30,5 68,4 0, 0, 0, 9365 PORCJA II 0, 0,4 30,5 68,4 0, 0, 0, 9367 POLUCJA 0,1 0, 30,5 69,0 0,1 0,1 0, PLISZAJ ,5 69, PONTIA 0, 0,4 30,5 68,4 0, 0, 0, 976 PLEO ,5 69, PORUSZA 0, 0,4 30,5 68,4 0, 0, 0, 9994 PLADORA ,5 69, PODRYW II 0,1 0, 30,5 69,0 0,1 0,1 0, PLAWAN ,5 69, PLUGO ,5 69, PLATYNKA ,5 69, PLAMISTA ,6 69, POTOMKA 0,1 0, 30,5 68,9 0,1 0,1 0, PLASTYK ,5 69, Udział założycieli

33 unikalnośc 8567 POLWITA 0 Białowieża 8568 PONTYJKA POKRYWKA POKUTNA PODPAŁKA 0, POCHODNA 0, POLSPAN 0, PODLASIANKA II 0, POWOJNA PODPAŁA PORWANKA PODJESIONEK POMPIER PORODNA 0 Hardehausen 9945 POLIANNA II 0, CLIMAT 0,0008 Margeride 9334 CLAQUE 0, PLISTA 0 Pszczyna 8544 PLATURA PODPINKA PLUGONKA PLAWIANT PLASTYKA POTAWA PORCJA II POLUCJA PLISZAJ PONTIA PLEO PORUSZA PLADORA PODRYW II PLAWAN PLUGO PLATYNKA PLAMISTA POTOMKA PLASTYK 0 Unikalność Prawdopodobieństwo posiadania unikalnych dla populacji genów

34 Linie mateczne od założycielek

35 Inbred

36 F t = 1 / (1+F t-1 ) F t = 1 / 4 (1+F t-1 +F t- ) pokolenie samozapłodnienie kojarzenia FS ,5 0,5 3 0,75 0, ,875 0,5 5 0,9375 0, , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , Narastanie poziomu inbredu

37 przyrost inbredu na pokolenie jest funkcją efektywnej wielkości stada (populacji) F 1 N e wielkość inbredu w pokoleniu t w populacji F t F F( 1 F ) t 1 t1 o jednakowej efektywnej wielkości F 1 (1 F) t t

38 Poziom inbredu w pokoleniach zależnie od Ne

39 Depresja inbredowa Różnica między średnią wartością cechy w populacji zinbredowanej i outbredowej Może być względna (względem populacji outbredowej) m inb m m out out m ID out m m inb out 1

40 Wyjaśnienie depresji inbredowej: dużo loci o małym efekcie albo mało loci o dużym efekcie malo loci duzo loci , 0,4 0,6 0,8 1

41 ocena depresji inbredowej dla przeżywalności S W przedziałowym szeregu rozdzielczym ln S β β F 0 1 e 0 e 0 1 szacowana przeżywalność w populacji outbredowej bo F=0 szacowana przeżywalność w populacji inbredowej 1 letalny równoważnik genotypu

42 Przykład dla okapi: ln S 0,48 1, 80 F e -0,48 = 0,619 Jeśli F=0,5 e -0,48-0,51,80 = 0,395 0,395 0,619 0,619 0,4 0,5 0,619 0,36

43 Jeśli przeżywalność będzie zmienną o rozkładzie dwupunktowym Regresja logistyczna: S e 1 β 0 e β β 0 1 F β 1 F. Analiza wariancji S ij β α β 0 i 1 F ij e ij

44 Poziom inbredu dla populacji w niewoli Gatunek N Średni inbred % osobników o F>0 Lew azjatycki (Panthera leo persica) 151 0,197 80,8 Koń Przewalskiego (Equus przewalskii) ,07 95,7 Hipopotam karłowaty (Choeropsis liberiensis) 641 0,057 5,9 Muntiak (Muntiacus reevesi) 136 0,11 69,1 Jeleń (Cervus eldi thamin) 314 0,110 51,6 Gaur (Bos gaurus) 518 0,145 69,5 Żubr (Bison bonasus) 878 0,47 93,8 Gazela dorkas (Gazella dorcas) 184 0,118 60,3 Gazela spekei (Gazella spekei) 164 0,166 8,9

45 Wielkość depresji inbredowej gatunek cecha Depresja na 1% of F absolutna względna [%] bydło Wydajność mleka - 1 ; -19 kg Wydajność tłuszczu kg 0.51 trzoda Wielkość miotu (dzień 0) -0.0 szt 0.46 Wielkość miotu (wiek 5 m-cy) szt 0.55 Masa ciała (5 m-cy) kg 0.7 owce Wydajność wełny kg 0.55 wysadność cm 0.13 Masa ciała (1 rok) kg kury nieśność szt 0.6 % wyklucia % 0.64 Masa ciała kg 0.50

46 Wpływ inbredu na śmiertelność młodych % śmiertelności P Liczebność gatunek F=0 F>0 F=0 F>0 kudu 8,6 7,3 ns zebra 5,9 40,0 ns 7 5 jeleń Dawida 11,8 13,6 ns 17 żyrafa 1,4 60,0, słoń indyjski 15,3 66,7, hipopotam karłowaty 4,5 54,9, oryks 0,1 100,

47 Depresja inbredowa u wilka (Canis lupus) Cecha N Wielkość depresji na 1 % inbredu Masa ciała w wieku 8 m-cy [kg] 48-0,3*** Długość życia [dni] 19-14,78 Plenność samic [szt] 36-0,07

48 rząd gatunek Wiek [dni] N Dokładność oszacowania Koszt inbredu F=0.5 [%] torbacze opos walabia naczelne lemur czarny lemur brązowy makak szympans gryzonie szczur akuczi drapieżne wilk grzywiasty tygrys sumatrzański ,3 nieparzystokopytne zebra parzystokopytne hipopotam karłowaty jeleń Dawida żyrafa kudu bongo gaur oryks gazela Spekes a

49 Model 1 locus A a A Aa a Aa aa Aa +x 0 aa -x

50 Model jednego locus A A A 1 A A 1 A 1 -a 0 d a P(A 1 )=p; P(A )=q; p+q=1

51 Średnia wartość populacji genotyp wartość częstość A 1 A 1 a p A 1 A d pq A A -a q dpq q p a pqd a q p q p pqd a q p a q d pq a p G ) ( ) )( ( ) ( ) (

52 Inbred w modelu jednego locus W populacji frekwencje genotypów, Aa, aa wynoszą p, pq i q. W populacji z kojarzeniami w pokrewieństwie genotypy homozygotyczne są częstsze, zatem frekwencja genotypów niech będzie p +, pq- i q +. Wartość możemy wyznaczyć opierając się na definicji inbredu jako korelacji między gametami, zakładając wartość gamety z allelem A na poziomie 1, a gamety z allelem a równą 0.

