Zarządzanie populacjami zwierząt. Relacje między osobnikami w populacji spokrewnienie i inbred Depresja inbredowa Ocena efektów krzyżowania
|
|
- Robert Piątkowski
- 6 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Zarządzanie populacjami zwierząt Relacje między osobnikami w populacji spokrewnienie i inbred Depresja inbredowa Ocena efektów krzyżowania
2 Czym będziemy się zajmować Genetyczne relacje między osobnikami w populacji Efektywna wielkość populacji i sposoby jej maksymalizacji Konsekwencje fragmentacji i izolacji populacji Struktura genetyczna populacji, prawo równowagi, czynniki wpływające na zmiany struktury i skutki ich stosowania w populacji zależnie od celu jej prowadzenia Parametry genetyczne cech Ocena wartości hodowlanej, dokładność i cele Selekcja naturalna i sztuczna, metody, efekty, cele Kojarzenia i krzyżowanie cele, techniki, osiągane rezultaty. Heterozja a depresja inbredowa Przykłady prowadzenia populacji zwierząt gospodarskich zależnie od celu uzyskiwanie postępu hodowlanego, zachowanie zmienności Gospodarowanie populacjami naturalnymi zwierząt gatunków łownych i chronionych
3 Populacja Populacja zbiór organizmów żywych posiadających pewną własność np. zwierzęta danego gatunku lub rasy
4
5
6 Populacja aa Aa aa aa aa aa aa aa aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa aa aa aa aa aa aa aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa aa Aa aa aa aa aa aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa aa aa aa aa aa Aa Aa Aa
7 Struktura populacji Frekwencja genotypów genotyp liczba osobników 1 Aa 16 aa p = 1/50 = 0,4 p Aa = 16/50 = 0,3 P aa = /50 = 0,44 Frekwencja alleli: p A = (x1+16)/100 = 0,40 p a = (x+16)/100 = 0,60 p = 1/50 = 0,4 Liczba alleli w locus A obs =
8 Genetyka populacji ocenia genetyczną strukturę populacji oraz zmiany tej struktury pod wpływem różnych czynników uwzględniając znane zasady dziedziczenia Struktura genetyczna populacji opis alleli i genotypów w poszczególnych loci wraz z częstością (prawdopodobieństwem) ich występowania w populacji
9 Cechy ilościowe Opisywane rozkładem zmiennej losowej ciągłej - rozkład normalny Opisywane przy pomocy parametrów: średnia, wariancja, odchylenie standardowe
10 % 0,35 0,3 0,5 0, 0,15 0,1 0,
11 RELACJE MIĘDZY OSOBNIKAMI W POPULACJI SPOKREWNIENIE i INBRED
12 Rodowód uporządkowany zestaw przodków
13
14 PLATON II 4736 PLAMARUS 1469 PLAMA PLEWNIK PLATON II 6834 PLOTKARA 1367 PLOTKA PLUD PLAMBOR 558 PLESO 1994 PLACENTA PLUDKA PLATON II PLAŻA 1357 PLATYNA II PLATON II PLAWIANT 4736 PLAMARUS 1469 PLAMA PLEWNIK PLATON II 6055 PLOTKARA 1367 PLOTKA PLAWNA PLAMIEC 391 PLUTON 91 KAMIONKA PLEŚNA PLATON II PLOMBA 1367 PLOTKA PLAMBOR POTOMKA 5307 PLESO 1994 PLACENTA PLANUS PLATON II 8056 PLAŻA 1357 PLATYNA II PLARON PLESO 7050 PLANUS 678 PLAŻA PLATORA PLAMARUS PLOTA 1994 PLACENTA PLAMARUS PORCJA II 683 PLEWNIK 544 PLOTKARA POWAŻNIK PLESO 8308 POWAGA II 3057 PLINTA PONTKA PLAMARUS 687 PLEWNIK 544 PLOTKARA PONITA PLESO PONURA II 476 PODPINKA
15
16 Podobieństwo między rodzicem a potomkiem ½ ½ ½ ½ R RP = ½
17 Podobieństwo pełnego rodzeństwa (FS full sibs) 1 ½ ½ 0 ½ 1 0 ½ ½ 0 1 ½ 0 ½ ½ 1 R FS = ½
18 Podobieństwo pół rodzeństwa (HS half sibs) ½ 0 ½ 0 0 ½ 0 ½ ½ 0 ½ 0 0 ½ 0 ½ R HS = ¼
19 Co to jest inbred kojarzenie FS F = 1 / 4
20 Co to jest inbred kojarzenie HS F = 1 / 8
21 Inbred Miara wynikająca ze spokrewnienia (podobieństwa) gamet tworzących zygotę. Inbred to prawdopodobieństwo, że obydwie gamety na tym samym locus mają identyczne allele. Identyczne czyli stanowiące kopię allelu wspólnego przodka. Biorąc pod uwagę wiele loci liczba informująca o homozygotyczności o wartości od 0 do 1
22 Rodowód strzałkowy A B C E F H L N M
23 Współczynnik inbredu n n F X 1 F A
24 Współczynnik spokrewnienia R XY 1 (1 F n i X n j (1 F ) (1 F Y A ) ) Gdzie: F A - współczynnik inbredu wspólnego przodka F X (F Y ) współczynnik inbredu osobnika X (Y) n i (n j ) liczba ścieżek między osobnikiem X (Y) a wspólnym przodkiem
25 Relacja między współczynnikami inbredu i spokrewnienia Współczynnik inbredu jest połową spokrewnienia rodziców jeśli nie są oni zinbredowani F X F A n n ) (1 ) (1 ) (1 1 Y X A n n XY F F F R j i
26 Rodowód strzałkowy R AB = 0 A B C R AE = ½ E F H R CN = ¼ L N R AL ( 1 ) ( 1 ) (1 0) (1 0,5) 0,5 1,5 0,447 P
27 Rodowód strzałkowy A B C E L F N H Ścieżki P N P L E N P L E B H N P L F B H N P L F B E N P L F A E N P R PN ( 1 ) (1 0,15) ( (1 0,5) (1 0,15) 0,5 1,15 0,15 0,15 1,51,15 1 ) 3 4 ( 0,815 1, ) 5 0,685
28 Jeden plus połowa wartości na skrzyżowaniu H oraz E Połowa wartości w kolumnach A oraz B A B A B B C E F E H L N A B C E F H L N P A ,5 0,5 0 0,5 0,5 0,375 B ,5 0,5 0,5 0,5 0,5 0,5 C ,5 0 0,5 0,15 E 0,5 0, ,5 0,5 0,75 0,65 0,6875 F 0,5 0,5 0 0,5 1 0,5 0,75 0,375 0,565 H 0 0,5 0,5 0,5 0,5 1 0,5 0,65 0,4375 L 0,5 0,5 0 0,75 0,75 0,5 1,5 0,5 0,875 N 0,5 0,5 0,5 0,65 0,375 0,65 0,5 1,15 0,815 P 0,375 0,5 0,15 0,6875 0,565 0,4375 0,875 0,815 1,5
29 Średnie spokrewnienie osobników w stadzie R 0,3651 A B C F H L M N P A 0 0 0,5 0,5 0 0,447 0,36 0,335 B 0 0 0,5 0,5 0,5 0,447 0,471 0,447 C ,5 0 0,36 0,11 F 0,5 0,5 0 0,5 0,5 0,671 0,589 0,615 H 0,5 0,5 0 0,5 0,5 0,671 0,354 0,503 L 0 0,5 0,5 0,5 0,5 0,4 0,589 0,391 M 0,447 0, ,671 0,671 0,4 0,4 0,700 N 0,36 0,471 0,36 0,589 0,354 0,589 0,4 0,685 P 0,335 0,447 0,11 0,615 0,503 0,391 0,700 0,685
