Typowanie szczepów Pseudomonas aeruginosa opornych na karbapenemy techniką PCR-RAPD
|
|
- Edward Brzeziński
- 6 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2010, 62: Tomasz Bogiel, Eugenia Gospodarek Typowanie szczepów Pseudomonas aeruginosa opornych na karbapenemy techniką PCR-RAPD Katedra i Zakład Mikrobiologii Collegium Medicum im. L. Rydygiera w Bydgoszczy Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu Kierownik: dr hab. n. med. E. Gospodarek, prof. UMK W związku ze znacznym wzrostem w 2007 roku liczby izolacji szczepów Pseudomonas aeruginosa opornych na karbapenemy, przeprowadzono genotypowanie techniką PCR-RAPD 16 wybranych izolatów z materiału od chorych leczonych w Szpitalu Uniwersyteckim nr 1 im. dr. A. Jurasza w Bydgoszczy. W roku objętym badaniem od 78 chorych izolowano 125 szczepów P. aeruginosa o fenotypie oporności na imipenem i meropenem. Wykazano, że wszystkie badane szczepy były odmienne, dowodząc przydatności techniki PCR-RAPD w typowaniu szczepów pałeczek ropy błękitnej. Pałeczki P. aeruginosa należą do najczęstszych etiologicznych czynników zakażeń szpitalnych spośród pałeczek niefermentujących (8). Nabywanie przez nie oporności na antybiotyki/chemioterapeutyki, niewrażliwość na czynniki fizyko-chemiczne i zdolność przeżycia w środowisku szpitala sprzyjają występowaniu zakażeń szpitalnych (8). Szczepy tego gatunku oporne na karbapenemy (carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa, CRPA) stanowią wyzwanie terapeutyczne, zarówno ze względu na ograniczoną liczbę opcji terapeutycznych, trudności w eradykacji oraz rodzaj i lokalizację zakażeń powstających z ich udziałem (8). Techniką uznawaną za złoty standard w typowaniu szczepów i często stosowaną do takich aplikacji jest genotypowanie polegające na cięciu chromosomalnego DNA enzymami restrykcyjnymi i jego rozdziale z wykorzystaniem elektroforezy w zmiennym polu elektrycznym (Pulsed Field Gel Electrophoresis, PFGE) (13). Jest to jednak procedura długotrwała i kosztowna, zwłaszcza w rutynowych badaniach. Alternatywą jest inna metoda genotypowa oparta na losowej amplifikacji materiału genetycznego i polimorfizmie wielkości powstających w jej wyniku produktów PCR-RAPD (Polymerase Chain Reaction-Random Amplified Polymorphic DNA) (18). Celem pracy była ocena przydatności techniki PCR-RAPD do wewnątrzgatunkowego typowania szczepów CRPA. W analizie uwzględniono 16 szczepów CRPA o podobnych i/lub różnych wzorach lekowrażliwości na antybiotyki/chemioterapeutyki, wyosobnionych od różnych chorych Szpitala Uniwersyteckiego nr 1 im. dr. A. Jurasza w Bydgoszczy w 2007 roku. 1 Praca została sfinansowana z Grantu UMK nr 30/2009
2 212 T. Bogiel, E. Gospodarek Nr 3 MATERIAŁ I METODY Przedmiotem badań było 16 szczepów P. aeruginosa niewykazujących stref zahamowania wzrostu wokół krążków z imipenemem (10 μg) i meropenemem (10 μg) (Becton Dickinson) w metodzie krążkowo-dyfuzyjnej według Kirby-Bauer. Były to izolaty pochodzące od różnych pacjentów, o takich samych i/lub różnych wzorach lekowrażliwości. Badane szczepy zostały wybrane spośród 125 CRPA, izolowanych w 2007 roku w Zakładzie Mikrobiologii Klinicznej od 78 chorych Szpitala Uniwersyteckiego nr 1 im. dr. A. Jurasza Collegium Medicum im. L. Rydygiera w Bydgoszczy. Identyfikację gatunkową przeprowadzano na podstawie morfologii kolonii na podłożu Columbia Agar z dodatkiem 5% krwi baraniej (biomérieux), podłożu MacConkey Agar (Becton Dickinson, biomérieux), podłożu z cetrymidem (Becton Dickinson), zdolności wytwarzania barwników oraz wyników reakcji biochemicznych ujętych w testach ID 32 GN, ID 32 E lub API 20 NE (biomérieux) wykonywanych zgodnie z zaleceniami producenta i odczytywanych w systemie komputerowym ATB Expression V (biomérieux). Lekowrażliwość szczepów P. aeruginosa oznaczano metodą krążkowo dyfuzyjną według Kirby Bauer, zachowując warunki standaryzacji podane przez Krajowy Ośrodek Referencyjny ds. Lekowrażliwości Drobnoustrojów (KORLD) (12) oraz interpretacji według Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) (5). Używano zawiesiny bakteryjnej o gęstości 0,5 według skali MacFarlanda i podłoża Mueller-Hinton Agar (biomérieux). Krążki z antybiotykami (Becton Dickinson) dobierano zgodnie z zaleceniami KORLD. W celu kontroli oznaczania lekowrażliwości stosowano szczepy wzorcowe z kolekcji ATCC: Pseudomonas aeruginosa i Escherichia coli Płytki antybiogramowe inkubowano godzin w temperaturze 35ºC w atmosferze tlenowej. Wyniki interpretowano na podstawie wielkości średnic stref zahamowania wzrostu bakterii wokół krążków z antybiotykami stosując aktualne zalecenia CLSI. Po wykonaniu identyfikacji i ocenie lekowrażliwości, szczepy przeznaczone do genotypowania przechowywano w temperaturze -80 C w podłożu BHI (Brain Heart Infusion, Becton Dickinson) z dodatkiem glicerolu (POCh). Następnie, izolowano DNA bakteryjne zgodnie z instrukcją producenta, wykorzystując zestaw Genomic Mini (A&A Biotechnology). W technice PCR-RAPD zastosowano metodę opisaną przez Mahenthiralingam i wsp. (18). Reakcję przeprowadzano w probówkach o objętości 200 μl (Eppendorf) w końcowej objętości 25 μl. Stosowano polimerazę Taq w ilości 1 U/reakcję w pięciokrotnie rozcieńczonym buforze (Green GoTaq Flexi Buffer), MgCl 2 w stężeniu końcowym 3 mm (GoTaq Flexi DNA Polymerase, Promega) oraz zestaw dntp w stężeniu 250 μm (dntp Mix, Promega). W dwóch oddzielnych reakcjach użyto w ilości 40 pmoli/reakcję dwóch dziesięcionukleotydowych starterów (Integrated DNA Technologies): 208 o sekwencji 5 ACGGCCGACC 3 i temperaturze topnienia 45,5 C oraz 272 o sekwencji 5 AGCGGGCCAA 3 i temperaturze topnienia 43,7 C. Następnie dodawano wyizolowanego DNA bakteryjnego w ilości 40 ng i do końcowej objętości dopełniano wodą do aplikacji biologii molekularnej Molecular Biology Grade Water (Eppendorf). Wykorzystano termocykler GeneAmp PCR System 2700 (Applied Biosystems) oraz następujące warunki reakcji: 1. pre-amplifikacja - 4 cykle, temperatura: 94 C 5 minut, 36 C 5 minut, 72 C 5 minut,
3 Nr 3 Typowanie P. aeruginosa metodą PCR-RAPD amplifikacja właściwa - 30 cykli, temperatura: 94 C 1 minuta, 36 C 1 minuta, 72 C 2 minuty, 3. końcowy etap wydłużania, temperatura 72 C 10 minut. Produkt amplifikacji PCR-RAPD w ilości 6 μl rozdzielano elektroforetycznie w 2,5% żelu agarozowym (Bio-Rad) w 1xTBE (Bio-Rad) pod napięciem 9 V/cm przez 3 godziny w aparacie do elektroforezy SUB-CELL GT (BioRad). Wykorzystano wzorzec wielkości pz (SolisBiodyne). Po zakończeniu elektroforezy żel wybarwiano przez 30 minut roztworem bromku etydyny, odbarwiano przez 40 minut wodą dejonizowaną. Odczytu dokonywano w świetle UV i wynik zapisywano korzystając z systemu dokumentacji żeli GEL DOC 2000 (BioRad) i programu Quantity One (Bio-Rad). WYNIKI Liczba izolacji CRPA w ogólnej liczbie izolacji szczepów gatunku wzrosła z 92 w 2006 roku do 210 w 2007 roku. Wynika to głównie z ogólnie większej liczby izolacji szczepów P. aeruginosa 740 w 2006 roku, a 919 w 2007 roku. Zaobserwowano ponadto znaczący wzrost odsetka izolacji CRPA z 12,4% w 2006 roku do 22,9% w 2007 roku. Odnotowano Klinika Anestezjologii i Intensyw nej Terapii 6,3 6,3 6,3 25,0 Klinika Chirurgii Dziecięcej Klinika Rehabilitacji 6,3 Klinika Nefrologii, Nadciśnienia Tętniczego i Chorób Wew nętrznych Klinika Chirurgii Ogólnej i Endokrynologicznej 12,5 18,8 Klinika Transplantologii i Chirurgii Ogólnej Klinika Neurochirurgii i Neurotraumatologii 18,8 Klinika Chirurgii Ogólnej i Naczyń Ryc. 1. Pochodzenie badanych szczepów (n=16) 6,3% 6,3% 6,3% 25,0% Popłuczyny oskrzelow o-pęcherzykow e Mocz i mocz z cew nika Wymaz z rany 12,5% Krew Wydzielina z dróg oddechow ych 18,8% 25,0% Wymaz z odbytu Kał Ryc. 2. Materiał kliniczny, z którego izolowano badane szczepy (n=16)