53 Inbred w modelu jednego locus Gameta żeńska oznaczona będzie przez X, a męska literą Y. Rozkład alleli w gamecie allel częstość A p EX = EY = p a q D X = D Y = pq W wyniku kojarzenia dochodzi do połączenia gamet: gameta X gameta Y XY częstość allel wartość allel wartość A 1 A 1 1 p + A 1 a 0 0 pq - a 0 A 1 0 pq - a 0 a 0 0 q +

54 Inbred w modelu jednego locus EXY = 1 x (p +)+0 x (pq-)+0 x (pq-)+0 x (q +) = p + COVXY = EXY EX x EY = p + - p = w populacji zinbredowanej genotyp Aa aa F pq częstość p +pqf pq(1-f) q +pqf pqf

55 Depresja inbredowa (ID) d w jednym locus ID pq d F a dla wielu loci 0 -a ID F p i q i d i aa

56 Ocena efektów krzyżowania

57 Krzyżowanie model jednego locus Populacja nr 1: frekwencje alleli p oraz q M p1 =a(p-q)+dpq Populacja nr : frekwencje alleli p-y oraz q+y M p =a(p-y-q-y)+d(p-y)(q+y)= =a(p-q-y)+d[(pq+y(p-q)-y ] Średnia dwóch populacji: M p = ½(M p1 +M p )= =a(p-q-y)+d[(pq+y(p-q)-y ]

58 populacja nr Krzyżowanie dwóch populacji populacja nr 1 A 1 A p q A 1 p-y p(p-y) q(p-y) A q+y p(q+y) q(q+y) Frekwencja heterozygot: p(q+y)+q(p-y) = pq+y(p-q)

59 Średnia pokolenia F 1 : M F1 =a[p(p-y)-q(q+y)]+d[pq+y(p-q)]= =a(p -py-q -qy)+d[pq+y(p-q)]= =a(p-q-y)+d[pq+y(p-q)] Średnia dwóch populacji: M p = =a(p-q-y)+d[(pq+y(p-q)-y ] Heterozja w pokoleniu F 1 : H F1 =M F1 -M p =dy

60 Kojarzenie w obrębie F 1 pokolenie F A 1 A p-½y q+½y A 1 p-½y (p-½y) (p-½y)(q+½y) A q+½y (q+½y)(p-½y) (q+½y) Frekwencja heterozygot: (p-½y)(q+½y) = pq+py-qy-½y = pq+y(p-q)-½y

61 Średnia pokolenia F : M F =a[(p-½y) -(q+½y) ]+d[pq+y(p-q)-½y ]= =a[(p-½y+q+½y)(p-½y-q-½y)+d[pq+y(p-q)-½y ]= =a(p-q-y)+d[pq+y(p-q) )-½y ] Średnia pokolenia wyjściowego: M p = =a(p-q-y)+d[(pq+y(p-q)-y ] Heterozja w pokoleniu F : H F =M F -M p =½dy

62 Przykład a d 7 A 1 A 1 A 1 A A A P1 0,16 0,48 0,36 M p1,96 p1 p P 0,64 0,3 0,04 M p 3,44 M p 3, A 1 0,4 0,8 F1 0,3 0,56 0,1 M F1 4,3 H F1 1,1 A 0,6 0, F 0,36 0,48 0,16 M F 3,76 H F 0,56 a d 1 A 1 A 1 A 1 A A A 0,16 0,48 0,36 M p1 5,36 p1 p 0,64 0,3 0,04 M p 5,04 M p 5, A 1 0,4 0,8 0,3 0,56 0,1 M F1 7,1 H F1 1,9 A 0,6 0, 0,36 0,48 0,16 M F 6,16 H F 0,96

63 Przykład a d 7 A 1 A 1 A 1 A A A 0,01 0,18 0,81 M p1-0,34 p1 p 0,81 0,18 0,01 M p,86 M p 1,6 A 1 0,1 0,9 0,09 0,8 0,09 M F1 5,74 H F1 4,48 A 0,9 0,1 0,5 0,5 0,5 M F 3,5 H F,4 a d 1 A 1 A 1 A 1 A A A 0,01 0,18 0,81 M p1 0,56 p1 p 0,81 0,18 0,01 M p 3,76 M p,16 A 1 0,1 0,9 0,09 0,8 0,09 M F1 9,84 H F1 7,68 A 0,9 0,1 0,5 0,5 0,5 M F 6 H F 3,84

64 Przykład a d 7 A 1 A 1 A 1 A A A M p1 - p1 p M p M p 0 A M F1 7 H F1 7 A 1 0 0,5 0,5 0,5 M F 3,5 H F 3,5

65 Zdolność kombinacyjna Wariancja między grupami mieszańców: c F G F D F GG F 3 GD F 4 DD itd gdzie F oznacza współczynnik inbredu wewnątrz linii ; ; G D GG ; ; GD GGG DD itd itd wariancje addytywne wariancje nieaddytywne

66 Zdolność kombinacyjna Ogólna zdolność kombinacyjna: F G F GG F 3 GGG itd Szczególna zdolność kombinacyjna: F D F 3 GD F 4 DD itd

67 Linie czyste mieszańce A 3 B*A 35 B 34 A*B 35 C 8 A*C 38 B*C 36 D 3 A*D 34 B*D 40 E 31 A*E 3 B*E 34 zdolność kombinacyjna A B C D E A ogólna 7,65 szczególna 6,5 1,5 6,5 5 B ogólna 5 szczególna 6, ,5 Przewaga mieszańców nad średnią linii czystszych

68 Selekcja na zdolność kombinacyjną Selekcja przemienna i ponawiana czyli dwóch linii lub jednej. Polega na tworzeniu par rodziców z dwóch linii (krzyżowaniu) i wybieraniu tych rodziców, którzy dali najlepsze potomstwo, następnie kojarzeniu ich w obrębie linii.

69 Krzyżowanie towarowe Można podzielić na terminowe rotacyjne oraz zależnie od liczby linii lub ras uczestniczących w systemie: dwurasowe trzyrasowe itd..

70 Krzyżowanie terminowe i rotacyjne Przykład 1: Bydło 1 cielę odchowane/rok/samicę, długość użytkowania 5 lat, stosunek poligamii 1:100 Utrzymanie 1000 samic mieszańców AB wymaga co najmniej 00 samic remontowych, co powoduje, że liczebności stad czystorasowych musza wynosić ponad 50% towarowego Przykład : Trzoda 16 prosiąt odchowanych/rok/samicę, długość użytkowania lata, stosunek poligamii 1:10 Utrzymanie stada 1000 samic mieszańców AB wymaga 500 samic remontowych, czyli liczebności stad czystorasowych na poziomie około 10%

71 bydło Krzyżowanie czterorasowe terminowe samice samce potomstwo A 691,0 69,1 880,0 B 69,1 0,7 8,8 C 69,1 0,7 8,8 D 0,7 0,0 0,3 A*B 880,0 8,8 100,0 C*D 8,8 0,3 1,0 AB*CD 100,0 1,0 1000,0 1171,3 trzoda samice samce potomstwo A 3,3 0,3 17,6 B 0,3 0,0 1,8 C 0,3 0,0 1,8 D 0,0 0,0 0, A*B 17,6 1,8 93,8 C*D 1,8 0, 9,4 AB*CD 93,8 9,4 1000,0 18,8

72 bydło Krzyżowanie czterorasowe rotacyjne samice samce potomstwo A 8,8 0,3 1,0 B 8,8 0,3 1,0 C 8,8 0,3 1,0 D 8,8 0,3 1,0 ABCD Rot 100,0 1,0 1000,0 138,4 trzoda samice samce potomstwo A 1,8 0, 9,4 B 1,8 0, 9,4 C 1,8 0, 9,4 D 1,8 0, 9,4 ABCD Rot 93,8 9,4 1000,0 110,9