30 inbred kinship hodowla 8567 POLWITA F 0,377 0,350 Białowieża 8568 PONTYJKA F 0,383 0, POKRYWKA F 0,399 0, POKUTNA F 0,377 0, PODPAŁKA F 0,346 0, POCHODNA F 0,330 0, POLSPAN M 0,334 0, PODLASIANKA II F 0,37 0, POWOJNA F 0,367 0, PODPAŁA F 0,356 0, PORWANKA F 0,385 0, PODJESIONEK M 0,360 0, POMPIER M 0,453 0,337 0,37 0, PORODNA F 0,360 0,334 Hardehausen 9945 POLIANNA II F 0,506 0,37 0,433 0, CLIMAT M 0,353 0,336 Margeride 9334 CLAQUE F 0,35 0,343 0,353 0, PLISTA F 0,586 0,441 Pszczyna 8544 PLATURA F 0,589 0, PODPINKA F 0,516 0, PLUGONKA F 0,596 0, PLAWIANT M 0,607 0, PLASTYKA F 0,607 0, POTAWA F 0,63 0, PORCJA II F 0,560 0, POLUCJA F 0,588 0, PLISZAJ M 0,617 0, PONTIA F 0,560 0, PLEO M 0,660 0, PORUSZA F 0,590 0, PLADORA F 0,633 0, PODRYW II M 0,595 0, PLAWAN M 0,65 0, PLUGO M 0,600 0, PLATYNKA F 0,65 0, PLAMISTA F 0,691 0, POTOMKA F 0,583 0, PLASTYK M 0,631 0,44 0,607 0,44 Współczynnik inbredu prawdopodobieństwo homozygotyczności w konsekwencji kojarzeń w pokrewieństwie Współczynnik kinship (wspólnego pochodzenia) dotyczy dwóch osobników i oznacza inbred hipotetycznego potomka Mean Kinship Średnia wsp. kinship osobnika ze wszystkimi innymi w populacji Mierzy podobieństwo osobnika do całej populacji
31 Udział założycieli Proporcja genów założycieli w genotypie osobnika A B C A 1 B 1 C 1 E 0,5 0,5 F 0,5 0,5 H 0,5 0,5 L 0,5 0,5 N 0,5 0,5 0,5 P 0,375 0,5 0,15
32 POLWITA 4,5 9,0 6, 48,7 3,6 3,6 4, PONTYJKA 3,9 7,8 7,5 49,1 3,9 3,9 3, POKRYWKA 4,0 8,0 7,5 48,3 4,1 4,1 4, POKUTNA 4,5 9,0 6, 48,7 3,6 3,6 4, PODPAŁKA 5,0 10,0 7,3 43,9 4,5 4,5 5, POCHODNA 4,7 9,4 6,0 48,1 3,6 3,6 4, POLSPAN 4,9 9,8 7,1 44,4 4,5 4,5 4,9 917 PODLASIANKA II 5,3 10,6 7,4 41,8 4,9 4,9 5, POWOJNA 4,6 9, 7,3 45,7 4,3 4,3 4,6 970 PODPAŁA 4,5 8,9 7,3 46,8 4,1 4,1 4, PORWANKA 4,8 9,6 6,8 45,8 4, 4, 4, PODJESIONEK 4,9 9,8 6,7 45,5 4, 4, 4, POMPIER 4,9 9,7 7,4 44,3 4,5 4,5 4, PORODNA 4,9 9,8 6,7 45,5 4, 4, 4, POLIANNA II 5, 10,4 7,4 4,3 4,8 4,8 5, 933 CLIMAT 4,5 9,0 7,3 46,5 4,1 4,1 4, CLAQUE 3,6 7, 7,9 49,5 4,1 4,1 3, PLISTA ,5 69, PLATURA ,5 69, PODPINKA 0,4 0,8 30,5 67, 0,4 0,4 0, PLUGONKA ,5 69, PLAWIANT ,6 69, PLASTYKA ,6 69, POTAWA 0, 0,4 30,5 68,4 0, 0, 0, 9365 PORCJA II 0, 0,4 30,5 68,4 0, 0, 0, 9367 POLUCJA 0,1 0, 30,5 69,0 0,1 0,1 0, PLISZAJ ,5 69, PONTIA 0, 0,4 30,5 68,4 0, 0, 0, 976 PLEO ,5 69, PORUSZA 0, 0,4 30,5 68,4 0, 0, 0, 9994 PLADORA ,5 69, PODRYW II 0,1 0, 30,5 69,0 0,1 0,1 0, PLAWAN ,5 69, PLUGO ,5 69, PLATYNKA ,5 69, PLAMISTA ,6 69, POTOMKA 0,1 0, 30,5 68,9 0,1 0,1 0, PLASTYK ,5 69, Udział założycieli
33 unikalnośc 8567 POLWITA 0 Białowieża 8568 PONTYJKA POKRYWKA POKUTNA PODPAŁKA 0, POCHODNA 0, POLSPAN 0, PODLASIANKA II 0, POWOJNA PODPAŁA PORWANKA PODJESIONEK POMPIER PORODNA 0 Hardehausen 9945 POLIANNA II 0, CLIMAT 0,0008 Margeride 9334 CLAQUE 0, PLISTA 0 Pszczyna 8544 PLATURA PODPINKA PLUGONKA PLAWIANT PLASTYKA POTAWA PORCJA II POLUCJA PLISZAJ PONTIA PLEO PORUSZA PLADORA PODRYW II PLAWAN PLUGO PLATYNKA PLAMISTA POTOMKA PLASTYK 0 Unikalność Prawdopodobieństwo posiadania unikalnych dla populacji genów
34 Linie mateczne od założycielek
35 Inbred
36 F t = 1 / (1+F t-1 ) F t = 1 / 4 (1+F t-1 +F t- ) pokolenie samozapłodnienie kojarzenia FS ,5 0,5 3 0,75 0, ,875 0,5 5 0,9375 0, , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , Narastanie poziomu inbredu
37 przyrost inbredu na pokolenie jest funkcją efektywnej wielkości stada (populacji) F 1 N e wielkość inbredu w pokoleniu t w populacji F t F F( 1 F ) t 1 t1 o jednakowej efektywnej wielkości F 1 (1 F) t t
38 Poziom inbredu w pokoleniach zależnie od Ne
39 Depresja inbredowa Różnica między średnią wartością cechy w populacji zinbredowanej i outbredowej Może być względna (względem populacji outbredowej) m inb m m out out m ID out m m inb out 1
40 Wyjaśnienie depresji inbredowej: dużo loci o małym efekcie albo mało loci o dużym efekcie malo loci duzo loci , 0,4 0,6 0,8 1
41 ocena depresji inbredowej dla przeżywalności S W przedziałowym szeregu rozdzielczym ln S β β F 0 1 e 0 e 0 1 szacowana przeżywalność w populacji outbredowej bo F=0 szacowana przeżywalność w populacji inbredowej 1 letalny równoważnik genotypu
42 Przykład dla okapi: ln S 0,48 1, 80 F e -0,48 = 0,619 Jeśli F=0,5 e -0,48-0,51,80 = 0,395 0,395 0,619 0,619 0,4 0,5 0,619 0,36
43 Jeśli przeżywalność będzie zmienną o rozkładzie dwupunktowym Regresja logistyczna: S e 1 β 0 e β β 0 1 F β 1 F. Analiza wariancji S ij β α β 0 i 1 F ij e ij
44 Poziom inbredu dla populacji w niewoli Gatunek N Średni inbred % osobników o F>0 Lew azjatycki (Panthera leo persica) 151 0,197 80,8 Koń Przewalskiego (Equus przewalskii) ,07 95,7 Hipopotam karłowaty (Choeropsis liberiensis) 641 0,057 5,9 Muntiak (Muntiacus reevesi) 136 0,11 69,1 Jeleń (Cervus eldi thamin) 314 0,110 51,6 Gaur (Bos gaurus) 518 0,145 69,5 Żubr (Bison bonasus) 878 0,47 93,8 Gazela dorkas (Gazella dorcas) 184 0,118 60,3 Gazela spekei (Gazella spekei) 164 0,166 8,9