4 214 T. Bogiel, E. Gospodarek Nr 3 również wzrost liczby i odsetka szczepów CRPA z 64 (8,6%) w 2006 roku do 125 (13,6%) w 2007 roku, izolowanych odpowiednio od 53 w 2006 roku i 78 pacjentów w 2007 roku. Pochodzenie badanych szczepów oraz rodzaj materiału klinicznego, z którego je wyosobniono zostały przedstawione, odpowiednio na rycinie 1 i 2. Najwyższy odsetek badanych szczepów pochodził od chorych leczonych w Klinice Anestezjologii i Intensywnej Terapii (25,0%). Były to najczęściej szczepy izolowane z popłuczyn oskrzelowo-pęcherzykowych (25,0%), moczu (25,0%) i wymazów z ran (18,8%). Wyniki oceny lekowrażliwości szczepów CRPA przedstawiono na rycinie 3. Większość badanych szczepów była oporna na doripenem (81,3%) i piperacylinę (75,0%). Najwyższy odsetek szczepów wrażliwych notowano wobec amikacyny (81,3%), netilmycyny i norfloksacyny (po 75,0%). Wszystkie badane szczepy CRPA pozostawały wrażliwe na kolistynę. Karbenicylina Tikarcylina Piperacylina Piperacylina/tazobaktam Tikarcylina/kwas klawulanowy Antybiotyk/chemioterapeutyk Cefotaksym Ceftazydym Cefepim Aztreonam Doripenem Gentamicyna Tobramycyna Amikacyna Netilmycyna Norfloksacyna Ciprofloksacyna 0,0% 20,0% 40,0% 60,0% 80,0% 100,0% Ryc. 3. Lekowrażliwość badanych szczepów (n=16) Oporne Średniowrażliwe Wrażliwe
5 Nr 3 Typowanie P. aeruginosa metodą PCR-RAPD 215 W wyniku rozdziału produktu amplifikacji DNA 16 szczepów uzyskano 14 różnych wzorów prążków z wykorzystaniem startera 208 (Ryc. 4). Podobny układ otrzymano dla trzech szczepów (numery 8, 9 i 14, Ryc. 4). Szczepy te izolowano od chorych leczonych na różnych oddziałach szpitala. Dodatkowo, dwa z nich posiadały taki sam wzór lekowrażliwości. Stosując starter 272 otrzymano 16 układów prążków, różnych dla każdego z badanych szczepów. Zdjęcie przedstawiające rozdzielony i wybarwiony bromkiem etydyny efekt rozdziału produktu PCR-RAPD z wykorzystaniem startera 208 został przedstawiony na rycinie M* Ryc. 4. Rozdział produktu amplifikacji DNA badanych szczepów (n=16) techniką PCR-RAPD z wykorzystaniem startera 208 *M wzorzec wielkości par zasad, 1-16 numery kolejnych badanych szczepów Na podstawie układów prążków uzyskanych w wyniku rozdziału elektroforetycznego produktu PCR-RAPD z wykorzystaniem przynajmniej jednego startera nie stwierdzono szczepów powtarzających się, dowodząc przydatności techniki w różnicowaniu szczepów CRPA. DYSKUSJA Z każdym rokiem notowany jest wzrost częstości izolacji szczepów P. aeruginosa, w tym szczepów CRPA. Nabywanie przez nie oporności pod wpływem presji antybiotykowej i przekazywania genów kodujących mechanizmy oporności jest niezwykle groźnym zjawiskiem. Tymczasem, jak wskazują wykorzystujące technikę PCR-RAPD, badania Kersulyte i wsp. (17), możliwe jest z jej zastosowaniem potwierdzenie izolacji od jednego chorego więcej niż jednego szczepu.
6 216 T. Bogiel, E. Gospodarek Nr 3 Niezwykle ważna jest wiedza na temat utrzymywania się takich szczepów w środowisku szpitalnym i monitorowanie ich występowania. Szczepy izolowane od pacjenta, jak dokumentują wyniki badań Nazik i wsp. (19) mają zdolność utrzymywania się nawet przez kilka miesięcy i rozprzestrzeniania się wśród pacjentów tego samego zakładu leczniczego. Szybkie wykrycie, izolowanie i zachowanie racjonalnych procedur w odniesieniu do pacjentów, u których doszło do zakażenia lekoopornymi szczepami P. aeruginosa, umożliwia ograniczenie ich rozprzestrzeniania (3, 16). W typowaniu szczepów wykorzystywane są metody zarówno fenotypowe, jak i genotypowe (1, 6, 11, 14). Mało rozpowszechnioną, choć opracowaną już w latach 90. ubiegłego wieku jest technika PCR-RAPD (22, 23). Mimo tego, że jej przydatność w typowaniu szczepów P. aeruginosa została wykazana przez Kersulyte i wsp. (17), w dostępnym piśmiennictwie jest niewiele informacji dotyczących jej wykorzystania w Polsce (2, 9). Jednak, jak wskazują wyniki uzyskane przez innych autorów, dzięki możliwości uwidoczniania heterogenności badanej populacji (4), technika ta jest bardzo użyteczna w typowaniu szczepów P. aeruginosa, także izolatów wielolekoopornych (20). Umożliwia ponadto stwierdzenie występowania i różnicowania szczepów epidemicznych, stanowiących szczególne zagrożenie ze względu na lekooporność (3, 20). Z piśmiennictwa wynika, że technika PCR-RAPD jest przydatna nie tylko w odniesieniu do szczepów klinicznych ale również w badaniach populacyjnych, np. kolonizacji pacjentów szczepami P. aeruginosa, badań epidemiologicznych wywoływania przez nie zakażeń krzyżowych (15). Z dostępnego piśmiennictwa wynika, że porównanie przydatności różnych technik fenotypowych i metody PCR-RAPD, jednoznacznie wskazuje na tę drugą jako lepszą (1, 6, 11, 14). W badaniach własnych, wykorzystując w niezależnych reakcjach startery 208 i 272, również wykazano użyteczność tej metody zarówno w stosunku do szczepów o takich samych, jak i różnych wzorach lekowrażliwości. Na podstawie przedstawionych wyników w niniejszej pracy po amplifikacji DNA metodą RAPD-PCR odmienny układ prążków dla każdego szczepu uzyskano tylko dla startera 272. Tymczasem badania Budak i wsp. (2) wskazują, że badając 31 szczepów tyle samo wzorów PCR-RAPD uzyskano dla obydwu, wykorzystanych w niniejszej pracy, starterów. Wskazywałoby to na podobną siłę różnicującą starterów 208 i 272, czego nie zaobserwowano na podstawie badań własnych. Saitou i wsp. (21) w badaniach z wykorzystaniem startera 208, wykazali natomiast jego przydatność w potwierdzeniu różnorodności wzorów DNA. Spośród ocenianych przez Grundmann i wsp. (13) metod molekularnych, technika rozdziału metodą PFGE poddanego restrykcyjnemu trawieniu materiału genetycznego, wykazywała najwyższą siłę różnicującą 81 szczepów różnorodnych geograficznie, epidemiologicznie i pod względem czasu izolacji. Z punktu widzenia konieczności przeprowadzenia dużej liczby badań, PCR-RAPD jest jednak techniką bardziej efektywną i szybszą. Niewątpliwym utrudnieniem wykorzystania techniki PCR-RAPD, jak wskazują niektórzy autorzy (10), jest fakt, że duże znaczenie w uzyskiwaniu wyników ma stabilność genomu pałeczek P. aeruginosa.