73 Heterozja w czterorasowym modelu terminowym rotacyjnym matka ½A +½B A ¼A ¼B ¼C ¼D ojciec ½C +½D B ¼A ¼B ¼C ¼D własna matki własna matki A*B 1 0,5*¼ 7/45 7/45 0,5*¼ A*C ¼ 0,5*¼ 7/45 7/45 0,5*¼ A*D ¼ 0,5*¼ 7/45 7/45 0,5*¼ B*C ¼ 0,5*¼ 7/45 7/45 0,5*¼ C*D ¼ 0,5*¼ 7/45 7/45 0,5*¼ B*D 7/45 7/45

74 Dziękuję, na dzisiaj wystarczy

Zarządzanie populacjami zwierząt. Relacje między osobnikami w populacji spokrewnienie i inbred Wykład 5

Zarządzanie populacjami zwierząt. Relacje między osobnikami w populacji spokrewnienie i inbred Wykład 5 Zarządzanie populacjami zwierząt Relacje między osobnikami w populacji spokrewnienie i inbred Wykład 5 Podobieństwo między rodzicem a potomkiem ½ ½ ½ ½ R RP = ½ Podobieństwo pełnego rodzeństwa (FS full

Bardziej szczegółowo

Zarządzanie populacjami zwierząt. Relacje między osobnikami w populacji spokrewnienie i inbred Depresja inbredowa Ocena efektów krzyżowania

Zarządzanie populacjami zwierząt. Relacje między osobnikami w populacji spokrewnienie i inbred Depresja inbredowa Ocena efektów krzyżowania Zarządzanie populacjami zwierząt Relacje między osobnikami w populacji spokrewnienie i inbred Depresja inbredowa Ocena efektów krzyżowania Podobieństwo między rodzicem a potomkiem ½ ½ ½ ½ R RP = ½ Podobieństwo

Bardziej szczegółowo

Zarządzanie populacjami zwierząt. Elementy pracy hodowlanej w prowadzeniu populacji dzikich gatunków

Zarządzanie populacjami zwierząt. Elementy pracy hodowlanej w prowadzeniu populacji dzikich gatunków Zarządzanie populacjami zwierząt Elementy pracy hodowlanej w prowadzeniu populacji dzikich gatunków Cel hodowli - Doskonalenie cech ilościowych - Utrwalenie mutacji jakościowej - Zachowanie zmienności

Bardziej szczegółowo

Genetyka populacji. Efektywna wielkość populacji

Genetyka populacji. Efektywna wielkość populacji Genetyka populacji Efektywna wielkość populacji DRYF GENETYCZNY Przypadkowe zmiany częstości alleli szczególnie ważne w małych populacjach 2015-10-22 2 DRYF GENETYCZNY Wybieramy z dużej populacji o p=q=0,5

Bardziej szczegółowo

DOBÓR. Kojarzenie, depresja inbredowa, krzyżowanie, heterozja

DOBÓR. Kojarzenie, depresja inbredowa, krzyżowanie, heterozja DOBÓR Kojarzenie, depresja inbredowa, krzyżowanie, heterozja SELEKCJA grupa osobników obu płci, która ma zostać rodzicami następnego pokolenia DOBÓR OSOBNIKÓW DO KOJARZEŃ POSTĘP HODOWLANY następne pokolenie

Bardziej szczegółowo

Selekcja, dobór hodowlany. ESPZiWP

Selekcja, dobór hodowlany. ESPZiWP Selekcja, dobór hodowlany ESPZiWP Celem pracy hodowlanej jest genetyczne doskonalenie zwierząt w wyznaczonym kierunku. Trudno jest doskonalić zwierzęta już urodzone, ale można doskonalić populację w ten

Bardziej szczegółowo

Zarządzanie populacjami zwierząt. Efektywna wielkość populacji Wykład 3

Zarządzanie populacjami zwierząt. Efektywna wielkość populacji Wykład 3 Zarządzanie populacjami zwierząt Efektywna wielkość populacji Wykład 3 DRYF GENETYCZNY Przypadkowe zmiany częstości alleli szczególnie ważne w małych populacjach DRYF GENETYCZNY Wybieramy z dużej populacji

Bardziej szczegółowo

Depresja inbredowa i heterozja

Depresja inbredowa i heterozja Depresja inbredowa i heterozja Charles Darwin Dlaczego rośliny chronią się przed samozapyleniem? Doświadczenie na 57 gatunkach roślin! Samozapłodnienie obniża wigor i płodność większości z 57 gatunków

Bardziej szczegółowo

Pokrewieństwo, rodowód, chów wsobny

Pokrewieństwo, rodowód, chów wsobny Pokrewieństwo, rodowód, chów wsobny Pokrewieństwo Pokrewieństwo, z punktu widzenia genetyki, jest podobieństwem genetycznym. Im osobniki są bliżej spokrewnione, tym bardziej są podobne pod względem genetycznym.

Bardziej szczegółowo

PORÓWNYWANIE POPULACJI POD WZGLĘDEM STRUKTURY

PORÓWNYWANIE POPULACJI POD WZGLĘDEM STRUKTURY PORÓWNYWANIE POPULACJI POD WZGLĘDEM STRUKTURY obliczanie dystansu dzielącego grupy (subpopulacje) wyrażonego za pomocą indeksu F Wrighta (fixation index) w modelu jednego locus 1 Ćwiczenia III Mgr Kaczmarek-Okrój

Bardziej szczegółowo

Genetyka populacji. Ćwiczenia 7

Genetyka populacji. Ćwiczenia 7 Genetyka populacji Ćwiczenia 7 Rodowody wraz z wynikami kontroli użytkowości stanowią podstawową informację potrzebną do doskonalenia zwierząt C F X S D C F C F S D strzałka oznacza przepływ genów między

Bardziej szczegółowo

ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT

ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT Ćwiczenia 1 mgr Magda Kaczmarek-Okrój magda_kaczmarek_okroj@sggw.pl 1 ZAGADNIENIA struktura genetyczna populacji obliczanie frekwencji genotypów obliczanie frekwencji alleli

Bardziej szczegółowo

GENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 1 Biologia I MGR /

GENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 1 Biologia I MGR / GENETYKA POPULACJI Ćwiczenia 1 Biologia I MGR 1 ZAGADNIENIA struktura genetyczna populacji obliczanie frekwencji genotypów obliczanie frekwencji alleli przewidywanie struktury następnego pokolenia przy

Bardziej szczegółowo

ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT SPOKREWNIENIE INBRED

ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT SPOKREWNIENIE INBRED ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT SPOKREWNIENIE INBRED Rodowody wraz z wynikami kontroli użytkowości stanowią podstawową informację potrzebną do doskonalenia zwierząt X S D C F C F C S D F strzałka oznacza

Bardziej szczegółowo

1 Genetykapopulacyjna

1 Genetykapopulacyjna 1 Genetykapopulacyjna Genetyka populacyjna zajmuje się badaniem częstości występowania poszczególnych alleli oraz genotypów w populacji. Bada także zmiany tych częstości spowodowane doborem naturalnym