45 Wielkość depresji inbredowej gatunek cecha Depresja na 1% of F absolutna względna [%] bydło Wydajność mleka - 1 ; -19 kg Wydajność tłuszczu kg 0.51 trzoda Wielkość miotu (dzień 0) -0.0 szt 0.46 Wielkość miotu (wiek 5 m-cy) szt 0.55 Masa ciała (5 m-cy) kg 0.7 owce Wydajność wełny kg 0.55 wysadność cm 0.13 Masa ciała (1 rok) kg kury nieśność szt 0.6 % wyklucia % 0.64 Masa ciała kg 0.50
46 Wpływ inbredu na śmiertelność młodych % śmiertelności P Liczebność gatunek F=0 F>0 F=0 F>0 kudu 8,6 7,3 ns zebra 5,9 40,0 ns 7 5 jeleń Dawida 11,8 13,6 ns 17 żyrafa 1,4 60,0, słoń indyjski 15,3 66,7, hipopotam karłowaty 4,5 54,9, oryks 0,1 100,
47 Depresja inbredowa u wilka (Canis lupus) Cecha N Wielkość depresji na 1 % inbredu Masa ciała w wieku 8 m-cy [kg] 48-0,3*** Długość życia [dni] 19-14,78 Plenność samic [szt] 36-0,07
48 rząd gatunek Wiek [dni] N Dokładność oszacowania Koszt inbredu F=0.5 [%] torbacze opos walabia naczelne lemur czarny lemur brązowy makak szympans gryzonie szczur akuczi drapieżne wilk grzywiasty tygrys sumatrzański ,3 nieparzystokopytne zebra parzystokopytne hipopotam karłowaty jeleń Dawida żyrafa kudu bongo gaur oryks gazela Spekes a
49 Model 1 locus A a A Aa a Aa aa Aa +x 0 aa -x
50 Model jednego locus A A A 1 A A 1 A 1 -a 0 d a P(A 1 )=p; P(A )=q; p+q=1
51 Średnia wartość populacji genotyp wartość częstość A 1 A 1 a p A 1 A d pq A A -a q dpq q p a pqd a q p q p pqd a q p a q d pq a p G ) ( ) )( ( ) ( ) (
52 Inbred w modelu jednego locus W populacji frekwencje genotypów, Aa, aa wynoszą p, pq i q. W populacji z kojarzeniami w pokrewieństwie genotypy homozygotyczne są częstsze, zatem frekwencja genotypów niech będzie p +, pq- i q +. Wartość możemy wyznaczyć opierając się na definicji inbredu jako korelacji między gametami, zakładając wartość gamety z allelem A na poziomie 1, a gamety z allelem a równą 0.
53 Inbred w modelu jednego locus Gameta żeńska oznaczona będzie przez X, a męska literą Y. Rozkład alleli w gamecie allel częstość A p EX = EY = p a q D X = D Y = pq W wyniku kojarzenia dochodzi do połączenia gamet: gameta X gameta Y XY częstość allel wartość allel wartość A 1 A 1 1 p + A 1 a 0 0 pq - a 0 A 1 0 pq - a 0 a 0 0 q +
54 Inbred w modelu jednego locus EXY = 1 x (p +)+0 x (pq-)+0 x (pq-)+0 x (q +) = p + COVXY = EXY EX x EY = p + - p = w populacji zinbredowanej genotyp Aa aa F pq częstość p +pqf pq(1-f) q +pqf pqf
55 Depresja inbredowa (ID) d w jednym locus ID pq d F a dla wielu loci 0 -a ID F p i q i d i aa
56 Ocena efektów krzyżowania
57 Krzyżowanie model jednego locus Populacja nr 1: frekwencje alleli p oraz q M p1 =a(p-q)+dpq Populacja nr : frekwencje alleli p-y oraz q+y M p =a(p-y-q-y)+d(p-y)(q+y)= =a(p-q-y)+d[(pq+y(p-q)-y ] Średnia dwóch populacji: M p = ½(M p1 +M p )= =a(p-q-y)+d[(pq+y(p-q)-y ]
58 populacja nr Krzyżowanie dwóch populacji populacja nr 1 A 1 A p q A 1 p-y p(p-y) q(p-y) A q+y p(q+y) q(q+y) Frekwencja heterozygot: p(q+y)+q(p-y) = pq+y(p-q)
59 Średnia pokolenia F 1 : M F1 =a[p(p-y)-q(q+y)]+d[pq+y(p-q)]= =a(p -py-q -qy)+d[pq+y(p-q)]= =a(p-q-y)+d[pq+y(p-q)] Średnia dwóch populacji: M p = =a(p-q-y)+d[(pq+y(p-q)-y ] Heterozja w pokoleniu F 1 : H F1 =M F1 -M p =dy
60 Kojarzenie w obrębie F 1 pokolenie F A 1 A p-½y q+½y A 1 p-½y (p-½y) (p-½y)(q+½y) A q+½y (q+½y)(p-½y) (q+½y) Frekwencja heterozygot: (p-½y)(q+½y) = pq+py-qy-½y = pq+y(p-q)-½y
61 Średnia pokolenia F : M F =a[(p-½y) -(q+½y) ]+d[pq+y(p-q)-½y ]= =a[(p-½y+q+½y)(p-½y-q-½y)+d[pq+y(p-q)-½y ]= =a(p-q-y)+d[pq+y(p-q) )-½y ] Średnia pokolenia wyjściowego: M p = =a(p-q-y)+d[(pq+y(p-q)-y ] Heterozja w pokoleniu F : H F =M F -M p =½dy
62 Przykład a d 7 A 1 A 1 A 1 A A A P1 0,16 0,48 0,36 M p1,96 p1 p P 0,64 0,3 0,04 M p 3,44 M p 3, A 1 0,4 0,8 F1 0,3 0,56 0,1 M F1 4,3 H F1 1,1 A 0,6 0, F 0,36 0,48 0,16 M F 3,76 H F 0,56 a d 1 A 1 A 1 A 1 A A A 0,16 0,48 0,36 M p1 5,36 p1 p 0,64 0,3 0,04 M p 5,04 M p 5, A 1 0,4 0,8 0,3 0,56 0,1 M F1 7,1 H F1 1,9 A 0,6 0, 0,36 0,48 0,16 M F 6,16 H F 0,96
63 Przykład a d 7 A 1 A 1 A 1 A A A 0,01 0,18 0,81 M p1-0,34 p1 p 0,81 0,18 0,01 M p,86 M p 1,6 A 1 0,1 0,9 0,09 0,8 0,09 M F1 5,74 H F1 4,48 A 0,9 0,1 0,5 0,5 0,5 M F 3,5 H F,4 a d 1 A 1 A 1 A 1 A A A 0,01 0,18 0,81 M p1 0,56 p1 p 0,81 0,18 0,01 M p 3,76 M p,16 A 1 0,1 0,9 0,09 0,8 0,09 M F1 9,84 H F1 7,68 A 0,9 0,1 0,5 0,5 0,5 M F 6 H F 3,84
64 Przykład a d 7 A 1 A 1 A 1 A A A M p1 - p1 p M p M p 0 A M F1 7 H F1 7 A 1 0 0,5 0,5 0,5 M F 3,5 H F 3,5
65 Zdolność kombinacyjna Wariancja między grupami mieszańców: c F G F D F GG F 3 GD F 4 DD itd gdzie F oznacza współczynnik inbredu wewnątrz linii ; ; G D GG ; ; GD GGG DD itd itd wariancje addytywne wariancje nieaddytywne
66 Zdolność kombinacyjna Ogólna zdolność kombinacyjna: F G F GG F 3 GGG itd Szczególna zdolność kombinacyjna: F D F 3 GD F 4 DD itd
67 Linie czyste mieszańce A 3 B*A 35 B 34 A*B 35 C 8 A*C 38 B*C 36 D 3 A*D 34 B*D 40 E 31 A*E 3 B*E 34 zdolność kombinacyjna A B C D E A ogólna 7,65 szczególna 6,5 1,5 6,5 5 B ogólna 5 szczególna 6, ,5 Przewaga mieszańców nad średnią linii czystszych
68 Selekcja na zdolność kombinacyjną Selekcja przemienna i ponawiana czyli dwóch linii lub jednej. Polega na tworzeniu par rodziców z dwóch linii (krzyżowaniu) i wybieraniu tych rodziców, którzy dali najlepsze potomstwo, następnie kojarzeniu ich w obrębie linii.