7 Nr 3 Typowanie P. aeruginosa metodą PCR-RAPD 217 W innych badaniach wykazano, że szczepy posiadające takie same wzory RAPD mogą różnić się cechami fenotypowymi, jak chociażby zdolnością czy obfitością tworzenia biofilmu (7). Stąd, te właściwości szczepów nie są wystarczające do ich różnicowania. Technika PCR-RAPD jest prostszą i szybszą niż PFGE metodą, której wykorzystanie dzięki czułości i skuteczności (17) może przyspieszyć dochodzenia epidemiologiczne, ułatwić badanie pokrewieństwa szczepów i uczynić takie badania bardziej celowymi. WNIOSKI 1. Technika PCR-RAPD jest szybką i prostą metodą, przydatną w typowaniu szczepów P. aeruginosa opornych na karbapenemy. 2. Na podstawie układu prążków uzyskiwanego po rozdziale produktów amplifikacji DNA szczepów z wykorzystaniem techniki PCR-RAPD można w pełni odróżnić od siebie izolaty. 3. Szczepy, zarówno o takim samym, jak i różnym wzorze lekowrażliwości, mogą różnić się wzorami uzyskanymi techniką PCR-RAPD. T. Bogiel, E. Gospodarek PCR-RAPD typing of carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa strains SUMMARY P. aeruginosa rods are opportunistic pathogens responsible generally for nosocomial infections. Resistance to carbapenems, observed among them, is a serious threat due to ability to be transmitted between bacterial species. The aim of our study was to evaluate the usefulness of PCR-RAPD technique in typing of 16 carbapenem-resistant P. aeruginosa strains isolated in 2007 from different patients of University Hospital No. 1 of dr A. Jurasz Collegium Medicum of L. Rydygier in Bydgoszcz Nicolaus Copernicus University in Toruń. Study shows increasing frequency of isolation that type of strains when compared to Percentage of carbapenem-resistant isolates raised from 12,4% in 2006 to 22,9% in The majority of examined strains were obtained from patients of the Intensive Care Units (25,0%) and were isolated from bronchoalveolar lavage (25,0%), urine (25,0%) and wound swabs (18,8%) samples. Examined P. aeruginosa strains demonstrated resistance to doripenem (81,3%) and piperacillin (75,0%) and susceptibility to colistin (100,0%), amikacin (81,3%), netilmicin and norfloxacin (75,0% each). Using PCR-RAPD amplification with 208 and 272 primers, 14 and 16 DNA patterns were obtained, respectively. Usefulness of PCR-RAPD in carbapenem-resistant P. aeruginosa strains typing was proved in case of strains presenting similar and/or different antimicrobials susceptibility patterns. PIŚMIENNICTWO 1. Ben Haj Khalifa A, Vu-Thien H, Pourcel C i inni. Phenotypic and genotypic (randomly amplified polymorphic DNA analysis and multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis) charaterization of 96 clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa in the F. Bourguiba hospital (Monastir, Tunisia). Pathol Biol (Paris). 2010; 58: 84-8.
8 218 T. Bogiel, E. Gospodarek Nr 3 2. Budak A, Paluchowska P, Włodarczyk D i inni. Genetyczna charakterystyka szczepów Acinetobacter baumannii oraz Pseudomonas aeruginosa izolowanych od chorych z zapaleniem płuc hospitalizowanych w oddziale intensywnej terapii. Med Dosw Mikrobiol. 2010; 62: Cardoso O, Alves AF, Leitão R. Metallo-beta-lactamase VIM-2 in Pseudomonas aeruginosa isolates from a cystic fibrosis patient. Int J Antimicrob Agents. 2008; 31: Clarke L, Moore JE, Millar BC, Crowe M i inni. Molecular epidemiology of Pseudomonas aeruginosa in adult patients with cystic fibrosis in Northern Ireland. Br J Biomed Sci. 2008; 65: Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. Eighteenth informational supplement (M100-S18). CLSI Wayne, Pa Coban AY, Ciftci A, Onuk EE i inni. Investigation of biofilm formation and relationship with genotype and antibiotic susceptibility of Pseudomonas aeruginosa strains isolated from patients with cystic fibrosis. Mikrobiyol Bul. 2009; 43: Deligianni E, Pattison S, Berrar D i inni. Pseudomonas aeruginosa cystic fibrosis isolates of similar RAPD genotype exhibit diversity in biofilm forming ability in vitro. BMC Microbiol. 2010; 10: Dzierżanowska D. Patogeny zakażeń szpitalnych. W: Zakażenia szpitalne. Red. D. Dzierżanowska, α-medica press, Bielsko-Biała. 2007, Fiett J, Trzciński K, Hryniewicz W, Gniadkowski M. The use of molecular biology in the modeling of Pseudomonas aeruginosa strains recovered from nosocomial infections Przegl Epidemiol. 1998; 52: Fothergill JL, White J, Foweraker JE i inni. Impact of Pseudomonas aeruginosa genomic instability on the application of typing methods for chronic cystic fibrosis infections. J Clin Microbiol. 2010; 48: Freitas AL, Barth AL. Typing of Pseudomonas aeruginosa from hospitalized patients: a comparison of susceptibility and biochemical profiles with genotype. Braz J Med Biol Res. 2004; 37: Gniadkowski M, Żabicka D, Hryniewicz W. Rekomendacje doboru testów do oznaczania wrażliwości bakterii na antybiotyki i chemioterapeutyki Oznaczanie wrażliwości pałeczek Gram-ujemnych. 13. Grundmann H, Schneider C, Hartung D i inni. Discriminatory power of three DNA-based typing techniques for Pseudomonas aeruginosa. J Clin Microbiol. 1995; 33: Hafiane A, Ravaoarinoro M. Characterization of Pseudomonas aeruginosa strains isolated from cystic fibrosis patients by different typing methods. Pathol Biol (Paris) (Epub ahead of print). 15. Hoogkamp-Korstanje JA, Meis JF, Kissing J i inni. Risk of cross-colonization and infection by Pseudomonas aeruginosa in a holiday camp for cystic fibrosis patients. J Clin Microbiol. 1995; 33: Iglesias NG, Marengo JM, Rentería F i inni. Molecular typification of Pseudomonas aeruginosa strains isolated from patients with cystic fibrosis. Rev Argent Microbiol. 2008; 40: Kersulyte D, Struelens MJ, Deplano A, Berg DE. Comparison of arbitrarily primed PCR and macrorestriction (pulsed-field gel electrophoresis) typing of Pseudomonas aeruginosa strains from cystic fibrosis patients. J Clin Microbiol. 1995; 33: Mahenthiralingam E, Campbell ME, Foster J i inni. Random amplified polymorphic DNA typing of Pseudomonas aeruginosa isolates recovered from patients with cystic fibrosis. J Clin Microbiol. 1996; 34: Nazik H, Ongen B, Erturan Z, Salcioğlu M. Genotype and antibiotic susceptibility patterns of Pseudomonas aeruginosa and Stenotrophomonas maltophilia isolated from cystic fibrosis patients. Jpn J Infect Dis. 2007; 60: 82-6.
9 Nr 3 Typowanie P. aeruginosa metodą PCR-RAPD Pellegrino FL, Casali N, Dos Santos KR i inni. Pseudomonas aeruginosa epidemic strain carrying bla(spm) metallo-beta-lactamase detected in Rio de Janeiro, Brazil. J Chemother. 2006; 18: Saitou K, Furuhata K, Fukuyama M. Genotyping of Pseudomonas aeruginosa isolated from cockroaches and human urine. J Infect Chemother (Epub ahead of print). 22. Welsh J, McClelland M. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers. Nucleic Acids Res. 1990; 18: Williams JG, Kubelik AR, Livak KJ i inni. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Res. 1990; 18: Otrzymano: 19 VII 2010 r. Adres Autora: Bydgoszcz, ul. M. Skłodowskiej-Curie 9, Katedra i Zakład Mikrobiologii Collegium Medicum w Bydgoszczy, Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu
10
SZCZEPY ACINETOBACTER BAUMANNII OPORNE NA KARBAPENEMY
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2, 62: 9-26 Tomasz Bogiel, Joanna Kwiecińska-Piróg, Katarzyna Jachna-Sawicka, Eugenia Gospodarek SZCZEPY ACINETOBACTER BAUMANNII OPORNE NA KARBAPENEMY Katedra i Zakład Mikrobiologii
Bardziej szczegółowoZastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych
Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych Wstęp teoretyczny Technika RAPD (ang. Random Amplification of Polymorphic DNA) opiera się na prostej reakcji PCR, przeprowadzanej na genomowym
Bardziej szczegółowoOCENA AKTYWNOŚCI DORIPENEMU WOBEC PAŁECZEK Z RODZAJÓW PSEUDOMONAS SP. I ACINETOBACTER SP.