Bardziej szczegółowo

Genetyka populacji. Analiza Trwałości Populacji

Genetyka populacji. Analiza Trwałości Populacji Genetyka populacji Analiza Trwałości Populacji Analiza Trwałości Populacji Ocena Środowiska i Trwałości Populacji- PHVA to wielostronne opracowanie przygotowywane na ogół podczas tworzenia planu ochrony

Bardziej szczegółowo

Genetyka Populacji http://ggoralski.com

Genetyka Populacji http://ggoralski.com Genetyka Populacji http://ggoralski.com Frekwencje genotypów i alleli Frekwencja genotypów Frekwencje genotypów i alleli Zadania P AA = 250/500 = 0,5 P Aa = 100/500 = 0,2 P aa = 150/500 = 0,3 = 1 Frekwencje

Bardziej szczegółowo

Ocena wartości hodowlanej. Dr Agnieszka Suchecka

Ocena wartości hodowlanej. Dr Agnieszka Suchecka Ocena wartości hodowlanej Dr Agnieszka Suchecka Wartość hodowlana genetycznie uwarunkowane możliwości zwierzęcia do ujawnienia określonej produkcyjności oraz zdolność przekazywania ich potomstwu (wartość

Bardziej szczegółowo

Spokrewnienie prawdopodobieństwo, że dwa losowe geny od dwóch osobników są genami IBD. IBD = identical by descent, geny identycznego pochodzenia

Spokrewnienie prawdopodobieństwo, że dwa losowe geny od dwóch osobników są genami IBD. IBD = identical by descent, geny identycznego pochodzenia prawdopodobieństwo, że dwa losowe geny od dwóch osobników są genami ID. Relationship Relatedness Kinship Fraternity ID = identical by descent, geny identycznego pochodzenia jest miarą względną. Przyjmuje

Bardziej szczegółowo

Szacowanie wartości hodowlanej. Zarządzanie populacjami

Szacowanie wartości hodowlanej. Zarządzanie populacjami Szacowanie wartości hodowlanej Zarządzanie populacjami wartość hodowlana = wartość cechy? Tak! Przy h 2 =1 ? wybitny ojciec = wybitne dzieci Tak, gdy cecha wysokoodziedziczalna. Wartość hodowlana genetycznie

Bardziej szczegółowo

GENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 4 Biologia I MGR

GENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 4 Biologia I MGR GEETYKA POPULACJI Ćwiczenia 4 Biologia I MGR Ad. Ćwiczenia Liczba możliwych genotypów w locus wieloallelicznym Geny sprzężone z płcią Prawo Hardy ego-weinberga p +pq+q = p+q= m( m ) p P Q Q P p AA Aa wszystkich_

Bardziej szczegółowo

Zarządzanie populacjami zwierząt. Parametry genetyczne cech

Zarządzanie populacjami zwierząt. Parametry genetyczne cech Zarządzanie populacjami zwierząt Parametry genetyczne cech Teoria ścieżki zależność przyczynowo-skutkowa X p 01 Z Y p 02 p 01 2 + p 02 2 = 1 współczynniki ścieżek miary związku między przyczyną a skutkiem

Bardziej szczegółowo

CECHY ILOŚCIOWE PARAMETRY GENETYCZNE

CECHY ILOŚCIOWE PARAMETRY GENETYCZNE CECHY ILOŚCIOWE PARAMETRY GENETYCZNE Zarządzanie populacjami zwierząt, ćwiczenia V Dr Wioleta Drobik Rodzaje cech Jakościowe o prostym dziedziczeniu uwarunkowane zwykle przez kilka genów Słaba podatność

Bardziej szczegółowo

ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT 1. RÓWNOWAGA GENETYCZNA POPULACJI. Prowadzący: dr Wioleta Drobik Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt

ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT 1. RÓWNOWAGA GENETYCZNA POPULACJI. Prowadzący: dr Wioleta Drobik Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT 1. RÓWNOWAGA GENETYCZNA POPULACJI Fot. W. Wołkow Prowadzący: dr Wioleta Drobik Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt POPULACJA Zbiór organizmów żywych, które łączy

Bardziej szczegółowo

1 Podstawowe pojęcia z zakresu genetyki. 2 Podstawowy model dziedziczenia

1 Podstawowe pojęcia z zakresu genetyki. 2 Podstawowy model dziedziczenia Rachunek Prawdopodobieństwa MAP8 Wydział Matematyki, Matematyka Stosowana Projekt - zastosowania rachunku prawdopodobieństwa w genetyce Opracowanie: Antonina Urbaniak Podstawowe pojęcia z zakresu genetyki

Bardziej szczegółowo

Zarządzanie populacjami zwierząt. Ocena wartości hodowlanej Wykład 7

Zarządzanie populacjami zwierząt. Ocena wartości hodowlanej Wykład 7 Zarządzanie populacjami zwierząt Ocena wartości odowlanej Wykład 7 Wartość fenotypowa Ceca ilościowa G GE E D I GE E E p E t,d,i addytywna, dominacyjna, interakcyjna (epistatyczna) część wartości genotypowej

Bardziej szczegółowo

Podstawy genetyki. ESPZiWP 2010

Podstawy genetyki. ESPZiWP 2010 Podstawy genetyki ESPZiWP 2010 Genetyka - nauka o dziedziczności i zmienności organizmów, wyjaśniająca prawa rządzące podobieństwami i różnicami pomiędzy osobnikami spokrewnionymi przez wspólnego przodka

Bardziej szczegółowo

Podstawy pracy hodowlanej

Podstawy pracy hodowlanej Podstawy pracy hodowlanej Zwiększenie produkcyjności stada jest możliwe dzięki poprawie warunków środowiska, w jakim bytują zwierzęta, przede wszystkim żywienia i pielęgnacji, a także dzięki prowadzeniu

Bardziej szczegółowo

Zmienność. środa, 23 listopada 11

Zmienność.  środa, 23 listopada 11 Zmienność http://ggoralski.com Zmienność Zmienność - rodzaje Zmienność obserwuje się zarówno między poszczególnymi osobnikami jak i między populacjami. Różnice te mogą mieć jednak różne podłoże. Mogą one

Bardziej szczegółowo

Genetyka ekologiczna i populacyjna W8

Genetyka ekologiczna i populacyjna W8 Genetyka ekologiczna i populacyjna W8 Genetyka populacji: Treść wykładów Zmienność genetyczna i środowiskowa Mutacje i rekombinacje Kojarzenie krewniacze Częstość genów i genotypów w populacji i prawdopodobieństwo

Bardziej szczegółowo

nosiciel choroby chora. mężczyzna kobieta. pleć nieokreślona. małżeństwo rozwiedzione. małżeństwo. potomstworodzeństwo

nosiciel choroby chora. mężczyzna kobieta. pleć nieokreślona. małżeństwo rozwiedzione. małżeństwo. potomstworodzeństwo mężczyzna kobieta nosiciel choroby chora pleć nieokreślona małżeństwo małżeństwo rozwiedzione potomstworodzeństwo potomstworodzeństwo P ciążapleć dziecka nieokreślona 9 poronienie w 9 tygodniu adopcja

Bardziej szczegółowo

Dziedziczenie poligenowe

Dziedziczenie poligenowe Dziedziczenie poligenowe Dziedziczenie cech ilościowych Dziedziczenie wieloczynnikowe Na wartość cechy wpływa Komponenta genetyczna - wspólne oddziaływanie wielu (najczęściej jest to liczba nieznana) genów,