69 Krzyżowanie towarowe Można podzielić na terminowe rotacyjne oraz zależnie od liczby linii lub ras uczestniczących w systemie: dwurasowe trzyrasowe itd..
70 Krzyżowanie terminowe i rotacyjne Przykład 1: Bydło 1 cielę odchowane/rok/samicę, długość użytkowania 5 lat, stosunek poligamii 1:100 Utrzymanie 1000 samic mieszańców AB wymaga co najmniej 00 samic remontowych, co powoduje, że liczebności stad czystorasowych musza wynosić ponad 50% towarowego Przykład : Trzoda 16 prosiąt odchowanych/rok/samicę, długość użytkowania lata, stosunek poligamii 1:10 Utrzymanie stada 1000 samic mieszańców AB wymaga 500 samic remontowych, czyli liczebności stad czystorasowych na poziomie około 10%
71 bydło Krzyżowanie czterorasowe terminowe samice samce potomstwo A 691,0 69,1 880,0 B 69,1 0,7 8,8 C 69,1 0,7 8,8 D 0,7 0,0 0,3 A*B 880,0 8,8 100,0 C*D 8,8 0,3 1,0 AB*CD 100,0 1,0 1000,0 1171,3 trzoda samice samce potomstwo A 3,3 0,3 17,6 B 0,3 0,0 1,8 C 0,3 0,0 1,8 D 0,0 0,0 0, A*B 17,6 1,8 93,8 C*D 1,8 0, 9,4 AB*CD 93,8 9,4 1000,0 18,8
72 bydło Krzyżowanie czterorasowe rotacyjne samice samce potomstwo A 8,8 0,3 1,0 B 8,8 0,3 1,0 C 8,8 0,3 1,0 D 8,8 0,3 1,0 ABCD Rot 100,0 1,0 1000,0 138,4 trzoda samice samce potomstwo A 1,8 0, 9,4 B 1,8 0, 9,4 C 1,8 0, 9,4 D 1,8 0, 9,4 ABCD Rot 93,8 9,4 1000,0 110,9
73 Heterozja w czterorasowym modelu terminowym rotacyjnym matka ½A +½B A ¼A ¼B ¼C ¼D ojciec ½C +½D B ¼A ¼B ¼C ¼D własna matki własna matki A*B 1 0,5*¼ 7/45 7/45 0,5*¼ A*C ¼ 0,5*¼ 7/45 7/45 0,5*¼ A*D ¼ 0,5*¼ 7/45 7/45 0,5*¼ B*C ¼ 0,5*¼ 7/45 7/45 0,5*¼ C*D ¼ 0,5*¼ 7/45 7/45 0,5*¼ B*D 7/45 7/45
74 Dziękuję, na dzisiaj wystarczy
Zarządzanie populacjami zwierząt. Relacje między osobnikami w populacji spokrewnienie i inbred Wykład 5
Zarządzanie populacjami zwierząt Relacje między osobnikami w populacji spokrewnienie i inbred Wykład 5 Podobieństwo między rodzicem a potomkiem ½ ½ ½ ½ R RP = ½ Podobieństwo pełnego rodzeństwa (FS full
Bardziej szczegółowoZarządzanie populacjami zwierząt. Relacje między osobnikami w populacji spokrewnienie i inbred Depresja inbredowa Ocena efektów krzyżowania
Zarządzanie populacjami zwierząt Relacje między osobnikami w populacji spokrewnienie i inbred Depresja inbredowa Ocena efektów krzyżowania Podobieństwo między rodzicem a potomkiem ½ ½ ½ ½ R RP = ½ Podobieństwo
Bardziej szczegółowoZarządzanie populacjami zwierząt. Elementy pracy hodowlanej w prowadzeniu populacji dzikich gatunków
Zarządzanie populacjami zwierząt Elementy pracy hodowlanej w prowadzeniu populacji dzikich gatunków Cel hodowli - Doskonalenie cech ilościowych - Utrwalenie mutacji jakościowej - Zachowanie zmienności
Bardziej szczegółowoGenetyka populacji. Efektywna wielkość populacji
Genetyka populacji Efektywna wielkość populacji DRYF GENETYCZNY Przypadkowe zmiany częstości alleli szczególnie ważne w małych populacjach 2015-10-22 2 DRYF GENETYCZNY Wybieramy z dużej populacji o p=q=0,5
Bardziej szczegółowoDOBÓR. Kojarzenie, depresja inbredowa, krzyżowanie, heterozja
DOBÓR Kojarzenie, depresja inbredowa, krzyżowanie, heterozja SELEKCJA grupa osobników obu płci, która ma zostać rodzicami następnego pokolenia DOBÓR OSOBNIKÓW DO KOJARZEŃ POSTĘP HODOWLANY następne pokolenie
Bardziej szczegółowoSelekcja, dobór hodowlany. ESPZiWP
Selekcja, dobór hodowlany ESPZiWP Celem pracy hodowlanej jest genetyczne doskonalenie zwierząt w wyznaczonym kierunku. Trudno jest doskonalić zwierzęta już urodzone, ale można doskonalić populację w ten
Bardziej szczegółowoZarządzanie populacjami zwierząt. Efektywna wielkość populacji Wykład 3
Zarządzanie populacjami zwierząt Efektywna wielkość populacji Wykład 3 DRYF GENETYCZNY Przypadkowe zmiany częstości alleli szczególnie ważne w małych populacjach DRYF GENETYCZNY Wybieramy z dużej populacji
Bardziej szczegółowoDepresja inbredowa i heterozja
Depresja inbredowa i heterozja Charles Darwin Dlaczego rośliny chronią się przed samozapyleniem? Doświadczenie na 57 gatunkach roślin! Samozapłodnienie obniża wigor i płodność większości z 57 gatunków
Bardziej szczegółowoPokrewieństwo, rodowód, chów wsobny
Pokrewieństwo, rodowód, chów wsobny Pokrewieństwo Pokrewieństwo, z punktu widzenia genetyki, jest podobieństwem genetycznym. Im osobniki są bliżej spokrewnione, tym bardziej są podobne pod względem genetycznym.