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 367-374 Tomasz Bogiel, Aleksander Deptuła, Eugenia Gospodarek OCENA AKTYWNOŚCI DORIPENEMU WOBEC PAŁECZEK Z RODZAJÓW PSEUDOMONAS SP. I ACINETOBACTER SP. Katedra i Zakład
Bardziej szczegółowoPAŁECZKI Z RODZAJU KLEBSIELLA IZOLOWANE OD PACJENTÓW ŁÓDZKICH SZPITALI W 2006 ROKU
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 41-46 Izabela Szczerba, Katarzyna Gortat, Karol Majewski PAŁECZKI Z RODZAJU KLEBSIELLA IZOLOWANE OD PACJENTÓW ŁÓDZKICH SZPITALI W 2006 ROKU Zakład Mikrobiologii Lekarskiej
Bardziej szczegółowoOcena lekowrażliwości szczepów Enterobacter sp. izolowanych z moczu
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2011, 63: 225-233 Anna Michalska, Paulina Dziurkowska, Eugenia Gospodarek Ocena lekowrażliwości szczepów Enterobacter sp. izolowanych z moczu Katedra i Zakład Mikrobiologii Collegium
Bardziej szczegółowoOCCURRENCE AND ANTIMICROBIAL SUSCEPTIBILITY OF MORGANELLA MORGANII STRAINS ISOLATED FROM CLINICAL SAMPLES
PRZEGL EPIDEMIOL ; 66: - 8 Prolbemy zakażeń Patrycja Zalas-Więcek, Eugenia Gospodarek, Joanna Wróblewska WYSTĘPOWANIE ORAZ LEKOWRAŻLIWOŚĆ SZCZEPÓW MORGANELLA MORGANII IZOLOWANYCH Z MATERIAŁU KLINICZNEGO
Bardziej szczegółowoPracownia Mikrobiologii ZDL, Wojewódzki Szpital Specjalistyczny im. L. Rydygiera, Kraków Kierownik: prof. dr hab. A. Budak 3
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2010, 62: 67-75 Alicja Budak 1,2, Paulina Paluchowska 1, Dorota Włodarczyk 1, Paweł Nowak 1, Małgorzata Węgrzyn, Wojciech Mudyna 3 GENETYCZNA CHARAKTERYSTYKA SZCZEPÓW ACINETOBACTER
Bardziej szczegółowoOCENA STOPNIA WRAŻLIWOŚCI NA AMINOGLIKOZYDY SZCZEPÓW BAKTERYJNYCH IZOLOWANYCH OD CHORYCH Z ZAKAŻENIAMI UKŁADOWYMI I UOGÓLNIONYMI.
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 8, 6: 5-4 Beata Kowalska - Krochmal, Izabela Dolna, Agata Dobosz, Ewa Wrzyszcz, Grażyna Gościniak OCENA STOPNIA WRAŻLIWOŚCI NA AMINOGLIKOZYDY SZCZEPÓW BAKTERYJNYCH IZOLOWANYCH OD
Bardziej szczegółowoESBL-DODATNIE I ESBL-UJEMNE SZCZEPY KLEBSIELLA PNEUMONIAE I KLEBSIELLA OXYTOCA WYSTĘPOWANIE W MATERIALE KLINICZNYM I WRAŻLIWOŚĆ NA WYBRANE ANTYBIOTYKI
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2008, 60: 39-44 Alicja Sękowska, Joanna Wróblewska, Eugenia Gospodarek ESBL-DODATNIE I ESBL-UJEMNE SZCZEPY KLEBSIELLA PNEUMONIAE I KLEBSIELLA OXYTOCA WYSTĘPOWANIE W MATERIALE KLINICZNYM
Bardziej szczegółowoPROBLEMY TERAPEUTYCZNE WTÓRNYCH ZAKAŻEŃ KRWI POWODOWANE PRZEZ PAŁECZKI Enterobacterales W PRAKTYCE ODDZIAŁÓW ZABIEGOWYCH I ZACHOWAWCZYCH
PROBLEMY TERAPEUTYCZNE WTÓRNYCH ZAKAŻEŃ KRWI POWODOWANE PRZEZ PAŁECZKI Enterobacterales W PRAKTYCE ODDZIAŁÓW ZABIEGOWYCH I ZACHOWAWCZYCH DOROTA ROMANISZYN KATEDRA MIKROBIOLOGII UJCM KRAKÓW Zakażenie krwi
Bardziej szczegółowoObszar niepewności technicznej oznaczania lekowrażliwościatu w rekomendacjach EUCAST 2019
Obszar niepewności technicznej oznaczania lekowrażliwościatu w rekomendacjach EUCAST 19 Dorota Żabicka Krajowy Ośrodek Referencyjny ds. LekowrażliwościDrobnoustrojów (KORLD) Zakład Epidemiologii i Mikrobiologii
Bardziej szczegółowoNarodowy Instytut Leków ul. Chełmska 30/34, 00-725 Warszawa Tel. 022 851-46-70, Fax. 022 841-29-49 www.korld.edu.pl Warszawa, dn. 21.10.2009r.
Narodowy Instytut Leków ul. Chełmska 30/34, 00-725 Warszawa Tel. 022 851-46-70, Fax. 022 841-29-49 www.korld.edu.pl Warszawa, dn. 21.10.2009r. Wytyczne postępowania w przypadku wykrycia szczepów pałeczek
Bardziej szczegółowoENTEROCOCCUS SP. OPORNE NA WANKOMYCYNĘ
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 351-357 Sylwia Kożuszko, Tomasz Bogiel, Eugenia Gospodarek ENTEROCOCCUS SP. OPORNE NA WANKOMYCYNĘ Katedra i Zakład Mikrobiologii Collegium Medicum w Bydgoszczy Uniwersytetu
Bardziej szczegółowoWrażliwość pałeczek Klebsiella oxytoca na wybrane antybiotyki
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2011, 63: 59-64 Alicja Sękowska, Kamila Buzała, Justyna Pluta, Eugenia Gospodarek Wrażliwość pałeczek Klebsiella oxytoca na wybrane antybiotyki Katedra i Zakład Mikrobiologii Collegium
Bardziej szczegółowoĆWICZENIE I BADANIE WRAŻLIWOŚCI BAKTERII NA ANTYBIOTYKI I CHEMIOTERAPEUTYKI
ĆWICZENIE I BADANIE WRAŻLIWOŚCI BAKTERII NA ANTYBIOTYKI I CHEMIOTERAPEUTYKI Autor i główny prowadzący dr Dorota Korsak Wstęp Jednym z najważniejszych etapów rutynowej diagnostyki mikrobiologicznej zakażeń
Bardziej szczegółowoRAPORT 1.1/SRM/2017 Z BADAŃ PRZEWIDZIANYCH W UMOWIE Z DNIA R.