Bardziej szczegółowo

GENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 3 Biologia I MGR

GENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 3 Biologia I MGR GENETYKA POPULACJI Ćwiczenia 3 Biologia I MGR Heterozygotyczność Rozpatrując różnorodność genetyczną w populacjach o układzie hierarchicznym zauważamy, że najwyższy poziom heterozygotyczności zawsze występuje

Bardziej szczegółowo

Depresja inbredowa vs. Heterozja

Depresja inbredowa vs. Heterozja Depresja inbredowa vs. Heterozja Depresja inbredowa Depresja inbredowa moe pojawi si w populacji, w której zachodz kojarzenia w pokrewiestwie i jest konsekwencj wzrostu homozygotycznoci wynikajcego z tego

Bardziej szczegółowo

Bliskie Spotkanie z Biologią. Genetyka populacji

Bliskie Spotkanie z Biologią. Genetyka populacji Bliskie Spotkanie z Biologią Genetyka populacji Plan wykładu 1) Częstości alleli i genotypów w populacji 2) Prawo Hardy ego-weinberga 3) Dryf genetyczny 4) Efekt założyciela i efekt wąskiego gardła 5)

Bardziej szczegółowo

2. CZYNNIKI ZABURZAJĄCE RÓWNOWAGĘ GENETYCZNĄ

2. CZYNNIKI ZABURZAJĄCE RÓWNOWAGĘ GENETYCZNĄ ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT 2. CZYNNIKI ZABURZAJĄCE RÓWNOWAGĘ GENETYCZNĄ POPULACJI Fot. W. Wołkow Prowadzący: dr Wioleta Drobik Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt MIGRACJE Zmiana frekwencji

Bardziej szczegółowo

ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT DRYF GENETYCZNY EFEKTYWNA WIELKOŚĆ POPULACJI PRZYROST INBREDU

ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT DRYF GENETYCZNY EFEKTYWNA WIELKOŚĆ POPULACJI PRZYROST INBREDU ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT DRYF GENETYCZNY EFEKTYWNA WIELKOŚĆ POPULACJI PRZYROST INBREDU DRYF GENETYCZNY ) Każdy żywy organizm wytwarza więcej gamet, niż zdolne jest przetrwać (Darwin). 2) Przypadek

Bardziej szczegółowo

Z poprzedniego wykładu

Z poprzedniego wykładu PODSTAWY STATYSTYKI 1. Teoria prawdopodobieństwa i elementy kombinatoryki 2. Zmienne losowe i ich rozkłady 3. Populacje i próby danych, estymacja parametrów 4. Testowanie hipotez 5. Testy parametryczne

Bardziej szczegółowo

WSTĘP. Copyright 2011, Joanna Szyda

WSTĘP. Copyright 2011, Joanna Szyda BIOINFORMATYKA 1. Wykład wstępny 2. Struktury danych w badaniach bioinformatycznych 3. Bazy danych: projektowanie i struktura 4. Bazy danych: projektowanie i struktura 5. Równowaga Hardyego-Weinberga,

Bardziej szczegółowo

GENETYKA POPULACJI. Fot. W. Wołkow

GENETYKA POPULACJI. Fot. W. Wołkow GENETYKA POPULACJI Fot. W. Wołkow GENETYKA POPULACJI Nauka która respektując zasady dziedziczenia z zakresu genetyki klasycznej bada mechanizmy dziedziczenia w odniesieniu do populacji Struktura genetyczna:

Bardziej szczegółowo

Dziedziczenie cech sprzężonych, crossing-over i mapy chromosomów

Dziedziczenie cech sprzężonych, crossing-over i mapy chromosomów Dziedziczenie cech sprzężonych, crossing-over i mapy chromosomów Zadanie 1. Komórka zawiera 3 pary chromosomów, mieszczących 5 par genów. Pary genów A, a i B, b sprzężone są w układzie cis. Pary C, c i

Bardziej szczegółowo

Wnioskowanie statystyczne. Statystyka w 5

Wnioskowanie statystyczne. Statystyka w 5 Wnioskowanie statystyczne tatystyka w 5 Rozkłady statystyk z próby Próba losowa pobrana z populacji stanowi realizacje zmiennej losowej jak ciąg zmiennych losowych (X, X,... X ) niezależnych i mających

Bardziej szczegółowo

Ekologia molekularna. wykład 4

Ekologia molekularna. wykład 4 Ekologia molekularna wykład 4 Zróżnicowanie między populacjami Przyczyny odchyleń od HWE Czynniki demograficzne nielosowe kojarzenie wsobność (inbred) struktura genetyczna populacji (subpopulacje) migracje

Bardziej szczegółowo

Przedmowa Wst p 1. Pochodzenie i udomowienie zwierz t gospodarskich 2. Genetyka ogólna

Przedmowa Wst p 1. Pochodzenie i udomowienie zwierz t gospodarskich 2. Genetyka ogólna Spis treści Przedmowa Wstęp Znaczenie metod genetycznych w doskonaleniu produkcji zwierzęcej MoŜliwości produkcyjne współczesnych ras zwierząt gospodarskich Znaczenie gospodarcze produkcji zwierzęcej 1.

Bardziej szczegółowo

Genetyka populacyjna

Genetyka populacyjna Genetyka populacyjna analizuje strukturę genetyczną całych populacji oraz wyniki kojarzeń wewnątrz populacji lub pomiędzy różnymi populacjami, opiera się na modelach matematycznych Prawo równowagi Hardy

Bardziej szczegółowo

INFORMATYKA W SELEKCJI

INFORMATYKA W SELEKCJI INFORMATYKA W SELEKCJI INFORMATYKA W SELEKCJI - zagadnienia 1. Dane w pracy hodowlanej praca z dużym zbiorem danych (Excel) 2. Podstawy pracy z relacyjną bazą danych w programie MS Access 3. Systemy statystyczne

Bardziej szczegółowo

Krzyżowanie świń: które rasy ze sobą łączyć?

Krzyżowanie świń: które rasy ze sobą łączyć? https://www. Krzyżowanie świń: które rasy ze sobą łączyć? Autor: prof. dr hab. inż. Damian Knecht Data: 28 listopada 2016 W produkcji towarowej, której najczęściej produktem końcowym mają być tuczniki

Bardziej szczegółowo

GENETYKA. Genetyka. Dziedziczność przekazywanie cech rodziców potomstwu Zmienność występowanie różnic pomiędzy różnymi osobnikami tego samego gatunku

GENETYKA. Genetyka. Dziedziczność przekazywanie cech rodziców potomstwu Zmienność występowanie różnic pomiędzy różnymi osobnikami tego samego gatunku GENETYKA Genetyka Nauka o dziedziczności i zmienności organizmów, wyjaśniająca prawa rządzące podobieństwami i różnicami pomiędzy osobnikami spokrewnionymi przez wspólnego przodka Dziedziczność przekazywanie

Bardziej szczegółowo

GENETYCZNE PODSTAWY ZMIENNOŚCI ORGANIZMÓW ZASADY DZIEDZICZENIA CECH PODSTAWY GENETYKI POPULACYJNEJ

GENETYCZNE PODSTAWY ZMIENNOŚCI ORGANIZMÓW ZASADY DZIEDZICZENIA CECH PODSTAWY GENETYKI POPULACYJNEJ GENETYCZNE PODSTAWY ZMIENNOŚCI ORGANIZMÓW ZASADY DZIEDZICZENIA CECH PODSTAWY GENETYKI POPULACYJNEJ ZMIENNOŚĆ - występowanie dziedzicznych i niedziedzicznych różnic między osobnikami należącymi do tej samej