Bardziej szczegółowoPORÓWNYWANIE POPULACJI POD WZGLĘDEM STRUKTURY
PORÓWNYWANIE POPULACJI POD WZGLĘDEM STRUKTURY obliczanie dystansu dzielącego grupy (subpopulacje) wyrażonego za pomocą indeksu F Wrighta (fixation index) w modelu jednego locus 1 Ćwiczenia III Mgr Kaczmarek-Okrój
Bardziej szczegółowoGenetyka populacji. Ćwiczenia 7
Genetyka populacji Ćwiczenia 7 Rodowody wraz z wynikami kontroli użytkowości stanowią podstawową informację potrzebną do doskonalenia zwierząt C F X S D C F C F S D strzałka oznacza przepływ genów między
Bardziej szczegółowoZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT Ćwiczenia 1 mgr Magda Kaczmarek-Okrój magda_kaczmarek_okroj@sggw.pl 1 ZAGADNIENIA struktura genetyczna populacji obliczanie frekwencji genotypów obliczanie frekwencji alleli
Bardziej szczegółowoGENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 1 Biologia I MGR /
GENETYKA POPULACJI Ćwiczenia 1 Biologia I MGR 1 ZAGADNIENIA struktura genetyczna populacji obliczanie frekwencji genotypów obliczanie frekwencji alleli przewidywanie struktury następnego pokolenia przy
Bardziej szczegółowoZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT SPOKREWNIENIE INBRED
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT SPOKREWNIENIE INBRED Rodowody wraz z wynikami kontroli użytkowości stanowią podstawową informację potrzebną do doskonalenia zwierząt X S D C F C F C S D F strzałka oznacza
Bardziej szczegółowo1 Genetykapopulacyjna
1 Genetykapopulacyjna Genetyka populacyjna zajmuje się badaniem częstości występowania poszczególnych alleli oraz genotypów w populacji. Bada także zmiany tych częstości spowodowane doborem naturalnym
Bardziej szczegółowoGenetyka populacji. Analiza Trwałości Populacji
Genetyka populacji Analiza Trwałości Populacji Analiza Trwałości Populacji Ocena Środowiska i Trwałości Populacji- PHVA to wielostronne opracowanie przygotowywane na ogół podczas tworzenia planu ochrony
Bardziej szczegółowoGenetyka Populacji http://ggoralski.com
Genetyka Populacji http://ggoralski.com Frekwencje genotypów i alleli Frekwencja genotypów Frekwencje genotypów i alleli Zadania P AA = 250/500 = 0,5 P Aa = 100/500 = 0,2 P aa = 150/500 = 0,3 = 1 Frekwencje
Bardziej szczegółowoOcena wartości hodowlanej. Dr Agnieszka Suchecka
Ocena wartości hodowlanej Dr Agnieszka Suchecka Wartość hodowlana genetycznie uwarunkowane możliwości zwierzęcia do ujawnienia określonej produkcyjności oraz zdolność przekazywania ich potomstwu (wartość
Bardziej szczegółowoSpokrewnienie prawdopodobieństwo, że dwa losowe geny od dwóch osobników są genami IBD. IBD = identical by descent, geny identycznego pochodzenia
prawdopodobieństwo, że dwa losowe geny od dwóch osobników są genami ID. Relationship Relatedness Kinship Fraternity ID = identical by descent, geny identycznego pochodzenia jest miarą względną. Przyjmuje
Bardziej szczegółowoSzacowanie wartości hodowlanej. Zarządzanie populacjami
Szacowanie wartości hodowlanej Zarządzanie populacjami wartość hodowlana = wartość cechy? Tak! Przy h 2 =1 ? wybitny ojciec = wybitne dzieci Tak, gdy cecha wysokoodziedziczalna. Wartość hodowlana genetycznie
Bardziej szczegółowoGENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 4 Biologia I MGR
GEETYKA POPULACJI Ćwiczenia 4 Biologia I MGR Ad. Ćwiczenia Liczba możliwych genotypów w locus wieloallelicznym Geny sprzężone z płcią Prawo Hardy ego-weinberga p +pq+q = p+q= m( m ) p P Q Q P p AA Aa wszystkich_
Bardziej szczegółowoZarządzanie populacjami zwierząt. Parametry genetyczne cech
Zarządzanie populacjami zwierząt Parametry genetyczne cech Teoria ścieżki zależność przyczynowo-skutkowa X p 01 Z Y p 02 p 01 2 + p 02 2 = 1 współczynniki ścieżek miary związku między przyczyną a skutkiem
Bardziej szczegółowoCECHY ILOŚCIOWE PARAMETRY GENETYCZNE
CECHY ILOŚCIOWE PARAMETRY GENETYCZNE Zarządzanie populacjami zwierząt, ćwiczenia V Dr Wioleta Drobik Rodzaje cech Jakościowe o prostym dziedziczeniu uwarunkowane zwykle przez kilka genów Słaba podatność
Bardziej szczegółowoZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT 1. RÓWNOWAGA GENETYCZNA POPULACJI. Prowadzący: dr Wioleta Drobik Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT 1. RÓWNOWAGA GENETYCZNA POPULACJI Fot. W. Wołkow Prowadzący: dr Wioleta Drobik Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt POPULACJA Zbiór organizmów żywych, które łączy
Bardziej szczegółowo1 Podstawowe pojęcia z zakresu genetyki. 2 Podstawowy model dziedziczenia
Rachunek Prawdopodobieństwa MAP8 Wydział Matematyki, Matematyka Stosowana Projekt - zastosowania rachunku prawdopodobieństwa w genetyce Opracowanie: Antonina Urbaniak Podstawowe pojęcia z zakresu genetyki
Bardziej szczegółowoZarządzanie populacjami zwierząt. Ocena wartości hodowlanej Wykład 7
Zarządzanie populacjami zwierząt Ocena wartości odowlanej Wykład 7 Wartość fenotypowa Ceca ilościowa G GE E D I GE E E p E t,d,i addytywna, dominacyjna, interakcyjna (epistatyczna) część wartości genotypowej
Bardziej szczegółowoPodstawy genetyki. ESPZiWP 2010
Podstawy genetyki ESPZiWP 2010 Genetyka - nauka o dziedziczności i zmienności organizmów, wyjaśniająca prawa rządzące podobieństwami i różnicami pomiędzy osobnikami spokrewnionymi przez wspólnego przodka
Bardziej szczegółowoPodstawy pracy hodowlanej
Podstawy pracy hodowlanej Zwiększenie produkcyjności stada jest możliwe dzięki poprawie warunków środowiska, w jakim bytują zwierzęta, przede wszystkim żywienia i pielęgnacji, a także dzięki prowadzeniu
Bardziej szczegółowoZmienność. środa, 23 listopada 11
Zmienność http://ggoralski.com Zmienność Zmienność - rodzaje Zmienność obserwuje się zarówno między poszczególnymi osobnikami jak i między populacjami. Różnice te mogą mieć jednak różne podłoże. Mogą one
Bardziej szczegółowoGenetyka ekologiczna i populacyjna W8
Genetyka ekologiczna i populacyjna W8 Genetyka populacji: Treść wykładów Zmienność genetyczna i środowiskowa Mutacje i rekombinacje Kojarzenie krewniacze Częstość genów i genotypów w populacji i prawdopodobieństwo
Bardziej szczegółowonosiciel choroby chora. mężczyzna kobieta. pleć nieokreślona. małżeństwo rozwiedzione. małżeństwo. potomstworodzeństwo
mężczyzna kobieta nosiciel choroby chora pleć nieokreślona małżeństwo małżeństwo rozwiedzione potomstworodzeństwo potomstworodzeństwo P ciążapleć dziecka nieokreślona 9 poronienie w 9 tygodniu adopcja
Bardziej szczegółowoDziedziczenie poligenowe
Dziedziczenie poligenowe Dziedziczenie cech ilościowych Dziedziczenie wieloczynnikowe Na wartość cechy wpływa Komponenta genetyczna - wspólne oddziaływanie wielu (najczęściej jest to liczba nieznana) genów,