RAPORT 1.1/SRM/2017 Z BADAŃ PRZEWIDZIANYCH W UMOWIE Z DNIA 25.04.2017 R. OCENA SKUTECZNOŚCI MIKROBIOBÓJCZEJ URZĄDZENIA INDUCT 750 FIRMY ACTIVTEK WOBEC PAŁECZEK KLEBSIELLA PNEUMONIAE W POWIETRZU Wykonawcy:
Bardziej szczegółowoWrażliwość pałeczek Morganella morganii na antybiotyki
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 20, 63: 55-62 Patrycja Zalas-Więcek, Anna Michalska, Barbara Sielska, Eugenia Gospodarek Wrażliwość pałeczek Morganella morganii na antybiotyki Katedra i Zakład Mikrobiologii Collegium
Bardziej szczegółowoĆwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Cel ćwiczenia Amplifikacja fragmentu genu amelogeniny, znajdującego się na chromosomach X i Y, jako celu molekularnego przydatnego
Bardziej szczegółowoWYKORZYSTANIE METOD FENOTYPOWYCH DO WEWNĄTRZGATUNKOWEGO RÓŻNICOWANIA METICYLINOOPORNYCH SZCZEPÓW STAPHYLOCOCCUS EPIDERMIDIS ANALIZA PORÓWNAWCZA
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 11-20 Tomasz Bogiel, Agnieszka Mikucka, Aleksander Deptuła, Eugenia Gospodarek WYKORZYSTANIE METOD FENOTYPOWYCH DO WEWNĄTRZGATUNKOWEGO RÓŻNICOWANIA METICYLINOOPORNYCH SZCZEPÓW
Bardziej szczegółowoSTRESZCZENIE CEL PRACY
STRESZCZENIE W ostatnich dekadach nastąpił ogromny wzrost występowania zakażeń szpitalnych wywołanych przez Acinetobacter baumannii. Zdecydowany postęp medycyny wraz ze stosowanymi inwazyjnymi zabiegami
Bardziej szczegółowoInstytut Genetyki i Mikrobiologii UW we Wrocławiu Kierownik: prof. dr hab. W. Doroszkiewicz 2
MED. DOŚW. MIKOBIOL., 28, 6: - Kamila Korzekwa,2, Dorota Wojnicz 3, Włodzimierz Doroszkiewicz, Stanisław Jankowski 3 WYSTĘPOWANIE I LEKOOPONOŚĆ PAŁECZEK NIEFEMENTUJĄCYCH IZOLOWANYCH OD PACJENTÓW HOSPITALIZOWANYCH
Bardziej szczegółowoWYSTĘPOWANIE W MATERIALE KLINICZNYM I LEKOWRAŻLIWOŚĆ SZCZEPÓW STENOTROPHOMONAS MALTOPHILIA
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2010, 62: 127-134 Karolina Hankiewicz-Ziołkowska, Agnieszka Mikucka, Eugenia Gospodarek WYSTĘPOWANIE W MATERIALE KLINICZNYM I LEKOWRAŻLIWOŚĆ SZCZEPÓW STENOTROPHOMONAS MALTOPHILIA
Bardziej szczegółowoWykrywanie karbapenemaz zalecenia 2015
Wykrywanie karbapenemaz zalecenia 2015 Dorota Żabicka 1, Anna Baraniak 2, Elżbieta Literacka 1, Marek Gniadkowski 2, Waleria Hryniewicz 1 1. Zakład Epidemiologii i Mikrobiologii Klinicznej, Narodowy Instytut
Bardziej szczegółowoNumer 3/2018. Oporność na antybiotyki w Polsce w 2017 roku dane sieci EARS-Net
AktualnoŚci Narodowego Programu Ochrony Antybiotyków Numer 3/2018 Oporność na antybiotyki w Polsce w 2017 roku dane sieci EARS-Net Opracowanie: dr n. med. Dorota Żabicka, Zakład Epidemiologii i Mikrobiologii
Bardziej szczegółowoSZCZEPY SALMONELLA SP. OPORNE NA LEKI PRZECIWBAKTERYJNE
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2010, 62: 37-42 Agata Białucha, Sylwia Kożuszko, Eugenia Gospodarek SZCZEPY SALMONELLA SP. OPORNE NA LEKI PRZECIWBAKTERYJNE Katedra i Zakład Mikrobiologii Collegium Medicum im. L.
Bardziej szczegółowoOporność na antybiotyki w Unii Europejskiej Dane zaprezentowane poniżej zgromadzone zostały w ramach programu EARS-Net, który jest koordynowany przez
Informacja o aktualnych danych dotyczących oporności na antybiotyki na terenie Unii Europejskiej Październik 2013 Główne zagadnienia dotyczące oporności na antybiotyki przedstawione w prezentowanej broszurze
Bardziej szczegółowoWystępowanie patogenów alarmowych w środowisku szpitalnym. Część I. Pałeczki z rodziny Enterobacteriaceae wytwarzające β-laktamazy ESBL
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2012, 64: 35-43 Występowanie patogenów alarmowych w środowisku szpitalnym. Część I. Pałeczki z rodziny Enterobacteriaceae wytwarzające β-laktamazy ESBL Occurrence of alert pathogens
Bardziej szczegółowoAmpli-LAMP Salmonella species
Novazym Products Novazym Polska ul. Żywokostowa 23, 61-680 Poznań, tel. +48 0 61 610 39 10, fax +48 0 61 610 39 11, email info@novazym.com Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego bakterii z rodzaju
Bardziej szczegółowoSekcja Higieny i Epidemiologii, Wojskowy Instytut Medyczny w Warszawie
ZASADY POSTĘPOWANIA W OGNISKACH EPIDEMICZNYCH WYWOŁYWANYCH PRZEZ SZCZEPY STAPHYLOCOCCUS AUREUS. ZADANIA ZESPOŁU DS. ZAKAŻEN SZPITALNYCH lek. med.marta Kania-Pudło 1, mgr Katarzyna Bojarska 2, prof. dr
Bardziej szczegółowoWykrywanie karbapenemaz zalecenia 2013
Zalecenia sfinansowane ze środków będących w dyspozycji Ministra Zdrowia w ramach programu zdrowotnego pn.: Narodowy Program Ochrony Antybiotyków Moduł I Monitorowanie zakażeń szpitalnych oraz inwazyjnych
Bardziej szczegółowoETIOLOGIA ZAKAŻEŃ SZPITALNYCH REJESTROWANYCH W SZPITALU UNIWERSYTECKIM NR 2 W BYDGOSZCZY W LATACH
PRACA ORYGINALNA ETIOLOGIA ZAKAŻEŃ SZPITALNYCH REJESTROWANYCH W SZPITALU UNIWERSYTECKIM NR 2 W BYDGOSZCZY W LATACH 2015 2017 ETIOLOGY OF HOSPITAL INFECTIONS REGISTERED IN UNIVERSITY HOSPITAL NO. 2 IN BYDGOSZCZ
Bardziej szczegółowoĆwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności
Bardziej szczegółowoZalecenia rekomendowane przez Ministra Zdrowia. KPC - ang: Klebsiella pneumoniae carbapenemase
Zalecenia dotyczące postępowania w przypadku identyfikacji w zakładach opieki zdrowotnej szczepów bakteryjnych Enterobacteriaceae wytwarzających karbapenemazy typu KPC * * KPC - ang: Klebsiella pneumoniae
Bardziej szczegółowoAmpli-LAMP Babesia canis
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego pierwotniaka Babesia canis canis techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-Bc-200 AML-Bc-400
Bardziej szczegółowoWpływ racjonalnej antybiotykoterapii na lekowrażliwość drobnoustrojów
WOJSKOWY SZPITAL KLINICZNY Wpływ racjonalnej BYDGOSZCZ antybiotykoterapii na lekowrażliwość drobnoustrojów 10 Wojskowy Szpital Kliniczny z Polikliniką SP ZOZ w Bydgoszczy dr n. med. Joanna Sierzputowska
Bardziej szczegółowoZMIANY DO TEKSTU. Rekomendacje doboru testów do oznaczania wraŝliwości bakterii na antybiotyki i chemioterapeutyki 2006 WPROWADZONE W ROKU 2007
Krajowy Ośrodek Referencyjny ds. LekowraŜliwości Drobnoustrojów Narodowego Instytutu Leków ZMIANY DO TEKSTU Rekomendacje doboru testów do oznaczania wraŝliwości bakterii na antybiotyki i chemioterapeutyki
Bardziej szczegółowoOPORNOŚĆ SZCZEPÓW PSEUDOMONAS AERUGINOSA NA KARBAPENEMY PO INKUBACJI Z SUBINHIBICYJNYMI STĘŻENIAMI IMIPENEMU I MEROPENEMU
Nowiny Lekarskie 2011, 80, 4, 258 265 PAWEŁ SACHA 1, PIOTR WIECZOREK 1, DOMINIKA OJDANA 1, SŁAWOMIR CZABAN 2, DOROTA OLSZAŃ- SKA 3, ELŻBIETA TRYNISZEWSKA 1, 3 OPORNOŚĆ SZCZEPÓW PSEUDOMONAS AERUGINOSA NA
Bardziej szczegółowoDORIPENEM NOWY LEK Z GRUPY KARBAPENEMÓW
DORIPENEM NOWY LEK Z GRUPY KARBAPENEMÓW dr n. med. Dorota Żabicka, prof. dr hab n. med. Waleria Hryniewicz Krajowy Ośrodek Referencyjny ds. Lekowrażliwości Drobnoustrojów Narodowy Instytut Leków, Warszawa
