Pomoc do serwisu biomart projektu GERMINATE-BD

Wielkość: px

Rozpocząć pokaz od strony:

Download "Pomoc do serwisu biomart projektu GERMINATE-BD"

Jarosław Malinowski
7 lat temu
Przeglądów:

1 Pomoc do serwisu biomart projektu GERMINATE-BD Wojciech Frohmberg 30 maja Strona domowa dostęp do pomocy możliwość zalogowania wybór zbioru danych informacje o projekcie 1.1 Logowanie Celem zalogowania kliknij link login w prawym górnym rogu strony (rys. 1). Zostaniesz poproszony o podanie loginu oraz hasła, po wpisaniu których zostaniesz przekierowany ponownie na stronę domową. Żeby uzyskać login i hasło skontaktuj się mailowo z naszą pracownią. 1.2 Wybór zbioru danych Zbiór danych określa rodzaj danych, których pobraniem jesteśmy zainteresowani. Mamy do wyboru dane fenotypowe i dane markerowe. Łącza do odpowiednich podstron serwisu znajdują się w lewym oknie strony domowej (rys. 1) Rysunek 1: Strona domowa. 1

Zostaniesz poproszony o podanie loginu oraz hasła, po wpisaniu których zostaniesz przekierowany ponownie na stronę domową.

2 2 Strona z wyborem danych zmiana zbioru danych definiowanie filtrów możliwość określania atrybutów przejście do strony z wynikami powrót do strony głównej 2.1 Zmiana zbioru danych U góry opcji udostępniono opcję zmiany zbioru danych, wybranego w poprzednim kroku. Pozwala ona na przejście pomiędzy danymi fenotypowymi i markerowymi. Umiejscowienie pola zmiany zbioru danych znajduje się na rysunku Filtry Udostępniają możliwość filtrowania wierszy wyniku w poszukiwaniu interesujących wartości. Panel filtrów, umożliwiających ustawienie tych ograniczeń, znajduje się tuż pod panelem wyboru zbioru danych (rys. 2). Możemy wybrać kilka wartości dla pojedynczego filtra. Spowoduje to wybranie wierszy z dowolną z wybranych wartości na określonym przez nazwę filtra atrybucie. Żeby zaznaczyć kilka wartości w pojedynczym filtrze, podczas zaznaczania należy trzymać wciśnięty na klawiaturze przycisk Ctrl. W każdym momencie możemy zresetować wybrane wartości dla filtra poprzez naciśnięcie pojawiającego się obok niego krzyżyka (rys. 2). W momencie, gdy nie wybierzemy żadnej wartości filtra, filtr ten jest nieaktywny. Nie ma konieczności wyboru wartości na każdym filtrze, żeby otrzymać w odpowiedzi jakiekolwiek dane. 2.3 Definiowanie atrybutów Atrybuty definiują wyświetlane w zbiorze wyników kolumny. Panel z możliwymi do wyboru atrybutami znajduje się tuż pod panelem filtrów (rys. 2). Specyficznym spośród atrybutów jest Show all (not distinct), który należy zaznaczyć w momencie, w którym chcemy otrzymać wszystkie możliwe wyniki znajdujące się w bazie, nawet jeśli wyniki się powtarzają (mają takie same wartości na wszystkich wybranych atrybutach/kolumnach). 2.4 Przejście do strony z danymi Gdy już wybierzemy interesujące nas kolumny oraz filtry, chcielibyśmy przejść do strony, w której będziemy mogli podejrzeć dane i pobrać je na nasz komputer. Do tego celu służy przycisk GO, umiejscowiony u dołu widoku (rys. 2). 2.5 Przejście do strony głównej W każdym momencie możemy również przejść do strony głównej serwisu. Do tego celu należy skorzystać z linku Home znajdującego się na pasku nawigacji (rys. 2). 2

Umiejscowienie pola zmiany zbioru danych znajduje się na rysunku 2. 2.2 Filtry Udostępniają możliwość filtrowania wierszy wyniku w poszukiwaniu interesujących wartości.

3 Cross Rysunek 2: Strona wyboru danych. 3

4 Etykiety kolumn 3.1 Linki z nr. stron Rysunek 3: Strona z danymi. 3 Strona z danymi wyświetlanie podglądu danych pobieranie danych powrót do strony z wyborem danych powrót do strony domowej 3.1 Podgląd danych Podgląd danych (rys. 3) służy tylko i wyłącznie temu, by użytkownik mógł stwierdzić, czy wybrane przez niego filtry i atrybuty są zgodne z jego oczekiwaniami. W celach wydajnościowych ograniczono podgląd do 1000 wierszy wyniku. W przypadku, gdy użytkownik będzie chciał poznać wszystkie wyniki, powinien przejść do sekcji pobierania danych. Wyniki podglądu przedstawiane są na stronach po 20 wyników (wierszy). Przechodzenie pomiędzy stronami zapewniają linki z numerami stron. Kolejność kolumn w podglądzie danych odpowiada kolejności zaznaczania atrybutów na poprzedniej stronie. Do wygodniejszej analizy otrzymanych w podglądzie wyników możemy posłużyć się funkcją sortowania wierszy po wybranej kolumnie. Celem posortowania wierszy po określonej kolumnie naciskamy na etykietę tejże kolumny. UWAGA!! Posortowaniu ulegną wszystkie dane z bazy danych a nie tylko te akurat widoczne na stronie! 4

3) służy tylko i wyłącznie temu, by użytkownik mógł stwierdzić, czy wybrane przez niego filtry i atrybuty są zgodne z jego oczekiwaniami.

5 3.2 Pobieranie danych Do pobierania danych w formacie TSV (z ang. tab-separated values) służy przycisk download data znajdujący się w górnej części widoku (rys. 3). Plik zapisany w tym formacie można otworzyć m.in. w popularnych narzędziach służących do przeprowadzania matematycznej analizy danych na przykład Microsoft Excel, czy Calc należący do pakietu Open Office. 3.3 Powrót do strony z wyborem danych Przycisk powrotu do strony z wyborem danych znajduje się tuż obok przycisku do pobierania danych (rys. 3). 3.4 Powrót do strony domowej Podobnie jak na stronie z wyborem danych, mamy tutaj dostępną opcję powrotu do strony głównej serwisu. Link do strony domowej znajduje się na pasku nawigacji (rys. 3). 5

w popularnych narzędziach służących do przeprowadzania matematycznej analizy danych na przykład Microsoft Excel, czy Calc należący do pakietu Open Office. 3.

Podobne dokumenty

Akademia Lidera. www.akademia-lidera.pl

Akademia Lidera. www.akademia-lidera.pl Akademia Lidera www.akademia-lidera.pl 2 Spis treści 1. LOGOWANIE 3 2. STRONA GŁÓWNA 4 3. KURS 5 4. ZADANIA KURSU 6 5. KALENDARZ 7 6. MOJE KURSY 8 7. WYSYŁANIE POWIADOMIEŃ (KOORDYNATORZY) 9 3 1. Logowanie