Bardziej szczegółowoGENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 3 Biologia I MGR
GENETYKA POPULACJI Ćwiczenia 3 Biologia I MGR Heterozygotyczność Rozpatrując różnorodność genetyczną w populacjach o układzie hierarchicznym zauważamy, że najwyższy poziom heterozygotyczności zawsze występuje
Bardziej szczegółowoDepresja inbredowa vs. Heterozja
Depresja inbredowa vs. Heterozja Depresja inbredowa Depresja inbredowa moe pojawi si w populacji, w której zachodz kojarzenia w pokrewiestwie i jest konsekwencj wzrostu homozygotycznoci wynikajcego z tego
Bardziej szczegółowoBliskie Spotkanie z Biologią. Genetyka populacji
Bliskie Spotkanie z Biologią Genetyka populacji Plan wykładu 1) Częstości alleli i genotypów w populacji 2) Prawo Hardy ego-weinberga 3) Dryf genetyczny 4) Efekt założyciela i efekt wąskiego gardła 5)
Bardziej szczegółowo2. CZYNNIKI ZABURZAJĄCE RÓWNOWAGĘ GENETYCZNĄ
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT 2. CZYNNIKI ZABURZAJĄCE RÓWNOWAGĘ GENETYCZNĄ POPULACJI Fot. W. Wołkow Prowadzący: dr Wioleta Drobik Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt MIGRACJE Zmiana frekwencji
Bardziej szczegółowoZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT DRYF GENETYCZNY EFEKTYWNA WIELKOŚĆ POPULACJI PRZYROST INBREDU
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT DRYF GENETYCZNY EFEKTYWNA WIELKOŚĆ POPULACJI PRZYROST INBREDU DRYF GENETYCZNY ) Każdy żywy organizm wytwarza więcej gamet, niż zdolne jest przetrwać (Darwin). 2) Przypadek
Bardziej szczegółowoZ poprzedniego wykładu
PODSTAWY STATYSTYKI 1. Teoria prawdopodobieństwa i elementy kombinatoryki 2. Zmienne losowe i ich rozkłady 3. Populacje i próby danych, estymacja parametrów 4. Testowanie hipotez 5. Testy parametryczne
Bardziej szczegółowoWSTĘP. Copyright 2011, Joanna Szyda
BIOINFORMATYKA 1. Wykład wstępny 2. Struktury danych w badaniach bioinformatycznych 3. Bazy danych: projektowanie i struktura 4. Bazy danych: projektowanie i struktura 5. Równowaga Hardyego-Weinberga,
Bardziej szczegółowoGENETYKA POPULACJI. Fot. W. Wołkow
GENETYKA POPULACJI Fot. W. Wołkow GENETYKA POPULACJI Nauka która respektując zasady dziedziczenia z zakresu genetyki klasycznej bada mechanizmy dziedziczenia w odniesieniu do populacji Struktura genetyczna:
Bardziej szczegółowoDziedziczenie cech sprzężonych, crossing-over i mapy chromosomów
Dziedziczenie cech sprzężonych, crossing-over i mapy chromosomów Zadanie 1. Komórka zawiera 3 pary chromosomów, mieszczących 5 par genów. Pary genów A, a i B, b sprzężone są w układzie cis. Pary C, c i
Bardziej szczegółowoWnioskowanie statystyczne. Statystyka w 5
Wnioskowanie statystyczne tatystyka w 5 Rozkłady statystyk z próby Próba losowa pobrana z populacji stanowi realizacje zmiennej losowej jak ciąg zmiennych losowych (X, X,... X ) niezależnych i mających
Bardziej szczegółowoEkologia molekularna. wykład 4
Ekologia molekularna wykład 4 Zróżnicowanie między populacjami Przyczyny odchyleń od HWE Czynniki demograficzne nielosowe kojarzenie wsobność (inbred) struktura genetyczna populacji (subpopulacje) migracje
Bardziej szczegółowoPrzedmowa Wst p 1. Pochodzenie i udomowienie zwierz t gospodarskich 2. Genetyka ogólna
Spis treści Przedmowa Wstęp Znaczenie metod genetycznych w doskonaleniu produkcji zwierzęcej MoŜliwości produkcyjne współczesnych ras zwierząt gospodarskich Znaczenie gospodarcze produkcji zwierzęcej 1.
Bardziej szczegółowoGenetyka populacyjna
Genetyka populacyjna analizuje strukturę genetyczną całych populacji oraz wyniki kojarzeń wewnątrz populacji lub pomiędzy różnymi populacjami, opiera się na modelach matematycznych Prawo równowagi Hardy
Bardziej szczegółowoINFORMATYKA W SELEKCJI
INFORMATYKA W SELEKCJI INFORMATYKA W SELEKCJI - zagadnienia 1. Dane w pracy hodowlanej praca z dużym zbiorem danych (Excel) 2. Podstawy pracy z relacyjną bazą danych w programie MS Access 3. Systemy statystyczne
Bardziej szczegółowoKrzyżowanie świń: które rasy ze sobą łączyć?
https://www. Krzyżowanie świń: które rasy ze sobą łączyć? Autor: prof. dr hab. inż. Damian Knecht Data: 28 listopada 2016 W produkcji towarowej, której najczęściej produktem końcowym mają być tuczniki
Bardziej szczegółowoGENETYKA. Genetyka. Dziedziczność przekazywanie cech rodziców potomstwu Zmienność występowanie różnic pomiędzy różnymi osobnikami tego samego gatunku
GENETYKA Genetyka Nauka o dziedziczności i zmienności organizmów, wyjaśniająca prawa rządzące podobieństwami i różnicami pomiędzy osobnikami spokrewnionymi przez wspólnego przodka Dziedziczność przekazywanie
Bardziej szczegółowoGENETYCZNE PODSTAWY ZMIENNOŚCI ORGANIZMÓW ZASADY DZIEDZICZENIA CECH PODSTAWY GENETYKI POPULACYJNEJ
GENETYCZNE PODSTAWY ZMIENNOŚCI ORGANIZMÓW ZASADY DZIEDZICZENIA CECH PODSTAWY GENETYKI POPULACYJNEJ ZMIENNOŚĆ - występowanie dziedzicznych i niedziedzicznych różnic między osobnikami należącymi do tej samej
Bardziej szczegółowoEkologia molekularna. wykład 3
Ekologia molekularna wykład 3 Dziedziczenie mendlowskie Grzegorz Mendel 1822-1884 Darwin + Mendel = Ronald Fisher 1890-1962 wykład 3/2 Prawo Hardy'ego-Weinberga A A gamety możliwe genotypy potomstwa genotyp
Bardziej szczegółowoPraca hodowlana. Wartość użytkowa, wartość hodowlana i selekcja bydła
Praca hodowlana Wartość użytkowa, wartość hodowlana i selekcja bydła Duże zróżnicowanie, obserwowane w zakresie wydajności poszczególnych krów w obrębie rasy, zależy od wielu czynników genetycznych i środowiskowych.
Bardziej szczegółowoSTATYSTYKA MATEMATYCZNA WYKŁAD 3. Populacje i próby danych
STATYSTYKA MATEMATYCZNA WYKŁAD 3 Populacje i próby danych POPULACJA I PRÓBA DANYCH POPULACJA population Obserwacje dla wszystkich osobników danego gatunku / rasy PRÓBA DANYCH sample Obserwacje dotyczące
Bardziej szczegółowoPraktyczne znaczenie pokrewieństwa i inbredu w hodowli ryb
Praktyczne znaczenie pokrewieństwa i inbredu w hodowli ryb Piotr Łapa 1 1 Towarzystwo Naukowe Branży Zoologicznej Animalian Pokrewieństwo pomiędzy osobnikami populacji to jedno z podstawowych zagadnień
Bardziej szczegółowoAnaliza sprzężeń u człowieka. Podstawy
Analiza sprzężeń u człowieka Podstawy Geny i chromosomy Allele genów zlokalizowanych na różnych chromosomach segregują niezależnie (II prawo Mendla) Dla 2 genów: 4 równoliczne klasy gamet W. S Klug, M.R
Bardziej szczegółowowykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Program wykładu 1. Jakie
Bardziej szczegółowoSTATYSTYKA MATEMATYCZNA
STATYSTYKA MATEMATYCZNA 1. Wykład wstępny. Teoria prawdopodobieństwa i elementy kombinatoryki 2. Zmienne losowe i ich rozkłady 3. Populacje i próby danych, estymacja parametrów 4. Testowanie hipotez 5.