Bardziej szczegółowoDetekcja i identyfikacja drobnoustrojów. oznaczanie lekowrażliwości bakterii
STRESZCZENIE W medycznych laboratoriach mikrobiologicznych do oznaczania lekowrażliwości bakterii stosowane są systemy automatyczne oraz metody manualne, takie jak metoda dyfuzyjno-krążkowa i oznaczanie
Bardziej szczegółowoLEKOWRAŻLIWOŚĆ I WŁAŚCIWOŚCI ADHEZYJNE SZCZEPÓW ESCHERICHIA COLI IZOLOWANYCH Z MOCZU I Z KRWI
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2010, 62: 43-50 Patrycja Zalas-Więcek, Eugenia Gospodarek, Katarzyna Piecyk LEKOWRAŻLIWOŚĆ I WŁAŚCIWOŚCI ADHEZYJNE SZCZEPÓW ESCHERICHIA COLI IZOLOWANYCH Z MOCZU I Z KRWI Katedra
Bardziej szczegółowoArkusz1. Nazwa artykułu opakowanie ilość opak. 1 Agar Columbia + 5% krew barania 20 płytek* 205
Nazwa artykułu opakowanie ilość opak. 1 Agar Columbia + 5% krew barania 20 płytek* 205 Agar czekoladowy + suplement antybiotykowy + czynniki wzrostowe dla Haemophilus 2 20 płytek 60 Torebki do hodowli
Bardziej szczegółowoLekowrażliwość szczepów Escherichia coli z antygenem K1 izolowanych od kobiet ciężarnych i noworodków
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2011, 63: 121-130 Agnieszka Kaczmarek, Anna Budzyńska, Eugenia Gospodarek Lekowrażliwość szczepów Escherichia coli z antygenem K1 izolowanych od kobiet ciężarnych i noworodków Katedra
Bardziej szczegółowoAutor: dr Mirosława Staniaszek
Zakład Hodowli Roślin Ogrodniczych Pracownia Genetyki i Hodowli Roślin Warzywnych Fot. J. Sobolewski Procedura identyfikacji genu Frl warunkującego odporność pomidora na Fusarium oxysporum f.sp. radicis-lycopersici
Bardziej szczegółowoOporność na wysokie stężenia aminoglikozydów wśród szczepów Enterococcus faecalis i Enterococcus faecium wyosobnionych z materiału klinicznego
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2011, 63: 105-113 Sylwia Kożuszko, Agata Białucha, Tomasz Bogiel, Eugenia Gospodarek Oporność na wysokie stężenia aminoglikozydów wśród szczepów Enterococcus faecalis i Enterococcus
Bardziej szczegółowoOporność na antybiotyki w Unii Europejskiej
Podsumowanie danych z 2014 roku o oporności na antybiotyki w Unii Europejskiej Dane z monitorowania sieci EARS-Net Listopad 2015 Poważne zagrożenie: oporność na antybiotyki w Unii Europejskiej Oporność
Bardziej szczegółowoAmpliTest Babesia spp. (PCR)
AmpliTest Babesia spp. (PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla pierwotniaków z rodzaju Babesia techniką PCR Nr kat.: BAC21-100 Wielkość zestawu: 100 oznaczeń Objętość pojedynczej reakcji:
Bardziej szczegółowoLEKOWRAŻLIWOŚĆ I POKREWIEŃSTWO SZCZEPÓW ENTEROCOCCUS SP. IZOLOWANYCH OD PACJENTÓW I ZE ŚRODOWISKA SZPITALNEGO.
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2008, 60: 19-26 Monika Eliza Łysakowska, Andrzej Denys LEKOWRAŻLIWOŚĆ I POKREWIEŃSTWO SZCZEPÓW ENTEROCOCCUS SP. IZOLOWANYCH OD PACJENTÓW I ZE ŚRODOWISKA SZPITALNEGO. Zakład Mikrobiologii
Bardziej szczegółowoOchrony Antybiotyków. AktualnoŚci Narodowego Programu. Podsumowanie aktualnych danych nt. oporności na antybiotyki w Unii Europejskiej.
AktualnoŚci Narodowego Programu Ochrony Antybiotyków Numer 3/2016 Podsumowanie aktualnych danych nt. oporności na antybiotyki w Unii Europejskiej. Dane z monitorowania sieci EARS-Net (listopad 2016) Opracowanie:
Bardziej szczegółowoWRAŻLIWOŚĆ NA WYBRANE TETRACYKLINY PAŁECZEK Z RODZINY ENTEROBACTERIACEAE
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 29, 61: 321-326 Alicja Sękowska, Anita Ibsz-Fijałkowska, Karolina Gołdyn, Eugenia Gospodarek WRAŻLIWOŚĆ NA WYBRANE TETRACYKLINY PAŁECZEK Z RODZINY ENTEROBACTERIACEAE Katedra i Zakład
Bardziej szczegółowoOPRACOWANIE ZESTAWU DIAGNOSTYCZNEGO DO GENETYCZNEGO TYPOWANIA SZCZEPÓW BAKTERYJNYCH METODĄ PCR MP
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2008, 60: 39-54 Beata Krawczyk, Karolina Stojowska, Justyna Leibner-Ciszak OPRACOWANIE ZESTAWU DIAGNOSTYCZNEGO DO GENETYCZNEGO TYPOWANIA SZCZEPÓW BAKTERYJNYCH METODĄ PCR MP Katedra
Bardziej szczegółowoWyniki molekularnych dochodzeń epidemiologicznych u chorych zakażonych szczepami z rodzaju Acinetobacter
PRACA ORYGINALNA Joanna Nowak, Agnieszka Pacholczyk, Violetta Petroniec, Beata Dziedzicka, Zofia Zwolska Zakład Mikrobiologii Instytutu Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie Kierownik: prof. dr hab. n. med.
Bardziej szczegółowoDr n. med. Dorota Żabicka, NPOA, KORLD, Zakład Epidemiologii i Mikrobiologii Klinicznej NIL
Raport opracowany ze środków finansowych będących w dyspozycji Ministra Zdrowia w ramach realizacji programu polityki zdrowotnej pn. Narodowy Program Ochrony Antybiotyków na lata 06-00 Narodowy Instytut
Bardziej szczegółowoUKŁAD MOCZOWY JAKO PIERWOTNE ŹRÓDŁO ZAKAŻENIA KRWI
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 343-350 Anna Budzyńska, Agnieszka Kaczmarek, Eugenia Gospodarek UKŁAD MOCZOWY JAKO PIERWOTNE ŹRÓDŁO ZAKAŻENIA KRWI Katedra i Zakład Mikrobiologii, Collegium Medicum im.
Bardziej szczegółowoPRACA ORYGINALNA. Andrzej Siwiec. 1 mgr Iwona Kowalska, Centrum Pediatrii im. Jana Pawła II w Sosnowcu. Dyrektor dr nauk. med.
PRACA ORYGINALNA MONITOROWANIE I KONTROLA ZAKAŻEŃ SZPITALNYCH W CENTRUM PEDIATRII IM. JANA PAWŁA II W SOSNOWCU [PROPHYLAXIS AND INSPECTION OF HOSPITAL INFECTIONS ON CENTRUM PEDIATRII IM. JANA PAWŁA II
Bardziej szczegółowoĆwiczenie 1. Oznaczanie wrażliwości szczepów na metycylinę
XI. Antybiotyki i chemioterpeutyki ćwiczenia praktyczne W przedstawionych ćwiczeniach narysuj i zinterpretuj otrzymane wyniki badań mechanizmów oporności. Opisz rodzaje krążków użytych do badań oraz sposób
Bardziej szczegółowoZestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych
Nr kat. PK15 Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania w moczu lub w kulturach komórkowych na 50 reakcji PCR (50µl), włączając w to kontrole Detekcja oparta jest na amplifikacji fragmentu genu crp (cysteine
Bardziej szczegółowoAnaliza zakażeń bakteryjnych u pacjentów Oddziału Intensywnej Terapii Uniwersyteckiego Szpitala Klinicznego Nr 1 w Łodzi w latach
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2016, 68: 39-46 Analiza zakażeń bakteryjnych u pacjentów Oddziału Intensywnej Terapii Uniwersyteckiego Szpitala Klinicznego Nr 1 w Łodzi w latach 2002-2015 Bacterial infections in
Bardziej szczegółowoWrażliwość na antybiotyki bakterii izolowanych z moczu chorych leczonych w oddziale dziecięcym
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2010, 62: 231-236 Elżbieta Justyńska 1,Anna Powarzyńska 1,Jolanta Długaszewska 2 Wrażliwość na antybiotyki bakterii izolowanych z moczu chorych leczonych w oddziale dziecięcym 1
Bardziej szczegółowoDane opracowane ze środków finansowych będących w dyspozycji Ministra Zdrowia w ramach realizacji programu polityki zdrowotnej pn.