Bardziej szczegółowo

Ekologia molekularna. wykład 3

Ekologia molekularna. wykład 3 Ekologia molekularna wykład 3 Dziedziczenie mendlowskie Grzegorz Mendel 1822-1884 Darwin + Mendel = Ronald Fisher 1890-1962 wykład 3/2 Prawo Hardy'ego-Weinberga A A gamety możliwe genotypy potomstwa genotyp

Bardziej szczegółowo

Praca hodowlana. Wartość użytkowa, wartość hodowlana i selekcja bydła

Praca hodowlana. Wartość użytkowa, wartość hodowlana i selekcja bydła Praca hodowlana Wartość użytkowa, wartość hodowlana i selekcja bydła Duże zróżnicowanie, obserwowane w zakresie wydajności poszczególnych krów w obrębie rasy, zależy od wielu czynników genetycznych i środowiskowych.

Bardziej szczegółowo

STATYSTYKA MATEMATYCZNA WYKŁAD 3. Populacje i próby danych

STATYSTYKA MATEMATYCZNA WYKŁAD 3. Populacje i próby danych STATYSTYKA MATEMATYCZNA WYKŁAD 3 Populacje i próby danych POPULACJA I PRÓBA DANYCH POPULACJA population Obserwacje dla wszystkich osobników danego gatunku / rasy PRÓBA DANYCH sample Obserwacje dotyczące

Bardziej szczegółowo

Praktyczne znaczenie pokrewieństwa i inbredu w hodowli ryb

Praktyczne znaczenie pokrewieństwa i inbredu w hodowli ryb Praktyczne znaczenie pokrewieństwa i inbredu w hodowli ryb Piotr Łapa 1 1 Towarzystwo Naukowe Branży Zoologicznej Animalian Pokrewieństwo pomiędzy osobnikami populacji to jedno z podstawowych zagadnień

Bardziej szczegółowo

Analiza sprzężeń u człowieka. Podstawy

Analiza sprzężeń u człowieka. Podstawy Analiza sprzężeń u człowieka Podstawy Geny i chromosomy Allele genów zlokalizowanych na różnych chromosomach segregują niezależnie (II prawo Mendla) Dla 2 genów: 4 równoliczne klasy gamet W. S Klug, M.R

Bardziej szczegółowo

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Program wykładu 1. Jakie

Bardziej szczegółowo

STATYSTYKA MATEMATYCZNA

STATYSTYKA MATEMATYCZNA STATYSTYKA MATEMATYCZNA 1. Wykład wstępny. Teoria prawdopodobieństwa i elementy kombinatoryki 2. Zmienne losowe i ich rozkłady 3. Populacje i próby danych, estymacja parametrów 4. Testowanie hipotez 5.

Bardziej szczegółowo

Biologia medyczna, lekarski Ćwiczenie ; Ćwiczenie 19

Biologia medyczna, lekarski Ćwiczenie ; Ćwiczenie 19 Ćwiczenie 19 Fenotyp sportowca. Geny warunkujące fenotyp sportowca. Testy DNA w ocenie predyspozycji sportowych i ich aspekty etyczne. Genetyka cech ilościowych. Prof. dr hab. Roman Zieliński 1. "Fenotyp

Bardziej szczegółowo

a) Zapisz genotyp tego mężczyzny... oraz zaznacz poniżej (A, B, C lub D), jaki procent gamet tego mężczyzny będzie miało genotyp ax b.

a) Zapisz genotyp tego mężczyzny... oraz zaznacz poniżej (A, B, C lub D), jaki procent gamet tego mężczyzny będzie miało genotyp ax b. W tomie 2 zbioru zadań z biologii z powodu nieprawidłowego wprowadzenia komendy przenoszenia spójników i przyimków do następnej linii wystąpiła zamiana samotnych dużych liter (A, I, W, U) na małe litery.

Bardziej szczegółowo

Badanie współczynnika inbredu

Badanie współczynnika inbredu Badanie współczynnika inbredu na przykładzie psów rasowych Spis treści 1 1. Współczynnik inbredu Pojęcie inbredu Pojęcie współczynnika inbredu 2. Okoliczności powstania inbredu oraz jego współczynnika

Bardziej szczegółowo

Podstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja

Podstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja Podstawy genetyki populacji Genetyka mendlowska i ewolucja Syntetyczna teoria ewolucji } Pierwsza synteza: połączenie teorii ewolucji Darwina z genetyką mendlowską na poziomie populacji } W naturalnych

Bardziej szczegółowo

Definicja. Odziedziczalność. Definicja. w potocznym rozumieniu znaczy tyle co dziedziczenie. Fenotyp( P)=Genotyp(G)+Środowisko(E) V P = V G + V E

Definicja. Odziedziczalność. Definicja. w potocznym rozumieniu znaczy tyle co dziedziczenie. Fenotyp( P)=Genotyp(G)+Środowisko(E) V P = V G + V E Odziedziczalność w potocznym rozumieniu znaczy tyle co dziedziczenie...ale ma ścisłą techniczną definicję. Definicja Fenotyp( P)=Genotyp(G)+Środowisko(E) V P = V G + V E H 2 (w szerszym sensie) = V G /

Bardziej szczegółowo

Selekcja Selekcja naturalna. Warunki selekcji. Rodzi się więcej osobników niż może przeżyć i rozmnażać się.

Selekcja Selekcja naturalna. Warunki selekcji. Rodzi się więcej osobników niż może przeżyć i rozmnażać się. Warunki selekcji Selekcja Rodzi się więcej osobników niż może przeżyć i rozmnażać się. Osobniki różnią się między sobą zdolnością przeżycia i rozmnażania. Zmnienność między osobnikami jest częściowo odziedziczalna.

Bardziej szczegółowo

Wprowadzenie do genetyki medycznej i sądowej

Wprowadzenie do genetyki medycznej i sądowej Genetyka medyczno-sądowa Wprowadzenie do genetyki medycznej i sądowej Kierownik Pracowni Genetyki Medycznej i Sądowej Ustalanie tożsamości zwłok Identyfikacja sprawców przestępstw Identyfikacja śladów

Bardziej szczegółowo

Rasy objęte programem hodowlanym. Szczegółowa analiza!

Rasy objęte programem hodowlanym. Szczegółowa analiza! https://www. Rasy objęte programem hodowlanym. Szczegółowa analiza! Autor: prof. dr hab. inż. Damian Knecht Data: 16 sierpnia 2018 Świnia domowa jest jednym z gatunków zwierząt gospodarskich. Hoduje się

Bardziej szczegółowo

Dobór naturalny. Ewolucjonizm i eugenika

Dobór naturalny. Ewolucjonizm i eugenika Dobór naturalny Ewolucjonizm i eugenika Silna i słaba selekcja - symulacje W cieniu eugeniki Początki - XIX w. (Francis Galton) XX w. - eugenika totalitarna Poprawa jakości gatunku ludzkiego poprzez kierowanie

Bardziej szczegółowo

Podstawy genetyki populacji. Populacje o skończonej liczebności. Dryf. Modele wielogenowe.