Bardziej szczegółowoBiologia medyczna, lekarski Ćwiczenie ; Ćwiczenie 19
Ćwiczenie 19 Fenotyp sportowca. Geny warunkujące fenotyp sportowca. Testy DNA w ocenie predyspozycji sportowych i ich aspekty etyczne. Genetyka cech ilościowych. Prof. dr hab. Roman Zieliński 1. "Fenotyp
Bardziej szczegółowoa) Zapisz genotyp tego mężczyzny... oraz zaznacz poniżej (A, B, C lub D), jaki procent gamet tego mężczyzny będzie miało genotyp ax b.
W tomie 2 zbioru zadań z biologii z powodu nieprawidłowego wprowadzenia komendy przenoszenia spójników i przyimków do następnej linii wystąpiła zamiana samotnych dużych liter (A, I, W, U) na małe litery.
Bardziej szczegółowoBadanie współczynnika inbredu
Badanie współczynnika inbredu na przykładzie psów rasowych Spis treści 1 1. Współczynnik inbredu Pojęcie inbredu Pojęcie współczynnika inbredu 2. Okoliczności powstania inbredu oraz jego współczynnika
Bardziej szczegółowoPodstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja
Podstawy genetyki populacji Genetyka mendlowska i ewolucja Syntetyczna teoria ewolucji } Pierwsza synteza: połączenie teorii ewolucji Darwina z genetyką mendlowską na poziomie populacji } W naturalnych
Bardziej szczegółowoDefinicja. Odziedziczalność. Definicja. w potocznym rozumieniu znaczy tyle co dziedziczenie. Fenotyp( P)=Genotyp(G)+Środowisko(E) V P = V G + V E
Odziedziczalność w potocznym rozumieniu znaczy tyle co dziedziczenie...ale ma ścisłą techniczną definicję. Definicja Fenotyp( P)=Genotyp(G)+Środowisko(E) V P = V G + V E H 2 (w szerszym sensie) = V G /
Bardziej szczegółowoSelekcja Selekcja naturalna. Warunki selekcji. Rodzi się więcej osobników niż może przeżyć i rozmnażać się.
Warunki selekcji Selekcja Rodzi się więcej osobników niż może przeżyć i rozmnażać się. Osobniki różnią się między sobą zdolnością przeżycia i rozmnażania. Zmnienność między osobnikami jest częściowo odziedziczalna.
Bardziej szczegółowoWprowadzenie do genetyki medycznej i sądowej
Genetyka medyczno-sądowa Wprowadzenie do genetyki medycznej i sądowej Kierownik Pracowni Genetyki Medycznej i Sądowej Ustalanie tożsamości zwłok Identyfikacja sprawców przestępstw Identyfikacja śladów
Bardziej szczegółowoRasy objęte programem hodowlanym. Szczegółowa analiza!
https://www. Rasy objęte programem hodowlanym. Szczegółowa analiza! Autor: prof. dr hab. inż. Damian Knecht Data: 16 sierpnia 2018 Świnia domowa jest jednym z gatunków zwierząt gospodarskich. Hoduje się
Bardziej szczegółowoDobór naturalny. Ewolucjonizm i eugenika
Dobór naturalny Ewolucjonizm i eugenika Silna i słaba selekcja - symulacje W cieniu eugeniki Początki - XIX w. (Francis Galton) XX w. - eugenika totalitarna Poprawa jakości gatunku ludzkiego poprzez kierowanie
Bardziej szczegółowoPodstawy genetyki populacji. Populacje o skończonej liczebności. Dryf. Modele wielogenowe.
Podstawy genetyki populacji Populacje o skończonej liczebności. Dryf. Modele wielogenowe. Dryf genetyczny a ewolucja } Dobór naturalny nie jest jedynym mechanizmem kształtującym zmiany ewolucyjne } Losowe
Bardziej szczegółowoMapowanie genów cz owieka. podstawy
Mapowanie genów czowieka podstawy Sprzężenie Geny leżące na różnych chromosomach spełniają II prawo Mendla Dla 2 genów: 4 równoliczne klasy gamet W. S Klug, M.R Cummings Concepts of Genetics 8 th edition,
Bardziej szczegółowoGenetyka populacyjna. Populacja
Genetyka populacyjna Populacja 1 Populacja Populacja jest to zbiór osobników jednego gatunku żyjących na danym terytorium w danym czasie. Genetykę populacyjną interesuje tzw. populacja panmiktyczna (mendlowska),
Bardziej szczegółowoWnioskowanie statystyczne Weryfikacja hipotez. Statystyka
Wnioskowanie statystyczne Weryfikacja hipotez Statystyka Co nazywamy hipotezą Każde stwierdzenie o parametrach rozkładu lub rozkładzie zmiennej losowej w populacji nazywać będziemy hipotezą statystyczną
Bardziej szczegółowoProblemy hodowlane populacji o małej liczebności na przykładzie owcy rasy olkuskiej
Wiadomości Zootechniczne, R. XLIX (2011), 1: 21 31 Problemy hodowlane populacji o małej liczebności na przykładzie owcy rasy olkuskiej Elżbieta Martyniuk Szkoła Główna Gospodarstwa wiejskiego, Katedra
Bardziej szczegółowoPodstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja. Dobór i dryf.
Podstawy genetyki populacji Genetyka mendlowska i ewolucja. Dobór i dryf. Dryf genetyczny W populacjach o skończonej liczebności może dochodzić do zmian częstości alleli nawet jeżeli nie działa na nie
Bardziej szczegółowoAnna Szewczyk. Wydział Geodezji Górniczej i InŜynierii środowiska AGH
Anna Szewczyk Wydział Geodezji Górniczej i InŜynierii środowiska AGH Zastosowania biblioteki Genetics programu R The genetics Package Tytuł: Populacja genetyczna Wersja:1.2.0 Data utworzenia: 2005-11-09
Bardziej szczegółowoAnaliza sprzężeń u człowieka. Podstawy
Analiza sprzężeń u człowieka Podstawy Badanie relacji genotyp-fenotyp u człowieka Analiza sprzężeń - poszukiwanie rejonów chromosomu położonych blisko genu determinującego daną cechę Analiza asocjacji
Bardziej szczegółowoBiologia molekularna z genetyką
Biologia molekularna z genetyką P. Golik i M. Koper Konwersatorium 2: Analiza genetyczna eukariontów Drosophilla melanogaster Makrokierunek: Bioinformatyka i Biologia Systemów; 2016 Opracowano na podstawie
Bardziej szczegółowoTestowanie hipotez statystycznych.