Dane opracowane ze środków finansowych będących w dyspozycji Ministra Zdrowia w ramach realizacji programu polityki zdrowotnej pn. Narodowy Program Ochrony Antybiotyków na lata 2016-2020 EARS-Net (do 2010
Bardziej szczegółowoVAT % Wartość netto za ilość określoną w kolumnie C. Cena jednostk. netto. Ilość jednostkowa płytek/ml/badań A B C D E F
Sprawa nr PN/7/D/2012 FORMULARZ ASORTYMENTOWO -CENOWY ZAŁĄCZNIK NR 1 DO SIWZ PAKIET 1 Podłoża mikrobiologiczne na płytkach Petriego o średnicy 90 mm LP Rodzaj podłoża Ilość jednostkowa płytek/ml/badań
Bardziej szczegółowo(Multi-drug resistant Pseudomonas aeruginosa; MDRP) 35 MDRP Etest (AB BIODISK) ceftazidime (CAZ) CAZ. Cefepime (CFPM) ciprofloxacin (CPFX)
2006 127 17 11 18 18 7 24 Micro Scan Walk Away96 2002 1 2005 3 39 35 (Multi-drug resistant Pseudomonas aeruginosa; MDRP) 35 MDRP Etest (AB BIODISK) ceftazidime (CAZ) CAZ 25 (71.4 ), CAZ 10 (28.6 ) CAZ
Bardziej szczegółowoWYMAZY Z RANY OPARZENIOWEJ ANALIZA MIKROBIOLOGICZNA
:7 13 PRACA ORYGINALNA ANNA PUDELEWICZ 1 MONIKA LISIECKA 2, 3 WYMAZY Z RANY OPARZENIOWEJ ANALIZA MIKROBIOLOGICZNA WOUND CULTURE IN BURN PATIENTS A MICROBIOLOGICAL ANALYSIS STRESZCZENIE: Wstęp W przypadku
Bardziej szczegółowoPRACE ORYGINALNE ORIGINAL PAPERS
Borgis Postępy Nauk Medycznych, t. XXVIII, nr 4B, 2015 PRACE ORYGINALNE ORIGINAL PAPERS *Magdalena Sikora 1, Marlena Gołaś 2, 3, Katarzyna Piskorska 2, 3, Ewa Swoboda-Kopeć 2, 3 Ocena pokrewieństwa genetycznego
Bardziej szczegółowoRAPORT 1.2/SRM/2017 Z BADAŃ PRZEWIDZIANYCH W UMOWIE Z DNIA R.
RAPORT 1.2/SRM/2017 Z BADAŃ PRZEWIDZIANYCH W UMOWIE Z DNIA 25.04.2017 R. OCENA SKUTECZNOŚCI MIKROBIOBÓJCZEJ URZĄDZENIA INDUCT 750 FIRMY ACTIVTEK WOBEC BAKTERII Z RODZAJU ENTEROCOCCUS W POWIETRZU Wykonawcy:
Bardziej szczegółowoMED. DOŚW. MIKROBIOL., 2014, 66: Kornelia Dobrzaniecka 1, Andrzej Młynarczyk 2, Ksenia Szymanek-Majchrzak 1, Grażyna Młynarczyk 1
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2014, 66: 177-184 Porównanie metod fenotypowych wykrywania beta-laktamaz MBL u szczepów z rodziny Enterobacteriaceae oraz pałeczek niefermentujących izolowanych z próbek materiałów
Bardziej szczegółowoSZCZEGÓŁOWY OPIS PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA
Załącznik nr 2 1 PAKIET NR II SZCZEGÓŁOWY OPIS PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA Automatyczny analizator mikrobiologiczny do identyfikacji i oznaczania lekowrażliwości drobnoustrojów na antybiotyki z określeniem wartości
Bardziej szczegółowoOdpowiedzi ekspertów EUCAST na pytania najczęściej zadawane przez lekarzy klinicystów i mikrobiologów
Odpowiedzi ekspertów EUCAST na pytania najczęściej zadawane przez lekarzy klinicystów i mikrobiologów Interpretacja klinicznych wartości granicznych oznaczania lekowrażliwości drobnoustrojów zgodnie z
Bardziej szczegółowoMED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: Sebastian Wardak, Marek Jagielski 1
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 63-77 Sebastian Wardak, Marek Jagielski 1 OCENA PRZYDATNOŚCI WYBRANYCH METOD GENOTYPOWYCH I FENOTYPOWYCH DO WEWNĄTRZGATUNKOWEGO RÓŻNICOWANIA PAŁECZEK CAMPYLOBACTER JEJUNI
Bardziej szczegółowoAnna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1
Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1 1 Zakład Genetyki i Hodowli Roślin Korzeniowych, Pracownia Biotechnologii, Instytut Hodowli i Aklimatyzacji
Bardziej szczegółowoBiegłość laboratoriów mikrobiologicznych w oznaczaniu lekowrażliwości drobnoustrojów POLMICRO 2012
diagnostyka laboratoryjna Journal of Laboratory Diagnostics 203 Volume 49 Number 7-24 Praca oryginalna Original Article Biegłość laboratoriów mikrobiologicznych w oznaczaniu lekowrażliwości drobnoustrojów
Bardziej szczegółowoOcena flory bakteryjnej izolowanej od chorych hospitalizowanych w Szpitalu Wojewódzkim nr 2 w Rzeszowie w latach
Wydawnictwo UR 28 ISSN 173-3524 Przegląd Medyczny Uniwersytetu Rzeszowskiego Rzeszów 29, 1, 7 77 Krzysztof Golec, Łukasz Golec, Jolanta Gruszecka Ocena flory bakteryjnej izolowanej od chorych hospitalizowanych
Bardziej szczegółowo- podłoża transportowo wzrostowe..
Ćw. nr 2 Klasyfikacja drobnoustrojów. Zasady pobierania materiałów do badania mikrobiologicznego. 1. Obejrzyj zestawy do pobierania materiałów i wpisz jakie materiały pobieramy na: - wymazówki suche. -
Bardziej szczegółowoADHEZJA PAŁECZEK ESCHERICHIA COLI DO CEWNIKÓW MOCZOWYCH
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 335-341 Patrycja Zalas-Więcek 1, Eugenia Gospodarek 1, Katarzyna Piecyk 2 ADHEZJA PAŁECZEK ESCHERICHIA COLI DO CEWNIKÓW MOCZOWYCH 1 Katedra i Zakład Mikrobiologii Collegium
Bardziej szczegółowoMETODY OZNACZANIA LEKOWRAŻLIWOŚCI DROBNOUSTROJÓW I WYKRYWANIA MECHANIZMÓW OPORNOŚCI NA LEKI MOŻLIWOŚCI TERAPII ZAKAŻEŃ PRZEWODU POKARMOWEGO
WNOZ- DIETETYKA SEMINARIUM 4 METODY OZNACZANIA LEKOWRAŻLIWOŚCI DROBNOUSTROJÓW I WYKRYWANIA MECHANIZMÓW OPORNOŚCI NA LEKI MOŻLIWOŚCI TERAPII ZAKAŻEŃ PRZEWODU POKARMOWEGO Mechanizmy działania chemioterapeutyków
Bardziej szczegółowoDane opracowane ze środków finansowych będących w dyspozycji Ministra Zdrowia w ramach realizacji programu polityki zdrowotnej pn.