Podstawy genetyki populacji. Populacje o skończonej liczebności. Dryf. Modele wielogenowe. Podstawy genetyki populacji Populacje o skończonej liczebności. Dryf. Modele wielogenowe. Dryf genetyczny a ewolucja } Dobór naturalny nie jest jedynym mechanizmem kształtującym zmiany ewolucyjne } Losowe

Bardziej szczegółowo

Mapowanie genów cz owieka. podstawy

Mapowanie genów cz owieka. podstawy Mapowanie genów czowieka podstawy Sprzężenie Geny leżące na różnych chromosomach spełniają II prawo Mendla Dla 2 genów: 4 równoliczne klasy gamet W. S Klug, M.R Cummings Concepts of Genetics 8 th edition,

Bardziej szczegółowo

Genetyka populacyjna. Populacja

Genetyka populacyjna. Populacja Genetyka populacyjna Populacja 1 Populacja Populacja jest to zbiór osobników jednego gatunku żyjących na danym terytorium w danym czasie. Genetykę populacyjną interesuje tzw. populacja panmiktyczna (mendlowska),

Bardziej szczegółowo

Wnioskowanie statystyczne Weryfikacja hipotez. Statystyka

Wnioskowanie statystyczne Weryfikacja hipotez. Statystyka Wnioskowanie statystyczne Weryfikacja hipotez Statystyka Co nazywamy hipotezą Każde stwierdzenie o parametrach rozkładu lub rozkładzie zmiennej losowej w populacji nazywać będziemy hipotezą statystyczną

Bardziej szczegółowo

Problemy hodowlane populacji o małej liczebności na przykładzie owcy rasy olkuskiej

Problemy hodowlane populacji o małej liczebności na przykładzie owcy rasy olkuskiej Wiadomości Zootechniczne, R. XLIX (2011), 1: 21 31 Problemy hodowlane populacji o małej liczebności na przykładzie owcy rasy olkuskiej Elżbieta Martyniuk Szkoła Główna Gospodarstwa wiejskiego, Katedra

Bardziej szczegółowo

Podstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja. Dobór i dryf.

Podstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja. Dobór i dryf. Podstawy genetyki populacji Genetyka mendlowska i ewolucja. Dobór i dryf. Dryf genetyczny W populacjach o skończonej liczebności może dochodzić do zmian częstości alleli nawet jeżeli nie działa na nie

Bardziej szczegółowo

Anna Szewczyk. Wydział Geodezji Górniczej i InŜynierii środowiska AGH

Anna Szewczyk. Wydział Geodezji Górniczej i InŜynierii środowiska AGH Anna Szewczyk Wydział Geodezji Górniczej i InŜynierii środowiska AGH Zastosowania biblioteki Genetics programu R The genetics Package Tytuł: Populacja genetyczna Wersja:1.2.0 Data utworzenia: 2005-11-09

Bardziej szczegółowo

Analiza sprzężeń u człowieka. Podstawy

Analiza sprzężeń u człowieka. Podstawy Analiza sprzężeń u człowieka Podstawy Badanie relacji genotyp-fenotyp u człowieka Analiza sprzężeń - poszukiwanie rejonów chromosomu położonych blisko genu determinującego daną cechę Analiza asocjacji

Bardziej szczegółowo

Biologia molekularna z genetyką

Biologia molekularna z genetyką Biologia molekularna z genetyką P. Golik i M. Koper Konwersatorium 2: Analiza genetyczna eukariontów Drosophilla melanogaster Makrokierunek: Bioinformatyka i Biologia Systemów; 2016 Opracowano na podstawie

Bardziej szczegółowo

Testowanie hipotez statystycznych.

Testowanie hipotez statystycznych. Bioinformatyka Wykład 9 Wrocław, 5 grudnia 2011 Temat. Test zgodności χ 2 Pearsona. Statystyka χ 2 Pearsona Rozpatrzmy ciąg niezależnych zmiennych losowych X 1,..., X n o jednakowym dyskretnym rozkładzie

Bardziej szczegółowo

Dorota Fopp-Bayat Mirosław Łuczyński Małgorzata Jankun

Dorota Fopp-Bayat Mirosław Łuczyński Małgorzata Jankun 1 Dorota Fopp-Bayat Mirosław Łuczyński Małgorzata Jankun Gospodarowanie stadami rozrodczymi naturalnych i hodowlanych populacji ryb podstawy genetyki ilościowej 2 Publikację przygotowano w ramach projektu

Bardziej szczegółowo

Dryf genetyczny i jego wpływ na rozkłady próbek z populacji - modele matematyczne. Adam Bobrowski, IM PAN Katowice

Dryf genetyczny i jego wpływ na rozkłady próbek z populacji - modele matematyczne. Adam Bobrowski, IM PAN Katowice Dryf genetyczny i jego wpływ na rozkłady próbek z populacji - modele matematyczne Adam Bobrowski, IM PAN Katowice 1 Tematyka cyklu referatów Dryf genetyczny Matematyczne modele równowagi między mutacja

Bardziej szczegółowo

PDF created with FinePrint pdffactory Pro trial version http://www.fineprint.com

PDF created with FinePrint pdffactory Pro trial version http://www.fineprint.com Analiza korelacji i regresji KORELACJA zależność liniowa Obserwujemy parę cech ilościowych (X,Y). Doświadczenie jest tak pomyślane, aby obserwowane pary cech X i Y (tzn i ta para x i i y i dla różnych

Bardziej szczegółowo

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ gamety matczyne Genetyka

Bardziej szczegółowo

SGGW w Warszawie, Wydział Nauk o Zwierzętach, Zakład Hodowli Bydła

SGGW w Warszawie, Wydział Nauk o Zwierzętach, Zakład Hodowli Bydła Krzyżowanie międzyrasowe bydła mlecznego Agnieszka Kądrowska, Marcin Gołębiewski SGGW w Warszawie, Wydział Nauk o Zwierzętach, Zakład Hodowli Bydła Krzyżowanie międzyrasowe jest obecnie gorącym tematem

Bardziej szczegółowo

2. CZYNNIKI ZABURZAJĄCE RÓWNOWAGĘ GENETYCZNĄ

2. CZYNNIKI ZABURZAJĄCE RÓWNOWAGĘ GENETYCZNĄ ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT 2. CZYNNIKI ZABURZAJĄCE RÓWNOWAGĘ GENETYCZNĄ POPULACJI Fot. W. Wołkow Prowadzący: dr Wioleta Drobik-Czwarno; mgr Magdalena Kaczmarek-Okrój Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli

Bardziej szczegółowo

Wybrane rozkłady zmiennych losowych. Statystyka

Wybrane rozkłady zmiennych losowych. Statystyka Wybrane rozkłady zmiennych losowych Statystyka Rozkład dwupunktowy Zmienna losowa przyjmuje tylko dwie wartości: wartość 1 z prawdopodobieństwem p i wartość 0 z prawdopodobieństwem 1- p x i p i 0 1-p 1

Bardziej szczegółowo

Zadania maturalne z biologii - 7

Zadania maturalne z biologii - 7 Koło Biologiczne Liceum Ogólnokształcące nr II w Gliwicach 2015-2016 Zadania maturalne z biologii - 7 Zadania: Zad.1 (Jesika Stępień, Natalia Świetlak, Daniela Schwedka 3D) Przeczytaj tekst i na jego podstawie

Bardziej szczegółowo

GENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 5 Biologia I MGR

GENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 5 Biologia I MGR GENETYKA POPULACJI Ćwiczenia 5 Biologia I MGR WSPÓŁCZESNA GENETYKA POPULACJI CÓRKA TRZECH MATEK TRZY MATKI trzy rewolucje dotyczące teorii i technologii 1) Rewolucja koncepcyjna: wyłoniona z teorii koalescencji,

Bardziej szczegółowo

z wykonanego zadania na rzecz postępu biologicznego w produkcji zwierzęcej

z wykonanego zadania na rzecz postępu biologicznego w produkcji zwierzęcej INFORMACJA z wykonanego zadania na rzecz postępu biologicznego w produkcji zwierzęcej Tytuł zadania: Analiza zmienności cech użytkowych i reprodukcyjnych w hodowlanych populacjach wybranych rodów kur,

Bardziej szczegółowo

Podstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja.

Podstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja. Podstawy genetyki populacji Genetyka mendlowska i ewolucja. Syntetyczna teoria ewolucji Pierwsza synteza: połączenie teorii ewolucji Darwina z genetyką mendlowską na poziomie populacji W naturalnych populacjach

Bardziej szczegółowo

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Choroby genetyczne o złożonym

Bardziej szczegółowo

Analiza sprzężeń u człowieka. Podstawy

Analiza sprzężeń u człowieka. Podstawy Analiza sprzężeń u człowieka Podstawy Geny i chromosomy Allele genów zlokalizowanych na różnych chromosomach segregują niezależnie (II prawo Mendla) Dla 2 genów: 4 równoliczne klasy gamet W. S Klug, M.R

Bardziej szczegółowo

Rozkłady statystyk z próby. Statystyka

Rozkłady statystyk z próby. Statystyka Rozkłady statystyk z próby tatystyka Rozkłady statystyk z próby Próba losowa pobrana z populacji stanowi realizacje zmiennej losowej jak ciąg zmiennych losowych (X, X,... X ) niezależnych i mających ten

Bardziej szczegółowo

Genetyka i modyfikacje genetyczne gatunków zwierząt przeznaczonych do wykorzystania lub wykorzystywanych w procedurach na przykładzie myszy domowych.

Genetyka i modyfikacje genetyczne gatunków zwierząt przeznaczonych do wykorzystania lub wykorzystywanych w procedurach na przykładzie myszy domowych. Józefa Styrna Genetyka i modyfikacje genetyczne gatunków zwierząt przeznaczonych do wykorzystania lub wykorzystywanych w procedurach na przykładzie myszy domowych. Zakład Genetyki i Ewolucjonizmu Instytut

Bardziej szczegółowo

Ekologia molekularna. wykład 14. Genetyka ilościowa

Ekologia molekularna. wykład 14. Genetyka ilościowa Ekologia molekularna wykład 14 Genetyka ilościowa Dziedziczenie mendlowskie wykład 14/2 Cechy wieloczynnikowe (ilościowe) wzrost masa ciała kolor skóry kolor oczu itp wykład 14/3 Rodzaje cech ilościowych

Bardziej szczegółowo

Modelowanie ewolucji. Dobór i dryf genetyczny

Modelowanie ewolucji. Dobór i dryf genetyczny Modelowanie ewolucji Dobór i dryf genetyczny Syntetyczna teoria ewolucji Pierwsza synteza: połączenie teorii ewolucji Darwina z genetyką mendlowską na poziomie populacji W naturalnych populacjach występują

Bardziej szczegółowo

Selekcja materiału rozrodowego

Selekcja materiału rozrodowego https://www. Selekcja materiału rozrodowego Autor: prof. dr hab. inż. Damian Knecht Data: 28 kwietnia 2019 Doskonalenie genetyczne świń ma bardzo duży wpływ na produkcję trzody chlewnej. Polega ono na

Bardziej szczegółowo

Podstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja. Dobór i dryf.

Podstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja. Dobór i dryf. Podstawy genetyki populacji Genetyka mendlowska i ewolucja. Dobór i dryf. Dryf genetyczny W populacjach o skończonej liczebności może dochodzić do zmian częstości alleli nawet jeżeli nie działa na nie

Bardziej szczegółowo

Wybrane rozkłady zmiennych losowych. Statystyka

Wybrane rozkłady zmiennych losowych. Statystyka Wybrane rozkłady zmiennych losowych Statystyka Rozkład dwupunktowy Zmienna losowa przyjmuje tylko dwie wartości: wartość 1 z prawdopodobieństwem p i wartość 0 z prawdopodobieństwem 1- p x i p i 0 1-p 1

Bardziej szczegółowo

Statystyka matematyczna. dr Katarzyna Góral-Radziszewska Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt

Statystyka matematyczna. dr Katarzyna Góral-Radziszewska Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt Statystyka matematyczna dr Katarzyna Góral-Radziszewska Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt Zasady zaliczenia przedmiotu: część wykładowa Maksymalna liczba punktów do zdobycia 40. Egzamin będzie

Bardziej szczegółowo

METODY BADAŃ NA ZWIERZĘTACH ze STATYSTYKĄ wykład 3-4. Parametry i wybrane rozkłady zmiennych losowych

METODY BADAŃ NA ZWIERZĘTACH ze STATYSTYKĄ wykład 3-4. Parametry i wybrane rozkłady zmiennych losowych METODY BADAŃ NA ZWIERZĘTACH ze STATYSTYKĄ wykład - Parametry i wybrane rozkłady zmiennych losowych Parametry zmiennej losowej EX wartość oczekiwana D X wariancja DX odchylenie standardowe inne, np. kwantyle,

Bardziej szczegółowo

Estymacja punktowa i przedziałowa

Estymacja punktowa i przedziałowa Temat: Estymacja punktowa i przedziałowa Kody znaków: żółte wyróżnienie nowe pojęcie czerwony uwaga kursywa komentarz 1 Zagadnienia 1. Statystyczny opis próby. Idea estymacji punktowej pojęcie estymatora

Bardziej szczegółowo

WYKŁAD 5 TEORIA ESTYMACJI II

WYKŁAD 5 TEORIA ESTYMACJI II WYKŁAD 5 TEORIA ESTYMACJI II Teoria estymacji (wyznaczanie przedziałów ufności, błąd badania statystycznego, poziom ufności, minimalna liczba pomiarów). PRÓBA Próba powinna być reprezentacyjna tj. jak

Bardziej szczegółowo

Dz.U. 1999 Nr 45 poz. 450 ROZPORZĄDZENIE MINISTRA ROLNICTWA I GOSPODARKI ŻYWNOŚCIOWEJ

Dz.U. 1999 Nr 45 poz. 450 ROZPORZĄDZENIE MINISTRA ROLNICTWA I GOSPODARKI ŻYWNOŚCIOWEJ Kancelaria Sejmu s. 1/1 Dz.U. 1999 Nr 45 poz. 450 ROZPORZĄDZENIE MINISTRA ROLNICTWA I GOSPODARKI ŻYWNOŚCIOWEJ z dnia 20 kwietnia 1999 r. w sprawie szczegółowych zasad prowadzenia ksiąg i rejestrów zwierząt

Bardziej szczegółowo