Bioinformatyka Wykład 9 Wrocław, 5 grudnia 2011 Temat. Test zgodności χ 2 Pearsona. Statystyka χ 2 Pearsona Rozpatrzmy ciąg niezależnych zmiennych losowych X 1,..., X n o jednakowym dyskretnym rozkładzie
Bardziej szczegółowoDorota Fopp-Bayat Mirosław Łuczyński Małgorzata Jankun
1 Dorota Fopp-Bayat Mirosław Łuczyński Małgorzata Jankun Gospodarowanie stadami rozrodczymi naturalnych i hodowlanych populacji ryb podstawy genetyki ilościowej 2 Publikację przygotowano w ramach projektu
Bardziej szczegółowoDryf genetyczny i jego wpływ na rozkłady próbek z populacji - modele matematyczne. Adam Bobrowski, IM PAN Katowice
Dryf genetyczny i jego wpływ na rozkłady próbek z populacji - modele matematyczne Adam Bobrowski, IM PAN Katowice 1 Tematyka cyklu referatów Dryf genetyczny Matematyczne modele równowagi między mutacja
Bardziej szczegółowoPDF created with FinePrint pdffactory Pro trial version http://www.fineprint.com
Analiza korelacji i regresji KORELACJA zależność liniowa Obserwujemy parę cech ilościowych (X,Y). Doświadczenie jest tak pomyślane, aby obserwowane pary cech X i Y (tzn i ta para x i i y i dla różnych
Bardziej szczegółowowykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ gamety matczyne Genetyka
Bardziej szczegółowoSGGW w Warszawie, Wydział Nauk o Zwierzętach, Zakład Hodowli Bydła
Krzyżowanie międzyrasowe bydła mlecznego Agnieszka Kądrowska, Marcin Gołębiewski SGGW w Warszawie, Wydział Nauk o Zwierzętach, Zakład Hodowli Bydła Krzyżowanie międzyrasowe jest obecnie gorącym tematem
Bardziej szczegółowo2. CZYNNIKI ZABURZAJĄCE RÓWNOWAGĘ GENETYCZNĄ
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT 2. CZYNNIKI ZABURZAJĄCE RÓWNOWAGĘ GENETYCZNĄ POPULACJI Fot. W. Wołkow Prowadzący: dr Wioleta Drobik-Czwarno; mgr Magdalena Kaczmarek-Okrój Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli
Bardziej szczegółowoWybrane rozkłady zmiennych losowych. Statystyka
Wybrane rozkłady zmiennych losowych Statystyka Rozkład dwupunktowy Zmienna losowa przyjmuje tylko dwie wartości: wartość 1 z prawdopodobieństwem p i wartość 0 z prawdopodobieństwem 1- p x i p i 0 1-p 1
Bardziej szczegółowoZadania maturalne z biologii - 7
Koło Biologiczne Liceum Ogólnokształcące nr II w Gliwicach 2015-2016 Zadania maturalne z biologii - 7 Zadania: Zad.1 (Jesika Stępień, Natalia Świetlak, Daniela Schwedka 3D) Przeczytaj tekst i na jego podstawie
Bardziej szczegółowoGENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 5 Biologia I MGR
GENETYKA POPULACJI Ćwiczenia 5 Biologia I MGR WSPÓŁCZESNA GENETYKA POPULACJI CÓRKA TRZECH MATEK TRZY MATKI trzy rewolucje dotyczące teorii i technologii 1) Rewolucja koncepcyjna: wyłoniona z teorii koalescencji,
Bardziej szczegółowoz wykonanego zadania na rzecz postępu biologicznego w produkcji zwierzęcej
INFORMACJA z wykonanego zadania na rzecz postępu biologicznego w produkcji zwierzęcej Tytuł zadania: Analiza zmienności cech użytkowych i reprodukcyjnych w hodowlanych populacjach wybranych rodów kur,
Bardziej szczegółowoPodstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja.
Podstawy genetyki populacji Genetyka mendlowska i ewolucja. Syntetyczna teoria ewolucji Pierwsza synteza: połączenie teorii ewolucji Darwina z genetyką mendlowską na poziomie populacji W naturalnych populacjach
Bardziej szczegółowowykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Choroby genetyczne o złożonym
Bardziej szczegółowoAnaliza sprzężeń u człowieka. Podstawy
Analiza sprzężeń u człowieka Podstawy Geny i chromosomy Allele genów zlokalizowanych na różnych chromosomach segregują niezależnie (II prawo Mendla) Dla 2 genów: 4 równoliczne klasy gamet W. S Klug, M.R
Bardziej szczegółowoRozkłady statystyk z próby. Statystyka
Rozkłady statystyk z próby tatystyka Rozkłady statystyk z próby Próba losowa pobrana z populacji stanowi realizacje zmiennej losowej jak ciąg zmiennych losowych (X, X,... X ) niezależnych i mających ten
Bardziej szczegółowoGenetyka i modyfikacje genetyczne gatunków zwierząt przeznaczonych do wykorzystania lub wykorzystywanych w procedurach na przykładzie myszy domowych.
Józefa Styrna Genetyka i modyfikacje genetyczne gatunków zwierząt przeznaczonych do wykorzystania lub wykorzystywanych w procedurach na przykładzie myszy domowych. Zakład Genetyki i Ewolucjonizmu Instytut
Bardziej szczegółowoEkologia molekularna. wykład 14. Genetyka ilościowa
Ekologia molekularna wykład 14 Genetyka ilościowa Dziedziczenie mendlowskie wykład 14/2 Cechy wieloczynnikowe (ilościowe) wzrost masa ciała kolor skóry kolor oczu itp wykład 14/3 Rodzaje cech ilościowych
Bardziej szczegółowoModelowanie ewolucji. Dobór i dryf genetyczny
Modelowanie ewolucji Dobór i dryf genetyczny Syntetyczna teoria ewolucji Pierwsza synteza: połączenie teorii ewolucji Darwina z genetyką mendlowską na poziomie populacji W naturalnych populacjach występują
Bardziej szczegółowoSelekcja materiału rozrodowego
https://www. Selekcja materiału rozrodowego Autor: prof. dr hab. inż. Damian Knecht Data: 28 kwietnia 2019 Doskonalenie genetyczne świń ma bardzo duży wpływ na produkcję trzody chlewnej. Polega ono na
Bardziej szczegółowoPodstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja. Dobór i dryf.
Podstawy genetyki populacji Genetyka mendlowska i ewolucja. Dobór i dryf. Dryf genetyczny W populacjach o skończonej liczebności może dochodzić do zmian częstości alleli nawet jeżeli nie działa na nie
Bardziej szczegółowoWybrane rozkłady zmiennych losowych. Statystyka
Wybrane rozkłady zmiennych losowych Statystyka Rozkład dwupunktowy Zmienna losowa przyjmuje tylko dwie wartości: wartość 1 z prawdopodobieństwem p i wartość 0 z prawdopodobieństwem 1- p x i p i 0 1-p 1
Bardziej szczegółowoStatystyka matematyczna. dr Katarzyna Góral-Radziszewska Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt
Statystyka matematyczna dr Katarzyna Góral-Radziszewska Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt Zasady zaliczenia przedmiotu: część wykładowa Maksymalna liczba punktów do zdobycia 40. Egzamin będzie
Bardziej szczegółowoMETODY BADAŃ NA ZWIERZĘTACH ze STATYSTYKĄ wykład 3-4. Parametry i wybrane rozkłady zmiennych losowych
METODY BADAŃ NA ZWIERZĘTACH ze STATYSTYKĄ wykład - Parametry i wybrane rozkłady zmiennych losowych Parametry zmiennej losowej EX wartość oczekiwana D X wariancja DX odchylenie standardowe inne, np. kwantyle,
Bardziej szczegółowoEstymacja punktowa i przedziałowa
Temat: Estymacja punktowa i przedziałowa Kody znaków: żółte wyróżnienie nowe pojęcie czerwony uwaga kursywa komentarz 1 Zagadnienia 1. Statystyczny opis próby. Idea estymacji punktowej pojęcie estymatora
Bardziej szczegółowoWYKŁAD 5 TEORIA ESTYMACJI II
WYKŁAD 5 TEORIA ESTYMACJI II Teoria estymacji (wyznaczanie przedziałów ufności, błąd badania statystycznego, poziom ufności, minimalna liczba pomiarów). PRÓBA Próba powinna być reprezentacyjna tj. jak
Bardziej szczegółowoDz.U. 1999 Nr 45 poz. 450 ROZPORZĄDZENIE MINISTRA ROLNICTWA I GOSPODARKI ŻYWNOŚCIOWEJ
Kancelaria Sejmu s. 1/1 Dz.U. 1999 Nr 45 poz. 450 ROZPORZĄDZENIE MINISTRA ROLNICTWA I GOSPODARKI ŻYWNOŚCIOWEJ z dnia 20 kwietnia 1999 r. w sprawie szczegółowych zasad prowadzenia ksiąg i rejestrów zwierząt
Bardziej szczegółowo