Dane opracowane ze środków finansowych będących w dyspozycji Ministra Zdrowia w ramach realizacji programu polityki zdrowotnej pn. Narodowy Program Ochrony Antybiotyków na lata 2016-2020 W sieci EARS-Net
Bardziej szczegółowoDiagnostyka molekularna w OIT
Diagnostyka molekularna w OIT B A R B A R A A D A M I K K A T E D R A I K L I N I K A A N E S T E Z J O L O G I I I I N T E N S Y W N E J T E R A P I I U N I W E R S Y T E T M E D Y C Z N Y W E W R O C
Bardziej szczegółowoĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków)
ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków) Celem ćwiczenia jest wprowadzenie mutacji punktowej do genu
Bardziej szczegółowoKatarzyna Jachna-Sawicka, Maja Kleszczyńska, Eugenia Gospodarek
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2012, 64: 221-228 Adhezja oraz wytwarzanie śluzu zewnątrzkomórkowego przez dzikie i kliniczne szczepy pałeczek Acinetobacter baumannii Adhesion and slime production by wild and clinical
Bardziej szczegółowoIdentyfikacja 20 nowych rejonów zmiennych w genomach Staphylococcus aureus przydatnych do genotypowania koagulazo-dodatnich gronkowców
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2017, 69: 93-103 Roman Kotłowski Identyfikacja 20 nowych rejonów zmiennych w genomach Staphylococcus aureus przydatnych do genotypowania koagulazo-dodatnich gronkowców Identification
Bardziej szczegółowoUDZIAŁ PAŁECZEK ALCALIGENES FAECALIS W ZAKAŻENIACH PACJENTÓW SZPITALA UNIWERSYTECKIEGO W BYDGOSZCZY
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 87-92 Katarzyna Jachna-Sawicka, Eugenia Gospodarek UDZIAŁ PAŁECZEK ALCALIGENES FAECALIS W ZAKAŻENIACH PACJENTÓW SZPITALA UNIWERSYTECKIEGO W BYDGOSZCZY Katedra i Zakład
Bardziej szczegółowoPODŁOŻA MIKROBIOLOGICZNE DO OZNACZANIA LEKOWRAŻLIWOŚCI
PODŁOŻA MIKROBIOLOGICZNE DO OZNACZANIA LEKOWRAŻLIWOŚCI Wystandaryzowane i zwalidowane podłoża mikrobiologiczne do oznaczania lekowrażliwości (AST) Aby spełnić zalecenia EUCAST* i CLSI **, biomérieux rozwinęło
Bardziej szczegółowoZestaw dydaktyczny. genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP
2014-07-17 Zestaw dydaktyczny EasyGenotyping PCR-RFLP - S. aureus genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP Celem ćwiczenia jest przeprowadzenie typowania genetycznego dostarczonych
Bardziej szczegółowoZRÓŻNICOW ANIE GENETYCZNE SZCZEPÓW DROŻDŻY FERM ENTUJĄCYCH KSYLOZĘ
ŻYW NO ŚĆ 3(20)Supl 1999 JOANNA CHMIELEWSKA, JOANNA KAWA-RYGIELSKA ZRÓŻNICOW ANIE GENETYCZNE SZCZEPÓW DROŻDŻY FERM ENTUJĄCYCH KSYLOZĘ S t r e s z c z e n i e W pracy podjęto próbę wykorzystania metody
Bardziej szczegółowoKlebsiella pneumoniae New Delhi alert dla polskich szpitali
Klebsiella pneumoniae New Delhi alert dla polskich szpitali Jak zatrzymać falę zakażeń powodowanych przez drobnoustrój o skrajnej oporności na antybiotyki? Tomasz Ozorowski Analiza faktów FAKT 1. SKRAJNA
Bardziej szczegółowoAKTUALNOÂCI BINET. Nr 10/ Drogie Koleżanki i Koledzy. Inwazyjna choroba meningokokowa w 2015 roku
www.koroun.edu.pl Drogie Koleżanki i Koledzy Witamy serdecznie, oddajemy w Państwa ręce kolejny numer Aktualności BINet. Jest on poświęcony epidemiologii inwazyjnych zakażeń wywoływanych przez Neisseria
Bardziej szczegółowoTYPOWANIE MOLEKULARNE W DOCHODZENIU EPIDEMIOLOGICZNYM
TYPOWANIE MOLEKULARNE W DOCHODZENIU EPIDEMIOLOGICZNYM Stefania Giedrys-Kalemba 7 110 Podstawowym zadaniem zespołu kontroli zakażeń jest prowadzenie systematycznego nadzoru i rejestracji zakażeń w celu
Bardziej szczegółowoNowe definicje klinicznych kategorii wrażliwości wprowadzone przez EUCAST w 2019 roku
Nowe definicje klinicznych kategorii wrażliwości wprowadzone przez EUCAST w 2019 roku Dorota Żabicka Krajowy Ośrodek Referencyjny ds. LekowrażliwościDrobnoustrojów (KORLD) Zakład Epidemiologii i Mikrobiologii
Bardziej szczegółowoWstęp. Key words: MSSCP, PCR RFLP, Staphylococcus spp., 16S rrna, 16S 23S rrna
Streszczenie Zakażenia szpitalne stanowią złożony problem dla współczesnego lecznictwa i są przyczyną przedłużonego leczenia, rekonwalescencji, zwiększonych kosztów a nawet wielu zgonów wśród pacjentów
Bardziej szczegółowoWŁAŚCIWOŚCI MORFOLOGICZNYCH WARIANTÓW PAŁECZEK ESCHERICHIA COLI
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 21, 62: 51-58 Patrycja Zalas-Więcek, Eugenia Gospodarek, Dorota Kamińska WŁAŚCIWOŚCI MORFOLOGICZNYCH WARIANTÓW PAŁECZEK ESCHERICHIA COLI Katedra i Zakład Mikrobiologii Collegium
Bardziej szczegółowoOdpowiedzi ekspertów EUCAST na pytania najczęściej zadawane przez mikrobiologów dotyczące oznaczeń wrażliwości drobnoustrojów
Odpowiedzi ekspertów EUCAST na pytania najczęściej zadawane przez mikrobiologów dotyczące oznaczeń wrażliwości drobnoustrojów Podłoża metoda dyfuzyjno-krążkowa EUCAST 1. Który z producentów podłoża agarowego
Bardziej szczegółowoBadanie mikrobiologiczne płynów z jam ciała
Badanie mikrobiologiczne płynów z jam ciała Dorota Olszańska Zakład Diagnostyki Mikrobiologicznej i Immunologii Infekcyjnej USK w Białymstoku Kierownik Prof. Dr hab. n. med. Elżbieta Tryniszewska Cel badań
Bardziej szczegółowoTaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R
TaqNova-RED Polimeraza DNA RP20R, RP100R RP20R, RP100R TaqNova-RED Polimeraza DNA Rekombinowana termostabilna polimeraza DNA Taq zawierająca czerwony barwnik, izolowana z Thermus aquaticus, o przybliżonej
Bardziej szczegółowoDr hab. Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii, Politechnika Gdańska
Narzędzia diagnostyki molekularnej w typowaniu genetycznym (genotypowaniu) Dr hab. Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii, Politechnika Gdańska Publikacja współfinansowana ze środków Unii Europejskiej w
Bardziej szczegółowoThe incidence of high level aminoglicoside and high level β lactam resistance among enterococcal strains of various origin.
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 202, 64: 8 Występowanie wysokiej oporności na aminoglikozydy i β laktamy enterokoków izolowanych z różnych środowisk The incidence of high level aminoglicoside and high level β lactam
Bardziej szczegółowoProjekt Alexander w Polsce w latach
Projekt Alexander w Polsce w latach 1996-2008 NaduŜywanie antybiotyków i chemioterapeutyków oraz ich niewłaściwe stosowanie doprowadziło do globalnego zagroŝenia, jakim jest powstawanie i szerzenie się
Bardziej szczegółowoCharakterystyka wzorów lekowrażliwości szpitalnych szczepów Clostridium difficile w Polsce oraz badanie mechanizmów oporności na wybrane leki
STRESZCZENIE W JĘZYKU POLSKIM Charakterystyka wzorów lekowrażliwości szpitalnych szczepów Clostridium difficile w Polsce oraz badanie mechanizmów oporności na wybrane leki Clostridium difficile to Gram-dodatnia,
Bardziej szczegółowoGenetic relatedness of resistant C. glabrata strains to azoles isolated from clinical specimens of patients hospitalized in Central Clinical Hospital
Postępy Nauk Medycznych, t. XXVIII, nr 4B, 2015 Borgis Emilia Tsimbalari 1, *Beata Sulik-Tyszka 2, Marlena Gołaś 2, 3, Magdalena Sikora 4, Katarzyna Piskorska 2, 3, Ewa Swoboda-Kopeć 2, 3 Analiza pokrewieństwa
Bardziej szczegółowoPodsumowanie najnowszych danych dotyczących oporności na antybiotyki w krajach Unii Europejskiej Dane z monitorowania sieci EARS-Net
EUROPEJSKI DZIEŃ WIEDZY O ANTYBIOTYKACH A European Health Initiative EUROPEJSKIE CENTRUM DS. ZAPOBIEGANIA Podsumowanie najnowszych danych dotyczących oporności na antybiotyki w krajach Unii Europejskiej
Bardziej szczegółowoMED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: Sebastian Wardak, Marek Jagielski 1
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 47-61 Sebastian Wardak, Marek Jagielski 1 OCENA PRZYDATNOŚCI WYBRANYCH METOD GENOTYPOWYCH I FENOTYPOWYCH DO WEWNĄTRZGATUNKOWEGO RÓŻNICOWANIA PAŁECZEK CAMPYLOBACTER JEJUNI
Bardziej szczegółowoRekomendacje doboru testów do oznaczania wrażliwości bakterii. na antybiotyki i chemioterapeutyki 2009
Rekomendacje doboru testów do oznaczania wrażliwości bakterii na antybiotyki i chemioterapeutyki 2009 Oznaczanie wrażliwości Neisseria meningitidis i Haemophilus influenzae Anna Skoczyńska 1, Dorota Żabicka
Bardziej szczegółowo